Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ECYICHARFTQSGTMKMHILQKHTENVAKFHCPHCDTVIARKSDLGVHLRKQHSYIEQGKKCRYCDAVFHERYALIQHQK
SHKN

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7w1m:H 322 84 1.0000 0.2609 1.0000 2.94e-56 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
2 7w1m:H 322 82 0.2976 0.0776 0.3049 0.025 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
3 7w1m:H 322 63 0.2024 0.0528 0.2698 0.58 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
4 7w1m:H 322 80 0.2619 0.0683 0.2750 1.3 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
5 2ct1:A 77 55 0.6548 0.7143 1.0000 3.40e-37
6 2kmk:A 82 85 0.2976 0.3049 0.2941 1.57e-05
7 3w5k:B 110 103 0.3452 0.2636 0.2816 3.75e-04
8 2dlq:A 124 83 0.3452 0.2339 0.3494 6.58e-04
9 2dlq:A 124 58 0.1905 0.1290 0.2759 0.61
10 1mey:F 84 83 0.2857 0.2857 0.2892 7.05e-04 1mey:C
11 1mey:F 84 53 0.1905 0.1905 0.3019 0.21 1mey:C
12 6j0d:A 87 28 0.1429 0.1379 0.4286 0.002
13 6j0d:A 87 20 0.1190 0.1149 0.5000 2.3
14 2i13:A 151 81 0.2857 0.1589 0.2963 0.003
15 2i13:A 151 63 0.2381 0.1325 0.3175 0.015
16 2i13:B 144 81 0.2857 0.1667 0.2963 0.006
17 2i13:B 144 53 0.1905 0.1111 0.3019 0.14
18 2i13:B 144 82 0.2500 0.1458 0.2561 0.54
19 8e3e:F 121 82 0.2976 0.2066 0.3049 0.006 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
20 8dey:C 57 49 0.2262 0.3333 0.3878 0.010 8dey:F
21 8dey:C 57 54 0.2262 0.3333 0.3519 0.11 8dey:F
22 2rsi:A 92 59 0.2500 0.2283 0.3559 0.018 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
23 2rsi:A 92 22 0.1310 0.1196 0.5000 1.2 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
24 8ffz:A 314 61 0.2262 0.0605 0.3115 0.037
25 2drp:D 65 52 0.1667 0.2154 0.2692 0.039 2drp:A
26 2dmd:A 96 82 0.2976 0.2604 0.3049 0.058
27 2rsj:A 92 65 0.2619 0.2391 0.3385 0.063 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
28 2lv2:A 85 47 0.2024 0.2000 0.3617 0.064
29 2yu5:A 44 26 0.1429 0.2727 0.4615 0.065
30 7txc:E 84 50 0.2143 0.2143 0.3600 0.10
31 7ysf:A 113 27 0.1310 0.0973 0.4074 0.13
32 6b0o:A 119 81 0.2738 0.1933 0.2840 0.27 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
33 6b0o:A 119 48 0.1548 0.1092 0.2708 9.2 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
34 6ml4:A 143 81 0.3095 0.1818 0.3210 0.28 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
35 6ml4:A 143 50 0.2024 0.1189 0.3400 0.87 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
36 2emb:A 44 22 0.1429 0.2727 0.5455 0.30
37 8g9u:P 757 28 0.1548 0.0172 0.4643 0.31
38 2ebt:A 100 80 0.2738 0.2300 0.2875 0.34
39 5wjq:D 281 83 0.2857 0.0854 0.2892 0.38 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
40 5wjq:D 281 53 0.2143 0.0641 0.3396 5.7 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
41 1p7a:A 37 35 0.1310 0.2973 0.3143 0.51 1u85:A, 1u86:A
42 1x6h:A 86 52 0.1548 0.1512 0.2500 0.70
43 1x6e:A 72 55 0.2024 0.2361 0.3091 0.80
44 1g2d:C 89 58 0.2262 0.2135 0.3276 0.83 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
45 4bxd:A 255 56 0.2381 0.0784 0.3571 0.92 4bxd:B, 4bxe:A, 4bxe:B
46 6e93:A 112 84 0.2738 0.2054 0.2738 0.99 6e94:A
47 2yrm:A 43 24 0.1071 0.2093 0.3750 1.1
48 2cot:A 77 54 0.2143 0.2338 0.3333 1.3
49 1bbo:A 57 54 0.2143 0.3158 0.3333 2.0 3znf:A, 4znf:A
50 4is1:D 54 53 0.1905 0.2963 0.3019 2.5 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
51 8qbn:Y 119 27 0.1071 0.0756 0.3333 2.6
52 2emy:A 46 22 0.1071 0.1957 0.4091 3.1 2el5:A
53 2emh:A 46 21 0.1190 0.2174 0.4762 3.1
54 8tho:A 100 51 0.2024 0.1700 0.3333 3.2 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
55 1bf6:A 291 50 0.1548 0.0447 0.2600 3.3 1bf6:B, 4lef:C, 4lef:D, 4lef:A, 4lef:B, 4lef:E, 4lef:F, 4lef:G, 4lef:H
56 3ubx:L 214 31 0.1429 0.0561 0.3871 3.3 3ubx:I
57 5ke9:A 88 47 0.1667 0.1591 0.2979 3.8 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
58 5ke9:A 88 80 0.2976 0.2841 0.3125 5.5 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
59 2em3:A 46 26 0.1190 0.2174 0.3846 3.8
60 6drt:A 230 34 0.1310 0.0478 0.3235 4.0 6drt:B, 6drt:C
61 3mhh:C 93 43 0.1429 0.1290 0.2791 4.2 6aqr:C, 4fk5:C, 3kjl:E, 3kjl:H, 3m99:B, 3mhs:C, 6t9l:M, 4wa6:C, 4zux:W, 4zux:b, 4zux:g, 4zux:l
62 2yso:A 46 26 0.1190 0.2174 0.3846 4.4
63 5hvq:C 236 42 0.1548 0.0551 0.3095 5.2 5wy5:A
64 2k7r:A 106 17 0.1190 0.0943 0.5882 5.3
65 5xxb:o 90 50 0.1667 0.1556 0.2800 5.7
66 6j2p:A 98 27 0.1071 0.0918 0.3333 6.1 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
67 2ema:A 46 22 0.1310 0.2391 0.5000 6.4
68 2ct0:A 74 42 0.1548 0.1757 0.3095 6.7
69 8gn3:B 60 58 0.2143 0.3000 0.3103 6.8 8gn3:A, 8gn4:A
70 5jc8:D 262 27 0.1310 0.0420 0.4074 6.9
71 2em0:A 46 26 0.1310 0.2391 0.4231 7.1
72 8fjl:D 1138 27 0.0833 0.0062 0.2593 7.9 8fjk:E, 8fjk:G, 8fjk:I, 8fjk:K, 8fjl:E, 8fjl:G, 8fjl:I, 8fjl:K, 6m99:C
73 5v3g:D 170 52 0.2024 0.1000 0.3269 8.0 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
74 2yt9:A 95 79 0.2381 0.2105 0.2532 8.4
75 8tzf:A 1589 35 0.1429 0.0076 0.3429 9.3
76 2yte:A 42 21 0.1071 0.2143 0.4286 9.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218