Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER D-I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK D-QUARK DRfold DRfold2 LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred TCRfinder

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA DeepMSA2 FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP Library
>protein
DYIIKEKTVLLQKKDSEGFGFVLRGAIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWRAGLRMGDFLIEVNGQNVVKVGHRQVVN
MIRQGGNTLMVKVVMVTR

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6yx0:B 112 103 1.0000 0.8750 0.9515 6.81e-66 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
2 5izu:A 124 103 0.8061 0.6371 0.7670 2.15e-44 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
3 3o5n:E 92 98 0.7245 0.7717 0.7245 1.17e-37
4 7pcb:A 415 88 0.3469 0.0819 0.3864 9.37e-12 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
5 2m0u:A 117 82 0.3367 0.2821 0.4024 3.01e-10
6 6x23:A 89 88 0.3163 0.3483 0.3523 5.51e-10
7 2os6:A 89 80 0.3061 0.3371 0.3750 3.77e-09
8 7d6f:A 87 87 0.2449 0.2759 0.2759 6.74e-09
9 2egn:A 83 93 0.2959 0.3494 0.3118 4.48e-08
10 2kqf:A 96 74 0.2449 0.2500 0.3243 1.22e-07 2kyl:A
11 2r4h:C 98 75 0.2449 0.2449 0.3200 8.83e-07
12 4wyu:A 201 91 0.2959 0.1443 0.3187 1.54e-06 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
13 4wyu:A 201 42 0.1633 0.0796 0.3810 6.63e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
14 6xa7:B 96 89 0.2551 0.2604 0.2809 4.99e-06 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
15 7qqn:C 414 94 0.2653 0.0628 0.2766 6.14e-06 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
16 4e34:A 87 91 0.2857 0.3218 0.3077 6.30e-06 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
17 8b82:A 108 91 0.2857 0.2593 0.3077 6.94e-06 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
18 2m0v:A 128 82 0.2959 0.2266 0.3537 8.78e-06
19 5wou:A 95 81 0.2653 0.2737 0.3210 5.41e-05
20 6ezi:A 86 81 0.2857 0.3256 0.3457 2.05e-04 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
21 2l4t:A 124 65 0.2245 0.1774 0.3385 3.93e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
22 2qt5:A 194 86 0.2449 0.1237 0.2791 6.17e-04 2qt5:B
23 2qt5:A 194 82 0.2449 0.1237 0.2927 0.010 2qt5:B
24 8bp4:A 93 82 0.2041 0.2151 0.2439 6.27e-04 8bp4:C, 8bp4:B
25 3pv3:A 392 76 0.2347 0.0587 0.3026 0.001 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
26 7x2e:A 163 91 0.2551 0.1534 0.2747 0.001 2kbs:A
27 4ynn:A 400 91 0.2755 0.0675 0.2967 0.002 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
28 4ynn:A 400 88 0.2041 0.0500 0.2273 1.6 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
29 5zys:A 90 85 0.2959 0.3222 0.3412 0.004
30 3bpu:A 86 28 0.1429 0.1628 0.5000 0.004
31 4xh7:A 110 59 0.2245 0.2000 0.3729 0.007
32 2kpl:A 129 74 0.2449 0.1860 0.3243 0.010
33 6hks:B 94 91 0.2347 0.2447 0.2527 0.012 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
34 4gvc:A 94 53 0.1531 0.1596 0.2830 0.013 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
35 1n7f:A 86 76 0.1735 0.1977 0.2237 0.016 1n7f:B
36 8blu:B 195 89 0.1837 0.0923 0.2022 0.016 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
37 8blu:B 195 30 0.1020 0.0513 0.3333 5.6 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
38 2pdz:A 86 90 0.2041 0.2326 0.2222 0.029
39 5n7d:A 423 73 0.2449 0.0567 0.3288 0.034 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
40 6kz1:A 97 82 0.2245 0.2268 0.2683 0.038 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
41 8bq8:C 93 90 0.2245 0.2366 0.2444 0.17 8bq8:A, 8bq8:B
42 2joa:A 105 52 0.1633 0.1524 0.3077 0.24
43 8tua:A 1329 75 0.2245 0.0166 0.2933 0.29 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
44 3ch8:A 190 39 0.1224 0.0632 0.3077 0.36 2qbw:A
45 5ez0:D 95 89 0.2347 0.2421 0.2584 0.37 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
46 5heb:A 119 45 0.1531 0.1261 0.3333 0.42 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
47 1n7t:A 103 39 0.1224 0.1165 0.3077 0.73 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
48 7p70:A 407 90 0.1939 0.0467 0.2111 0.84 7pc4:A, 7qql:A
49 2ejy:A 85 49 0.1531 0.1765 0.3061 1.1
50 8tl6:B 353 27 0.1224 0.0340 0.4444 1.1
51 1ihj:B 95 79 0.1837 0.1895 0.2278 1.2 1ihj:A
52 1vrb:C 298 25 0.1122 0.0369 0.4400 1.4
53 7w6x:A 447 31 0.1224 0.0268 0.3871 1.4
54 3tka:A 283 43 0.1429 0.0495 0.3256 1.4
55 7zcc:B 326 25 0.1122 0.0337 0.4400 1.5 1vrb:A, 1vrb:B, 1vrb:D, 7zcc:A, 7zcc:C, 7zcc:D
56 3jxt:A 96 45 0.1531 0.1562 0.3333 2.0 3jxt:B
57 7xft:A 86 54 0.1939 0.2209 0.3519 3.6
58 4ab7:H 422 27 0.1020 0.0237 0.3704 3.6 4ab7:D, 3zzf:A, 3zzf:B, 3zzf:C, 3zzf:D, 3zzh:A, 3zzh:B, 3zzh:C, 3zzh:D
59 2qry:C 318 40 0.1327 0.0409 0.3250 4.9 2qry:A, 2qry:B, 2qry:D
60 8xqw:P 617 24 0.1224 0.0194 0.5000 4.9 8xqx:P
61 6adq:F 552 52 0.1531 0.0272 0.2885 4.9 6adq:R, 7e1v:F, 7e1v:R, 7e1w:F, 7e1w:R, 7e1x:F, 7e1x:R, 8hcr:F, 8hcr:R, 8ovc:R, 8ovc:L, 8ovd:R, 8ovd:L, 7rh5:R, 7rh5:L, 7rh6:R, 7rh6:L, 7rh7:R, 7rh7:L
62 2exg:A 101 89 0.2347 0.2277 0.2584 5.0 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
63 8sxg:A 366 45 0.1122 0.0301 0.2444 5.0 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
64 4xhv:A 94 45 0.1224 0.1277 0.2667 5.8
65 6nid:B 88 49 0.1633 0.1818 0.3265 6.2 6nid:A, 6nid:C
66 6vs7:A 409 36 0.1327 0.0318 0.3611 6.6 6vs7:E, 6vt2:A, 6vt2:E, 6vu6:A, 6vu6:E
67 6ei3:A 511 31 0.1327 0.0254 0.4194 7.5
68 2m0z:A 97 47 0.1531 0.1546 0.3191 7.5 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
69 6d41:B 579 65 0.1531 0.0259 0.2308 8.0 6d41:A, 6d6w:A, 6d6w:B, 6d6w:C, 6d6w:D, 6d7f:A, 6d7f:B, 6d7f:C, 6d7f:D, 6d7f:E, 6d7f:F
70 5f67:A 98 45 0.1020 0.1020 0.2222 8.5 5f67:B
71 1zub:A 109 56 0.1531 0.1376 0.2679 9.2

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417