Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DVPVNLYRPNAPFIGKVISNEPLVKEGGIGIVQHIKFDLTGGNLKYIEGQSIGIIPPGVDKNGKPERLRLYSIASTRHGD
DVDDKTISLCVRQLEYKHPESGETVYGVCSTYLTHIEPGSEVKITGPVGKEMLLPDDPEANVIMLATGTGIAPMRTYLWR
MFKDAERAANPEYQFKGFSWLVFGVPTTPNILYKEELEEIQQKYPDNFRLTYAISREQKNPQGGRMYIQDRVAEHADQLW
QLIKNQKTHTYICGLRGMEEGIDAALSAAAAKEGVTWSDYQKDLKKAGRWHVETY

The query sequence (length=295) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ewy:A 303 295 0.9932 0.9670 0.9932 0.0 1b2r:A, 1bjk:A, 2bmw:A, 4bpr:A, 1bqe:A, 2bsa:A, 4c43:A, 1e62:A, 1e63:A, 1e64:A, 1ewy:B, 1gjr:A, 1go2:A, 1gr1:A, 1h42:A, 1h85:A, 1ogi:A, 1ogj:A, 1qgy:A, 1qgz:A, 1qh0:A, 1que:A, 1quf:A, 2vyq:A, 2vzl:A, 1w34:A, 1w35:A, 1w87:A, 1w87:B, 2x3u:A, 3zbt:A, 3zbu:A, 3zc3:A, 3zc3:B
2 2b5o:A 292 295 0.6271 0.6336 0.6271 3.84e-141 2b5o:B
3 3vo2:A 296 292 0.5254 0.5236 0.5308 2.00e-112 3vo1:A, 3vo1:B, 3vo2:B
4 1gaw:B 305 294 0.5085 0.4918 0.5102 5.11e-111 1gaq:A, 1gaq:C, 1gaw:A, 3w5u:A, 3w5u:C, 3w5u:E, 3w5u:G, 3w5v:A, 3w5v:C
5 1qfy:A 308 294 0.5220 0.5000 0.5238 1.51e-108 4af6:A, 4af6:B, 4af7:A, 4af7:B, 3mhp:A, 3mhp:B, 1qfy:B, 1qfz:A, 1qfz:B, 1qg0:A, 1qg0:B, 1qga:A, 1qga:B, 1sm4:A, 1sm4:B, 2xnc:A, 2xnc:B
6 1bx0:A 296 294 0.4983 0.4966 0.5000 1.61e-104 1bx1:A, 1fnb:A, 1fnc:A, 1fnd:A, 1frn:A, 1frq:A
7 5h59:A 311 299 0.4746 0.4502 0.4682 1.02e-90 5h5j:A, 5h5j:C, 1jb9:A, 3lo8:A, 3lvb:A, 5vw2:A, 5vw3:A, 5vw4:A, 5vw5:A, 5vw6:A, 5vw7:A, 5vw8:A, 5vw9:A, 5vwa:A, 5vwb:A
8 2rc5:A 306 312 0.3661 0.3529 0.3462 2.69e-44 2rc5:B, 2rc5:C, 2rc5:D, 2rc6:A, 2rc6:B, 2rc6:C, 2rc6:D
9 3jqp:D 269 296 0.2983 0.3271 0.2973 1.11e-35 3jqp:A, 3jqp:B, 3jqp:C, 3jqp:E, 3jqp:F, 3jqq:A, 3jqq:B, 3jqq:C, 3jqq:D, 3jqq:E, 3jqq:F, 3jqr:A, 2ok7:A, 2ok7:B, 2ok7:C, 2ok7:D, 2ok7:E, 2ok7:F, 2ok8:A, 2ok8:B, 2ok8:C, 2ok8:D
10 6efv:A 530 217 0.2373 0.1321 0.3226 1.72e-16 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
11 6efv:A 530 48 0.0441 0.0245 0.2708 0.86 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
12 2bf4:A 645 174 0.1797 0.0822 0.3046 2.28e-15 2bf4:B, 2bn4:A, 2bn4:B, 2bpo:A, 2bpo:B
13 2bf4:A 645 45 0.0441 0.0202 0.2889 1.1 2bf4:B, 2bn4:A, 2bn4:B, 2bpo:A, 2bpo:B
14 1tll:A 630 238 0.2339 0.1095 0.2899 4.01e-14 1f20:A, 1tll:B
15 5gxu:A 552 249 0.2475 0.1322 0.2932 1.51e-13 5gxu:B
16 6j79:A 816 234 0.2203 0.0797 0.2778 2.62e-13 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
17 6j79:A 816 109 0.0881 0.0319 0.2385 1.7 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
18 7suz:A 389 201 0.1864 0.1414 0.2736 7.50e-13 7sux:A, 7sv0:A
19 8dme:A 1034 191 0.2068 0.0590 0.3194 1.28e-12 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
20 2qtl:A 448 142 0.1492 0.0982 0.3099 9.10e-10 2qtz:A
21 3fjo:A 603 234 0.2034 0.0995 0.2564 1.07e-09 3qfs:A, 3qft:A
22 3fjo:A 603 109 0.0881 0.0431 0.2385 1.6 3qfs:A, 3qft:A
23 6t1t:A 635 224 0.1864 0.0866 0.2455 1.94e-09 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
24 6t1t:A 635 123 0.1051 0.0488 0.2520 0.004 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
25 2r6h:C 289 112 0.1051 0.1073 0.2768 2.55e-09 2r6h:A, 2r6h:B, 2r6h:D
26 2xnj:A 255 157 0.1424 0.1647 0.2675 2.62e-08 1fdr:A, 2xnj:B
27 7qty:A 279 189 0.1525 0.1613 0.2381 7.82e-08 7qu0:A
28 7qu5:A 280 177 0.1458 0.1536 0.2429 3.33e-07 7qu3:A
29 1krh:A 337 238 0.2068 0.1810 0.2563 1.80e-06 1krh:B
30 2eix:A 243 167 0.1424 0.1728 0.2515 2.31e-06 2eix:B
31 5gv7:A 272 164 0.1458 0.1581 0.2622 2.34e-06 5gv8:A, 1ndh:A, 7thg:A, 7tnv:A, 7tsw:A, 7tsw:B, 7tsw:C, 7tsw:D, 7tsw:E, 7tsw:F, 1umk:A, 3w2e:A, 3w2f:A, 3w2g:A, 3w2h:A, 3w2i:A, 7w3o:A, 7w3o:B, 7w3o:C, 7w3o:D, 3w5h:A
32 8dos:A 247 150 0.1288 0.1538 0.2533 1.48e-05 8dos:B
33 7rom:A 255 131 0.1288 0.1490 0.2901 3.62e-05
34 1i7p:A 272 149 0.1220 0.1324 0.2416 6.66e-05 1ib0:A, 1qx4:A, 1qx4:B
35 8a1y:F 408 112 0.0949 0.0686 0.2500 1.05e-04 8a1t:F, 8a1u:F, 8a1v:F, 8a1w:F, 8a1x:F, 8acw:F, 8acy:F, 8ad0:F, 8ad3:A, 8ad3:B, 8ad4:A, 8ad4:B, 8ad5:A, 8ad5:B, 4u9u:A, 4u9u:B, 4uaj:A, 7xk3:F, 7xk4:F, 7xk5:F, 7xk6:F, 7xk7:F
36 3fpk:A 247 150 0.1322 0.1579 0.2600 1.23e-04 3fpk:B
37 1cne:A 260 137 0.1220 0.1385 0.2628 2.65e-04 1cnf:A, 2cnd:A
38 4b4d:A 256 113 0.1119 0.1289 0.2920 0.002
39 6rr3:A 257 106 0.1119 0.1284 0.3113 0.002 6rra:A
40 5yly:B 269 159 0.1186 0.1301 0.2201 0.005 5yly:A
41 5ogx:A 333 180 0.1559 0.1381 0.2556 0.008
42 3crz:A 257 240 0.2000 0.2296 0.2458 0.008 2qdx:A
43 1a8p:A 257 117 0.1017 0.1167 0.2564 0.011
44 2bgj:A 260 101 0.1085 0.1231 0.3168 0.012 2bgi:A, 2bgj:B, 2bgj:C, 2bgj:D, 4k1x:A, 4k1x:B, 2vnh:A, 2vni:A, 2vnj:A, 2vnk:A, 2vnk:B, 2vnk:C, 2vnk:D
45 5thx:A 257 113 0.1085 0.1245 0.2832 0.013
46 4eh1:A 237 126 0.1153 0.1435 0.2698 0.036 4eh1:B
47 1tvc:A 250 154 0.1186 0.1400 0.2273 0.45
48 7zoa:B 570 96 0.0983 0.0509 0.3021 0.69 7znu:A, 7znu:B, 7zo9:A, 7zo9:B, 7zoa:A
49 1k6m:A 432 112 0.1085 0.0741 0.2857 0.86 1c7z:A, 1c7z:B, 1c80:A, 1c80:B, 1c81:A, 1fbt:A, 1fbt:B, 1k6m:B, 1tip:A, 1tip:B
50 6lpv:A 434 40 0.0475 0.0323 0.3500 1.1
51 6o0a:A 383 58 0.0475 0.0366 0.2414 1.4
52 6rm3:SDD 67 44 0.0576 0.2537 0.3864 1.8
53 8qq7:A 399 177 0.1458 0.1078 0.2429 4.4 8qq1:C, 8qq1:F, 8qq1:G, 8qq5:A, 8qq5:B, 8qq5:C, 8qt6:A, 8qt7:A, 8qt9:A, 8qta:A
54 1lj8:A 492 61 0.0644 0.0386 0.3115 5.0 1m2w:A, 1m2w:B
55 4um9:D 455 44 0.0508 0.0330 0.3409 6.0 5ffg:B, 5ffo:B, 5ffo:F, 5neu:B, 8tcg:B, 4um8:B, 4um8:D, 4um9:B
56 1jcn:A 395 77 0.0644 0.0481 0.2468 6.4 1jcn:B
57 4fk8:A 247 105 0.1017 0.1215 0.2857 6.5 4fk8:B
58 1cir:A 39 21 0.0339 0.2564 0.4762 6.5 1ciq:A, 1cq4:A
59 6mv2:A 356 97 0.0746 0.0618 0.2268 7.7 6mv1:A
60 2c43:A 280 37 0.0407 0.0429 0.3243 9.7 2cg5:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218