BioLiP

>protein
DTTPPTITVPSDIIAYRGEEFEFYFEITDDSGQVKNIELSTFGKPLGLNWLEYSEDNFNVPGNATSDNPLRVRVHGTVPL
NEPIPADKNRAQFTETIRAWDAAGNVSSNITFVIKYRAQTDKYNPADPTITYVDRLSSLSPSEKNAVEAAVRAANPQIPA
AARITVSANGTVTITYPDSSTDTITANRVVKDLA

The query sequence (length=194) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5eq2:A	201	194	0.9948	0.9602	0.9948	1.71e-140	5eq2:B, 5eq3:A, 5eq3:B, 5eq4:A, 5eq4:B, 5eq4:C, 5eq4:D, 5iiy:A, 5iiy:B, 5ij1:A, 5ij1:B, 5ij2:A, 5ij2:B, 5ij3:A, 5ij3:B, 5kiq:A, 5kiq:B
2	6efi:B	208	210	0.5825	0.5433	0.5381	1.80e-64	6efi:A
3	6vs7:A	409	201	0.5515	0.2616	0.5323	1.51e-61	6vs7:E, 6vt2:A, 6vt2:E, 6vu6:A, 6vu6:E
4	6vs7:A	409	196	0.4021	0.1907	0.3980	9.62e-25	6vs7:E, 6vt2:A, 6vt2:E, 6vu6:A, 6vu6:E
5	6efd:A	206	207	0.5464	0.5146	0.5121	3.42e-55	6efc:A, 7kmj:A, 8st6:A, 6x3k:A, 6x3q:A
6	6eff:B	206	197	0.5361	0.5049	0.5279	1.25e-51	6eff:A, 6eff:C, 6eff:D
7	3qc5:X	352	222	0.3557	0.1960	0.3108	1.67e-19	6ef7:A, 6efa:A, 5iuc:A, 5iuc:B, 3qc6:X
8	6efb:A	201	218	0.3505	0.3383	0.3119	1.22e-15
9	8pxc:A	252	235	0.2990	0.2302	0.2468	1.52e-04
10	5cyx:A	318	76	0.0825	0.0503	0.2105	0.66
11	6z1p:An	158	34	0.0670	0.0823	0.3824	0.73
12	6rgs:B	626	29	0.0619	0.0192	0.4138	1.9
13	1jil:A	323	56	0.0876	0.0526	0.3036	2.0	1jii:A, 1jij:A, 1jik:A
14	6f6t:B	677	29	0.0619	0.0177	0.4138	3.6	6f6t:A, 6hqf:A, 6hqf:B
15	4h7u:A	577	38	0.0670	0.0225	0.3421	4.7
16	2vl4:B	841	54	0.1082	0.0250	0.3889	5.9	7op6:A, 7op6:B, 7op7:A, 7op7:B, 2vjx:A, 2vjx:B, 2vl4:A, 2vmf:A, 2vmf:B, 2vo5:A, 2vo5:B, 2vot:A, 2vot:B, 2vqt:A, 2vqt:B, 2vqu:A, 2vqu:B, 2vr4:A, 2vr4:B, 2wbk:A, 2wbk:B
17	6i1r:B	310	41	0.0670	0.0419	0.3171	6.6	6i1r:A
18	6tt9:AAA	233	74	0.0876	0.0730	0.2297	6.9	6tt9:BBB, 6tt9:CCC, 6tt9:DDD
19	7jv8:C	529	88	0.1237	0.0454	0.2727	7.4	7bbj:A, 7bbj:B, 4h1s:A, 4h1s:B, 4h1y:P, 4h2b:A, 4h2f:A, 4h2g:A, 4h2i:A, 6hxw:A, 6hxw:B, 7jv8:A, 7jv8:B, 7jv8:D, 7jv9:A, 7jv9:B, 7p9n:A, 7p9r:A, 7p9t:A, 7pa4:A, 7pb5:A, 7pba:A, 7pbb:A, 7pby:A, 7pcp:A, 7pd9:A, 7qga:A, 7qgl:A, 7qgm:A, 7qgo:A, 6s7f:A, 6s7h:A, 6tve:P, 6tvg:A, 6tvx:A, 6tw0:A, 6twa:A, 6twf:A, 6vc9:A, 6xue:A, 6xue:B, 6xug:A, 6xug:B, 6xuq:A, 6ye1:A, 6ye1:B, 6ye2:A, 6ye2:B, 6z9b:A, 6z9d:A
20	3jze:A	344	30	0.0567	0.0320	0.3667	9.5	3jze:B, 3jze:C, 3jze:D
21	6os6:A	362	70	0.0979	0.0525	0.2714	9.8	6os5:A, 6os5:B, 6os5:C

[Back]