Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DTRQHLLDTGYRIMAVKGFSGVGLNEILQSAGVPKGSFYHYFKSKEQFGQALLEDYFRVYLADMDQRFSAPGLNARERLM
SYWQKWLDNACPPCDEQRCLVVKLSAEVADLSESMRITLRDGSDGIIERLVGCLGQGRDDGSLAPCDARHMASALYQLWL
GASLLSKLHRSPGPLETAMQTTRSLLE

The query sequence (length=187) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4l62:A 190 187 1.0000 0.9842 1.0000 8.78e-140 4l62:B, 4l62:C, 4l62:D, 4l62:E, 4l62:F, 4l62:G, 4l62:H, 4l62:I, 4l62:J, 4l62:K, 4l62:L, 4l62:M, 4l62:N, 4l62:O, 4l62:P
2 3aqt:B 196 65 0.1337 0.1276 0.3846 3.60e-09 3aqt:A
3 3qbm:A 199 183 0.2406 0.2261 0.2459 4.45e-09 3qbm:B
4 6en8:C 191 126 0.1872 0.1832 0.2778 2.00e-07 6el2:A, 6el2:B, 6en8:D, 6en8:F, 6en8:A, 6en8:B, 6en8:E
5 6srn:A 187 65 0.1016 0.1016 0.2923 7.62e-07
6 7ju3:B 203 53 0.1123 0.1034 0.3962 1.96e-06 8fw0:A, 8fw0:B, 8fw0:C, 8fw0:D, 8fw3:C, 8fw3:D, 8fw3:A, 8fw3:B, 8fw8:B, 8fw8:C, 8fw8:D, 7jnp:A, 7jnp:B, 7ju3:A, 8ssh:C, 8ssh:D, 8ssh:A, 8ssh:B
7 2eh3:A 171 53 0.0963 0.1053 0.3396 5.14e-06
8 6ayi:A 183 109 0.1711 0.1749 0.2936 7.39e-06 6ayi:B, 6ayi:C, 6ayi:D
9 4i6z:B 200 131 0.1711 0.1600 0.2443 1.16e-05 4i76:A
10 8sva:A 200 89 0.1283 0.1200 0.2697 4.37e-05 8suk:D, 8suk:C, 8sva:F, 8sva:G, 8sva:T, 8t5y:A
11 6wp9:E 218 54 0.0909 0.0780 0.3148 6.10e-05 6wp9:A, 6wp9:B, 6wp9:C, 6wp9:D, 6wp9:F, 6wp9:G, 6wp9:H, 6wpa:A, 6wpa:B
12 3whc:A 190 146 0.1765 0.1737 0.2260 6.98e-05 1vi0:A, 1vi0:B, 3whb:A, 3whb:B, 3whc:B, 3whc:C, 3whc:D, 3whc:E, 3whc:F
13 5h58:B 204 53 0.0963 0.0882 0.3396 7.66e-05 5h58:A, 5h58:C, 5h58:D, 4pxi:A, 4pxi:B, 4pxi:C, 4pxi:D
14 8svd:T 197 89 0.1283 0.1218 0.2697 2.47e-04 8sua:A, 8svd:A, 8svd:G, 8svd:F, 8svd:E, 8svd:I, 8svd:J, 8svd:K
15 5vl9:C 191 161 0.2193 0.2147 0.2547 2.64e-04 5vl9:B, 5vl9:A, 5vl9:D, 5vlg:A, 5vlg:B, 5vlg:C, 5vlg:D, 5vlg:E, 5vlg:F, 5vlg:G, 5vlg:H, 5vlm:A, 5vlm:B, 5vlm:C, 5vlm:D, 5vlm:E, 5vlm:F, 5vlm:G, 5vlm:H
16 6hs0:B 201 44 0.0856 0.0796 0.3636 4.10e-04 6c31:E, 6c31:F, 6c31:G, 6c31:H, 6c31:A, 6c31:B, 6c31:C, 6c31:D, 6hrw:A, 6hrx:A, 6hrx:B, 6hry:A, 6hry:B, 6hrz:A, 6hs0:A, 6hs1:B, 6hs2:B, 5icj:A, 5icj:B, 5n7o:A, 5n7o:B
17 7k1c:B 208 60 0.0909 0.0817 0.2833 5.29e-04 7k1a:A, 7k1a:B, 7k1c:A, 7kd8:A, 7kd8:B, 7kd8:D, 7kd8:C, 2uxh:A, 2uxh:B, 2uxi:A, 2uxi:B, 2uxo:B, 2uxp:A, 2uxp:B, 2uxu:A, 2uxu:B
18 6o6n:A 195 86 0.1337 0.1282 0.2907 5.43e-04 6o6p:A, 6o6p:B
19 6g8g:A 195 135 0.1711 0.1641 0.2370 0.001 6g8g:B, 6g8g:C, 6g8g:D, 6g8h:CCC, 6g8h:BBB
20 6ayh:A 192 161 0.2193 0.2135 0.2547 0.001
21 4w97:A 196 187 0.2513 0.2398 0.2513 0.002
22 5fgl:B 206 175 0.2086 0.1893 0.2229 0.002 5fgl:A, 5fgl:C, 5fgl:D, 5fgl:E, 5fgl:F
23 7xaq:B 201 55 0.1016 0.0945 0.3455 0.002 8hjb:A, 7xaq:D, 7xaq:H, 7xaq:A, 7xaq:G, 7xaq:C
24 3lsj:A 205 67 0.1070 0.0976 0.2985 0.002 3lsj:B, 3lsp:A, 3lsr:A
25 6yl2:B 192 161 0.2620 0.2552 0.3043 0.003 6yl2:A
26 4aci:B 177 52 0.0802 0.0847 0.2885 0.004 4aci:A, 4af5:A
27 6z1b:B 202 144 0.1872 0.1733 0.2431 0.005 4jyk:A, 4jyk:B, 3loc:A, 3loc:B, 3loc:C, 3loc:D, 4xk4:A, 4xk4:B, 4xk4:C, 4xk4:D, 6z1b:A
28 5k7z:A 185 48 0.0749 0.0757 0.2917 0.010 5k7h:A, 5k7h:B, 5k7z:B, 5k7z:C, 5k7z:D
29 5dy0:A 220 54 0.0749 0.0636 0.2593 0.013 5dy0:B, 5dy0:C, 5dy0:D, 5dy1:A, 5dy1:B, 6gy3:A, 6gy3:B
30 3hth:B 173 64 0.1016 0.1098 0.2969 0.016 3hth:A, 3hti:A, 3htj:A, 3htj:B
31 7eqf:A 184 48 0.0642 0.0652 0.2500 0.020 7eqf:B, 7eqf:C, 7eqf:D
32 5gpc:A 190 51 0.0749 0.0737 0.2745 0.022 5gpc:B, 5gpc:C, 5gpc:D
33 3v78:B 173 41 0.0695 0.0751 0.3171 0.054 3v78:A
34 3ba0:A 365 53 0.0802 0.0411 0.2830 0.073 8b2n:A, 8b2n:C, 5cxa:A, 5czm:A, 5d2b:A, 5d3c:A, 4efs:A, 3ehx:A, 3ehy:A, 6ekn:A, 6ela:A, 6ela:B, 6ela:C, 6ela:D, 6enm:A, 6enm:B, 6eox:A, 3f15:A, 3f16:A, 3f17:A, 3f18:A, 3f19:A, 3f1a:A, 4gql:A, 4gr0:A, 4gr3:A, 4gr8:A, 4guy:A, 4h30:A, 4h30:B, 4h49:A, 4h49:B, 4h49:C, 4h49:D, 4h76:A, 4h84:A, 4h84:B, 2hu6:A, 4i03:A, 5i0l:A, 5i0l:B, 5i2z:A, 5i2z:B, 5i2z:C, 5i2z:D, 5i3m:A, 5i3m:B, 5i3m:C, 5i3m:D, 5i43:A, 5i43:B, 5i43:C, 5i43:D, 5i4o:A, 5i4o:C, 5i4o:B, 5i4o:D, 4ijo:A, 1jiz:A, 1jiz:B, 1jk3:A, 2jxy:A, 2k2g:A, 2k9c:A, 2krj:A, 5l79:A, 5l7f:A, 5l7f:B, 5lab:A, 3lik:A, 3lil:A, 3lir:A, 3ljg:A, 3lk8:A, 3lka:A, 2mlr:A, 2mls:A, 3n2u:A, 3n2v:A, 5n5j:A, 5n5k:A, 2n8r:A, 3nx7:A, 1os2:A, 1os2:B, 1os2:C, 1os2:D, 1os2:E, 1os2:F, 1os9:A, 1os9:B, 1os9:C, 1os9:D, 1os9:E, 1os9:F, 7ovy:A, 2oxu:A, 2oxw:A, 2oxz:A, 2poj:A, 6rd0:A, 8rij:A, 6rly:A, 1rmz:A, 1ros:A, 1ros:B, 3rts:A, 3rtt:A, 3ts4:A, 3tsk:A, 1utt:A, 1utz:A, 1utz:B, 3uvc:A, 3uvc:B, 2w0d:A, 2w0d:B, 2w0d:C, 2w0d:D, 2wo8:A, 2wo8:B, 2wo8:C, 2wo8:D, 2wo9:A, 2wo9:B, 2wo9:C, 2wo9:D, 2woa:A, 2woa:B, 2woa:C, 2woa:D, 1y93:A, 1ycm:A, 2z2d:A, 1z3j:A
35 3ang:C 201 54 0.0856 0.0796 0.2963 0.078 3ang:D, 3ang:A, 3ang:B, 3anp:C, 3anp:D, 3anp:A, 3anp:B
36 5mym:C 205 59 0.0909 0.0829 0.2881 0.089 4dw6:A, 5eyr:A, 5ezg:A, 5ezh:A, 5f04:A, 5f08:A, 5f0c:A, 5f0f:A, 5f0h:A, 5f1j:A, 5f27:A, 3g1l:A, 3g1m:A, 3g1o:A, 6hnx:A, 6hnz:A, 6ho0:A, 6ho1:A, 6ho2:A, 6ho3:A, 6ho4:A, 6ho5:A, 6ho6:A, 6ho7:A, 6ho8:A, 6ho9:A, 6hoa:A, 6hob:A, 6hoc:A, 6hod:A, 6hoe:A, 6hof:A, 5ioy:A, 5ioz:A, 5ip6:A, 5ipa:A, 5j1r:A, 5j1u:A, 5j1y:A, 5j3l:A, 4m3b:A, 4m3d:A, 4m3e:A, 4m3f:A, 4m3g:A, 5mwo:A, 5mxk:A, 5mxv:A, 5myl:A, 5mym:B, 5myn:A, 5myr:A, 5mys:A, 5myt:A, 5myw:A, 7ngd:A, 7ngg:C, 7ngi:A, 7ngj:A, 7ngk:A, 7ngm:A, 7ngn:A, 7ngo:A, 7ngr:A, 7ngs:A, 7ngt:A, 7ngu:A, 7ngw:A, 7ngx:A, 7ngy:A, 5nim:A, 5nio:A, 5niz:A, 5nj0:A, 5nz0:A, 5nz1:A, 5nz1:C, 5nz1:D, 3o8g:A, 3o8h:A, 3q0u:A, 3q0v:A, 3q0v:B, 3q0w:A, 3q3s:A, 6r1p:A, 6r1s:A, 3sdg:A, 3sfi:A, 3tp0:A, 1u9n:A, 1u9o:A, 1u9o:B
37 6pbm:A 426 69 0.1123 0.0493 0.3043 0.098 6c4n:A, 6c4n:B, 6pbm:B, 6pbn:A, 6pbn:B, 6pbp:A, 6pbp:B, 6pbt:A, 6pbt:B
38 2np5:A 187 133 0.1872 0.1872 0.2632 0.12
39 6ko7:C 186 126 0.1604 0.1613 0.2381 0.14 6ie8:A, 6ie9:A, 6ko7:A, 6ko7:B, 6ko7:D, 6ko9:A, 6ko9:B, 6ko9:C, 6ko9:D, 7n4w:A, 7n4z:A, 7n4z:C, 7n4z:B, 7n4z:D, 7n53:A, 7n53:B, 7n54:A, 7n54:B, 7n54:C, 7n54:D, 3vvy:A, 3vvy:B, 3vvy:C, 3vvy:D, 3vvz:A, 3vvz:B, 3vvz:C, 3vvz:D, 3vw0:B, 3vw0:D, 3vw1:B, 3vw1:D, 3vw2:A, 3vw2:B, 3vw2:C, 3vw2:D
40 5fmp:A 184 45 0.0749 0.0761 0.3111 0.16 5aqc:A, 5aqc:B, 5cw8:A, 5cw8:B, 5cxi:A, 5cxi:B, 5fmp:B, 5ua1:B, 5ua1:A, 5ua2:A
41 3p9t:A 213 169 0.2353 0.2066 0.2604 0.17
42 5d1w:D 196 48 0.0588 0.0561 0.2292 0.29 5d1w:A, 5d1w:B, 5d1w:C
43 4jl3:C 182 59 0.0749 0.0769 0.2373 0.48 4jl3:A, 4jl3:B, 4jl3:D
44 7z8i:F 279 118 0.1818 0.1219 0.2881 1.2
45 3vp5:A 185 43 0.0588 0.0595 0.2558 1.9 3vok:A
46 4bts:AF 89 32 0.0642 0.1348 0.3750 2.3 4bts:BF, 4bts:CF, 4bts:DF, 4v5o:AF, 4v5o:BF
47 7w5n:A 492 31 0.0749 0.0285 0.4516 3.1 7w5k:A, 7w5k:B, 7w5k:C, 7w5k:D, 7w5n:B, 7w5n:C, 7w5n:D
48 7acm:B 178 68 0.0909 0.0955 0.2500 4.8 7acm:A
49 5l3p:z 545 45 0.0802 0.0275 0.3333 5.5
50 6k5z:B 314 42 0.0749 0.0446 0.3333 7.4 6k5z:A, 6k9z:A, 6k9z:B
51 1jt0:A 188 47 0.0588 0.0585 0.2340 8.1 3bqz:A, 3br0:A, 3br1:A, 3br2:B, 3br2:A, 3br3:A, 3br5:A, 3br6:A, 3bt9:B, 3bt9:A, 3btc:A, 3bti:A, 3btj:B, 3btj:A, 3btl:A, 2g0e:D, 2gby:A, 1jt0:B, 1jt0:C, 1jt0:D, 1jt6:B, 1jt6:A, 1jtx:A, 1jty:A, 1jum:A, 1jup:A, 1jus:A, 3pm1:A, 1qvt:A, 1qvu:B, 1qvu:A, 1rkw:A, 1rpw:B
52 4zxw:A 443 40 0.0695 0.0293 0.3250 8.6 4zxw:B
53 6f6t:B 677 42 0.0856 0.0236 0.3810 9.5 6f6t:A, 6hqf:A, 6hqf:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218