Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DTIRYNFHPTHIDTTSFPFEQWRKYFKQTMCKENHRLLLNGDHQGEASFRREIAYYLHHSRGVNCTPEQVVVGAGVETLL
QQLFLLLGESKVYGIEDPGYQLMRKLLSHYPNDYVPFQVDEEGIDVDSIVRTAVDVVYTTPSRHFPYGSVLSINRRKQLL
HWAEAHENRYIIEDDYDSEFRYTGKTIPSLQSMDVHNKVIYLGAFSKSLIPSVRISYMVLPAPLAHLYKNKFSYYHSTVS
RIDQQVLTAFMKQGDFEKHLNRMRKIYRRKLEKVLSLLKRYEDKLLIIGERSGLHIVLVVKNGMDEQTLVEKALAAKAKV
YPLSAYSLERAIHPPQIVLGFGSIPEDELEEAIATVLNAWGFLVPR

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7zla:B 458 362 0.9891 0.7904 1.0000 0.0 7pq9:AAA, 7pq9:BBB, 7pq9:CCC, 7pq9:DDD, 7pq9:EEE, 7pq9:FFF, 7pq9:GGG, 7pq9:HHH, 7pq9:III, 7pq9:JJJ, 7zpa:A, 7zpa:B
2 7zn5:B 435 362 0.9863 0.8299 0.9972 0.0 7zn5:A
3 5x03:B 365 359 0.3552 0.3562 0.3621 4.94e-80 5t4j:B, 5t4k:A, 6uxz:B, 6uxz:C, 5x03:A
4 3aov:A 404 351 0.2514 0.2277 0.2621 4.09e-27 3aov:C, 3aow:A, 3aow:C, 3ath:A, 3ath:C, 3av7:A, 3av7:C, 3wx9:A, 3wx9:C
5 1wst:A 403 354 0.2295 0.2084 0.2373 6.25e-27
6 8tn3:A 388 377 0.2377 0.2242 0.2308 7.42e-21 8tn3:B, 7uky:A, 7uky:B
7 1vp4:A 420 358 0.2186 0.1905 0.2235 1.49e-17 1vp4:B
8 2zyj:A 397 271 0.1885 0.1738 0.2546 2.50e-15 3cbf:A, 3cbf:B, 2egy:A, 2egy:B, 2egy:C, 2egy:D, 2z1y:A, 2z1y:B, 2zp7:A, 2zp7:C, 2zp7:B, 2zp7:D, 2zp7:E, 2zp7:F, 2zyj:B
9 2zc0:A 405 276 0.2022 0.1827 0.2681 5.28e-15 2zc0:B, 2zc0:C, 2zc0:D
10 4gdy:B 428 334 0.2022 0.1729 0.2216 1.43e-13 4gdy:A, 4ge4:A, 4ge4:B, 4ge7:A, 4ge7:B, 4ge9:A, 4ge9:B, 4ge9:C, 4ge9:D, 4geb:A, 4geb:B, 2r2n:A, 2r2n:B, 2r2n:C, 2r2n:D, 6t8p:A, 6t8p:B, 6t8q:A, 5tf5:A, 5tf5:B, 3ue8:A, 3ue8:B, 2vgz:A, 2vgz:B, 2xh1:B, 2xh1:A
11 1xi9:C 393 243 0.1776 0.1654 0.2675 6.84e-07 1xi9:A, 1xi9:B, 1xi9:D
12 6s8w:C 470 188 0.1366 0.1064 0.2660 9.57e-07
13 6s8w:B 491 190 0.1366 0.1018 0.2632 2.64e-06 6s8w:A, 6s8w:D
14 6hnu:B 480 133 0.1066 0.0813 0.2932 8.29e-05 6hnu:A
15 3jtx:B 393 206 0.1557 0.1450 0.2767 8.43e-05
16 4fl0:B 409 208 0.1311 0.1174 0.2308 0.034 4fl0:A
17 1o4s:B 384 248 0.1503 0.1432 0.2218 0.055 1o4s:A
18 1iay:A 419 83 0.0601 0.0525 0.2651 0.12 1iax:A, 1iax:B
19 3ei9:A 412 216 0.1148 0.1019 0.1944 0.12 3ei5:A, 3ei5:B, 3ei6:A, 3ei6:B, 3ei8:A, 3ei8:B, 3ei9:B, 3eia:A, 3eia:B, 3eib:A, 3eib:B, 2z1z:A, 2z1z:B, 2z20:A, 2z20:B
20 4je5:B 497 274 0.1448 0.1066 0.1934 0.17 4je5:A, 4je5:C, 4je5:D
21 4r2n:A 353 195 0.1339 0.1388 0.2513 0.20 4r2n:C, 4r2n:B, 4r2n:D, 4r5z:A, 4r5z:B, 4r5z:C, 4r5z:D
22 3cq5:B 366 140 0.0902 0.0902 0.2357 0.83 3cq5:A, 3cq5:C, 3cq6:A, 3cq6:C, 3cq6:E
23 1g55:A 313 89 0.0601 0.0703 0.2472 1.2
24 3abk:A 514 45 0.0383 0.0272 0.3111 1.7 3abk:N, 3abl:A, 3abl:N, 3abm:A, 3abm:N, 3ag1:A, 3ag1:N, 3ag2:A, 3ag2:N, 3ag3:A, 3ag3:N, 3ag4:A, 3ag4:N, 3asn:A, 3asn:N, 3aso:A, 3aso:N, 5b1a:A, 5b1a:N, 5b1b:A, 5b1b:N, 5b3s:A, 5b3s:N, 7coh:A, 7coh:N, 7cp5:A, 7cp5:N, 8d4t:N, 7d5w:A, 7d5w:N, 7d5x:A, 7d5x:N, 7dgq:C3, 7dgr:A9, 7dgs:A9, 7dkf:A3, 2dyr:A, 2dyr:N, 2dys:A, 2dys:N, 2eij:A, 2eij:N, 2eik:A, 2eik:N, 2eil:A, 2eil:N, 2eim:A, 2eim:N, 2ein:A, 2ein:N, 7ev7:A, 7ev7:N, 8gbt:A, 8gbt:N, 8gcq:A, 8gcq:N, 5gpn:y, 5gup:Ak, 8gvm:A, 8gvm:N, 8h8r:A, 8h8r:N, 8h8s:A, 8h8s:N, 8ijn:A, 8ijn:N, 5iy5:A, 5iy5:N, 5j4z:BN, 5j7y:BN, 6j8m:A, 6j8m:N, 6juw:A, 6juw:N, 6jy3:A, 6jy4:A, 5luf:x, 6nkn:A, 6nkn:N, 6nmf:A, 6nmf:N, 6nmp:A, 6nmp:N, 7o37:a, 7o3c:a, 7o3e:a, 1occ:A, 1occ:N, 1oco:A, 1oco:N, 1ocr:A, 1ocr:N, 1ocz:A, 1ocz:N, 2occ:A, 2occ:N, 8pw5:n, 8pw5:a, 8pw6:n, 8pw7:n, 7thu:A, 7thu:N, 7tie:A, 7tie:N, 7tih:A, 7tih:N, 7tii:A, 7tii:N, 8ugh:4A, 8ugi:4A, 8ugj:4A, 8ugj:8A, 8ugl:4A, 8ugn:4A, 8ugn:8A, 8ugr:4A, 8ugr:8A, 1v54:A, 1v54:N, 1v55:A, 1v55:N, 7vuw:A, 7vuw:N, 7vvr:A, 7vvr:N, 7w3e:A, 7w3e:N, 5w97:A, 5w97:a, 5wau:A, 5wau:a, 3wg7:A, 3wg7:N, 5x19:A, 5x19:N, 5x1b:A, 5x1b:N, 5x1f:A, 5x1f:N, 3x2q:A, 3x2q:N, 5xdq:A, 5xdq:N, 5xdx:A, 5xdx:N, 7xma:A, 7xma:N, 7xmb:A, 7xmb:N, 5xth:x, 5xti:x, 5xti:Bx, 7y44:A, 7y44:N, 2y69:A, 2y69:N, 2ybb:L, 7ypy:A, 7ypy:N, 5z62:A, 5z84:A, 5z84:N, 5z85:A, 5z85:N, 5z86:A, 5z86:N, 5zco:A, 5zco:N, 5zcp:A, 5zcp:N, 5zcq:A, 5zcq:N, 2zxw:A, 2zxw:N
25 3j6q:A 1058 149 0.1011 0.0350 0.2483 2.7 3j6q:B, 3j6q:C, 3j6q:D, 3j6q:E, 3jay:A, 3jb0:A, 3jb1:A, 3jb2:A, 3jb3:A, 7whp:A, 7whp:B
26 7rqu:A 604 54 0.0492 0.0298 0.3333 3.3 5irx:A, 5irx:B, 5irx:D, 5irx:C, 5irz:D, 5irz:E, 5irz:B, 5irz:C, 5is0:C, 5is0:B, 5is0:D, 5is0:E, 7l2l:A, 7l2l:D, 7l2l:C, 7l2l:B, 7l2m:A, 7l2m:C, 7l2m:D, 7l2m:B, 7l2n:A, 7l2n:D, 7l2n:C, 7l2n:B, 7l2o:A, 7l2o:C, 7l2o:D, 7l2o:B, 7lpa:A, 7lpa:B, 7lpa:D, 7lpa:C, 7lpb:A, 7lpb:B, 7lpb:C, 7lpb:D, 7lpc:C, 7lpc:A, 7lpc:B, 7lpc:D, 7lpd:A, 7lpd:B, 7lpd:C, 7lpd:D, 7lpe:C, 7lpe:B, 7lpe:A, 7lpe:D, 7mz5:A, 7mz5:D, 7mz5:C, 7mz5:B, 7rqu:C, 7rqu:B, 7rqu:D, 7rqv:A, 7rqv:D, 7rqv:C, 7rqv:B, 7rqx:A, 7rqx:C, 7rqx:D, 7rqx:B, 8t0y:B, 8t0y:A, 8t0y:D, 8t0y:C, 8t10:B, 8t10:A, 8t10:D, 8t10:C, 8t3l:A, 8t3l:D, 8t3l:B, 8t3l:C, 8t3m:A, 8t3m:D, 8t3m:C, 8t3m:B, 8u2z:A, 8u2z:D, 8u2z:B, 8u2z:C
27 3qgu:A 406 64 0.0355 0.0320 0.2031 4.5
28 6k1z:A 544 86 0.0656 0.0441 0.2791 5.0
29 7yni:A 566 86 0.0792 0.0512 0.3372 5.5
30 6hnd:B 470 166 0.0956 0.0745 0.2108 5.5 6hnd:A, 6hnv:A, 6hnv:B
31 7wmv:A 602 76 0.0628 0.0382 0.3026 6.9
32 8r1a:A 587 86 0.0656 0.0409 0.2791 8.2 2b8w:A, 2b8w:B, 2b92:A, 2b92:B, 2bc9:A, 8cqb:A, 8cqb:B, 2d4h:A, 1f5n:A, 6loj:B, 8r1a:B, 8r1a:C, 8r1a:D, 8r1a:E, 8r1a:F
33 7mxd:A 472 114 0.0902 0.0699 0.2895 8.4 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
34 7lqy:A 659 55 0.0464 0.0258 0.3091 8.6 8gf8:A, 8gf8:B, 8gf8:C, 8gf8:D, 8gf9:A, 8gf9:B, 8gf9:C, 8gf9:D, 8gfa:A, 8gfa:B, 8gfa:C, 8gfa:D, 8jqr:A, 8jqr:B, 8jqr:C, 8jqr:D, 7l2h:A, 7l2h:D, 7l2h:B, 7l2h:C, 7l2i:A, 7l2i:C, 7l2i:D, 7l2i:B, 7l2j:A, 7l2j:B, 7l2j:C, 7l2j:D, 7l2p:A, 7l2p:B, 7l2p:D, 7l2p:C, 7l2r:A, 7l2r:B, 7l2r:C, 7l2r:D, 7l2s:D, 7l2s:A, 7l2s:B, 7l2s:C, 7l2t:A, 7l2t:D, 7l2t:B, 7l2t:C, 7l2u:A, 7l2u:B, 7l2u:D, 7l2u:C, 7l2v:A, 7l2v:D, 7l2v:B, 7l2v:C, 7l2w:A, 7l2w:D, 7l2w:B, 7l2w:C, 7l2x:A, 7l2x:D, 7l2x:B, 7l2x:C, 7lp9:A, 7lp9:B, 7lp9:C, 7lp9:D, 7lqy:B, 7lqy:C, 7lqy:D, 7lqz:A, 7lqz:B, 7lqz:C, 7lqz:D, 7lr0:A, 7lr0:B, 7lr0:C, 7lr0:D, 7mz6:A, 7mz6:B, 7mz6:D, 7mz6:C, 7mz7:A, 7mz7:D, 7mz7:B, 7mz7:C, 7mz9:A, 7mz9:D, 7mz9:C, 7mz9:B, 7mza:A, 7mza:D, 7mza:B, 7mza:C, 7mzb:A, 7mzb:D, 7mzb:B, 7mzb:C, 7mzc:A, 7mzc:D, 7mzc:C, 7mzc:B, 7mzd:A, 7mzd:D, 7mzd:B, 7mzd:C, 7mze:A, 7mze:D, 7mze:B, 7mze:C, 2nyj:A, 2pnn:A, 7rqw:A, 7rqw:C, 7rqw:D, 7rqw:B, 7rqy:A, 7rqy:C, 7rqy:B, 7rqy:D, 7rqz:A, 7rqz:C, 7rqz:B, 7rqz:D, 8t0c:A, 8t0c:D, 8t0c:B, 8t0c:C, 8t0e:A, 8t0e:D, 8t0e:B, 8t0e:C, 8u30:A, 8u30:D, 8u30:B, 8u30:C, 8u3a:D, 8u3c:D, 8u43:A, 8u43:B, 8u43:C, 8u43:D, 8u4d:A, 8u4d:D, 8u4d:C, 8u4d:B, 8x94:A, 8x94:B, 8x94:C, 8x94:D
35 6jr7:A 812 62 0.0492 0.0222 0.2903 9.0 6jr7:B, 6jr7:C, 6jr7:D, 6jr8:A, 6jr8:B, 6jr8:C, 6jr8:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218