Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DTDEKCTICLSMLEDGEDVRRLPCAHLFHQLCVDQWLAMSKKCPICRVDIE

The query sequence (length=51) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7r70:A 150 51 0.9804 0.3333 0.9804 9.42e-33 5d0i:A, 5d0i:B, 5d0k:C, 5d0k:F, 5d0k:I, 5d0k:L, 7r70:B, 7r71:A
2 5d0m:C 60 48 0.9020 0.7667 0.9583 2.18e-27 5ulh:C, 5ulk:C
3 2kiz:A 69 47 0.7843 0.5797 0.8511 1.57e-25 5lg0:A, 5lg7:A, 7p2k:A
4 1iym:A 55 51 0.4902 0.4545 0.4902 5.00e-13
5 6w7z:B 71 47 0.3725 0.2676 0.4043 4.35e-12 6w9a:B, 6w9a:D, 6w9d:B, 6w9d:E, 6w9d:H
6 5zbu:A 74 46 0.4510 0.3108 0.5000 3.65e-11 5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
7 4v3k:C 75 44 0.4118 0.2800 0.4773 8.87e-11 7ojx:A, 4v3k:F, 4v3l:C
8 1x4j:A 75 44 0.4118 0.2800 0.4773 9.17e-11
9 7bvw:A 79 49 0.4510 0.2911 0.4694 3.49e-10 7bvw:B
10 2ect:A 78 46 0.3922 0.2564 0.4348 7.84e-10
11 6a3z:A 56 48 0.3725 0.3393 0.3958 1.50e-08
12 2l0b:A 91 42 0.3922 0.2198 0.4762 1.67e-08
13 2lxh:C 58 50 0.3529 0.3103 0.3600 2.44e-08 2lxp:C
14 5ywr:B 87 40 0.3137 0.1839 0.4000 8.21e-08
15 2ecn:A 70 48 0.4118 0.3000 0.4375 1.56e-07 5xek:A
16 4lad:B 69 43 0.3529 0.2609 0.4186 2.10e-07
17 6f98:A 78 60 0.3725 0.2436 0.3167 4.78e-07
18 2ep4:A 74 50 0.3137 0.2162 0.3200 1.30e-06
19 1chc:A 68 49 0.3725 0.2794 0.3878 1.44e-06
20 7t92:C 317 43 0.3137 0.0505 0.3721 3.64e-06
21 4orh:H 142 29 0.2745 0.0986 0.4828 1.07e-04 4ayc:A, 4ayc:B, 4orh:C, 4orh:G, 4orh:K, 4orh:L, 4whv:C, 4whv:D, 4whv:I, 4whv:J
22 2ecm:A 55 47 0.3137 0.2909 0.3404 1.56e-04
23 7ynx:A 188 46 0.3137 0.0851 0.3478 8.32e-04 2jrj:A, 7ynx:B
24 7zj3:A 86 48 0.2941 0.1744 0.3125 0.006 8a38:A, 8a38:B, 8a38:C, 8ams:C, 8ams:D, 7zj3:D, 7zj3:G, 7zj3:J
25 5d1l:B 111 53 0.2941 0.1351 0.2830 0.006 5d1k:B, 5d1m:B
26 2d8t:A 71 49 0.3529 0.2535 0.3673 0.013
27 6wi7:A 206 45 0.2941 0.0728 0.3333 0.015 2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
28 7oni:R 86 26 0.1961 0.1163 0.3846 0.017 2ecl:A, 6v9i:R
29 4qpl:A 153 29 0.2549 0.0850 0.4483 0.023 4qpl:C, 3v3l:A, 3v3l:B
30 5j3x:B 389 52 0.3529 0.0463 0.3462 0.032 4a4b:A, 4a4c:A, 1b47:A, 1b47:B, 1b47:C, 3bum:B, 3bun:B, 3buo:B, 3buo:D, 3buw:B, 3buw:D, 3bux:B, 3bux:D, 2cbl:A, 1fbv:A, 4gpl:B, 5hkx:A, 5hky:A, 5hkz:A, 5hl0:A, 5j3x:A, 5j3x:C, 5j3x:D, 5j3x:E, 5j3x:F, 2k4d:A, 5o76:A, 5o76:C, 3ob1:B, 3ob2:B, 3plf:B, 3plf:D, 7siy:A, 6xar:A, 6xar:B, 2y1m:A, 2y1m:B, 2y1m:C, 2y1m:D, 2y1m:E, 2y1m:F, 2y1n:A, 2y1n:C, 1yvh:A
31 6y5p:B 229 68 0.4314 0.0961 0.3235 0.038 6y5n:A, 6y5n:B, 6y5p:A
32 5o6c:A 252 61 0.3529 0.0714 0.2951 0.053 6t7f:A
33 2ea6:A 69 50 0.2745 0.2029 0.2800 0.060
34 3zni:A 390 51 0.3529 0.0462 0.3529 0.070 4a49:A, 5axi:B, 5axi:A, 5axi:C, 9fqh:A, 9fqi:A, 9fqj:A, 9fqj:B, 8gcy:A, 2ldr:A, 3pfv:A, 3pfv:B, 8qng:A, 8qnh:A, 8qni:A, 8qtg:A, 8qth:A, 8qtj:A, 8qtk:A, 8vw4:A, 8vw4:B, 8vw5:A, 8vw5:B, 3zni:E, 3zni:I, 3zni:M
35 5ait:A 129 50 0.2745 0.1085 0.2800 0.11 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
36 5ait:A 129 50 0.2745 0.1085 0.2800 0.11 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
37 8i3x:A 60 50 0.3529 0.3000 0.3600 0.11 8i3x:B
38 2lgv:A 100 44 0.2549 0.1300 0.2955 0.13 4a0c:D, 8b3g:R, 8b3i:R, 7b5l:R, 7b5m:R, 7b5n:R, 7b5s:R, 8cdk:R, 3dpl:R, 3dqv:R, 3dqv:Y, 4f52:B, 4f52:D, 8gq6:E, 8gq6:D, 8h33:D, 8h33:K, 8h33:L, 8h33:E, 8h34:R, 8h34:Q, 8h34:E, 8h34:D, 8h34:L, 8h34:K, 8h35:E, 8h35:D, 8h35:L, 8h35:K, 8h35:R, 8h35:Q, 8h35:W, 8h35:X, 8h36:E, 8h36:D, 8h37:E, 8h37:D, 8h37:R, 8h37:Q, 8h38:R, 8h3a:R, 8h3f:R, 8h3q:E, 8h3r:E, 8h3r:D, 2hye:D, 8jaq:R, 8jaq:V, 8jas:R, 8jas:V, 8jav:R, 8jav:V, 1ldj:B, 1ldk:C, 5n4w:R, 8or0:B, 8or2:B, 8or3:B, 4p5o:B, 4p5o:D, 7plo:T, 8pql:K, 8q7h:C, 8q7h:D, 8q7r:R, 8qu8:E, 8r5h:R, 6r7i:R, 6r7n:R, 8rhz:C, 8rhz:D, 3rtr:B, 3rtr:D, 3rtr:F, 3rtr:H, 8rwz:R, 8rx0:R, 6ttu:R, 1u6g:B, 8wqa:J, 8wqa:I, 8wqb:I, 8wqb:E, 8wqc:F, 8wqc:J, 8wqe:J, 8wqe:I, 8wqf:I, 8wqf:E, 8wqg:F, 8wqg:J, 8wqh:J, 8wqh:B, 7z8b:R, 7z8r:R, 7z8t:R, 7z8v:R, 7zbz:R
39 2djb:A 72 46 0.2549 0.1806 0.2826 0.13
40 5h7r:D 124 47 0.3529 0.1452 0.3830 0.13 5h7s:D, 5h7s:B
41 3j92:0 36 26 0.2157 0.3056 0.4231 0.16
42 2y43:A 88 46 0.2353 0.1364 0.2609 0.29 2y43:B
43 5a31:B 84 59 0.3529 0.2143 0.3051 0.41 5g04:B, 5g05:B, 9gaw:C, 5jg6:A, 5jg6:D, 2mt5:A, 7qe7:C, 4r2y:A, 4r2y:B, 4r2y:C, 4r2y:D, 8s4g:C, 6tm5:B, 6tnt:B, 4ui9:B
44 4a0c:F 80 22 0.1765 0.1125 0.4091 0.47 8ij1:R, 7shk:R
45 6y2x:A 231 67 0.4118 0.0909 0.3134 0.55 6ir0:A, 6y22:A, 6y3j:A
46 2ecj:A 58 48 0.2549 0.2241 0.2708 1.8
47 7v6c:A 1540 28 0.2353 0.0078 0.4286 1.9
48 8hf0:A 1561 28 0.2353 0.0077 0.4286 1.9 8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
49 7w0b:A 1586 28 0.2353 0.0076 0.4286 1.9 7w0d:F
50 5mac:A 473 36 0.2549 0.0275 0.3611 2.1 5mac:B, 5mac:D, 5mac:C, 5mac:E
51 7mgm:A 2274 52 0.2549 0.0057 0.2500 2.2
52 8dzz:A 2363 52 0.2549 0.0055 0.2500 2.2 8dzz:D, 8e00:A
53 4w8f:B 2609 52 0.2549 0.0050 0.2500 2.2 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
54 8adl:C 782 21 0.1373 0.0090 0.3333 2.2 8adl:Q
55 8a3t:U 114 27 0.2549 0.1140 0.4815 2.5 8a5y:U
56 8adl:A 633 25 0.1765 0.0142 0.3600 2.7 8adl:I
57 5din:B 124 47 0.3333 0.1371 0.3617 2.9 5din:A
58 7oik:A 4426 48 0.3137 0.0036 0.3333 3.1 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
59 7yui:B 232 41 0.2353 0.0517 0.2927 3.6 3b08:K, 3b08:B, 3b08:E, 3b08:H, 3b0a:B
60 4v4c:B 274 24 0.1961 0.0365 0.4167 3.6 4v4c:D, 4v4c:F, 4v4c:H, 4v4c:J, 4v4c:L, 4v4c:N, 4v4c:P, 4v4c:R, 4v4c:T, 4v4c:V, 4v4c:X, 4v4d:B, 4v4d:D, 4v4d:F, 4v4d:H, 4v4d:J, 4v4d:L, 4v4d:N, 4v4d:P, 4v4d:R, 4v4d:T, 4v4d:V, 4v4d:X, 4v4e:B, 4v4e:D, 4v4e:F, 4v4e:H, 4v4e:J, 4v4e:L, 4v4e:N, 4v4e:P, 4v4e:R, 4v4e:T, 4v4e:V, 4v4e:X
61 2ma6:A 61 28 0.1961 0.1639 0.3571 3.7
62 2yho:E 70 44 0.2353 0.1714 0.2727 3.9 2yhn:A, 2yhn:B, 2yho:A, 2yho:C, 2yho:G
63 8eaz:A 254 41 0.2353 0.0472 0.2927 4.2 8bvl:A, 8bvl:B, 8eaz:B, 7yuj:A, 7yuj:B
64 3eb5:A 65 30 0.2549 0.2000 0.4333 4.3 3eb6:A
65 4ai6:A 2650 52 0.2353 0.0045 0.2308 4.9 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
66 7kzp:L 370 36 0.2353 0.0324 0.3333 5.3 4ccg:X, 4ccg:Y, 7kzq:L, 7kzq:M, 7kzr:L, 7kzr:M, 7kzs:L, 7kzs:M, 7kzt:L, 7kzt:M, 7kzv:L, 7kzv:M, 3zqs:A
67 2d8s:A 80 27 0.1765 0.1125 0.3333 6.2
68 3v00:C 353 28 0.1961 0.0283 0.3571 6.2 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
69 5lwv:A 711 31 0.1961 0.0141 0.3226 7.6 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
70 7yeh:A 1020 31 0.1961 0.0098 0.3226 7.6 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
71 5eya:G 86 47 0.2941 0.1744 0.3191 8.1 5eya:F, 5fer:A, 5fer:D
72 9atn:A 98 29 0.2157 0.1122 0.3793 8.5
73 5jne:A 351 24 0.1765 0.0256 0.3750 9.5 3i2d:A, 5jne:E

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218