Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DPSVYVRFPLKEPKKLGLEKASLLIWTTTPWTLPGNVAAAVHPEYTYAAFQVGDEALILEEGLGRKLLGEGTPVLKTFPG
KALEGLPYTPPYPQALEKGYFVVLADYVSQEDGTGIVHQAPAFGAEDLETARVYGLPLLKTVDEEGKLLVEPFKGLYFRE
ANRAILRDLRGRGLLFKEES

The query sequence (length=180) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ile:A 821 180 0.9944 0.2180 0.9944 1.36e-119 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
2 8c8v:A 1032 182 0.3944 0.0688 0.3901 8.26e-36 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
3 1ffy:A 917 183 0.3500 0.0687 0.3443 1.22e-28 1qu2:A, 1qu3:A
4 6ldk:A 813 193 0.3944 0.0873 0.3679 2.98e-27
5 8c9e:A 921 181 0.3389 0.0662 0.3370 1.83e-25 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
6 8wnf:A 918 192 0.4056 0.0795 0.3802 6.36e-25 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
7 7d5c:A 919 193 0.3667 0.0718 0.3420 3.57e-24
8 1obh:A 762 56 0.1222 0.0289 0.3929 3.21e-04
9 2bte:A 876 56 0.1222 0.0251 0.3929 3.76e-04 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
10 8pos:A 168 173 0.2556 0.2738 0.2659 6.16e-04 8por:A, 8pos:B
11 6q89:A 852 205 0.3056 0.0646 0.2683 0.002 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
12 7nu2:A 875 205 0.3056 0.0629 0.2683 0.003 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
13 3pz0:B 211 84 0.1611 0.1374 0.3452 0.004
14 1gax:A 862 90 0.1556 0.0325 0.3111 0.030 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
15 7pqk:A 195 85 0.1389 0.1282 0.2941 0.046 5agr:A, 5ags:A, 5agt:A
16 7bzj:A 183 40 0.0833 0.0820 0.3750 0.37 4k47:A
17 5us8:A 445 130 0.2056 0.0831 0.2846 0.70 6e5y:A, 5us8:B
18 2b30:A 284 45 0.0889 0.0563 0.3556 1.4 2b30:B, 2b30:C, 2b30:D
19 7n12:B 188 41 0.0778 0.0745 0.3415 1.4 7n12:A
20 8iqi:C 916 23 0.0611 0.0120 0.4783 1.9 8iqc:A, 8iqc:B, 8iqd:A, 8iqd:B, 8iqd:C, 8iqd:D, 8iqi:A, 8iqi:B, 8iqi:D, 8iqi:E, 8iqi:F
21 4gcj:A 304 125 0.1944 0.1151 0.2800 2.0 2a0c:X, 5a14:A, 2a4l:A, 7ack:A, 7ack:C, 5ane:A, 5ang:A, 5ani:A, 5anj:A, 1b38:A, 1b39:A, 2b52:A, 2b53:A, 2b54:A, 8b54:A, 8b54:C, 7b7s:A, 7b7s:C, 4bck:A, 4bck:C, 4bcm:A, 4bcm:C, 4bcn:A, 4bcn:C, 4bco:A, 4bcp:A, 4bcq:A, 4bcq:C, 3bht:A, 3bhu:A, 3bhv:A, 2bkz:A, 2bkz:C, 2bpm:A, 2bpm:C, 2c4g:A, 2c4g:C, 2c5n:A, 2c5n:C, 2c5o:A, 2c5o:C, 2c5v:A, 2c5v:C, 2c5x:A, 2c5x:C, 2c5y:A, 2c68:A, 2c69:A, 2c6i:A, 2c6k:A, 2c6l:A, 2c6m:A, 2c6o:A, 2c6t:A, 2c6t:C, 2cch:A, 2cch:C, 2cci:A, 2cci:C, 4cfm:A, 4cfn:A, 4cfn:C, 4cfu:A, 4cfv:A, 4cfw:A, 4cfw:C, 4cfx:A, 4cfx:C, 2cjm:A, 2cjm:C, 1ckp:A, 2clx:A, 5cyi:A, 5cyi:C, 4d1x:A, 4d1z:A, 5d1j:A, 3ddp:A, 3ddp:C, 3ddq:A, 1di8:A, 3dog:A, 2ds1:A, 1e1v:A, 1e1x:A, 7e34:A, 1e9h:A, 1e9h:C, 3eid:A, 3ej1:A, 3ej1:C, 4ek4:A, 4ek5:A, 4ek8:A, 3eoc:A, 3eoc:C, 4eoi:A, 4eoi:C, 4eoj:A, 4eoj:C, 4eok:A, 4eok:C, 4eol:A, 4eol:C, 4eom:A, 4eon:A, 4eon:C, 4eoo:A, 4eoo:C, 4eop:A, 4eop:C, 4eoq:A, 4eor:A, 4eos:A, 4eos:C, 4erw:A, 8erd:A, 8ern:A, 2exm:A, 4ez3:A, 4ez7:A, 3f5x:A, 3f5x:C, 1fin:A, 1fin:C, 4fkg:A, 4fki:A, 4fkl:A, 4fko:A, 4fkp:A, 4fkq:A, 4fkr:A, 4fkt:A, 4fku:A, 4fkv:A, 4fkw:A, 8fow:A, 5fp6:A, 8fp5:A, 1fq1:B, 9fr2:A, 1fvt:A, 1fvv:A, 1fvv:C, 2fvd:A, 4fx3:A, 4fx3:C, 3fz1:A, 2g9x:A, 1gii:A, 6gub:A, 6gub:C, 6guc:A, 6guc:C, 6gue:A, 6gue:C, 6guf:A, 6guf:C, 6guh:A, 6gva:A, 1gy3:A, 1gy3:C, 1gz8:A, 1h00:A, 1h01:A, 1h07:A, 1h08:A, 1h0v:A, 1h0w:A, 1h1p:A, 1h1p:C, 1h1q:A, 1h1q:C, 1h1r:A, 1h1r:C, 1h1s:A, 1h1s:C, 8h6p:A, 8h6t:A, 1hck:A, 4i3z:A, 4i3z:C, 2i40:A, 2i40:C, 5iev:A, 5iex:A, 5iey:A, 3igg:A, 4ii5:A, 4ii5:C, 2iw6:A, 2iw6:C, 2iw8:A, 2iw9:A, 6jgm:A, 5jq5:A, 5jq8:A, 1jst:A, 1jst:C, 1jsv:A, 1jvp:P, 5k4j:A, 4kd1:A, 1ke5:A, 1ke6:A, 1ke7:A, 1ke8:A, 1ke9:A, 7kjs:A, 5l2w:A, 3le6:A, 3lfn:A, 3lfq:A, 3lfs:A, 5lmk:A, 4lyn:A, 7m2f:A, 5mhq:A, 7mkx:A, 7mkx:C, 3my5:A, 5nev:A, 5nev:C, 3ns9:A, 7nvq:A, 1ogu:A, 1oi9:A, 1oi9:C, 1oiq:A, 1oir:A, 1oit:A, 1oiu:A, 1oiy:A, 1oiy:C, 5oo0:A, 5oo1:A, 5oo3:A, 6oqi:A, 5osj:A, 5osm:A, 1p5e:A, 1p5e:C, 1pf8:A, 3pj8:A, 1pkd:A, 1pkd:C, 1pxi:A, 1pxj:A, 1pxk:A, 1pxl:A, 1pxm:A, 1pxn:A, 1pxo:A, 1pxp:A, 3pxf:A, 3pxq:A, 3pxy:A, 3pxz:A, 3py0:A, 3py1:A, 6q3b:A, 6q3c:A, 6q3f:A, 6q48:A, 6q49:A, 6q4a:A, 6q4b:A, 6q4c:A, 6q4d:A, 6q4e:A, 6q4f:A, 6q4g:A, 6q4h:A, 6q4i:A, 6q4j:A, 6q4k:A, 3qhr:C, 3qhr:A, 3qhw:A, 3qhw:C, 7qhl:A, 7qhl:C, 3ql8:A, 1qmz:A, 1qmz:C, 3qqf:A, 3qqg:A, 3qqh:A, 3qqj:A, 3qqk:A, 3qql:A, 3qrt:A, 3qru:A, 3qtq:A, 3qtr:A, 3qts:A, 3qtu:A, 3qtw:A, 3qtx:A, 3qtz:A, 3qu0:A, 3qwj:A, 3qwk:A, 3qx2:A, 3qx4:A, 3qxo:A, 3qxp:A, 3qzf:A, 3qzg:A, 3qzh:A, 3qzi:A, 3r1q:A, 3r1s:A, 3r1y:A, 3r28:A, 2r3f:A, 2r3g:A, 2r3h:A, 2r3i:A, 2r3j:A, 2r3m:A, 2r3o:A, 2r3p:A, 2r3q:A, 2r3r:A, 2r64:A, 3r6x:A, 3r71:A, 3r73:A, 3r7e:A, 3r7i:A, 3r7u:A, 3r7v:A, 3r7y:A, 3r83:A, 3r8l:A, 3r8m:A, 3r8p:A, 3r8u:A, 3r8v:A, 3r8z:A, 3r9d:A, 3r9h:A, 3r9n:A, 3r9o:A, 3rah:A, 3rai:A, 6rij:A, 6rij:C, 3rjc:A, 4rj3:A, 3rk5:A, 3rk7:A, 3rk9:A, 3rkb:A, 3rm6:A, 3rm7:A, 3rni:A, 3roy:A, 3rpo:A, 3rpr:A, 3rpv:A, 7rwe:A, 7rwf:A, 7rxo:A, 3rzb:A, 3s00:A, 3s0o:A, 3s2p:A, 7s4t:A, 7s7a:A, 7s84:A, 7s85:A, 7s9x:A, 7sa0:A, 3sqq:A, 3sw4:A, 3ti1:A, 3tiy:A, 3tiz:A, 3tnw:A, 3tnw:C, 7ug1:A, 3uli:A, 3unj:A, 3unk:A, 2uue:A, 2uue:C, 8uv0:A, 7uxi:A, 2uzb:A, 2uzb:C, 2uzd:A, 2uzd:C, 2uze:A, 2uze:C, 2uzl:A, 2uzl:C, 2uzn:A, 2uzo:A, 2v0d:A, 7vdu:A, 8vq3:A, 8vq4:A, 2vti:A, 2vtl:A, 2vtm:A, 2vto:A, 2vtp:A, 2vtr:A, 2vts:A, 2vu3:A, 2vv9:A, 1vyw:A, 1vyw:C, 1vyz:A, 1w0x:C, 2w06:A, 2w17:A, 2w1h:A, 1w8c:A, 3wbl:A, 1wcc:A, 2wev:A, 2wev:C, 2wih:A, 2wih:C, 2wip:A, 2wip:C, 2wmb:A, 2wpa:A, 2wpa:C, 2wxv:A, 2wxv:C, 2x1n:A, 2x1n:C, 2xmy:A, 2xnb:A, 1y8y:A, 1y91:A, 1ykr:A, 6yl1:A, 6ylk:A, 7zpc:A
22 1boo:A 282 108 0.1444 0.0922 0.2407 2.2
23 4eom:C 276 122 0.1778 0.1159 0.2623 2.2 4bco:C, 4bcp:C, 3bht:C, 3bhu:C, 3bhv:C, 4cfm:C, 4cfu:C, 4cfv:C, 3ddq:C, 3dog:C, 4eoq:C, 4eor:C, 2g9x:C, 2iw8:C, 2iw9:C, 5lmk:C, 3my5:C, 1ogu:C, 1oiu:C, 7uxk:A
24 3sma:B 268 37 0.0667 0.0448 0.3243 4.0 3sma:A, 3sma:C, 3sma:D
25 5d9b:A 307 40 0.1000 0.0586 0.4500 4.1 5d9c:A, 5d9d:A, 5gtq:A, 5gx1:A, 5gx2:A, 5gx3:A, 5gx4:A, 5gx5:A, 5xfe:A
26 4mz0:B 823 108 0.1889 0.0413 0.3148 4.7
27 7ezx:k6 285 38 0.0722 0.0456 0.3421 5.1 7ezx:kH, 6kgx:31, 6kgx:34, 7y4l:fA, 7y4l:hA, 7y5e:fB, 7y5e:hB, 7y7a:fA, 7y7a:hA, 7y7a:fW, 7y7a:hW
28 2a21:A 263 43 0.1000 0.0684 0.4186 5.4 2a21:B, 2a2i:A, 2a2i:B, 3e0i:A, 3e0i:B, 3e12:A, 3e12:B, 2ef9:A, 2ef9:B, 1fwn:A, 1fwn:B, 1fws:A, 1fws:B, 1fwt:A, 1fwt:B, 1fww:A, 1fww:B, 1fx6:A, 1fx6:B, 1fxp:A, 1fxp:B, 1fxq:A, 1fxq:B, 1fy6:A, 1fy6:B, 1jcx:A, 1jcx:B, 1jcy:A, 1jcy:B, 1lrn:A, 1lrn:B, 1lro:A, 1lro:B, 1lrq:A, 1lrq:B, 2nwr:A, 2nwr:B, 2nws:A, 2nws:B, 2nx1:A, 2nx1:B, 2nx3:A, 2nx3:B, 2nx3:C, 2nx3:D, 2nx3:E, 2nx3:F, 2nx3:G, 2nx3:H, 2nx3:I, 2nx3:J, 2nx3:K, 2nx3:L, 2nxg:A, 2nxg:B, 2nxh:A, 2nxh:B, 2nxh:C, 2nxh:D, 2nxh:E, 2nxh:F, 2nxh:G, 2nxh:H, 2nxh:I, 2nxh:J, 2nxh:K, 2nxh:L, 2nxi:A, 2nxi:B, 2nxi:C, 2nxi:D, 2nxi:E, 2nxi:F, 2nxi:G, 2nxi:H, 2nxi:I, 2nxi:J, 2nxi:K, 2nxi:L, 1pck:A, 1pck:B, 1pcw:A, 1pcw:B, 1pe1:A, 1pe1:B, 1t8x:A, 1t8x:B, 1t96:A, 1t96:B, 1zha:A, 1zha:B, 1zji:A, 1zji:B
29 8ip8:HB 205 59 0.0889 0.0780 0.2712 6.0 8ipa:HB, 8ipb:HB, 8jiv:CI
30 1vtm:P 158 19 0.0611 0.0696 0.5789 7.7
31 6xyw:Bq 62 36 0.0667 0.1935 0.3333 7.8
32 6psm:C 448 38 0.0667 0.0268 0.3158 8.6 6prm:A, 6prm:B, 6prm:C, 6prm:D, 6psm:A, 6psm:B, 6psm:D, 6psm:E, 6psm:F, 6pso:B, 6pso:A
33 3zgz:D 867 120 0.1889 0.0392 0.2833 8.6 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
34 4ek6:A 278 44 0.0833 0.0540 0.3409 8.8 4acm:A, 5and:A, 5ank:A, 1aq1:A, 2b55:A, 4bgh:A, 2bhe:A, 2bhh:A, 2btr:A, 2bts:A, 4bzd:A, 8cur:A, 1dm2:A, 2duv:A, 3ezr:A, 3ezv:A, 4fkj:A, 4fks:A, 5fp5:A, 8fp0:A, 1g5s:A, 1gih:A, 1gij:A, 6guk:A, 3ig7:A, 6inl:A, 2j9m:A, 4nj3:A, 8oy2:A, 1p2a:A, 1pye:A, 2r3k:A, 2r3l:A, 2r3n:A, 1r78:A, 3rak:A, 3ral:A, 7ra5:A, 3rmf:A, 3rpy:A, 8ru8:A, 3s1h:A, 3sw7:A, 1urw:A, 1v1k:A, 2vta:A, 2vth:A, 2vtj:A, 2vtn:A, 2vtq:A, 2vtt:A, 2w05:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218