Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DKEINNTIDAIEDKNFKQVYKDSSYISKSDNGEVEMTERPIKIYNSLGVKDINIQDRKIKKVSKNKKRVDAQYKIKTNYG
NIDRNVQFNFVKEDGMWKLDWDHSVIIPGMQKDQSIHIENLKSERGKILDRNNVELANTGTAYEIGIVPKNVSKKDYKAI
AKELSISEDYIKQQMDQNWVQDDTFVPLKTVKKMDEYLSDFAKKFHLTTNETESRNYPLGKATSHLLGYVGPINSEELKQ
KEYKGYKDDAVIGKKGLEKLYDKKLQHEDGYRVTIVDDNSNTIAHTLIEKKKKDGKDIQLTIDAKVQKSIYNNMKNDYGS
GTAIHPQTGELLALVSTPSYDVYPFMYGMSNEEYNKLTEDKKEPLLNKFQITTSPGSTQKILTAMIGLNNKTLDDKTSYK
IDGKGWQKDKSWGGYNVTRYEVVNGNIDLKQAIESSDNIFFARVALELGSKKFEKGMKKLGVGEDIPSDYPFYNAQISNK
NLDNEILLADSGYGQGEILINPVQILSIYSALENNGNINAPHLLKDTKNKVWKKNIISKENINLLTDGMQQVVNKTHKED
IYRSYANLIGKSGTAELGRQIGWFISYDKDNPNMMMAINVKDVQDKGMASYNAKISGKVYDELYENGNKKYDIDE

The query sequence (length=635) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4cjn:A 642 642 1.0000 0.9891 0.9891 0.0 4bl3:A, 4bl3:B, 4cjn:B, 4cpk:A, 4cpk:B, 4dki:A, 4dki:B, 6h5o:B, 5m18:A, 5m18:B, 5m19:A, 5m19:B, 5m1a:A, 5m1a:B, 1mwt:A, 1mwt:B, 1mwu:A, 1mwu:B, 6q9n:A, 3zfz:A, 3zfz:B, 3zg0:A, 3zg0:B, 3zg5:A, 3zg5:B
2 6h5o:A 598 637 0.9370 0.9950 0.9341 0.0
3 8f3i:A 641 602 0.3339 0.3307 0.3522 4.63e-112 8f3g:A, 8f3l:A, 8f3n:A, 8f3p:A, 8f3s:A, 8f3u:A, 8f3w:A, 8f3y:A, 6g88:A, 6mkf:A, 6mkg:A
4 6g88:C 597 590 0.3228 0.3434 0.3475 3.12e-104 6g88:B
5 6mkh:A 445 492 0.2661 0.3798 0.3435 1.27e-75 6bsr:A, 6mki:A
6 6tix:BBB 533 546 0.2315 0.2758 0.2692 4.37e-40 6tix:AAA
7 6g9f:A 539 530 0.2362 0.2783 0.2830 6.90e-40 6g9s:A
8 7kis:A 458 418 0.1921 0.2664 0.2919 2.06e-36 7kis:B
9 8yjx:A 558 507 0.2142 0.2437 0.2682 4.47e-35
10 7zg8:AAA 525 542 0.2173 0.2629 0.2546 1.79e-34 7zg8:BBB
11 8yjx:B 490 503 0.2016 0.2612 0.2545 1.41e-33
12 6pl6:B 577 523 0.1937 0.2132 0.2352 6.44e-26
13 7rcz:A 511 556 0.2220 0.2759 0.2536 1.36e-20 7rcz:B
14 7rcy:A 828 433 0.1748 0.1341 0.2564 5.00e-20 7rcw:A
15 7rcx:A 811 435 0.1795 0.1406 0.2621 1.51e-18
16 4kqq:A 520 482 0.1701 0.2077 0.2241 6.09e-16 7ato:A, 7atw:A, 7atx:A, 7au0:A, 7au1:A, 7au8:A, 7au9:A, 7aub:A, 7auh:A, 5df7:A, 5df7:B, 5df8:A, 5df8:B, 5df9:A, 4fsf:A, 6hr6:A, 6hr9:A, 6i1e:A, 7jwl:A, 7kit:A, 4kqo:A, 4kqo:B, 4kqq:B, 4kqr:A, 4kqr:B, 4l0l:A, 3ocl:A, 3ocn:A, 7onk:A, 7onk:B, 4ool:A, 4oom:A, 3pbq:A, 3pbr:A, 3pbs:A, 3pbt:A, 6r3x:A, 6r42:A, 6un1:A, 6un3:A, 6vje:A, 6vot:A, 4wej:A, 4wek:A, 4wel:A, 6y6u:A, 6y6z:A
17 7onw:A 485 557 0.1953 0.2557 0.2226 1.45e-15 8gpw:A, 8gpw:B, 6i1i:A, 7onn:A, 8rtz:AAA
18 5oj1:A 675 522 0.1811 0.1704 0.2203 1.54e-15 5oiz:A, 2z2m:B, 2z2m:E, 2zc3:B, 2zc3:E, 2zc4:B, 2zc4:E
19 5oj0:A 658 549 0.1827 0.1763 0.2113 1.60e-15 1qmf:A
20 4ovd:A 422 453 0.1685 0.2536 0.2362 2.03e-15
21 7rd0:A 482 420 0.1638 0.2158 0.2476 8.00e-14
22 3upp:A 445 356 0.1228 0.1753 0.2191 3.72e-13 3upn:A, 3upn:B, 3upo:A, 3upo:B, 3upp:B
23 7ok9:B 525 556 0.2126 0.2571 0.2428 6.45e-13 7o4a:AAA, 7ok9:A, 7ok9:E, 7ok9:C, 7ok9:G, 7ok9:H, 7ok9:I, 7ok9:D, 7ok9:F, 7ok9:J
24 8vbu:A 505 559 0.2079 0.2614 0.2361 2.18e-11 7o4a:BBB, 7o4b:A, 7o4b:C, 8vbu:B, 8vbv:A, 8vbv:B, 8vbw:A, 8vbw:B
25 7atm:A 478 478 0.1591 0.2113 0.2113 4.82e-11 7kiv:A, 7kiw:A, 7lc4:A, 7ly1:A, 3pbo:A
26 1pyy:A 607 498 0.1622 0.1697 0.2068 2.47e-09
27 6syn:A 471 544 0.1717 0.2314 0.2004 2.70e-09
28 2wad:C 607 424 0.1606 0.1680 0.2406 9.44e-09 2wad:A, 2wae:A
29 4r1g:B 419 433 0.1433 0.2172 0.2102 6.43e-08 4n1x:A, 4n1x:B, 4qjg:A, 4qjg:B, 4r0q:A, 4r0q:B, 4r1g:A, 4r23:A, 4r23:B, 4r3j:A, 4r3j:B, 4ra7:A, 4ra7:B
30 8c5w:A 634 450 0.1685 0.1688 0.2378 1.19e-07 8c5o:A
31 3zg8:B 458 296 0.1055 0.1463 0.2264 3.97e-04 3zg9:B, 3zga:B
32 3vsl:A 631 444 0.1512 0.1521 0.2162 0.001 3vsl:B
33 6am5:E 242 115 0.0441 0.1157 0.2435 0.043 6amu:E, 6d78:E, 6dkp:E, 4l3e:E, 3qdg:E, 3qdj:E
34 7u4h:A 576 249 0.0945 0.1042 0.2410 0.071 7u4h:B
35 4y0u:A 243 139 0.0504 0.1317 0.2302 0.12 7vvi:A, 7vx3:A, 7vx6:A, 4y0u:B, 4y0u:C, 4y0u:D
36 5fq9:B 247 95 0.0425 0.1093 0.2842 0.13 1fof:A, 1fof:B, 5fq9:A, 1h5x:A, 1h5x:B, 1h8y:A, 1h8y:B, 2hp5:A, 2hp5:B, 2hp5:C, 2hp5:D, 1k54:A, 1k54:B, 1k6r:A, 1k6r:B, 1k6s:A, 1k6s:B, 7l5t:A, 7l5t:B, 3lce:A, 3lce:B, 5mmy:B, 5mnu:A, 5mnu:B, 5mox:A, 5mox:B, 5moz:A, 5moz:B, 6rtn:A, 6rtn:B, 4s2o:A, 4s2o:B, 6skp:A, 6skp:B, 6skq:A, 6skq:B, 6skq:C, 6skq:D, 6skr:A, 6skr:B, 2wgi:A, 2wgi:B, 2wgv:A, 2wgv:B, 2wkh:A, 2wkh:B, 4wz5:A, 4wz5:B, 6zrg:A, 6zrh:A, 6zrh:B, 6zrh:C, 6zrh:D, 6zri:A, 6zri:B, 6zri:C, 6zri:D, 6zw2:A
37 4k0x:A 243 143 0.0535 0.1399 0.2378 0.15 4jf4:A, 4jf4:B, 4k0w:A, 6n6u:A, 6n6v:A, 6n6x:A, 6n6y:A, 7t7d:A, 7t7e:A, 7t7f:A, 7t7g:A, 5wi3:B, 5wi3:A, 5wi7:A, 5wi7:B, 5wib:A, 5wib:B, 4x55:A, 4x55:B
38 8exs:A 556 90 0.0394 0.0450 0.2778 0.30 8c0p:A, 8c0p:B, 8c0s:A, 8c0s:B, 8cf3:C, 8cf3:E, 8exp:A, 8exp:B, 8exq:B, 8exq:A, 8exr:B, 8exr:A, 8exs:B, 8ext:A, 8ext:B, 6o9w:B, 3q7z:A, 3q7z:B, 3q81:A, 3q81:B, 3q82:A, 3q82:B, 1xa1:A, 1xa1:B, 1xa1:C, 1xa1:D, 1xa7:A, 1xa7:B, 1xkz:A, 1xkz:B, 1xkz:C, 1xkz:D
39 3m9g:A 201 52 0.0268 0.0846 0.3269 2.3
40 8veq:A 325 355 0.1118 0.2185 0.2000 3.0 6vbd:A, 8ven:A, 8vep:A
41 4dxg:A 194 71 0.0362 0.1186 0.3239 3.3 4rco:A, 4rco:B
42 2xz1:A 353 53 0.0205 0.0368 0.2453 4.9 1afr:A, 1afr:B, 1afr:C, 1afr:D, 1afr:E, 1afr:F, 2j2f:A, 2j2f:B, 2j2f:C, 2j2f:D, 2j2f:E, 2j2f:F, 1oq4:A, 1oq4:B, 1oq4:C, 1oq4:D, 1oq4:E, 1oq4:F, 1oq9:A, 1oqb:A, 1oqb:B, 1oqb:C, 1oqb:D, 1oqb:E, 1oqb:F, 4v0j:A, 4v0j:B, 4v0j:C, 4v0j:D, 4v0j:E, 4v0j:F, 2xz0:A, 2xz0:B, 2xz0:C, 2xz1:B
43 6peu:B 385 68 0.0315 0.0519 0.2941 5.3 6pe3:A, 6peu:A, 6peu:C, 6peu:D
44 8yf8:C 305 51 0.0236 0.0492 0.2941 5.8 4rfu:A, 4rfu:B, 4rfu:C, 4wiz:BA, 4wiz:AA, 4wiz:CA, 4wiz:BB, 4wiz:AB, 4wiz:CB, 4wiz:BC, 4wiz:AC, 4wiz:CC, 4wiz:BD, 4wiz:AD, 4wiz:CD, 4wiz:BE, 4wiz:AE, 4wiz:CE, 4wiz:BF, 4wiz:AF, 4wiz:CF, 4wiz:BG, 4wiz:AG, 4wiz:CG, 4wiz:BH, 4wiz:AH, 4wiz:CH, 4wiz:BI, 4wiz:AI, 4wiz:CI, 4wiz:BJ, 4wiz:AJ, 4wiz:CJ, 4wiz:BK, 4wiz:AK, 4wiz:CK, 4wiz:BL, 4wiz:AL, 4wiz:CL, 4wiz:BM, 4wiz:AM, 4wiz:CM, 4wiz:BN, 4wiz:AN, 4wiz:CN, 4wiz:BO, 4wiz:AO, 4wiz:CO, 4wiz:BP, 4wiz:AP, 4wiz:CP, 4wiz:BQ, 4wiz:AQ, 4wiz:CQ, 4wiz:BR, 4wiz:AR, 4wiz:CR, 4wiz:BS, 4wiz:AS, 4wiz:CS, 4wiz:BT, 4wiz:AT, 4wiz:CT, 4wiz:BU, 4wiz:AU, 4wiz:CU, 4wiz:BV, 4wiz:AV, 4wiz:CV, 4wiz:BW, 4wiz:AW, 4wiz:CW, 4wiz:BX, 4wiz:AX, 4wiz:CX, 4wiz:BY, 4wiz:AY, 4wiz:CY, 4wiz:BZ, 4wiz:AZ, 4wiz:CZ, 4wiz:Ba, 4wiz:Aa, 4wiz:Ca, 4wiz:Bb, 4wiz:Ab, 4wiz:Cb, 4wiz:Bc, 4wiz:Ac, 4wiz:Cc, 4wiz:Bd, 4wiz:Ad, 4wiz:Cd, 8yf6:A, 8yf6:B, 8yf6:C, 8yf7:A, 8yf7:C, 8yf7:B, 8yf8:A, 8yf8:B, 8yf9:A, 8yf9:B, 8yf9:C
45 3hc3:L 213 91 0.0409 0.1221 0.2857 6.6 8go8:L, 8go8:M, 8go9:E, 8go9:C, 8goc:E, 8goc:L, 8goc:N, 8goo:E, 8goo:L, 8goo:N, 3hc4:L, 3ixt:L, 4jqi:L
46 4f94:A 245 44 0.0268 0.0694 0.3864 7.4 6b22:A, 8cul:A, 8cum:A, 8cuo:A, 3fv7:A, 3fyz:A, 3fzc:A, 3mbz:A, 6mpq:A, 3pae:A, 3pae:B, 3pag:A, 3pag:B, 7rp8:A, 7rp9:A, 7rpa:A, 7rpb:A, 7rpc:A, 7rpd:A, 7rpe:A, 7rpf:A, 7rpg:A, 5tg4:A, 5tg5:A, 5tg6:A, 5tg7:A, 5vfd:A, 4wm9:A, 4x53:A, 4x56:A, 3znt:A
47 4rul:A 823 45 0.0236 0.0182 0.3333 8.1 1cy1:A, 1cy2:A, 1cy4:A, 1cy6:A, 1cy7:A, 1cy8:A, 1mw8:X, 3px7:A
48 8ep6:A 245 72 0.0331 0.0857 0.2917 8.2

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218