BioLiP

>protein
DKAYTDAESYTKGLHKIYSVWALSGTALLRCWWTLQEQPTDEMKNAWNDAWCTEVNYMTWTTNKVEPIEGVYQRCMYIVA
LVNEFLKNIPNAPESIDKESYIAQARFNRAFAYYVLMDMFALPPFITEKNYSIEPAPLSREDLFNWIEAELNEIKPNLPS
PRSEYGVADQAVASALLARMYLNAEIYTGKARYTECINACNEVIKAGYQLADNYADLFKADNGENPDTKKEIIYPIIFDG
DSWGMAAIIIGARGAEDKDVLLAHSGVDQGWAGFRATSNLVHLFDFQNDEEPKASEIQDKRGIFYDKGRSIDITSSVSGT
FETEGWSVFKFSNLNSNGQPGKNTLWVDTDFPMFRLGDIYLMYAEAVARGGEGSKASAVEYINALRKRAYGDDKHNISEN
WLEENNFRNLLDERGRELYWEGIRRTDLVRFDLLTSGSYTWDFKGGINTGVGVNKRYNVYPIPVTDLTVNGNLQQNEGY

The query sequence (length=479) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3jys:A	479	479	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	3ck9:B	515	498	0.3507	0.3262	0.3373	7.38e-68	3ck7:A, 3ck7:B, 3ck7:C, 3ck7:D, 3ck8:A, 3ck8:B, 3ck9:A, 3ckb:A, 3ckb:B, 3ckc:A, 3ckc:B
3	3kez:B	448	152	0.1002	0.1071	0.3158	7.80e-10	3kez:A
4	5e76:A	492	434	0.2046	0.1992	0.2258	1.61e-08
5	3jq1:B	464	433	0.2067	0.2134	0.2286	5.01e-08	3jq1:A
6	6sli:A	482	370	0.1837	0.1826	0.2378	9.28e-05	5cx8:A, 5cx8:B, 6sli:C, 6sli:F, 6sli:I, 6slj:D, 6slj:C, 6sln:C, 6sln:D, 6sm3:A, 6smq:A
7	3l22:A	429	416	0.1962	0.2191	0.2260	1.78e-04
8	7kv3:AAA	467	443	0.2025	0.2077	0.2190	1.95e-04
9	3mcx:A	459	401	0.2025	0.2113	0.2419	2.99e-04
10	8yb6:J	443	72	0.0438	0.0474	0.2917	0.095	8yha:J
11	5cjz:A	603	151	0.0856	0.0680	0.2715	0.14	5ck1:A
12	5cjz:A	603	86	0.0543	0.0431	0.3023	3.0	5ck1:A
13	6gnj:C	210	67	0.0480	0.1095	0.3433	0.62	6gnk:C
14	4cn1:A	649	25	0.0271	0.0200	0.5200	3.2	4cn1:B, 4cn4:A, 4cn4:B, 4cn6:A, 4cn6:B, 5cvs:A, 5cvs:B, 8d6k:B, 8d6k:A, 5lgv:A, 5lgv:B, 5lgw:A, 5lgw:B, 7mel:A, 7mel:B, 7mgy:A, 7mgy:B, 4u2y:A, 4u2y:B, 4u2z:A, 4u2z:B, 4u31:A, 4u31:B, 7uvd:B, 7uvd:A, 5vsj:A, 5vsj:B, 5vt4:A, 5vt4:B, 5vt4:C, 5vt4:D, 3zst:A, 3zst:B, 3zt5:A, 3zt5:B, 3zt5:C, 3zt5:D, 3zt6:A, 3zt6:B, 3zt6:C, 3zt6:D, 3zt7:B, 3zt7:A, 3zt7:D, 3zt7:C
15	3av4:A	1140	31	0.0292	0.0123	0.4516	3.6	3av5:A, 3av6:A, 4da4:B, 5gut:A, 5guv:A, 3pt9:A, 6w8v:B, 6w8w:A, 6w8w:B, 5wy1:A
16	2d6f:D	522	74	0.0418	0.0383	0.2703	3.8	2d6f:C
17	3rii:A	212	59	0.0397	0.0896	0.3220	3.9	3tb3:B
18	7qbk:A	284	77	0.0501	0.0845	0.3117	4.3
19	4j19:A	77	33	0.0313	0.1948	0.4545	5.8	4j19:B
20	5ero:A	301	71	0.0376	0.0598	0.2535	6.2	5ero:B, 5ero:C
21	6awn:A	544	43	0.0334	0.0294	0.3721	7.5	6awo:A, 6awp:A, 6awq:A, 8de3:A, 8de4:A, 6dzv:A, 6dzw:A, 6dzy:A, 6dzz:A, 5i6x:A, 5i71:A, 5i73:A, 5i74:A, 5i75:A, 7li6:A, 7li7:A, 7li9:A, 7lia:A, 7lwd:A, 7mgw:A, 7txt:S, 6vrh:A, 6vrk:A, 6vrl:A, 6w2b:A, 6w2c:A
22	2p6r:A	683	38	0.0334	0.0234	0.4211	9.1

[Back]