Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DHVRVGVVITDPALEDNPIVYVNQGFVQMTGYETEEILGKNCRFLQGKHTDPAEVDNIRTALQNKEPVTVQIQNYKKDGT
MFWNELNIDPMEIEDKTYFVGIQNDITKQKEYEKLLEDSLTEITALS

The query sequence (length=127) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2mwg:A 261 127 1.0000 0.4866 1.0000 5.87e-92 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
2 4gcz:B 378 127 0.8661 0.2910 0.8661 2.88e-79 4gcz:A
3 8qi8:A 110 109 0.4094 0.4727 0.4771 4.53e-34 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
4 6i21:A 135 85 0.3543 0.3333 0.5294 1.56e-31 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
5 4hhd:A 152 119 0.4409 0.3684 0.4706 1.79e-31 4hhd:B
6 8c05:A 305 109 0.3858 0.1607 0.4495 1.81e-31
7 6t74:B 141 104 0.3937 0.3546 0.4808 1.93e-31 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
8 2wkp:A 320 104 0.4252 0.1688 0.5192 5.81e-31 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
9 7qf2:AAA 117 100 0.3937 0.4274 0.5000 9.00e-31 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
10 3ue6:E 138 111 0.3937 0.3623 0.4505 4.30e-30 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
11 8pm1:A 109 108 0.3937 0.4587 0.4630 5.21e-30 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
12 6ph4:B 460 113 0.4094 0.1130 0.4602 7.79e-30 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
13 4r3a:A 318 119 0.4173 0.1667 0.4454 1.03e-29 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
14 7tbq:A 375 104 0.4173 0.1413 0.5096 1.27e-29 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
15 5hzh:A 320 104 0.4173 0.1656 0.5096 1.78e-29
16 7tcd:A 436 104 0.4173 0.1216 0.5096 2.34e-29 4wf0:A, 4wf0:B
17 7r56:A 137 122 0.3858 0.3577 0.4016 3.07e-29 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
18 6hmj:A 359 115 0.3622 0.1281 0.4000 4.60e-29 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
19 1g28:A 104 101 0.3780 0.4615 0.4752 5.68e-29 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
20 5hzi:A 476 111 0.4173 0.1113 0.4775 8.89e-29 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
21 4eeu:A 109 100 0.3701 0.4312 0.4700 2.89e-28 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
22 6gb3:A 120 108 0.3701 0.3917 0.4352 3.27e-28 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
23 8a5r:AAA 206 104 0.3622 0.2233 0.4423 4.00e-28 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
24 4r3a:B 278 109 0.3622 0.1655 0.4220 6.93e-28
25 7a6p:A 149 128 0.3701 0.3154 0.3672 1.39e-27 7a6p:B
26 7r5n:B 151 106 0.3465 0.2914 0.4151 1.85e-27 7r5n:A
27 2z6c:A 121 104 0.3622 0.3802 0.4423 2.03e-27 2z6c:B
28 2z6d:A 118 103 0.3543 0.3814 0.4369 2.79e-27 2z6d:B
29 8a6x:B 368 129 0.3622 0.1250 0.3566 7.82e-27 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
30 7oo9:A 106 105 0.3858 0.4623 0.4667 1.70e-25 7oo9:B
31 7yx0:A 166 125 0.3701 0.2831 0.3760 2.29e-25 7yx0:C
32 8j68:A 129 108 0.3780 0.3721 0.4444 2.52e-25 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
33 7wa4:B 107 101 0.3228 0.3832 0.4059 5.92e-22
34 4wuj:C 145 109 0.3465 0.3034 0.4037 5.56e-21 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
35 3hjk:A 150 112 0.3071 0.2600 0.3482 1.54e-17 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
36 5svu:B 135 110 0.3150 0.2963 0.3636 3.91e-17 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
37 4hj6:B 178 116 0.2913 0.2079 0.3190 4.53e-14 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
38 2gj3:A 119 110 0.2756 0.2941 0.3182 1.55e-12 2gj3:B
39 7yid:A 660 111 0.2677 0.0515 0.3063 6.29e-11 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
40 3ewk:A 227 100 0.2126 0.1189 0.2700 1.25e-07
41 3ewk:A 227 107 0.1969 0.1101 0.2336 1.41e-04
42 1s66:L 119 107 0.2047 0.2185 0.2430 1.46e-07 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
43 8dik:A 127 78 0.1732 0.1732 0.2821 4.14e-06 8dik:B
44 1d06:A 130 96 0.1969 0.1923 0.2604 1.96e-04 1ew0:A
45 6pl0:B 608 91 0.1575 0.0329 0.2198 0.005 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
46 8js5:B 253 122 0.2126 0.1067 0.2213 0.045 2cmn:A, 1dp6:A, 1dp8:A, 1dp9:A, 1drm:A, 8js5:A, 8js5:C, 8js5:D, 8js5:E, 8js5:F, 8js5:G, 8js5:H, 8js5:I, 8js5:J, 8js6:A, 8js6:B, 8js6:C, 8js6:D, 8js6:E, 8js6:F, 8js6:G, 8js6:H, 8js6:I, 8js6:J, 8js7:A, 8js7:B, 8js7:C, 8js7:D, 8js7:E, 8js7:F, 8js7:G, 8js7:H, 8js7:I, 8js7:J, 1lsv:A, 1lsw:A, 1lsx:A, 1lt0:A, 2owh:A, 2owj:A, 2vv6:A, 2vv6:D, 2vv6:B, 2vv6:C, 2vv7:A, 2vv7:B, 2vv7:C, 2vv7:D, 2vv8:A, 2vv8:D, 2vv8:B, 2vv8:C, 1xj2:A, 1xj3:A, 1xj4:A, 1xj4:B, 1xj6:A, 1xj6:B, 1y28:A
47 8osl:N 290 100 0.2205 0.0966 0.2800 0.059 4h10:A, 8osk:N, 8osl:P
48 3bwl:A 125 91 0.1732 0.1760 0.2418 0.37 3bwl:B, 3bwl:C, 3bwl:D
49 8pdg:AAA 462 30 0.0945 0.0260 0.4000 2.0 8pdh:AAA, 8pdi:A, 8pdj:AAA, 5rw2:A, 5rw4:A, 5rw5:A, 5rw6:A, 5rw7:A, 5rw8:A, 5rw9:A, 5rwa:A, 5rwb:A, 5rwc:A, 5rwd:A, 5rwe:A, 5rwf:A, 5rwg:A, 5rwh:A, 5rwj:A, 5rwk:A, 5rwl:A, 5rwn:A, 5rwp:A, 5rwq:A, 5rwr:A, 5rws:A, 5rwt:A, 5rwu:A, 5rwv:A, 5rww:A, 5rwx:A, 5rwy:A, 5rwz:A, 5rx0:A, 5rx1:A, 5rx2:A, 5rx3:A, 5rx4:A, 5rx5:A, 5rx6:A, 5rx7:A, 5rx8:A, 5rx9:A, 5rxa:A, 5rxb:A, 5rxc:A, 5rxd:A, 5rxe:A, 5rxf:A, 5rxg:A, 5rxh:A, 5rxi:A, 5rxj:A, 5rxk:A, 5rxl:A, 5rxo:A, 5rxp:A, 5rxq:A, 5rxr:A, 5rxs:A, 5rxt:A, 5rxu:A, 5rxv:A, 5rxw:A, 5rxy:A, 5rxz:A, 5ry0:A, 5ry1:A, 5ry2:A, 5ry3:A, 5ry4:A, 5ry5:A, 5ry6:A, 5ry7:A, 5ry8:A, 5ry9:A, 5rya:A, 5ryb:A, 5ryc:A, 5ryd:A, 5rye:A, 5ryg:A, 5ryh:A, 5ryi:A, 5ryj:A, 5ryk:A, 5ryl:A, 6xy7:AAA
50 2bgg:B 394 34 0.1102 0.0355 0.4118 2.5 2w42:B
51 8ok9:A 430 34 0.1102 0.0326 0.4118 2.7 2bgg:A, 8pvv:A, 8qg0:A, 6t5t:A, 6tuo:A, 2w42:A, 6xu0:A, 6xu0:B, 6xup:A, 6xup:B, 1ytu:A, 1ytu:B
52 5npu:A 547 45 0.1260 0.0293 0.3556 3.4 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
53 1m1b:A 291 88 0.1654 0.0722 0.2386 4.2 1m1b:B, 1pym:A, 1pym:B
54 8dvh:A 196 41 0.0866 0.0561 0.2683 6.1 8dvh:B
55 2gsi:H 213 27 0.0709 0.0423 0.3333 6.1
56 5v51:F 137 39 0.0945 0.0876 0.3077 7.7 5v51:A, 5v51:B, 5v51:D, 5v51:E, 5v51:G
57 5drn:A 216 33 0.0787 0.0463 0.3030 8.2 5drn:H, 5dsc:C, 5dsc:A, 5dsc:E, 5dsc:H
58 5z06:B 698 21 0.0787 0.0143 0.4762 9.1 5z06:A
59 4zpk:B 321 102 0.2047 0.0810 0.2549 9.6 8ck3:A, 8ck4:A, 8ck8:A, 6czw:A, 6d09:A, 6d0b:A, 6e3s:B, 6e3t:B, 6e3u:B, 3f1o:A, 4ghi:A, 4gs9:A, 3h7w:A, 3h82:A, 5tbm:A, 5ufp:A, 7w80:B, 6x21:A, 6x28:A, 6x2h:A, 6x37:A, 6x3d:A, 4xt2:C, 4zqd:B
60 4eu2:N 233 23 0.0866 0.0472 0.4783 9.9 5d0t:M, 4eu2:2, 5l5w:M, 4q1s:a, 4q1s:M

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218