BioLiP

>protein
DAIMRGKFTLNELMTQLEAIENMGSMKLTEAKIKKYKVIISSMTKEERENPKIIKASRIRRIARGSGTTENDVREVLRYY
ETTKNAIDKLRKG

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4xco:C	157	112	1.0000	0.5924	0.8304	2.56e-57
2	3ndb:B	420	93	0.9570	0.2119	0.9570	2.98e-54	2v3c:C, 2v3c:D, 4xco:D
3	3dm5:A	416	90	0.4839	0.1082	0.5000	1.66e-23	3dm5:B
4	7epk:A	426	109	0.4301	0.0939	0.3670	2.14e-15
5	2j28:9	430	103	0.3441	0.0744	0.3107	9.57e-11	5aka:5
6	7o5b:g	403	95	0.3333	0.0769	0.3263	3.94e-10	7o9f:A, 7o9f:C, 7o9f:B, 4ue4:C
7	5gaf:i	398	74	0.3011	0.0704	0.3784	3.34e-09	1dul:A, 1hq1:A, 3lqx:A, 2pxb:A, 2pxd:A, 2pxe:A, 2pxf:A, 2pxk:A, 2pxl:A, 2pxp:A, 2pxq:A, 2pxt:A, 2pxu:A, 2pxv:A
8	1qzw:A	432	98	0.3763	0.0810	0.3571	7.79e-09	3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M
9	5gad:i	450	93	0.3226	0.0667	0.3226	8.88e-09	4c7o:A, 4c7o:C, 5gag:i, 5gah:i, 5nco:i, 7o9g:A, 7o9i:A, 2xkv:C, 2xxa:A, 2xxa:C
10	7obr:x	488	111	0.3226	0.0615	0.2703	6.32e-06	2go5:W, 2j37:W, 5l3q:A, 5l3q:C, 1mfq:C, 7nfx:x, 7qwq:x, 1ry1:W, 4ue5:D, 6y2z:A, 6y32:A, 6y32:C, 6y32:E, 6y32:G
11	3jaj:z	426	109	0.3118	0.0681	0.2661	7.09e-05	6frk:x, 3jan:z, 7obq:x, 6r6g:AB
12	6fvt:L	388	53	0.1505	0.0361	0.2642	0.67	6ef0:L, 6ef1:L, 6ef2:L, 6ef3:L, 6fvu:L, 6fvv:L, 6fvw:L, 6fvx:L, 6fvy:L, 5mp9:L, 5mpa:L, 5mpb:L, 5mpc:L, 7qo4:L, 7qo5:L, 7qo6:L
13	8ouw:6	707	39	0.1398	0.0184	0.3333	1.6
14	7q3y:A	1201	38	0.1290	0.0100	0.3158	3.1	5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
15	1im5:A	179	56	0.1720	0.0894	0.2857	3.4
16	6qmm:B	280	35	0.1398	0.0464	0.3714	4.3	6qmm:A
17	6rfl:Y	600	35	0.1505	0.0233	0.4000	5.6	7aoh:Y, 8c8h:Y
18	8ear:A	2389	58	0.1505	0.0059	0.2414	6.1	8eaq:A, 8eaq:B, 8eaq:C, 8eaq:D, 8ear:D, 8ear:B, 8ear:C
19	7lhf:C	2300	43	0.1183	0.0048	0.2558	7.1	7lhe:A, 7lhe:D, 7lhe:C, 7lhe:B, 7lhf:A, 7lhf:D, 7lhf:B
20	8deb:A	397	53	0.1505	0.0353	0.2642	7.2	8deb:B
21	3iam:2	179	27	0.1290	0.0670	0.4444	8.7	2fug:2, 2fug:B, 2fug:K, 2fug:T, 4hea:2, 4hea:C, 6i0d:2, 6i0d:C, 6i1p:2, 6i1p:C, 3i9v:2, 3i9v:B, 3iam:B, 3ias:2, 3ias:B, 3ias:K, 3ias:T, 3m9s:2, 3m9s:B, 6q8o:2, 6q8o:C, 6q8w:2, 6q8w:C, 6q8x:2, 6q8x:C, 6y11:2, 6y11:C, 2ybb:2, 6ziy:2, 6zjl:2, 6zjn:2, 6zjy:2
22	6fvt:I	385	53	0.1613	0.0390	0.2830	8.9	6ef0:I, 6ef1:I, 6ef2:I, 6ef3:I, 6fvu:I, 6fvv:I, 6fvw:I, 6fvx:I, 6fvy:I, 5mp9:I, 5mpa:I, 5mpb:I, 5mpc:I, 7qo4:I, 7qo5:I, 7qo6:I

[Back]