Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
MKPADSE

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4lmz:A 176 87 0.9080 0.4489 0.9080 1.30e-58 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
2 4lmz:A 176 82 0.3563 0.1761 0.3780 6.10e-13 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
3 4qqb:A 169 82 0.3218 0.1657 0.3415 4.02e-10 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
4 1fnx:H 174 82 0.3333 0.1667 0.3537 1.16e-08 1fxl:A, 1g2e:A
5 4ed5:B 169 80 0.2989 0.1538 0.3250 1.54e-08 4ed5:A
6 4ed5:B 169 67 0.2299 0.1183 0.2985 2.47e-04 4ed5:A
7 7dvq:Y 140 71 0.2414 0.1500 0.2958 3.09e-08 8i0p:Y, 8i0r:Y
8 2mgz:B 105 59 0.2989 0.2476 0.4407 3.90e-08 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
9 2xs2:A 87 73 0.2759 0.2759 0.3288 2.49e-07 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
10 2mb0:B 95 77 0.2874 0.2632 0.3247 3.66e-07
11 2fy1:A 108 66 0.2414 0.1944 0.3182 5.86e-07
12 2leb:A 101 72 0.2989 0.2574 0.3611 6.81e-07 2lec:A
13 6jvx:A 87 59 0.2644 0.2644 0.3898 2.74e-06 6jvy:A
14 5ifm:C 256 66 0.2644 0.0898 0.3485 3.50e-06 5ifm:A
15 9gpj:A 184 50 0.2299 0.1087 0.4000 4.42e-06 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
16 9gpj:A 184 62 0.2529 0.1196 0.3548 1.63e-05 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
17 2n82:B 104 68 0.2414 0.2019 0.3088 9.02e-06 2err:A, 7vrl:B
18 2rs2:A 84 84 0.2989 0.3095 0.3095 9.79e-06
19 5en1:A 184 50 0.2184 0.1033 0.3800 1.55e-05 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
20 5en1:A 184 50 0.2069 0.0978 0.3600 6.48e-04 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
21 2rra:A 99 57 0.2184 0.1919 0.3333 2.85e-05 2kxn:B
22 8xxm:3G 84 47 0.2069 0.2143 0.3830 3.40e-05 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
23 2mkc:A 118 71 0.1839 0.1356 0.2254 4.09e-05 2my3:A
24 7dco:X 128 71 0.1839 0.1250 0.2254 5.52e-05 5gm6:V, 5zwm:X
25 8ch6:U 295 70 0.2644 0.0780 0.3286 8.21e-05 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
26 7ohx:o 112 78 0.2299 0.1786 0.2564 1.04e-04
27 8esq:o 137 64 0.2184 0.1387 0.2969 1.13e-04 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
28 7abi:P 237 70 0.2644 0.0970 0.3286 1.18e-04 7aav:P, 7abg:P
29 2cjk:A 167 67 0.2184 0.1138 0.2836 1.29e-04 2km8:C
30 2cjk:A 167 68 0.2299 0.1198 0.2941 0.004 2km8:C
31 6c0f:o 133 78 0.2299 0.1504 0.2564 1.66e-04 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
32 7csz:A 175 71 0.2759 0.1371 0.3380 1.88e-04
33 7csz:A 175 59 0.1954 0.0971 0.2881 0.003
34 6hpj:B 84 59 0.2184 0.2262 0.3220 2.68e-04
35 7q33:A 93 69 0.2184 0.2043 0.2754 3.41e-04 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
36 7s7b:C 79 67 0.2414 0.2658 0.3134 3.51e-04 7s7b:G, 7s7c:C
37 5x3z:A 96 50 0.1954 0.1771 0.3400 0.001
38 1rk8:A 87 68 0.2414 0.2414 0.3088 0.001
39 1wtb:A 79 50 0.2069 0.2278 0.3600 0.001 1x0f:A
40 7q4l:A 227 70 0.2184 0.0837 0.2714 0.001
41 4bs2:A 174 56 0.2184 0.1092 0.3393 0.003 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
42 4bs2:A 174 63 0.2069 0.1034 0.2857 0.098 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
43 7zap:A 97 53 0.2069 0.1856 0.3396 0.003
44 5x8p:v 190 54 0.1954 0.0895 0.3148 0.004 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
45 6xlv:A 203 68 0.1839 0.0788 0.2353 0.004 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
46 4a8x:A 88 66 0.2299 0.2273 0.3030 0.005
47 6m75:A 167 67 0.2184 0.1138 0.2836 0.011
48 2yka:A 124 82 0.2989 0.2097 0.3171 0.011
49 8i0v:4 161 81 0.2874 0.1553 0.3086 0.012
50 8y6o:W 167 60 0.1839 0.0958 0.2667 0.014
51 5det:B 94 82 0.2414 0.2234 0.2561 0.017 5det:A
52 2xb2:D 89 77 0.2644 0.2584 0.2987 0.025 2xb2:Z
53 8pv1:CI 152 49 0.1494 0.0855 0.2653 0.025 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
54 8ro0:O 342 66 0.2644 0.0673 0.3485 0.027 8ro1:O
55 2rqc:A 115 76 0.2299 0.1739 0.2632 0.032
56 3d2w:A 72 56 0.1954 0.2361 0.3036 0.066
57 6gd2:A 84 67 0.2184 0.2262 0.2836 0.070 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
58 8by6:B 152 67 0.1954 0.1118 0.2537 0.075 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
59 2l41:A 77 32 0.1264 0.1429 0.3438 0.076 2xnr:A
60 5tkz:A 89 83 0.2644 0.2584 0.2771 0.081 5tkz:B
61 6r5k:H 394 61 0.2069 0.0457 0.2951 0.085 6r5k:D, 6r5k:F
62 6r5k:H 394 63 0.2184 0.0482 0.3016 0.64 6r5k:D, 6r5k:F
63 4pkd:B 240 54 0.1954 0.0708 0.3148 0.12 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
64 7uj1:B 270 65 0.1954 0.0630 0.2615 0.14 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
65 6qx9:1K 201 54 0.1954 0.0846 0.3148 0.21 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
66 7pcv:A 116 67 0.2299 0.1724 0.2985 0.24 2lk0:A, 2lk1:A, 7pcv:B, 7pdv:E, 7pdv:A, 7pdv:C, 7pdv:G
67 7qde:B 169 64 0.1954 0.1006 0.2656 0.31 7qdd:B
68 7jfs:A 958 34 0.0920 0.0084 0.2353 0.40 7jnb:A, 7jnd:A, 7jnf:A, 5kdj:B, 5kdj:A, 5kdn:A, 5kds:A, 5kdu:A
69 7awt:G 907 44 0.1609 0.0154 0.3182 1.0 7nyr:G, 7nyu:G, 7nyv:G, 7nz1:G, 7p61:G, 7p62:G, 7p63:G, 7p64:G, 7p69:G, 7p7c:G, 7p7e:G, 7p7j:G, 7p7k:G, 7p7l:G, 7p7m:G, 7z7r:G, 7z7s:G, 7z7t:G, 7z7v:G, 7z80:G, 7z83:G, 7z84:G, 7zc5:G, 7zci:G
70 2n7c:A 89 59 0.1609 0.1573 0.2373 1.1
71 7dco:4 174 64 0.2069 0.1034 0.2812 1.6 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
72 5z43:A 292 38 0.1609 0.0479 0.3684 1.8 5z43:B, 5z44:A, 5z44:B, 5z45:A, 5z45:B, 5z46:A, 5z46:B
73 6uh2:B 255 33 0.1034 0.0353 0.2727 1.8 6uh2:A
74 2bkl:B 677 48 0.1954 0.0251 0.3542 2.2 2bkl:A
75 5vsu:A 387 48 0.1839 0.0413 0.3333 2.3 6aso:A, 2kh9:A, 4n0t:A, 5tf6:A, 5tf6:C
76 2i2y:A 150 78 0.2414 0.1400 0.2692 2.4 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
77 6jbj:A 565 36 0.1839 0.0283 0.4444 3.2 6jbj:B
78 1nup:A 213 29 0.1149 0.0469 0.3448 3.5 1nup:B, 1nuq:A, 1nuq:B, 1nus:A, 1nus:B, 1nut:A, 1nut:B, 1nuu:A, 1nuu:B
79 6grd:A 407 35 0.1609 0.0344 0.4000 4.0 5cnq:A, 5co8:C, 5co8:A, 6grb:A, 6grc:A
80 7mxb:A 672 29 0.1494 0.0193 0.4483 4.3 7mxb:B, 7mxj:A, 7mxk:A
81 7y47:B 767 41 0.1264 0.0143 0.2683 5.8
82 7n7v:A 321 26 0.1149 0.0312 0.3846 6.0 7n7v:B
83 5c91:A 375 99 0.2759 0.0640 0.2424 6.2 2xbf:A
84 7kon:T 126 21 0.1494 0.1032 0.6190 6.5
85 7aoi:XH 402 66 0.2644 0.0572 0.3485 6.5
86 2rok:A 100 29 0.1149 0.1000 0.3448 7.0
87 8h6e:4R 106 84 0.1954 0.1604 0.2024 7.0 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
88 4o2z:A 363 28 0.0920 0.0220 0.2857 7.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417