Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AYQYVNVVTINKVAVIEFNYGRKLNALSKVFIDDLMQALSDLNRPEIRCIILRAPSGSKVFSAGHDIHELPSGGRDPLSY
DDPLRQITRMIQKFPKPIISMVEGSVWGGAFEMIMSSDLIIAASTSTFSMTPVNLGVPYNLVGIHNLTRDAGFHIVKELI
FTASPITAQRALAVGILNHVVEVEELEDFTLQMAHHISEKAPLAIAVIKEELRVLGEAHTMNSDEFERIQGMRRAVYDSE
DYQEGMNAFLEKRKPNFVGH

The query sequence (length=260) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1ef9:A 261 260 0.9962 0.9923 0.9962 0.0 6n92:A, 6n92:B, 6n92:C, 6n92:D, 6n92:E, 6n92:F, 6n93:A, 6n93:B, 6n93:C, 6n93:D, 6n93:E, 6n93:F, 6n94:A, 6n94:B, 6n94:C, 6n94:D, 6n94:E, 6n94:F, 6n95:A, 6n95:B, 6n95:C, 6n95:D, 6n95:E, 6n95:F, 6n96:A, 6n96:B, 6n96:C, 6n96:D, 6n96:E, 6n96:F, 6n97:A, 6n97:B, 6n97:C, 6n97:D, 6n97:E, 6n97:F
2 5zai:C 259 250 0.3077 0.3089 0.3200 1.35e-33 5zai:A, 5zai:B, 5zai:E
3 2hw5:C 260 253 0.3038 0.3038 0.3123 3.03e-33
4 1dub:A 260 263 0.3038 0.3038 0.3004 7.54e-32 1dub:B, 1dub:C, 1dub:E, 1dub:F, 1dub:D, 2dub:A, 2dub:B, 2dub:C, 2dub:E, 2dub:F, 2dub:D, 1ey3:A, 1ey3:B, 1ey3:C, 1ey3:D, 1ey3:E, 1ey3:F, 1mj3:A, 1mj3:B, 1mj3:C, 1mj3:E, 1mj3:F
5 5jbx:B 261 242 0.2654 0.2644 0.2851 1.44e-25 5jbx:A
6 3h81:A 256 262 0.2923 0.2969 0.2901 1.23e-24 3h81:C, 3q0g:C, 3q0g:D, 3q0g:F, 3q0j:C, 3q0j:F
7 6slb:AAA 257 255 0.2769 0.2802 0.2824 3.63e-24 6sla:AAA, 6sla:BBB, 6sla:CCC, 6sla:DDD, 6sla:EEE, 6sla:FFF
8 4i42:A 285 257 0.2692 0.2456 0.2724 2.14e-23 4els:A, 4els:B, 4els:C, 4els:D, 4els:E, 4els:F, 4elw:A, 4elw:B, 4elw:C, 4elw:D, 4elw:E, 4elw:F, 4elx:A, 4elx:B, 4elx:C, 4elx:D, 4elx:F, 3h02:A, 3h02:B, 3h02:C, 3h02:D, 3h02:E, 3h02:F, 4i42:F, 4i42:B, 4i42:D, 4i42:C, 4i42:E, 4i42:G, 4i42:L, 4i42:H, 4i42:J, 4i42:I, 4i42:K, 3t88:A, 3t88:E, 3t88:B, 3t88:F, 3t88:C, 3t88:D
9 2uzf:A 260 260 0.2885 0.2885 0.2885 4.15e-23
10 4i4z:A 275 256 0.2885 0.2727 0.2930 4.17e-19 4eml:A, 4eml:B, 4eml:C, 4eml:D, 4eml:E, 4eml:F, 4i4z:F, 4i4z:B, 4i4z:D, 4i4z:C, 4i4z:E, 4i4z:G, 4i4z:H, 4i4z:I, 4i52:A, 4i52:B, 4i52:C, 4i52:D, 4i52:E, 4i52:F, 4i52:G, 4i52:H, 4i52:I
11 5duf:A 245 258 0.2500 0.2653 0.2519 1.61e-17 5dtw:A, 5dtw:D, 5du4:A, 5du6:A, 5du6:B, 5du6:C, 5du8:A, 5du8:B, 5du8:C, 5duc:A, 5duc:B, 5duc:C
12 3ome:C 247 215 0.2538 0.2672 0.3070 2.24e-17 3ome:A, 3ome:B, 3ome:D, 3ome:E, 3ome:F
13 2vss:B 247 215 0.1923 0.2024 0.2326 9.78e-17 6l3p:A, 6l3p:B, 2vss:D, 2vss:E, 2vss:F, 2vsu:A, 2vsu:B, 2vsu:D, 2vsu:E, 2vsu:F
14 6p5u:E 246 208 0.2154 0.2276 0.2692 3.12e-16 6p5u:A, 6p5u:B, 6p5u:C, 6p5u:D, 6p5u:F
15 1rjn:B 275 252 0.2500 0.2364 0.2579 7.27e-16 1q51:A, 1q51:C, 1q51:D, 1q51:E, 1q51:F, 1q51:G, 1q51:H, 1q51:I, 1q51:J, 1q51:K, 1q51:L, 1rjm:A, 1rjm:B, 1rjm:C, 1rjn:A, 1rjn:C, 3t8a:B, 3t8a:C
16 3t3w:F 248 218 0.2500 0.2621 0.2982 8.42e-16 3t3w:A, 3t3w:B, 3t3w:C, 3t3w:D, 3t3w:E
17 4qii:B 301 264 0.2692 0.2326 0.2652 2.01e-15 1q51:B, 4qii:A, 4qii:F, 4qii:E, 4qii:C, 4qii:D, 4qii:G, 4qii:L, 4qii:H, 4qii:K, 4qii:I, 4qii:J, 4qij:A, 4qij:F, 4qij:B, 4qij:E, 4qij:C, 4qij:D, 4qij:G, 4qij:K, 4qij:H, 4qij:J, 4qij:I, 4qij:L
18 2a81:A 235 188 0.1923 0.2128 0.2660 9.56e-12
19 7xwt:B 277 263 0.2346 0.2202 0.2319 3.52e-09 7xwv:A, 7xwv:B
20 6iun:B 692 183 0.1462 0.0549 0.2077 8.74e-09 6iun:A
21 4izc:B 266 199 0.1846 0.1805 0.2412 3.42e-08 4izc:A, 4izd:A, 4izd:B
22 1jxz:B 269 221 0.1962 0.1896 0.2308 4.00e-08 1jxz:A, 1jxz:C, 1nzy:A, 1nzy:B, 1nzy:C
23 3pe8:A 219 194 0.1769 0.2100 0.2371 1.90e-07
24 5kag:D 423 215 0.2077 0.1277 0.2512 2.71e-07 5kag:A, 5kag:B, 5kag:C, 5kag:E, 5kag:F, 5kag:G, 5kag:H, 5kag:I, 5kag:J, 5kag:K, 5kag:L, 5kah:A, 5kah:B, 5kah:C, 5kah:D, 5kah:E, 5kah:F, 5kah:G, 5kah:H, 5kah:I, 5kah:J, 5kah:K, 5kah:L, 5kaj:A, 5kaj:B, 5kaj:C, 5kaj:D, 5kaj:E, 5kaj:F, 5kaj:G, 5kaj:H, 5kaj:I, 5kaj:J, 5kaj:K, 5kaj:L, 2np9:A, 2np9:B, 2np9:C, 2pg8:A, 2pg8:B, 2pg8:C, 4ylh:A, 4ylh:B, 4ylh:C, 4ylh:D, 4ylh:E, 4ylh:F, 4ylh:G, 4ylh:H, 4ylh:I, 4ylh:J, 4ylh:K, 4ylh:L
25 1wdl:A 715 194 0.1692 0.0615 0.2268 3.21e-07 2d3t:A, 2d3t:B, 1wdk:A, 1wdk:B, 1wdl:B, 1wdm:A, 1wdm:B
26 6eqo:A 1804 203 0.1923 0.0277 0.2463 3.72e-07 6eqo:B
27 3zwa:A 727 178 0.1769 0.0633 0.2584 1.16e-06 5mgb:A, 5mgb:B, 5omo:A, 5omo:B, 2x58:A, 2x58:B, 6z5f:AAA, 6z5f:BBB, 6z5o:AAA, 6z5v:AAA, 6z5v:BBB, 6zib:AAA, 6zib:BBB, 6zic:AAA, 6zic:BBB, 3zw9:A, 3zw9:B, 3zwa:B, 3zwb:A, 3zwb:B, 3zwc:A, 3zwc:B
28 6tnm:A 719 184 0.1692 0.0612 0.2391 1.52e-06
29 7bor:A 247 116 0.1154 0.1215 0.2586 2.70e-06 7bor:C
30 6ysw:A 707 193 0.1654 0.0608 0.2228 1.79e-05
31 1xx4:A 254 169 0.1769 0.1811 0.2722 3.27e-05
32 4hdt:A 340 183 0.1500 0.1147 0.2131 3.56e-05
33 3rrv:B 254 179 0.1731 0.1772 0.2514 5.78e-05 3rrv:A, 3rrv:C, 3rrv:D, 3rrv:E, 3rrv:F
34 3bpt:A 362 180 0.1615 0.1160 0.2333 1.24e-04
35 2j5s:A 250 176 0.1615 0.1680 0.2386 1.53e-04 2j5s:B
36 1szo:D 251 154 0.1615 0.1673 0.2727 3.74e-04 1szo:A, 1szo:B, 1szo:C, 1szo:E, 1szo:F, 1szo:G, 1szo:H, 1szo:I, 1szo:J, 1szo:K, 1szo:L
37 1sg4:B 258 185 0.1731 0.1744 0.2432 0.001
38 8oqs:B 735 198 0.1692 0.0599 0.2222 0.013 4b3i:A, 4b3i:B, 4b3j:A, 4b3j:B, 7o4s:A, 7o4s:B, 7o4t:A, 7o4t:B, 7o4u:A, 7o4u:B, 7o4v:B, 7o4v:A, 8opu:A, 8opu:B, 8opv:A, 8opv:B, 8oql:A, 8oql:B, 8oqn:A, 8oqn:B, 8oqo:A, 8oqo:B, 8oqp:A, 8oqp:B, 8oqq:A, 8oqq:B, 8oqr:A, 8oqr:B, 8oqs:A, 8oqt:B, 8oqt:A, 8oqu:A, 8oqu:B, 8oqv:A, 8oqv:B, 8pf8:A, 8pf8:B
39 6j0p:A 564 179 0.1423 0.0656 0.2067 0.054 6j0p:B, 6j1e:A, 6j1f:A, 6j1f:B, 6j1g:A, 6j1i:A, 6j1j:A
40 7qxa:A 954 51 0.0654 0.0178 0.3333 0.38 7bg9:A, 7qxb:A, 7qxs:A, 7trd:A, 7tre:A, 7trf:A
41 7v99:A 991 51 0.0654 0.0172 0.3333 0.38 5ugw:A
42 8k7v:B 755 42 0.0577 0.0199 0.3571 0.74 8k7v:A, 8k7v:C, 8k7v:D
43 7aor:z 1071 73 0.0808 0.0196 0.2877 1.1
44 6z1p:BI 1413 130 0.1154 0.0212 0.2308 1.3
45 6ftt:A 379 51 0.0692 0.0475 0.3529 1.5 6ftt:C, 6ftt:B, 6ftt:D, 6fu7:B, 6r02:A, 6r02:B, 6r02:C, 6r02:D
46 6a2d:A 519 64 0.0692 0.0347 0.2812 1.9 6a2c:A, 6a2c:B, 6a2d:B
47 8x1c:W 187 48 0.0615 0.0856 0.3333 2.0
48 3upt:A 671 31 0.0385 0.0149 0.3226 3.6 3upt:B
49 8tci:A 283 62 0.0615 0.0565 0.2581 4.5 8tci:D
50 1yge:A 839 58 0.0769 0.0238 0.3448 5.0 3bnb:A, 3bnc:A, 3bnd:A, 3bne:A, 5eeo:A, 1f8n:A, 1fgm:A, 1fgo:A, 1fgq:A, 1fgr:A, 1fgt:A, 3pzw:A, 2sbl:B, 2sbl:A, 7soi:A, 7soi:B, 7soj:A, 7soj:B, 5t5v:A, 5t5v:B, 5tqn:A, 5tqn:B, 5tqo:A, 5tqo:B, 5tqp:A, 5tqp:B, 5tr0:A, 5tr0:B, 4wfo:A, 4wha:A, 1y4k:A
51 1n1z:A 537 53 0.0577 0.0279 0.2830 5.3 1n1b:A, 1n1b:B, 1n1z:B, 1n20:A, 1n20:B, 1n21:A, 1n22:A, 1n22:B, 1n23:A, 1n23:B, 1n24:A, 1n24:B
52 6a1i:A 522 64 0.0654 0.0326 0.2656 6.1 6a1d:A, 6a1e:A, 6a3x:A, 7e9r:B, 7e9r:C, 6k16:A, 6o9p:A
53 3b7r:L 610 68 0.0808 0.0344 0.3088 7.3 5aen:A, 7auz:A, 7av0:A, 7av1:A, 7av2:A, 8ava:A, 8awh:A, 3b7s:A, 3b7t:A, 3b7u:X, 5bpp:A, 3cho:A, 3chp:A, 3chq:A, 3chr:A, 3chs:A, 4dpr:A, 6enb:A, 6enc:A, 6end:A, 3fh5:A, 3fh7:A, 3fh8:A, 3fhe:A, 3fts:A, 3ftu:A, 3ftv:A, 3ftw:A, 3ftx:A, 3fty:A, 3ftz:A, 3fu0:A, 3fu3:A, 3fu5:A, 3fu6:A, 3fud:A, 3fue:A, 3fuf:A, 3fuh:A, 3fui:A, 3fuj:A, 3fuk:A, 3ful:A, 3fum:A, 3fun:A, 5fwq:A, 1gw6:A, 1h19:A, 1hs6:A, 7kze:A, 7kze:B, 7kze:C, 4l2l:A, 7llq:A, 7llq:B, 7llq:C, 4mkt:A, 4ms6:A, 5n3w:A, 5ni2:A, 5ni4:A, 5ni4:B, 5ni4:C, 5ni6:A, 5nia:A, 5nid:A, 5nie:A, 5nie:B, 5nie:C, 6o5h:A, 6o5h:B, 6o5h:C, 8qow:A, 8qpn:A, 8qq4:A, 2r59:A, 4r7l:A, 4rsy:A, 4rvb:A, 8rx3:A, 8rx7:A, 8rx9:A, 1sqm:A, 8twx:A, 8twx:B, 8twx:C, 3u9w:A, 2vj8:A
54 6f6t:B 677 84 0.0923 0.0355 0.2857 7.4 6f6t:A, 6hqf:A, 6hqf:B
55 5xyf:A 192 57 0.0615 0.0833 0.2807 8.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218