BioLiP

>protein
ATNFFIQPITEEAEAYYPPSVITNKRKDLGVDVYCCSDLVLQPGLNIVRLHIKVACEHMGKKCGFKIMARSSMCTHERLL
ILANGIGLIDPGYVGELMLKIINLGDTPVQIWAKECLVQLVAQGDHVPDHINILKRNQIF

The query sequence (length=140) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6lj3:A	164	140	1.0000	0.8537	1.0000	3.91e-103	6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
2	3t64:A	153	109	0.2714	0.2484	0.3486	1.60e-09	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
3	2y8c:C	136	94	0.2500	0.2574	0.3723	3.23e-09	2y8c:B
4	4gcy:A	163	98	0.2429	0.2086	0.3469	3.81e-06	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
5	4a6a:A	189	72	0.1286	0.0952	0.2500	2.50e-04	4a6a:E, 4a6a:B, 4a6a:D, 4a6a:C, 4a6a:F, 4a6a:G, 4a6a:K, 4a6a:H, 4a6a:J, 4a6a:I, 4a6a:L, 2qxx:A, 2qxx:B
6	6hde:B	152	95	0.2000	0.1842	0.2947	0.002	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
7	2ol1:C	125	101	0.1929	0.2160	0.2673	0.005	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
8	6ljj:A	150	101	0.1643	0.1533	0.2277	0.061	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
9	4wrk:A	158	80	0.1714	0.1519	0.3000	0.067	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
10	5cct:A	169	80	0.1714	0.1420	0.3000	0.11	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
11	6mjk:A	144	107	0.1857	0.1806	0.2430	0.14
12	4xjc:A	177	55	0.1143	0.0904	0.2909	0.22	4xjc:E, 4xjc:C, 4xjc:B, 4xjc:F, 4xjc:D
13	1f7r:A	133	102	0.1714	0.1805	0.2353	0.29	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
14	6mao:A	137	103	0.2000	0.2044	0.2718	0.30
15	2bt1:A	254	37	0.1000	0.0551	0.3784	1.4	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
16	4lcd:A	419	48	0.1143	0.0382	0.3333	3.2	4lcd:B
17	4pa0:A	974	104	0.1714	0.0246	0.2308	3.4	4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
18	1ytm:A	517	26	0.0786	0.0213	0.4231	3.4	1ytm:B
19	4pa0:B	920	104	0.1714	0.0261	0.2308	3.5	8qyu:B
20	7n6s:C	147	41	0.1071	0.1020	0.3659	3.6	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
21	8act:A	873	104	0.1714	0.0275	0.2308	4.5	8act:B, 9f6c:B, 8qyp:A, 8qyq:A, 8qyq:B, 8qyr:B
22	1uoc:A	263	71	0.1286	0.0684	0.2535	6.8	1uoc:B
23	5tj3:A	520	17	0.0714	0.0192	0.5882	9.6	5too:A

[Back]