BioLiP

>protein
ASAYQRFEPRAYLRNNYAPPRGDLCNPNGVGPWKLRCLAQTFATGEVSGRTLIDIGSGPTVYQLLSACSHFEDITMTDFL
EVNRQELGRWLQEEPGAFNWSMYSQHACLIEGKGECWQDKERQLRARVKRVLPIDVHQPQPLGAGSPAPLPADALVSAFC
LEAVSPDLASFQRALDHITTLLRPGGHLLLIGALEESWYLAGEARLTVVPVSEEEVREALVRSGYKVRDLRTYIMPAHLQ
TGVDDVKGVFFAWAQKV

The query sequence (length=257) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2an3:B	269	257	1.0000	0.9554	1.0000	0.0	2an3:A, 2an4:A, 2an4:B, 2an5:A, 2an5:B, 4dm3:A, 4dm3:B, 2g70:A, 2g70:B, 2g71:A, 2g71:B, 2g72:A, 2g72:B, 2g8n:A, 2g8n:B, 3hca:A, 3hca:B, 3hcb:A, 3hcb:B, 3hcc:A, 3hcc:B, 3hcd:A, 3hcd:B, 3hce:A, 3hce:B, 3hcf:A, 3hcf:B, 1hnn:A, 1hnn:B, 3kpj:A, 3kpj:B, 3kpu:A, 3kpu:B, 3kpv:A, 3kpv:B, 3kpw:A, 3kpw:B, 3kpy:A, 3kpy:B, 3kqm:A, 3kqm:B, 3kqo:A, 3kqo:B, 3kqp:A, 3kqp:B, 3kqq:A, 3kqq:B, 3kqs:A, 3kqs:B, 3kqt:A, 3kqt:B, 3kqv:A, 3kqv:B, 3kqw:A, 3kqw:B, 3kqy:A, 3kqy:B, 3kr0:A, 3kr0:B, 3kr1:A, 3kr1:B, 3kr2:A, 3kr2:B, 4mik:A, 4mik:B, 4mq4:A, 4mq4:B, 1n7i:A, 1n7i:B, 1n7j:A, 1n7j:B, 2obf:A, 2obf:B, 2ony:A, 2ony:B, 2onz:A, 2onz:B, 2opb:A, 2opb:B, 7twu:A, 7twu:B, 7tx2:A, 7tx2:B, 6ws1:A, 6ws1:B, 1yz3:A, 1yz3:B
2	2i62:B	261	244	0.3813	0.3755	0.4016	6.60e-58	2i62:A, 2i62:C, 2i62:D, 5xvk:A, 5xvk:B, 5yji:A, 5yji:B
3	2a14:A	257	234	0.3696	0.3696	0.4060	3.25e-55
4	6orr:C	273	252	0.3813	0.3590	0.3889	8.17e-54	7bkg:A, 7bkg:B, 7bkg:C, 7bkg:D, 7ble:A, 7ble:B, 7ble:C, 7ble:D, 6chh:A, 6chh:B, 6chh:C, 6chh:D, 7egu:A, 7ehz:A, 7ei2:A, 7et7:A, 7et7:B, 7et7:C, 7et7:D, 7eu5:A, 7eu5:B, 7eu5:C, 7eu5:D, 2iip:A, 2iip:B, 2iip:C, 2iip:D, 7nbj:A, 7nbj:B, 7nbj:C, 7nbj:D, 7nbm:A, 7nbm:B, 7nbm:C, 7nbm:D, 7nbq:A, 7nbq:B, 7nbq:C, 7nbq:D, 6orr:A, 6orr:B, 6orr:D, 6pve:A, 6pve:B, 6pve:C, 6pve:D, 6pvs:A, 6pvs:B, 6pvs:C, 6pvs:D, 7rkk:A, 7rkk:B, 7rkl:A, 7rkl:B, 7rkl:C, 7rkl:D, 3rod:A, 3rod:B, 3rod:C, 3rod:D, 7sok:C, 7sok:A, 7sok:B, 7sok:D, 7wmc:A, 7wmc:B, 7wmt:A, 5xvq:A, 5xvq:B, 5yjf:A, 5yjf:B, 5yjf:C, 5yjf:D
5	8u9f:A	271	66	0.0778	0.0738	0.3030	0.68	8u48:B, 8u48:A
6	6uv8:A	183	58	0.0661	0.0929	0.2931	0.69	6uvb:A
7	7z8g:A	3047	92	0.1089	0.0092	0.3043	2.6	8fdu:A, 7z8l:f
8	7z8f:e	4579	44	0.0661	0.0037	0.3864	2.6	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
9	8ptk:f	4502	44	0.0661	0.0038	0.3864	2.7	8ptk:e
10	8dyu:A	2562	92	0.1089	0.0109	0.3043	2.8	8dyv:A
11	8fcy:A	2864	92	0.1089	0.0098	0.3043	2.8	8fd6:A, 8fdt:A
12	5nug:A	2920	92	0.1089	0.0096	0.3043	3.0	5nug:B
13	8pqw:A	2892	92	0.1089	0.0097	0.3043	3.1	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
14	7cpx:A	2262	105	0.1051	0.0119	0.2571	3.7	7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
15	8apo:Bb	236	58	0.0739	0.0805	0.3276	5.7
16	3ofk:A	204	56	0.0661	0.0833	0.3036	5.8	3ofk:B, 3ofk:C, 3ofk:D
17	6k8d:A	290	56	0.0778	0.0690	0.3571	6.0	6ikz:B, 6k8d:B, 6k8d:C, 6k8d:D, 6knj:A, 6knj:B, 6knl:A, 6knl:B
18	5thy:A	387	45	0.0623	0.0413	0.3556	6.5	5thy:B, 5thz:B, 5thz:A
19	6mvj:A	213	44	0.0739	0.0892	0.4318	6.5
20	8pnu:G	155	48	0.0623	0.1032	0.3333	8.3	8pnu:H, 8pnu:I, 8pnu:A, 8pnu:B, 8pnu:C, 8pnv:A, 8pnv:C, 8pnv:B, 8pnv:G, 8pnv:I, 8pnv:H

[Back]