Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ARIEEEELTLTILRLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKLLEVNGVALQGAEHHEAVEALRTA
VQMRVWRE

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8b82:A 108 95 1.0000 0.8148 0.9263 8.21e-54 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
2 5wou:A 95 82 0.5114 0.4737 0.5488 4.83e-28
3 6xa7:B 96 67 0.4318 0.3958 0.5672 1.24e-18 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
4 1n7t:A 103 79 0.3750 0.3204 0.4177 1.31e-14 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
5 3ch8:A 190 79 0.3750 0.1737 0.4177 4.84e-14 2qbw:A
6 6q0m:B 94 79 0.3523 0.3298 0.3924 5.69e-13
7 4wyu:A 201 65 0.3750 0.1642 0.5077 1.09e-12 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
8 4wyu:A 201 70 0.4318 0.1891 0.5429 3.71e-12 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
9 8cn1:H 101 93 0.4659 0.4059 0.4409 1.03e-11 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
10 2l4t:A 124 71 0.3409 0.2419 0.4225 2.17e-11 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
11 2ka9:A 189 91 0.4545 0.2116 0.4396 1.62e-10 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 2ka9:A 189 70 0.3182 0.1481 0.4000 4.78e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
13 7p73:A 420 89 0.4205 0.0881 0.4157 7.23e-10 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
14 7pc3:A 405 65 0.3409 0.0741 0.4615 1.08e-09 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
15 5heb:A 119 69 0.3636 0.2689 0.4638 1.50e-09 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
16 7qqm:A 413 79 0.3409 0.0726 0.3797 1.81e-09
17 3jxt:A 96 72 0.3409 0.3125 0.4167 2.34e-09 3jxt:B
18 8bq8:C 93 65 0.3068 0.2903 0.4154 9.04e-09 8bq8:A, 8bq8:B
19 7x2e:A 163 66 0.2955 0.1595 0.3939 1.02e-08 2kbs:A
20 2m0z:A 97 82 0.3636 0.3299 0.3902 1.92e-08 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
21 2r4h:C 98 66 0.2614 0.2347 0.3485 2.40e-08
22 2os6:A 89 48 0.2045 0.2022 0.3750 1.25e-07
23 2m0v:A 128 45 0.2159 0.1484 0.4222 1.84e-07
24 2koh:A 111 68 0.2841 0.2252 0.3676 3.71e-07 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
25 8bv7:A 95 60 0.2841 0.2632 0.4167 6.68e-07 8buw:A, 8buw:B
26 8c1t:A 90 91 0.3409 0.3333 0.3297 1.06e-06 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
27 4e34:A 87 65 0.3409 0.3448 0.4615 2.16e-06 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
28 6x23:A 89 80 0.2727 0.2697 0.3000 3.17e-06
29 7pcb:A 415 42 0.2386 0.0506 0.5000 5.29e-06 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
30 2egn:A 83 45 0.1932 0.2048 0.3778 7.81e-06
31 8blu:B 195 59 0.2386 0.1077 0.3559 1.51e-05 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
32 3tsz:A 341 48 0.2386 0.0616 0.4375 1.96e-05 3shw:A
33 7qqn:C 414 81 0.3068 0.0652 0.3333 2.29e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
34 4xh7:A 110 44 0.2273 0.1818 0.4545 3.90e-05
35 2i0i:A 81 69 0.3409 0.3704 0.4348 1.04e-04 2i0i:B, 2i0i:C
36 7p70:A 407 67 0.3182 0.0688 0.4179 1.20e-04 7pc4:A, 7qql:A
37 4xhv:A 94 86 0.2955 0.2766 0.3023 1.59e-04
38 2pdz:A 86 66 0.3068 0.3140 0.4091 1.68e-04
39 8sxg:A 366 51 0.2273 0.0546 0.3922 1.80e-04 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
40 1n7f:A 86 78 0.2727 0.2791 0.3077 3.39e-04 1n7f:B
41 2qt5:A 194 49 0.2273 0.1031 0.4082 3.41e-04 2qt5:B
42 2qt5:A 194 68 0.2386 0.1082 0.3088 0.81 2qt5:B
43 2m0u:A 117 66 0.2500 0.1880 0.3333 3.72e-04
44 6yx0:B 112 43 0.2045 0.1607 0.4186 4.62e-04 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
45 6ew9:A 305 59 0.2273 0.0656 0.3390 8.18e-04 6ew9:B, 6ew9:C, 3gcn:A, 3gco:A, 3gds:A, 3gdu:A, 3gdu:C, 3gdv:A, 3gdv:C, 2r3y:B, 2r3y:C, 1soz:A, 1soz:B
46 2kqf:A 96 54 0.2273 0.2083 0.3704 0.001 2kyl:A
47 2kaw:A 90 69 0.2955 0.2889 0.3768 0.001 6lcb:A, 2mx6:A
48 1l6o:A 95 69 0.2841 0.2632 0.3623 0.001 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
49 6gbe:A 119 35 0.1818 0.1345 0.4571 0.002
50 1ihj:B 95 67 0.2045 0.1895 0.2687 0.004 1ihj:A
51 5f67:A 98 47 0.2273 0.2041 0.4255 0.004 5f67:B
52 2exg:A 101 80 0.3068 0.2673 0.3375 0.005 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
53 7xft:A 86 57 0.1818 0.1860 0.2807 0.007
54 5oak:A 90 61 0.2159 0.2111 0.3115 0.007 5oak:C
55 6kz1:A 97 72 0.2841 0.2577 0.3472 0.009 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
56 7d6f:A 87 56 0.2045 0.2069 0.3214 0.012
57 4c2c:A 433 61 0.1932 0.0393 0.2787 0.014 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
58 6zbq:A 89 69 0.2614 0.2584 0.3333 0.018 6zc4:A
59 6ezi:A 86 47 0.1818 0.1860 0.3404 0.018 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
60 4ynn:A 400 62 0.1818 0.0400 0.2581 0.021 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
61 4wsi:A 372 46 0.1705 0.0403 0.3261 0.036 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
62 5t63:A 283 44 0.2045 0.0636 0.4091 0.041 5b6l:A, 5gnd:A
63 4gvc:A 94 30 0.1250 0.1170 0.3667 0.042 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
64 3pv3:A 392 59 0.1705 0.0383 0.2542 0.069 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
65 7xs0:A 376 82 0.2500 0.0585 0.2683 0.083
66 7xs0:A 376 32 0.1477 0.0346 0.4062 0.40
67 3cs0:A 392 60 0.1818 0.0408 0.2667 0.083 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
68 3cs0:A 392 29 0.1364 0.0306 0.4138 0.37 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
69 7co7:D 329 32 0.1477 0.0395 0.4062 0.19 7co2:A, 7co3:A, 7co5:H, 7co5:B, 7co5:D, 7co5:F, 7co5:J, 7co5:L
70 3gdv:B 284 27 0.1364 0.0423 0.4444 0.20 3gdu:B, 2r3y:A, 4rqz:A, 4rqz:B, 4rqz:C
71 1rzx:A 98 45 0.1818 0.1633 0.3556 0.21 5i7z:A, 1x8s:A
72 1u38:A 89 34 0.1250 0.1236 0.3235 0.28
73 7w6z:A 414 26 0.1136 0.0242 0.3846 0.32 7w6y:A
74 3o5n:E 92 43 0.2159 0.2065 0.4419 0.37
75 5izu:A 124 43 0.2159 0.1532 0.4419 0.55 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
76 4ydp:A 83 44 0.1477 0.1566 0.2955 0.66 4ydp:B
77 5zys:A 90 51 0.1818 0.1778 0.3137 0.72
78 3dpm:A 522 40 0.1932 0.0326 0.4250 1.1 3dpm:B
79 8j9c:A 605 42 0.1705 0.0248 0.3571 1.1 8j9c:B, 8j9c:C, 8j9c:D, 8j9d:A, 8j9d:B, 8j9d:C, 8j9d:D
80 8tun:C 258 49 0.1932 0.0659 0.3469 1.2 8tt3:C, 8tt3:D, 8tun:D
81 8kic:A 300 33 0.1477 0.0433 0.3939 2.0 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
82 4fgm:A 587 59 0.1932 0.0290 0.2881 5.8
83 3wev:B 681 25 0.1250 0.0162 0.4400 6.8 3wev:A
84 3bpu:A 86 28 0.1136 0.1163 0.3571 8.2
85 2v0n:A 459 39 0.1705 0.0327 0.3846 8.9 2v0n:B, 1w25:A, 1w25:B, 2wb4:A, 2wb4:B
86 2ejy:A 85 54 0.1591 0.1647 0.2593 9.3
87 1e3a:B 560 23 0.1364 0.0214 0.5217 9.4 1ai4:B, 1ai5:B, 1ai6:B, 1ai7:B, 1ajn:B, 1ajp:B, 1ajq:B, 1fxh:B, 1fxv:B, 1gk9:B, 1gkf:B, 1gm7:B, 1gm8:B, 1gm9:B, 1h2g:B, 1jx9:B, 1k5q:B, 1k5s:B, 1k7d:B, 1kec:B, 1pnk:B, 1pnl:B, 1pnm:B
88 7efl:A 987 24 0.1250 0.0111 0.4583 9.8 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417