BioLiP

>protein
AQTTLMLSQKSDVNYLGWSTDESKVARQEVYRGTTSNPDLRERIAVLDAETRTFKDALNYWYWVDVVSENQAQVVSNAVT
TASECKPGATFENRTVDCGGVTIGTSCPKPLIILKNATVKNLRISASGGADGIHCDSGNCTIENVIWEDICEDAATNNGK
TMTIVGGIAHNADKVLQHNSKNSTTVVKGNFTLTGEHGKLWRSCGDCSNNGGPRFLTVTSATVNGTIDSIAGVNRNYGDV
ATISGLKIKNYKEGKPPVCEEFKGVVKGQGSTEKYGEKWDTTNCKVSRSGVSKL

The query sequence (length=294) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3b8y:B	294	294	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	3b4n:A	314	314	1.0000	0.9363	0.9363	0.0	3b4n:B, 3b8y:A, 3b90:A, 3b90:B
3	4u49:B	318	316	0.6871	0.6352	0.6392	2.37e-137
4	1ee6:A	197	100	0.1531	0.2284	0.4500	4.20e-11
5	4yz0:A	198	101	0.1497	0.2222	0.4356	1.10e-08	4ew9:A, 4ew9:B, 3t9g:A, 3t9g:B, 4yz0:B, 4yza:A, 4yza:B, 4yzq:A, 4yzq:B, 4yzx:A, 4yzx:B, 4z03:A, 4z03:B, 4z05:A, 4z05:B, 4z06:A, 4z06:B
6	3fn0:H	221	114	0.1054	0.1403	0.2719	7.5
7	3wr5:A	401	90	0.0714	0.0524	0.2333	7.8	6juj:A, 6juj:B, 6juk:A, 6juk:B, 2nad:A, 2nad:B, 8oq2:A, 8oq2:B, 8oq2:C, 8oq2:D, 8oq2:E, 8oq2:F, 3wr5:B, 3wr5:C
8	1d7l:A	394	34	0.0374	0.0279	0.3235	8.0	1bf3:A, 1bgj:A, 1bgn:A, 1bkw:A, 1cc4:A, 1cc6:A, 1cj2:A, 1cj3:A, 1cj4:A, 1dob:A, 1doc:A, 1dod:A, 1doe:A, 1ius:A, 1iut:A, 1iuu:A, 1iuv:A, 1iuw:A, 1iux:A, 6ju1:A, 1k0i:A, 1k0j:A, 1k0l:A, 1pbb:A, 1pbc:A, 1pbd:A, 1pbe:A, 1pbf:A, 1pdh:A, 1phh:A, 2phh:A, 1pxa:A, 1pxb:A, 1pxc:A, 8y2s:A, 1ykj:A, 1ykj:B
9	7vo5:A	276	69	0.0510	0.0543	0.2174	9.3
10	6d57:B	151	20	0.0340	0.0662	0.5000	9.5	6d57:A, 4ets:A, 4ets:B

[Back]