BioLiP

>protein
APGETKEDIARKEQLKSLLPPLDNIINLYDFEYLASQTLTKQAWAYYSSGANDEVTHRENHNAYHRIFFKPKILVDVRKV
DISTDMLGSHVDVPFYVSATALCKLGNPLEGEKDVARGCGQGVTKVPQMISTLASCSPEEIIEAAPSDKQIQWYQLYVNS
DRKITDDLVKNVEKLGVKALFVTVDAPSLGQREKDMKLKFSNGASRALSKFIDPSLTWKDIEELKKKTKLPIVIKGVQRT
EDVIKAAEIGVSGVVLSNQGGRQLDFSRAPIEVLAETMPILEQRNLKDKLEVFVDGGVRRGTDVLKALCLGAKGVGLGRP
FLYANSCYGRNGVEKAIEILRDEIEMSMRLLGVTSIAELKPDLLDLSTLKARTVGVPNDVLYNEVYEGPTLTEFED

The query sequence (length=396) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1kbi:A	504	406	0.9975	0.7837	0.9729	0.0	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
2	1ldc:B	382	392	0.9571	0.9921	0.9668	0.0
3	7r4p:A	337	338	0.3586	0.4214	0.4201	3.08e-83	7m2o:A, 2rdt:A, 2w0u:A, 2w0u:B, 2w0u:C, 2w0u:D, 6w44:A, 6w45:A, 6w4c:A
4	5zbm:B	353	353	0.3434	0.3853	0.3853	2.44e-81	1al7:A, 1al8:A, 1gox:A, 1gyl:A, 5zbm:A
5	6gmb:A	362	364	0.3611	0.3950	0.3929	6.14e-80	6gmc:A, 2nzl:A, 5qib:A, 5qic:A, 5qid:A, 5qie:A, 5qif:A, 5qig:A, 5qih:A, 7r4n:A, 7r4o:A, 2rdu:A, 2rdw:A
6	3sgz:A	336	346	0.3460	0.4077	0.3960	5.48e-78	3sgz:B, 3sgz:C, 1tb3:A, 1tb3:B, 1tb3:C, 1tb3:D, 1tb3:E, 1tb3:F, 1tb3:G, 1tb3:H
7	6a08:A	335	337	0.3056	0.3612	0.3591	7.35e-60	6a00:A, 6a01:A, 6a0b:A, 6a0d:A, 6a0g:A, 6a0m:A, 6a0o:A, 6a0v:A, 6a0y:A, 6a11:A, 6a13:A, 6a19:A, 6a1a:A, 6a1b:A, 6a1h:A, 6a1l:A, 6a1m:A, 6a1n:A, 6a1p:A, 6a1r:A, 6a1w:A, 6a21:A, 6a23:A, 6a36:A, 6a39:A, 6a3d:A, 6a3t:A, 6a4g:A, 6a4h:A, 6ai7:A, 7bsr:A, 5zzr:A, 5zzs:A, 5zzt:A, 5zzx:A, 5zzy:A, 5zzz:A
8	5zzq:A	355	357	0.3106	0.3465	0.3445	1.57e-57	6a24:A, 5zzp:A
9	6r9v:A	369	358	0.2879	0.3089	0.3184	2.98e-53	6rhs:A, 6rht:A
10	6m73:A	364	352	0.2803	0.3049	0.3153	9.36e-52	6m74:A
11	1huv:A	349	360	0.2778	0.3152	0.3056	1.22e-49
12	2j6x:H	348	343	0.2677	0.3046	0.3090	2.81e-46	8ufy:B, 2zfa:B
13	6bfg:A	373	383	0.2778	0.2949	0.2872	1.85e-45	2a7n:A, 2a7p:A, 2a85:A, 6bfg:B, 3giy:A, 1p4c:A, 1p5b:A
14	6dvh:A	394	378	0.2677	0.2690	0.2804	6.26e-45	6dvh:B, 6dvh:C, 6dvh:D, 6dvh:E, 6dvh:F, 6dvi:A, 6dvi:B, 6dvi:C, 6dvi:E, 6dvi:F
15	2du2:A	374	360	0.2677	0.2834	0.2944	6.48e-43	2du2:B, 2du2:C, 2du2:D, 2e77:A, 2e77:B, 2e77:C, 2e77:D, 5ebu:A, 5ebu:B, 5ebu:C, 5ebu:D, 5ebu:E, 5ebu:F, 5ebu:G, 5ebu:H, 7f1y:A, 7f1y:B, 7f20:A, 7f20:B, 7f21:A, 7f21:B, 7f22:A, 7f22:B, 2j6x:A, 2j6x:B, 2j6x:C, 2j6x:D, 2j6x:E, 2j6x:F, 2j6x:G, 2nli:A, 4rje:A, 4rje:B, 4rje:C, 4rje:D, 8ufy:A, 4yl2:A, 4yl2:B, 4yl2:C, 4yl2:D, 2zfa:A
16	6dvi:D	338	343	0.2475	0.2899	0.2857	1.16e-41
17	2nli:B	326	343	0.2551	0.3098	0.2945	4.65e-39
18	4n02:A	332	313	0.2071	0.2470	0.2620	2.65e-11
19	1p0k:B	309	142	0.0960	0.1230	0.2676	3.32e-09	1p0k:A, 1p0n:A, 1p0n:B
20	1ea0:A	1452	81	0.0606	0.0165	0.2963	0.004	1ea0:B
21	6s6t:A	1472	81	0.0606	0.0163	0.2963	0.004	6s6s:A, 6s6s:B, 6s6s:C, 6s6s:D, 6s6t:B, 6s6t:C, 6s6t:D, 6s6u:A, 6s6u:B, 6s6u:C, 6s6u:D, 6s6u:E, 6s6u:F, 6s6x:A, 6s6x:B, 6s6x:C, 6s6x:D, 6s6x:E, 6s6x:F, 2vdc:A, 2vdc:B, 2vdc:C, 2vdc:D, 2vdc:E, 2vdc:F
22	3q94:A	285	94	0.0606	0.0842	0.2553	0.021	3q94:B
23	1ofd:A	1491	60	0.0480	0.0127	0.3167	0.023	1ofd:B, 1ofe:A, 1ofe:B
24	1llw:A	1475	60	0.0480	0.0129	0.3167	0.024	1llz:A, 1lm1:A
25	3b03:B	364	66	0.0530	0.0577	0.3182	0.048	3b03:A, 3b03:C, 3b03:D, 3b04:A, 3b04:B, 3b04:C, 3b04:D, 3b05:A, 3b05:B, 3b05:C, 3b05:D, 3b06:A, 3b06:B, 3b06:C, 3b06:D, 3vkj:A, 3vkj:B, 3vkj:C, 3vkj:D, 2zru:A, 2zru:B, 2zru:C, 2zru:D, 2zrv:A, 2zrv:B, 2zrv:C, 2zrv:D, 2zrw:A, 2zrw:B, 2zrw:C, 2zrw:D, 2zrx:A, 2zrx:B, 2zrx:C, 2zrx:D, 2zry:A, 2zry:B, 2zry:C, 2zry:D, 2zrz:A, 2zrz:B, 2zrz:C, 2zrz:D
26	1zfj:A	476	93	0.0631	0.0525	0.2688	0.56
27	8p4q:E	390	40	0.0379	0.0385	0.3750	0.73	8p37:A, 8p4q:A, 8p4q:B, 8p4q:C, 8p4q:D, 8p4q:F, 8p4q:G, 8p4q:H
28	3n9s:A	307	77	0.0480	0.0619	0.2468	1.2	3c4u:A, 3c4u:B, 3c52:A, 3c52:B, 3c56:A, 3c56:B, 3n9r:A, 3n9r:B, 3n9r:K, 3n9r:P, 3n9r:U, 3n9r:Z, 3n9r:e, 3n9r:j, 3n9s:B, 5uck:A, 5uck:B, 5ucn:A, 5ucn:B, 5ucp:A, 5ucp:B, 5ucs:A, 5ucs:B, 5ucz:A, 5ucz:B, 5ud0:B, 5ud2:A, 5ud2:B, 5ud3:A, 5ud3:B, 5ud4:A, 5ud4:B, 5vjf:A, 5vjf:B
29	5mcp:E	387	66	0.0505	0.0517	0.3030	1.2	5mcp:G
30	7puk:A	425	48	0.0556	0.0518	0.4583	1.7	7puj:A, 7puk:C
31	1eep:A	314	30	0.0328	0.0414	0.4333	1.9
32	2cu0:A	358	29	0.0354	0.0391	0.4828	2.0	2cu0:B
33	4to8:A	279	80	0.0556	0.0789	0.2750	2.0	4to8:B
34	1hg3:A	224	58	0.0480	0.0848	0.3276	2.1	1hg3:B, 1hg3:C, 1hg3:D, 1hg3:E, 1hg3:F, 1hg3:G, 1hg3:H
35	1jcn:A	395	70	0.0505	0.0506	0.2857	2.2	1jcn:B
36	3usb:B	401	35	0.0379	0.0374	0.4286	2.5
37	3tsb:A	490	35	0.0379	0.0306	0.4286	2.6	3tsd:A, 3usb:A
38	3tsd:B	426	35	0.0379	0.0352	0.4286	2.6
39	3tsb:B	434	35	0.0379	0.0346	0.4286	2.7
40	4myx:G	356	35	0.0379	0.0421	0.4286	3.4	6mgu:A, 6mgu:B, 7mtu:A, 7mtu:C, 7mtu:B, 7mtu:D, 7mtu:E, 7mtu:G, 7mtu:F, 7mtu:H, 7mtx:A, 7mtx:C, 7mtx:B, 7mtx:D, 7mtx:E, 7mtx:G, 7mtx:F, 7mtx:H, 4my1:A, 4my1:C, 4my1:B, 4my1:D, 4my1:E, 4my1:F, 4my1:G, 4my1:H, 4my8:A, 4my8:B, 4my8:C, 4my8:D, 4my9:A, 4my9:C, 4my9:B, 4my9:D, 4my9:E, 4my9:F, 4my9:H, 4my9:G, 4mya:A, 4mya:B, 4myx:A, 4myx:C, 4myx:B, 4myx:D, 4myx:E, 4myx:F, 4myx:H, 4qm1:A, 4qm1:B, 4qm1:D, 4qm1:C, 5urs:A, 5urs:C, 5urs:B, 5urs:D, 5urs:E, 5urs:G, 5urs:F, 5urs:H, 5uuv:A, 5uuv:D, 5uuv:B, 5uuv:C, 5uuz:A, 5uuz:C, 5uuz:B, 5uuz:D, 5uuz:E, 5uuz:G, 5uuz:F, 5uuz:H
41	4hy7:A	170	42	0.0429	0.1000	0.4048	3.7
42	1b3o:A	304	71	0.0480	0.0625	0.2676	3.8
43	7mfm:G	1483	54	0.0455	0.0121	0.3333	3.8	7mfm:H, 7mft:G
44	2vyo:A	206	56	0.0455	0.0874	0.3214	3.9
45	7rfh:H	451	69	0.0505	0.0443	0.2899	4.1	7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
46	5mcp:C	446	67	0.0505	0.0448	0.2985	4.7	5mcp:A, 5mcp:B, 5mcp:D, 6rpu:A
47	6e2a:A	326	49	0.0379	0.0460	0.3061	4.9	2gjl:A, 2gjn:A
48	1b3o:B	410	71	0.0480	0.0463	0.2676	5.4
49	9c4m:A	335	33	0.0328	0.0388	0.3939	5.6	9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
50	4jej:A	241	67	0.0606	0.0996	0.3582	6.1
51	4ii4:A	304	54	0.0404	0.0526	0.2963	6.8	4iit:A, 3pvr:A, 3pvt:A, 3pvy:A, 3pw1:A, 3pw8:C, 3pw8:D
52	6gaw:BT	240	85	0.0556	0.0917	0.2588	7.8	5aj4:BT, 6gb2:BT, 7nqh:BT, 7nql:BT, 7nsh:BT, 7nsi:BT, 7nsj:BT, 8oin:BX, 8oiq:BX, 4v19:T, 6ydp:BT, 6ydw:BT
53	4jjm:A	170	42	0.0404	0.0941	0.3810	8.2	4jjm:B
54	7t09:B	497	31	0.0253	0.0201	0.3226	8.2	3q73:B, 3q75:B, 3q78:B, 3q79:B, 3q7a:B, 3q7f:B, 3sfx:B, 3sfy:B, 7t08:B, 7t0a:B, 7t0b:B, 7t0c:B, 7t0d:B, 7t0e:B, 8t70:B
55	5zue:A	309	54	0.0379	0.0485	0.2778	8.3	4kwe:A, 4kwe:B, 4kwe:C, 2q1y:A, 1rlu:A, 1rq7:A, 5v68:B, 5v68:E, 6y1u:A, 6y1u:B, 6y1v:A, 6y1v:B, 6ym1:A, 6ym9:A
56	5bmp:A	449	44	0.0303	0.0267	0.2727	8.5	5bmn:A, 5kl0:A, 6mlf:A, 6mlh:A, 6mlw:A, 6mnv:A, 6n1e:A, 6nn1:A, 6nn2:A, 6nnn:A, 6nno:A, 6nnp:A, 6nns:A, 6nnt:A, 6nnu:A, 6nol:A, 6noq:A, 6np8:A, 6npx:A, 6nqe:A, 6nqf:A, 6nqg:A, 6nqh:A
57	4qq3:A	302	42	0.0379	0.0497	0.3571	9.9

[Back]