Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ANTSSAYNSVYDFLRYHDRGDGLTVNGKTSYSIDQAAAQITRENVSWNGTNVFGKSANLTFKFLQSVSSIPSGDTGFVKF
NAEQIEQAKLSLQSWSDVANLTFTEVTGNKSANITFGNYTRDASGNLDYGTQAYAYYPGNYQGAGSSWYNYNQSNIRNPG
SEEYGRQTFTHEIGHALGLAHPGEYNAGEGDPSYNDAVYAEDSYQFSIMSFWGENETGADYNGHYGGAPMIDDIAAIQRL
YGANMTTRTGDSVYGFNSNTDRDFYTATDSSKALIFSVWDAGGTDTFDFSGYSNNQRINLNEGSFSDVGGLKGNVSIAHG
VTIENAIGGSGNDILVGNSADNILQGGAGNDVLYGGAGADTLYGGAGRDTFVYGSGQDSTVAAYDWIADFQKGIDKIDLS
AFRNEGQLSFVQDQFTGKGQEVMLQWDAANSITNLWLHEAGHSSVDFLVRIVGQAAQSDIIV

The query sequence (length=462) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1go7:P 462 462 0.9935 0.9935 0.9935 0.0 1go8:P, 3hb2:P, 3hbu:P, 1k7g:A, 1k7i:A, 1k7q:A
2 3hda:P 382 419 0.8268 1.0000 0.9117 0.0 3hbv:P
3 1af0:A 470 469 0.6299 0.6191 0.6205 0.0 5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A
4 6ixx:A 463 473 0.5390 0.5378 0.5264 2.78e-156 1g9k:A, 1h71:P, 1o0q:A, 1o0t:A, 1om6:A, 1om7:A, 1om8:A, 1omj:A, 3u1r:A
5 1akl:A 470 479 0.5498 0.5404 0.5303 3.80e-156 1jiw:P, 1kap:P, 3vi1:A, 3vi1:B
6 2ml1:A 153 90 0.0844 0.2549 0.4333 1.02e-09
7 7usl:C 715 56 0.0649 0.0420 0.5357 3.73e-09
8 7usl:C 715 74 0.0693 0.0448 0.4324 9.12e-07
9 7usl:C 715 96 0.0736 0.0476 0.3542 1.97e-04
10 7usl:C 715 44 0.0498 0.0322 0.5227 0.001
11 7usl:C 715 45 0.0498 0.0322 0.5111 0.019
12 7usl:C 715 45 0.0476 0.0308 0.4889 0.11
13 7usl:C 715 49 0.0433 0.0280 0.4082 2.0
14 8ja4:A 480 105 0.0887 0.0854 0.3905 1.32e-08 8ja6:A, 8jaz:B, 8jaz:A, 8xfq:A, 8xfr:A
15 6sus:A 258 56 0.0606 0.1085 0.5000 3.98e-07 5cvw:A, 5cxl:A, 5cxl:B
16 6sus:A 258 76 0.0671 0.1202 0.4079 0.001 5cvw:A, 5cxl:A, 5cxl:B
17 7rah:E 360 53 0.0606 0.0778 0.5283 4.51e-07
18 7rah:E 360 114 0.0779 0.1000 0.3158 6.89e-05
19 2ml3:A 181 73 0.0758 0.1934 0.4795 1.02e-06
20 1hv5:E 165 107 0.0801 0.2242 0.3458 1.51e-05 1hv5:A, 1hv5:B, 1hv5:C, 1hv5:D, 1hv5:F
21 2jsd:A 160 192 0.1104 0.3187 0.2656 1.93e-04
22 1su3:B 416 168 0.1017 0.1130 0.2798 4.42e-04 966c:A, 4auo:A, 4auo:B, 1ayk:A, 2ayk:A, 3ayk:A, 4ayk:A, 1cge:A, 1cgf:A, 1cgf:B, 1cgl:A, 1cgl:B, 2clt:A, 2clt:B, 1hfc:A, 2j0t:A, 2j0t:B, 2j0t:C, 3shi:A, 3shi:G, 3shi:M, 1su3:A, 2tcl:A
23 5gwd:A 239 97 0.0714 0.1381 0.3402 0.001 5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
24 1bzs:A 165 149 0.0887 0.2485 0.2752 0.002 1a85:A, 1a86:A, 3dng:A, 3dng:B, 3dpe:A, 3dpf:A, 3dpf:B, 5h8x:A, 1i73:A, 1i76:A, 1jan:A, 1jao:A, 1jap:A, 1jaq:A, 1jh1:A, 1jj9:A, 1kbc:A, 1kbc:B, 1mmb:A, 1mnc:A, 2oy2:A, 2oy2:F, 2oy4:A, 2oy4:F, 4qkz:A, 3tt4:A, 1zp5:A, 1zs0:A, 1zvx:A
25 3a6z:C 616 54 0.0541 0.0406 0.4630 0.002 3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
26 3a6z:C 616 83 0.0584 0.0438 0.3253 0.003 3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
27 3a6z:C 616 60 0.0563 0.0422 0.4333 0.24 3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
28 3a6z:C 616 52 0.0476 0.0357 0.4231 0.46 3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
29 1rm8:A 169 114 0.0693 0.1893 0.2807 0.003
30 5juh:A 137 59 0.0541 0.1825 0.4237 0.005
31 1fbl:A 367 103 0.0693 0.0872 0.3107 0.011
32 2qua:A 615 55 0.0498 0.0374 0.4182 0.070 2qub:A, 2qub:C, 2qub:E, 2qub:G, 2qub:I, 2qub:K
33 2qua:A 615 84 0.0541 0.0407 0.2976 0.095 2qub:A, 2qub:C, 2qub:E, 2qub:G, 2qub:I, 2qub:K
34 1slm:A 226 134 0.0736 0.1504 0.2537 0.23 1b3d:A, 1b3d:B, 1b8y:A, 1biw:A, 1biw:B, 1bm6:A, 1bqo:A, 1bqo:B, 1c3i:A, 1c3i:B, 1c8t:A, 1c8t:B, 1caq:A, 1ciz:A, 1cqr:A, 1cqr:B, 2d1o:A, 2d1o:B, 1d5j:A, 1d5j:B, 1d7x:A, 1d7x:B, 1d8f:A, 1d8f:B, 1d8m:A, 1d8m:B, 4dpe:A, 4dpe:B, 1g05:A, 1g05:B, 1g49:A, 1g49:B, 1g4k:A, 1g4k:B, 1g4k:C, 4g9l:A, 4g9l:B, 1hfs:A, 1hy7:A, 1hy7:B, 4ja1:A, 4ja1:B, 2jnp:A, 2jt5:A, 2jt6:A, 6mav:A, 6n9d:A, 3ohl:A, 3oho:A, 1qia:A, 1qia:B, 1qia:C, 1qia:D, 1qic:A, 1qic:B, 1qic:C, 1qic:D, 7s7l:A, 7s7m:A, 1sln:A, 2srt:A, 1uea:A, 1uea:C, 1ums:A, 1umt:A, 1usn:A, 2usn:A, 3usn:A
35 2ml2:A 161 89 0.0758 0.2174 0.3933 0.41
36 1bqq:M 174 110 0.0649 0.1724 0.2727 0.51 1buv:M, 5h0u:A, 3ma2:D, 3ma2:A
37 6o38:A 573 60 0.0498 0.0401 0.3833 0.57 6o38:B, 6o38:C, 6o38:D, 6o38:E, 6o38:F
38 8h78:A 168 97 0.0628 0.1726 0.2990 0.60 3ayu:A, 8h78:B, 1hov:A, 1qib:A, 7xgj:A, 7xgj:B, 7xgj:C, 7xjo:A, 7xjo:B
39 3d31:A 348 47 0.0390 0.0517 0.3830 0.84 3d31:B
40 3ba0:A 365 105 0.0671 0.0849 0.2952 0.92 8b2n:A, 8b2n:C, 5cxa:A, 5czm:A, 5d2b:A, 5d3c:A, 4efs:A, 3ehx:A, 3ehy:A, 6ekn:A, 6ela:A, 6ela:B, 6ela:C, 6ela:D, 6enm:A, 6enm:B, 6eox:A, 3f15:A, 3f16:A, 3f17:A, 3f18:A, 3f19:A, 3f1a:A, 4gql:A, 4gr0:A, 4gr3:A, 4gr8:A, 4guy:A, 4h30:A, 4h30:B, 4h49:A, 4h49:B, 4h49:C, 4h49:D, 4h76:A, 4h84:A, 4h84:B, 2hu6:A, 4i03:A, 5i0l:A, 5i0l:B, 5i2z:A, 5i2z:B, 5i2z:C, 5i2z:D, 5i3m:A, 5i3m:B, 5i3m:C, 5i3m:D, 5i43:A, 5i43:B, 5i43:C, 5i43:D, 5i4o:A, 5i4o:C, 5i4o:B, 5i4o:D, 4ijo:A, 1jiz:A, 1jiz:B, 1jk3:A, 2jxy:A, 2k2g:A, 2k9c:A, 2krj:A, 5l79:A, 5l7f:A, 5l7f:B, 5lab:A, 3lik:A, 3lil:A, 3lir:A, 3ljg:A, 3lk8:A, 3lka:A, 2mlr:A, 2mls:A, 3n2u:A, 3n2v:A, 5n5j:A, 5n5k:A, 2n8r:A, 3nx7:A, 1os2:A, 1os2:B, 1os2:C, 1os2:D, 1os2:E, 1os2:F, 1os9:A, 1os9:B, 1os9:C, 1os9:D, 1os9:E, 1os9:F, 7ovy:A, 2oxu:A, 2oxw:A, 2oxz:A, 2poj:A, 6rd0:A, 8rij:A, 6rly:A, 1rmz:A, 1ros:A, 1ros:B, 3rts:A, 3rtt:A, 3ts4:A, 3tsk:A, 1utt:A, 1utz:A, 1utz:B, 3uvc:A, 3uvc:B, 2w0d:A, 2w0d:B, 2w0d:C, 2w0d:D, 2wo8:A, 2wo8:B, 2wo8:C, 2wo8:D, 2wo9:A, 2wo9:B, 2wo9:C, 2wo9:D, 2woa:A, 2woa:B, 2woa:C, 2woa:D, 1y93:A, 1ycm:A, 2z2d:A, 1z3j:A
41 1q3a:B 160 134 0.0736 0.2125 0.2537 1.1 4ilw:D, 4ilw:F, 1q3a:A, 1q3a:C, 3v96:B
42 1zm5:A 293 126 0.0628 0.0990 0.2302 1.9 2cdm:A, 2cdm:C, 1omh:A, 1osb:A, 1osb:C, 4pcb:A, 4pcb:C, 1qx0:A, 1s6m:A
43 2c0b:L 488 59 0.0390 0.0369 0.3051 2.3 2vmk:C, 2vrt:A, 2vrt:B
44 4l63:A 249 31 0.0346 0.0643 0.5161 3.5 4l6t:A
45 4fu4:A 368 146 0.0844 0.1060 0.2671 4.1 830c:A, 830c:B, 456c:A, 456c:B, 4a7b:A, 4a7b:B, 5b5o:A, 5b5o:B, 5b5p:A, 5b5p:B, 5bot:A, 5bot:B, 5boy:A, 5boy:B, 5bpa:A, 5bpa:B, 1cxv:A, 1cxv:B, 2d1n:A, 2d1n:B, 2e2d:A, 3elm:A, 3elm:B, 1eub:A, 1fls:A, 1fm1:A, 4fu4:B, 4fvl:A, 4fvl:B, 4g0d:A, 4g0d:B, 4g0d:C, 4g0d:D, 6hv2:A, 3i7g:A, 3i7g:B, 3i7i:A, 3i7i:B, 4jp4:A, 4jp4:B, 4jpa:A, 4jpa:B, 7ju8:A, 7ju8:B, 3kec:A, 3kec:B, 3kej:A, 3kej:B, 3kek:A, 3kek:B, 3kry:A, 3kry:B, 3kry:C, 3kry:D, 4l19:A, 4l19:B, 3ljz:A, 3ljz:B, 3ljz:C, 3ljz:D, 3o2x:A, 3o2x:B, 3o2x:C, 3o2x:D, 2ow9:A, 2ow9:B, 2ozr:A, 2ozr:B, 2ozr:C, 2ozr:D, 2ozr:E, 2ozr:F, 2ozr:G, 2ozr:H, 1pex:A, 2pjt:A, 2pjt:B, 2pjt:C, 2pjt:D, 3tvc:A, 5uwk:A, 5uwk:B, 5uwl:A, 5uwl:B, 5uwm:A, 5uwm:B, 5uwn:A, 5uwn:B, 5uwn:C, 5uwn:D, 5uwn:E, 3wv1:A, 3wv1:B, 3wv2:A, 3wv2:B, 3wv3:A, 3wv3:B, 1xuc:A, 1xuc:B, 1xud:A, 1xud:B, 1xur:A, 1xur:B, 2yig:A, 2yig:B, 1you:A, 1you:B, 1ztq:A, 1ztq:B, 1ztq:C, 1ztq:D, 3zxh:A, 3zxh:B
46 6z7p:A 1025 117 0.0844 0.0380 0.3333 4.5 8bqe:B, 8bqe:C, 8bqe:E, 8bqe:D, 8bqe:F, 8bqe:A, 5n8p:A, 5n8p:B, 5n8p:C, 5n8p:D, 5n8p:E, 5n8p:F, 5n97:A, 5n97:B, 5n97:C, 5n97:D, 5n97:E, 5n97:F, 7peo:A, 6t72:A
47 8aaf:e 1527 143 0.0671 0.0203 0.2168 6.5 8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
48 4j4m:B 200 14 0.0216 0.0500 0.7143 7.0 4j4m:A
49 6ces:A 300 27 0.0260 0.0400 0.4444 8.9 8dhb:B, 6s6a:A, 6s6a:B, 6s6d:A, 6s6d:B, 6sb0:C, 6sb0:I, 6sb2:C, 6sb2:I, 7t3a:K, 7t3b:D, 7t3c:D, 7t3c:K, 6u62:B, 6ulg:F, 7ux2:B, 7ux2:I, 7uxc:D, 7uxc:K, 7uxh:F, 7uxh:M, 7uxh:V, 7uxh:c, 6wj2:F, 6wj3:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218