BioLiP

>protein
AMKVKIYTRNGCPYCVWAKQWFEENNIAFDETIIDDYAQRSKFYDEMNQSGKVIFPISTVPQIFIDDEHIGGFTELKANA
DKILNKK

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3msz:B	87	87	1.0000	1.0000	1.0000	2.48e-62	3msz:A
2	3grx:A	82	75	0.3563	0.3780	0.4133	1.06e-12
3	1grx:A	85	80	0.3563	0.3647	0.3875	1.06e-11	1qfn:A
4	4tr0:A	92	85	0.3448	0.3261	0.3529	2.69e-09	4tr0:B, 4tr1:A, 4tr1:B
5	2ht9:B	111	73	0.2529	0.1982	0.3014	2.89e-06	2fls:A, 2ht9:A
6	3uiw:A	110	74	0.2299	0.1818	0.2703	6.05e-06	3uiw:B
7	5w1j:A	584	84	0.2989	0.0445	0.3095	7.95e-04	5w1j:B, 5w1l:A, 5w1l:B
8	4i2u:A	109	85	0.2874	0.2294	0.2941	0.001
9	3rhc:A	103	72	0.2069	0.1748	0.2500	0.003	3rhb:A, 3rhc:B
10	3d5j:A	112	71	0.2299	0.1786	0.2817	0.003	3d5j:B
11	2e7p:C	115	70	0.1954	0.1478	0.2429	0.004	2e7p:A, 2e7p:B, 2e7p:D
12	3fz9:A	106	79	0.2529	0.2075	0.2785	0.005	3fza:A
13	4n11:A	108	78	0.2299	0.1852	0.2564	0.020	7din:A, 7dio:A, 7dip:A, 7diq:A
14	5kqa:A	110	68	0.1954	0.1545	0.2500	0.023
15	7f75:G	129	28	0.1379	0.0930	0.4286	0.042
16	4rqr:A	107	77	0.2299	0.1869	0.2597	0.046	1b4q:A
17	8a1r:A	593	68	0.2184	0.0320	0.2794	0.049	8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
18	3ir4:A	218	45	0.1839	0.0734	0.3556	0.23
19	4kx4:A	217	37	0.1379	0.0553	0.3243	0.41	7d9l:A, 7dkp:A, 7dkp:B, 7dkp:C, 7dkp:D
20	4ags:A	445	60	0.1839	0.0360	0.2667	0.57	4ags:B, 4ags:C
21	6wmt:S	202	29	0.1264	0.0545	0.3793	0.64	6weg:D
22	2jac:A	108	19	0.1149	0.0926	0.5263	1.8	3c1s:A
23	2qdg:A	366	67	0.1839	0.0437	0.2388	1.9	2qap:A, 2qap:B, 2qap:C, 2qap:D, 2qdg:B, 2qdg:C, 2qdg:D, 2qdh:A, 2qdh:B, 2qdh:C, 2qdh:D
24	7u2r:A	244	78	0.2184	0.0779	0.2436	1.9
25	7d0i:B	424	39	0.1494	0.0307	0.3333	2.1	7d0i:D, 7d0i:F, 7d0i:H, 7d0i:J, 7d0i:L
26	4yd9:A	1656	40	0.1494	0.0079	0.3250	2.1	4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
27	3mm5:B	363	32	0.1264	0.0303	0.3438	3.1	3mm5:E, 3mm6:B, 3mm6:E, 3mm7:B, 3mm7:E, 3mm8:B, 3mm8:E, 3mm9:B, 3mm9:E, 3mma:B, 3mma:E, 3mmb:B, 3mmb:E, 3mmc:B, 3mmc:E
28	6btm:B	948	34	0.1609	0.0148	0.4118	3.3
29	2x3j:A	586	28	0.1149	0.0171	0.3571	6.3	2w02:A, 2w02:B, 2w03:A, 2w03:B, 2w04:B, 2x3j:B, 2x3k:A, 2x3k:B
30	2w98:B	355	41	0.1149	0.0282	0.2439	7.1	2vna:A, 2w4q:A, 2w98:A, 2zb4:A, 2zb7:A, 2zb8:A
31	2br3:F	233	26	0.1264	0.0472	0.4231	7.3	2bm9:A, 2bm9:B, 2bm9:C, 2bm9:D, 2bm9:E, 2bm9:F, 2br3:B, 2br3:C, 2br3:D, 2br3:E, 2br4:A, 2br4:B, 2br4:C, 2br4:D, 2br4:E, 2br4:F, 2br5:A, 2br5:B, 2br5:C, 2br5:D, 2br5:E
32	7q2x:D	994	35	0.1264	0.0111	0.3143	8.5	7q2y:D
33	2wul:A	109	54	0.1724	0.1376	0.2778	9.2	2wul:B, 2wul:C, 2wul:D
34	1e3d:B	537	22	0.1149	0.0186	0.4545	9.2	1e3d:D
35	7qen:D	1050	35	0.1264	0.0105	0.3143	9.2

[Back]