Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ALLTAKTFSLQFNNKRRVNKPYYPRKALLCYQLTPQNGSTPTRGHLINKKEDHAEIRFINEIKSMGLDETQDYQVTCYLT
WSPCPSCAGELVDFIKAHRHLNLRIFASRLYYHWHPNYQEGLLLLCGSQVPVEVMGLPEFTDCWENFVDHKEPPSFNPSE
KLKELDKNSQAIKRRLERIKSR

The query sequence (length=182) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5w3v:A 186 182 0.9945 0.9731 0.9945 3.34e-137 5w3v:B, 5w3v:C, 5w3v:D
2 5z98:B 182 180 0.8077 0.8077 0.8167 2.26e-99 5z98:A
3 5w45:A 181 181 0.7857 0.7901 0.7901 2.89e-95 6b0b:A, 6b0b:E, 6bbo:A, 6bbo:E, 8fvi:A, 5w45:B
4 8j62:A 180 180 0.3462 0.3500 0.3500 5.32e-32 8j62:B
5 7d3v:B 199 193 0.3846 0.3518 0.3627 5.07e-31 7d3v:A, 7d3w:A, 7d3x:A, 8fii:B, 8fii:A, 8fij:A, 8fij:B, 8fik:A, 8fik:B, 8fil:A, 8fil:B, 8fim:B, 8fim:A, 5keg:A, 2m65:A, 5sww:A, 5sww:B, 5sww:C, 5sww:D, 5td5:A, 4xxo:A, 4xxo:B
6 5zva:B 185 164 0.3462 0.3405 0.3841 1.63e-30 4j4j:A, 4j4j:B, 5w2m:A, 5w2m:B, 5w2m:C, 5w2m:D, 5w2m:M, 5w2m:J, 5w2m:K, 5w2m:L, 3wus:A, 3wus:B, 5zva:A, 5zvb:A, 5zvb:B
7 3vm8:A 187 134 0.3187 0.3102 0.4328 6.50e-29 3vm8:B, 3vow:A, 3vow:B
8 2nbq:A 197 193 0.3791 0.3503 0.3575 8.19e-29 5cqd:A, 5cqd:C, 5cqh:A, 5cqi:A, 5cqk:A, 6nfl:A, 7rw6:B, 7rw6:D, 5sxg:A, 5sxg:B, 5sxh:A, 5sxh:B
9 6bwy:B 346 180 0.3626 0.1908 0.3667 1.24e-27 6bwy:A, 6bwy:G, 6bwy:E, 1qzg:A, 1qzg:B, 1qzh:A, 1qzh:B, 1qzh:F, 1qzh:C, 1qzh:D, 1qzh:E
10 8cx1:A 381 186 0.3681 0.1759 0.3602 4.00e-27 8cx0:A, 8cx1:F, 8cx2:A, 8cx2:F, 3e1u:A, 3iqs:A, 3ir2:A, 3ir2:B, 2jyw:A, 6k3j:A, 6k3k:A, 2kbo:A, 2kem:A, 4rov:A, 4rov:B, 4row:A, 3v4j:A, 3v4j:B, 3v4k:A, 3v4k:B
11 8cx1:A 381 155 0.2967 0.1417 0.3484 1.07e-22 8cx0:A, 8cx1:F, 8cx2:A, 8cx2:F, 3e1u:A, 3iqs:A, 3ir2:A, 3ir2:B, 2jyw:A, 6k3j:A, 6k3k:A, 2kbo:A, 2kem:A, 4rov:A, 4rov:B, 4row:A, 3v4j:A, 3v4j:B, 3v4k:A, 3v4k:B
12 6wmc:A 362 187 0.3571 0.1796 0.3476 1.54e-26 6bux:A, 8h0i:A, 8h0i:B, 2mzz:A, 7uxd:A, 6wma:A, 6wmb:A
13 6wmc:A 362 178 0.3352 0.1685 0.3427 1.67e-26 6bux:A, 8h0i:A, 8h0i:B, 2mzz:A, 7uxd:A, 6wma:A, 6wmb:A
14 4iou:B 179 175 0.3407 0.3464 0.3543 7.69e-26 5hx5:A, 5hx5:B, 4iou:A, 4iou:C, 4iou:D
15 7uu5:A 379 191 0.3846 0.1847 0.3665 1.01e-24 8e40:A, 8edj:A, 5k81:A, 5k81:B, 5k81:C, 5k81:D, 5k81:E, 5k81:F, 5k82:A, 5k82:B, 5k82:C, 5k82:D, 5k83:C, 5k83:E, 5k83:A, 5k83:D, 5k83:F, 5k83:B, 6p3x:A, 6p3x:B, 6p3y:A, 6p3y:B, 6p3z:A, 6p3z:B, 6p40:A, 6p40:B, 7uu3:A, 7uu3:B, 7uu4:A, 7uu5:B
16 7uu5:A 379 167 0.3022 0.1451 0.3293 1.38e-23 8e40:A, 8edj:A, 5k81:A, 5k81:B, 5k81:C, 5k81:D, 5k81:E, 5k81:F, 5k82:A, 5k82:B, 5k82:C, 5k82:D, 5k83:C, 5k83:E, 5k83:A, 5k83:D, 5k83:F, 5k83:B, 6p3x:A, 6p3x:B, 6p3y:A, 6p3y:B, 6p3z:A, 6p3z:B, 6p40:A, 6p40:B, 7uu3:A, 7uu3:B, 7uu4:A, 7uu5:B
17 5tkm:A 184 158 0.2857 0.2826 0.3291 1.31e-23 5tkm:B
18 5w0r:A 548 182 0.3297 0.1095 0.3297 7.50e-22 5jj4:C, 5jj4:A, 5jj4:B, 5w0r:B, 5w0u:B, 5w0u:A, 5w0z:B, 5w0z:A, 5w1c:B, 5w1c:A
19 2rpz:A 192 163 0.2802 0.2656 0.3129 1.63e-14
20 2nyt:B 190 168 0.2692 0.2579 0.2917 1.19e-12 2nyt:A, 2nyt:C, 2nyt:D
21 6x91:A 592 132 0.2088 0.0642 0.2879 1.48e-12 6x91:B, 6x91:C, 6x91:E, 6x91:F, 6x91:G
22 6x91:H 558 132 0.2088 0.0681 0.2879 1.73e-12 6x91:D
23 7cph:B 156 83 0.1484 0.1731 0.3253 0.005 7cph:A
24 8e2q:B 160 72 0.1044 0.1187 0.2639 0.18 8e2p:A, 8e2p:B, 8e2p:C, 8e2p:D, 8e2q:A, 8e2q:C, 8e2q:D, 8e2r:A, 8e2r:B, 8e2s:A, 8e2s:B, 8e2s:C, 8e2s:D, 8e2s:E, 8e2s:F, 8e2s:G, 8e2s:H, 6vpc:F
25 5chc:A 895 71 0.0879 0.0179 0.2254 0.83 5ch7:A, 5ch7:C, 5ch7:E, 5chc:C, 5chc:E, 5e7o:A, 5e7o:C, 5e7o:E, 5e7o:G, 5e7o:I, 5e7o:K, 4ydd:A, 4ydd:C, 4ydd:E
26 8i3p:B 166 62 0.0989 0.1084 0.2903 1.0 8i3n:A, 8i3n:B, 8i3n:C, 8i3n:D, 8i3o:A, 8i3o:B, 8i3o:C, 8i3o:D, 8i3p:A, 2o3k:A, 2o3k:B, 1ox7:A, 1ox7:B, 1p6o:A, 1p6o:B, 1rb7:A, 1rb7:B, 1uaq:A, 1uaq:B, 8vlj:A, 8vlj:B, 8vlk:A, 8vlk:B, 8vlk:C, 8vlk:D, 8vll:A, 8vll:B, 8vlm:A, 8vlm:B, 8vlm:C, 8vlm:D, 1ysb:A, 1ysb:B, 1ysd:A, 1ysd:B
27 2bx9:A 53 50 0.0879 0.3019 0.3200 1.1 2bx9:B, 2bx9:C, 2bx9:D, 2bx9:E, 2bx9:F, 2bx9:G, 2bx9:H, 2bx9:I, 2bx9:J, 2bx9:K, 2bx9:L, 2ko8:A, 2ko8:B, 2ko8:C, 2zp8:E, 2zp8:F, 2zp8:G, 2zp8:H, 2zp8:I, 2zp8:J, 2zp9:E
28 7bv5:A 234 42 0.0934 0.0726 0.4048 1.7 7bv5:B
29 8wus:E 453 83 0.1154 0.0464 0.2530 1.9 6b1q:A, 6b1r:A, 6b1s:A, 6b1s:B, 8cs0:A, 1d0e:A, 1d1u:A, 8dw1:A, 8dw8:A, 8dwm:A, 2fjv:A, 2fjw:A, 2fjx:A, 3fsi:A, 2fvp:A, 2fvq:A, 2fvr:A, 2fvs:A, 4hkq:A, 1i6j:A, 4m94:A, 4m95:A, 6mig:A, 6mih:A, 6mik:A, 1n4l:A, 1qai:A, 1qai:B, 1qaj:A, 2r2r:A, 2r2s:A, 2r2t:A, 2r2u:A, 7uyn:A, 7uyo:A, 7uyp:A, 5vbs:A, 8wut:E, 8wuv:E, 4xo0:A, 4xpc:A, 4xpe:A, 8ygj:E, 1ztt:A, 1ztw:A
30 1z3a:A 156 60 0.0989 0.1154 0.3000 2.4 3ocq:A, 1z3a:B
31 6k6s:A 443 62 0.0934 0.0384 0.2742 3.2 6k6s:B
32 1vq2:A 173 41 0.0879 0.0925 0.3902 5.2
33 5adz:A 566 55 0.1044 0.0336 0.3455 6.2 5ae1:A, 5ae1:C, 5ae1:D, 5ae2:A, 4bby:A, 4bc7:A, 4bc9:A, 4bca:A
34 6r7x:A 629 28 0.0549 0.0159 0.3571 6.3 5oc9:A, 5oc9:B, 6r65:A, 6r65:B, 6r7x:B, 6r7y:A, 6r7y:B
35 3wuh:B 350 57 0.0989 0.0514 0.3158 6.7 3wuh:A
36 1w6s:D 72 44 0.0824 0.2083 0.3409 6.9
37 4l9m:A 522 55 0.1099 0.0383 0.3636 8.4

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218