BioLiP

>protein
AKVIEVELNDDYFNPNVITIPINESTTLLLKNKGKSEHTFTIKKLGIDVVVESGKEKNITVKPKSAGTYELICRYHLLKG
MEGKVIVK

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4hcf:B	96	88	1.0000	0.9167	1.0000	3.48e-59	4hcf:A, 4hcg:A, 4hcg:B
2	1iby:A	112	62	0.1591	0.1250	0.2258	4.43e-04	1iby:B, 1iby:C, 1iby:D, 1ibz:A, 1ibz:B, 1ibz:C, 1ibz:D, 1ic0:A, 1ic0:B, 1ic0:C, 1ic0:D, 1ic0:E, 1ic0:F
3	1ov8:A	139	49	0.1705	0.1079	0.3061	0.003	1ov8:B, 1ov8:C, 1ov8:D, 1qhq:A
4	3tu6:A	127	78	0.2841	0.1969	0.3205	0.004
5	1byo:A	99	40	0.1818	0.1616	0.4000	0.076	1byo:B, 1byp:A
6	9pcy:A	99	87	0.2727	0.2424	0.2759	0.10
7	1j5c:A	98	84	0.2500	0.2245	0.2619	0.21	1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
8	2plt:A	98	29	0.1477	0.1327	0.4483	0.27	7zqe:M
9	6kol:A	125	102	0.2727	0.1920	0.2353	0.30	6l9s:A
10	6yez:P	99	87	0.2614	0.2323	0.2644	0.32	6zoo:P
11	7aat:A	401	29	0.1364	0.0299	0.4138	0.39	7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
12	6ptt:A	119	63	0.1932	0.1429	0.2698	0.56	6ptt:B, 6pty:A, 6pty:B
13	4dp0:X	99	87	0.2727	0.2424	0.2759	0.74	4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
14	1pla:A	97	97	0.2841	0.2577	0.2577	0.84	1plb:A
15	1bxu:A	91	87	0.2841	0.2747	0.2874	1.3	1bxv:A
16	1pmy:A	123	77	0.2386	0.1707	0.2727	1.5
17	1ag6:A	99	40	0.1705	0.1515	0.3750	1.8	1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
18	8ajz:B	167	79	0.2273	0.1198	0.2532	1.9	3bvd:B, 2cua:A, 2cua:B, 1ehk:B, 3eh3:B, 3eh4:B, 3eh5:B, 4fa7:B, 4faa:B, 2fwl:B, 4g70:B, 4g71:B, 4g72:B, 4g7q:B, 4g7r:B, 4g7s:B, 4gp4:B, 4gp5:B, 4gp8:B, 8hua:B, 8k65:B, 8k6y:B, 4n4y:B, 5ndc:B, 3qjq:B, 3qjr:B, 3qjs:B, 3qjt:B, 3qju:B, 3qjv:B, 2qpd:B, 2qpe:B, 3s33:B, 3s38:B, 3s39:B, 3s3a:B, 3s3b:B, 3s3c:B, 3s3d:B, 3s8f:B, 3s8g:B, 5u7n:A, 5u7n:B, 5u7n:C, 5u7n:D, 5u7n:E, 5u7n:F, 5u7n:G, 5u7n:H, 1xme:B
19	4r0o:A	106	23	0.1250	0.1038	0.4783	3.0	1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
20	8iuf:C2	196	36	0.1364	0.0612	0.3333	3.1	8iuj:c2, 8iuj:C2
21	8yk5:A	664	42	0.1591	0.0211	0.3333	4.0	8yk5:B
22	6lxe:A	768	16	0.1023	0.0117	0.5625	6.5
23	2bz7:A	102	100	0.2727	0.2353	0.2400	6.5	2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
24	6lxd:A	918	16	0.1023	0.0098	0.5625	6.5	9asm:A, 9asn:A, 9aso:A, 9asp:A, 9asq:A, 6v5b:A, 6v5c:A
25	2vzp:B	127	23	0.1136	0.0787	0.4348	6.6	2vzp:A, 2vzq:A, 2vzq:B, 2vzr:A, 2vzr:B
26	5x7o:A	1247	52	0.1932	0.0136	0.3269	6.9	5x7o:B, 5x7p:B, 5x7p:A, 5x7q:A, 5x7q:B, 5x7r:A, 5x7r:B, 5x7s:A, 5x7s:B
27	2gim:A	106	40	0.1364	0.1132	0.3000	8.0	2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
28	8r0s:A	470	28	0.1250	0.0234	0.3929	8.9
29	7us3:A	428	26	0.1136	0.0234	0.3846	9.0	7us3:B, 7us3:C, 7us3:D
30	6jj7:A	465	29	0.1477	0.0280	0.4483	9.2	6jj7:C, 6jj7:E, 6jj8:C, 6jj8:A, 6jj8:B, 6jj9:C, 6jj9:A, 6jj9:E, 5zqt:A, 5zqt:B, 5zqt:C

[Back]