BioLiP

>protein
AKKWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEIVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISL
WDQSLKPCVKLTPLCCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNSKTFNGSGPCTNVSTVQCTHGIRPVVSTQLL
LNGSLAEEEIVIRSENITDNAKTIIVQLNEAVEINCTRPNNNTRKSIHNIRQAHCNISKARWNETLGQIVAKLEEQFPNK
TIIFNHSSGGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNTTPLFNSTWNNTRTDDYPTGGEQNITLQCRIKQIINMWQGVGKAMYAPPIR
GQIRCSSNITGLLLTRDGGRDQNGTETFRPGGGNMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGIAPTACKRRV

The query sequence (length=385) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6opp:A	389	394	0.9870	0.9769	0.9645	0.0	6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
2	6edu:D	401	423	0.9299	0.8928	0.8463	0.0	6edu:E, 6edu:F
3	6x5b:A	353	383	0.9169	1.0000	0.9217	0.0	6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
4	7n6u:B	595	454	0.8519	0.5513	0.7225	0.0	5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
5	6meo:G	398	403	0.8130	0.7864	0.7767	0.0	6met:G
6	7txd:A	397	403	0.7948	0.7708	0.7593	0.0	7txd:E
7	6ch9:G	448	457	0.8545	0.7344	0.7199	0.0	6mug:G
8	8fae:A	468	467	0.8182	0.6731	0.6745	0.0	8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
9	8czz:A	440	449	0.7766	0.6795	0.6659	0.0	8czz:E, 8czz:I
10	6cm3:D	372	388	0.7688	0.7957	0.7629	0.0	6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
11	4laj:A	343	361	0.7922	0.8892	0.8449	0.0	4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
12	8d53:G	446	447	0.7688	0.6637	0.6622	0.0
13	3tgs:A	345	360	0.7013	0.7826	0.7500	0.0	5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
14	5w4l:G	357	369	0.6987	0.7535	0.7290	0.0	6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
15	4r4n:B	342	359	0.6935	0.7807	0.7437	0.0	4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
16	4xmp:G	337	359	0.7039	0.8042	0.7549	0.0
17	8tgw:A	387	435	0.7455	0.7416	0.6598	0.0
18	4j6r:G	343	362	0.6961	0.7813	0.7403	0.0
19	5fa2:A	336	357	0.6649	0.7619	0.7171	0.0
20	1gc1:G	297	320	0.6597	0.8552	0.7937	1.23e-180
21	5te4:G	341	367	0.6545	0.7390	0.6866	6.58e-176
22	8d0y:G	455	460	0.6909	0.5846	0.5783	2.20e-170	5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
23	7lu9:e	461	308	0.5714	0.4772	0.7143	8.70e-155	7lu9:f
24	7lu9:e	461	92	0.2182	0.1822	0.9130	1.10e-55	7lu9:f
25	7mxd:A	472	308	0.5610	0.4576	0.7013	4.22e-150	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
26	7mxd:A	472	107	0.2208	0.1801	0.7944	1.14e-53	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
27	5fyj:G	479	469	0.6390	0.5136	0.5245	5.85e-149
28	6pwu:A	615	305	0.5532	0.3463	0.6984	3.43e-148	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
29	6pwu:A	615	92	0.2182	0.1366	0.9130	7.55e-54	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
30	6tyb:G	345	366	0.3091	0.3449	0.3251	1.81e-51	3fus:A
31	7t4g:A	493	309	0.2545	0.1988	0.3172	2.38e-39	7t4g:C, 7t4g:E
32	7t4g:A	493	104	0.1221	0.0953	0.4519	7.00e-19	7t4g:C, 7t4g:E
33	2zpa:B	662	59	0.0571	0.0332	0.3729	2.1	2zpa:A
34	3s5m:A	1094	89	0.0545	0.0192	0.2360	2.9	7di7:A, 7dij:A, 8ho4:A, 8ho5:A, 3s5h:A, 7vpe:A, 8wxw:A, 8wxz:A, 8wyu:A
35	7dia:A	1072	89	0.0545	0.0196	0.2360	3.1	3s5k:A, 8wyt:A, 8wyx:A, 8wyy:A
36	3lez:A	260	120	0.0909	0.1346	0.2917	3.2
37	7rsw:B	125	28	0.0312	0.0960	0.4286	3.7
38	1hi9:A	274	45	0.0312	0.0438	0.2667	5.2	1hi9:B, 1hi9:C, 1hi9:D, 1hi9:E
39	7jgr:E	398	41	0.0364	0.0352	0.3415	7.5	7jgs:E, 7jk2:E, 7jk3:E, 7jk4:E, 7jk5:E, 7jk6:E
40	8hud:A	767	50	0.0286	0.0143	0.2200	7.5
41	3atp:A	151	34	0.0208	0.0530	0.2353	9.1	3atp:B

[Back]