BioLiP

>protein
AIRRNMAVFSMSVVSKLTDLTPRQIRYYETHELIKPERTEGQKRLFSLNDLERLLEIKSLLEKGFNIKEIKQIIYD

The query sequence (length=76) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7tea:B	78	76	1.0000	0.9744	1.0000	3.34e-51	7tea:E, 7tea:A, 7tea:C
2	4r4e:B	84	73	0.5395	0.4881	0.5616	4.09e-25
3	7tec:A	72	69	0.5132	0.5417	0.5652	1.16e-21
4	4r24:B	85	68	0.3816	0.3412	0.4265	6.94e-14	4r22:B
5	1r8d:A	109	67	0.2895	0.2018	0.3284	9.86e-06	1r8d:B
6	4wlw:A	130	67	0.2763	0.1615	0.3134	1.39e-05	7c17:G, 7c17:H, 6ldi:G, 6ldi:H, 1q05:A, 1q05:B, 4wls:A, 4wls:B, 6xh7:G, 6xh7:H, 6xh8:G, 6xh8:H
7	5c8d:E	280	59	0.2895	0.0786	0.3729	2.62e-05	8c31:A, 8c31:B, 8c31:C, 8c31:D, 8c32:A, 8c32:B, 8c32:C, 8c32:D, 8c33:A, 8c33:B, 8c33:C, 8c33:D, 8c34:A, 8c34:B, 8c34:C, 8c34:D, 8c35:A, 8c35:B, 8c35:C, 8c35:D, 8c36:A, 8c36:B, 8c36:C, 8c36:D, 8c37:A, 8c37:B, 8c37:C, 8c37:D, 8c73:A, 8c73:B, 8c73:C, 8c73:D, 8c76:A, 8c76:B, 8c76:C, 8c76:D, 5c8a:A, 5c8a:B, 5c8a:C, 5c8a:D, 5c8d:A, 5c8d:B, 5c8d:C, 5c8d:D, 5c8d:F, 5c8d:G, 5c8d:H, 5c8e:A, 5c8e:B, 5c8e:C, 5c8e:E, 5c8e:F, 5c8e:G, 5c8e:D, 5c8e:H, 5c8f:A, 3whp:A
8	5gpe:D	129	62	0.2763	0.1628	0.3387	4.94e-05	5gpe:A, 5gpe:B, 5gpe:C, 5gpe:E, 5gpe:F, 5gpe:G, 5gpe:H
9	6jni:A	145	62	0.2632	0.1379	0.3226	7.76e-05	6jgw:B, 6jgw:A, 6jgx:A, 6jgx:B, 6jni:B, 6jni:H, 6jni:C, 6jni:D, 6jni:E, 6jni:F, 6jni:G, 6jyw:A, 6jyw:B
10	2vz4:A	100	69	0.2763	0.2100	0.3043	7.99e-05
11	3d6y:A	277	68	0.2763	0.0758	0.3088	0.036	1bow:A, 7ckq:G, 7ckq:I, 3d6z:A, 3d70:A, 3d71:A, 1exi:A, 1exj:A, 3q1m:A, 3q2y:A, 3q3d:A, 3q5p:A, 3q5r:A, 3q5s:A, 1r8e:A
12	4ua1:B	125	66	0.2895	0.1760	0.3333	1.5	4ua1:A
13	5d8c:B	128	70	0.2105	0.1250	0.2286	1.9	5d8c:A, 5e01:A, 5e01:B
14	8re3:A	445	51	0.2237	0.0382	0.3333	2.5	8re2:A, 8re3:B
15	2wwf:C	212	20	0.1711	0.0613	0.6500	2.6	2wwf:A, 2wwf:B, 2wwg:A, 2wwg:B, 2wwg:C, 2wwh:A, 2wwh:B, 2wwh:C, 2wwi:A, 2wwi:B, 2wwi:C, 2yof:A, 2yof:B, 2yof:C, 2yog:A, 2yog:B, 2yoh:A, 2yoh:B
16	8foe:B	370	33	0.1842	0.0378	0.4242	3.1
17	1vz0:B	192	59	0.2237	0.0885	0.2881	3.7	1vz0:A, 1vz0:C, 1vz0:D
18	2a9y:A	351	35	0.1579	0.0342	0.3429	3.9	2a9z:A, 2aa0:A, 2ab8:A, 2abs:A, 1dgm:A, 1lii:A, 1lij:A, 1lik:A
19	8foc:B	450	33	0.1842	0.0311	0.4242	4.1	6di2:A, 6di6:A, 6dtv:A, 6dtz:A, 6du0:A, 8fod:B, 8foh:B, 8foj:B, 8fok:B, 3lgb:A, 3lgb:B, 7tl2:A, 7tl3:A, 7tl4:A
20	2iv7:A	370	32	0.1579	0.0324	0.3750	4.7	2iw1:A
21	3gka:B	351	31	0.1184	0.0256	0.2903	4.9	3gka:A

[Back]