Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AIIRKNVNSLTPSDIKELRDAMAKVQADTSDNGYQKIASYHGIPLSCHYENGTAYACCQHGMVTFPNWHRLLTKQMEDAL
VAKGSHVGIPYWDWTTTFANLPVLVTEEKDNSFHHAHIDVANTDTTRSPRAQLFSFFYRQIALALEQTDFCDFEIQFEIG
HNAIHSWVGGSSPYGMSTLHYTSYDPLFYLHHSNTDRIWSVWQALQKYRGLPYNTANCEINKLVKPLKPFNLDTNPNAVT
KAHSTGATSFDYHKLGYDYDNLNFHGMTIPELEEHLKEIQHEDRVFAGFLLRTIGQSADVNFDVCTKDGECTFGGTFCIL
GGEHEMFWAFDRLFKYDITTSLKHLRLDAHDDFDIKVTIKGIDGHVLSNKYLSPPTVFLAPA

The query sequence (length=382) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1js8:A 382 382 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1js8:B
2 4yd9:L 366 375 0.7356 0.7678 0.7493 0.0 4yd9:C, 4yd9:a, 4yd9:F, 4yd9:R, 4yd9:I, 4yd9:O, 4yd9:U, 4yd9:X, 4yd9:d
3 4bed:B 1734 388 0.5864 0.1292 0.5773 2.13e-155 4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
4 4bed:B 1734 406 0.4791 0.1055 0.4507 9.15e-109 4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
5 4bed:B 1734 404 0.4555 0.1003 0.4307 8.12e-105 4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
6 4bed:B 1734 392 0.4215 0.0928 0.4107 1.32e-94 4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
7 8tnv:A 393 390 0.5314 0.5165 0.5205 1.93e-153 8tnv:B
8 1lnl:A 408 403 0.4660 0.4363 0.4417 2.73e-116 1lnl:B, 1lnl:C
9 4bed:A 1664 402 0.4895 0.1124 0.4652 4.35e-116 4bed:C
10 4bed:A 1664 395 0.4581 0.1052 0.4430 2.96e-106 4bed:C
11 4bed:A 1664 399 0.4581 0.1052 0.4386 1.73e-100 4bed:C
12 4bed:A 1664 406 0.4136 0.0950 0.3892 5.58e-86 4bed:C
13 4yd9:B 825 404 0.4476 0.2073 0.4233 1.31e-111 4yd9:E, 4yd9:H, 4yd9:K, 4yd9:N, 4yd9:Q, 4yd9:T, 4yd9:W, 4yd9:Z, 4yd9:c
14 4yd9:B 825 406 0.4712 0.2182 0.4433 1.80e-110 4yd9:E, 4yd9:H, 4yd9:K, 4yd9:N, 4yd9:Q, 4yd9:T, 4yd9:W, 4yd9:Z, 4yd9:c
15 4yd9:A 1656 403 0.4634 0.1069 0.4392 1.22e-108 4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
16 4yd9:A 1656 401 0.4424 0.1021 0.4214 2.99e-105 4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
17 4yd9:A 1656 405 0.4476 0.1033 0.4222 8.03e-98 4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
18 4yd9:A 1656 398 0.4162 0.0960 0.3995 4.10e-92 4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
19 6j2u:B 273 269 0.1623 0.2271 0.2305 1.09e-12
20 5m6b:C 514 246 0.1832 0.1362 0.2846 3.37e-12
21 8hpi:A 289 100 0.0916 0.1211 0.3500 7.38e-10 4d87:A, 4d87:B, 6ei4:A, 6ei4:B, 4hd4:A, 4hd4:B, 4hd6:A, 4hd6:B, 4hd7:A, 4hd7:B, 8hpi:B, 5i38:A, 5i38:B, 5i3a:A, 5i3a:B, 5i3b:A, 5i3b:B, 4j6t:A, 4j6t:B, 4j6v:A, 4j6v:B, 3nm8:A, 3nm8:B, 3npy:A, 3npy:B, 3nq0:A, 3nq0:B, 3nq1:A, 3nq1:B, 3nq5:A, 3nq5:B, 3ntm:A, 3ntm:B, 5oae:A, 5oae:B, 4p6r:A, 4p6r:B, 4p6s:A, 4p6s:B, 4p6t:A, 4p6t:B, 6qxd:A, 6qxd:B
22 8hpi:A 289 94 0.0733 0.0969 0.2979 0.003 4d87:A, 4d87:B, 6ei4:A, 6ei4:B, 4hd4:A, 4hd4:B, 4hd6:A, 4hd6:B, 4hd7:A, 4hd7:B, 8hpi:B, 5i38:A, 5i38:B, 5i3a:A, 5i3a:B, 5i3b:A, 5i3b:B, 4j6t:A, 4j6t:B, 4j6v:A, 4j6v:B, 3nm8:A, 3nm8:B, 3npy:A, 3npy:B, 3nq0:A, 3nq0:B, 3nq1:A, 3nq1:B, 3nq5:A, 3nq5:B, 3ntm:A, 3ntm:B, 5oae:A, 5oae:B, 4p6r:A, 4p6r:B, 4p6s:A, 4p6s:B, 4p6t:A, 4p6t:B, 6qxd:A, 6qxd:B
23 5zre:B 474 150 0.1126 0.0907 0.2867 2.07e-08 5zre:A, 5zre:C
24 5zre:B 474 138 0.1178 0.0949 0.3261 2.15e-04 5zre:A, 5zre:C
25 4z11:A 513 49 0.0524 0.0390 0.4082 1.06e-07 4z0y:A, 4z0y:B, 4z0y:D, 4z0y:C, 4z0z:A, 4z0z:B, 4z0z:C, 4z0z:D, 4z10:A, 4z10:C, 4z10:B, 4z10:D, 4z10:E, 4z10:F, 4z11:B, 4z11:C, 4z11:D, 4z12:A, 4z12:B, 4z13:A, 4z13:B, 4z14:D, 4z14:B, 4z14:H, 4z14:F, 4z14:C, 4z14:E, 4z14:G, 4z14:A
26 5zrd:A 534 148 0.1099 0.0787 0.2838 1.31e-07 5zrd:B, 5zrd:C, 5zrd:D
27 5zrd:A 534 145 0.1152 0.0824 0.3034 0.004 5zrd:B, 5zrd:C, 5zrd:D
28 5z0f:A 279 264 0.1675 0.2294 0.2424 1.66e-07 2ahk:A, 2ahl:A, 3aws:A, 3awt:A, 3awu:A, 3awv:A, 3aww:A, 3awx:A, 3awy:A, 3awz:A, 3ax0:A, 7cit:A, 7ciy:A, 1wx2:A, 1wx4:A, 5z0d:A, 5z0e:A, 5z0g:A, 5z0h:A, 5z0i:A, 5z0j:A, 5z0k:A, 5z0l:A, 5z0m:A, 2zmx:A, 2zmy:A, 2zmz:A, 2zwd:A, 2zwe:A, 2zwf:A, 2zwg:A
29 4oua:B 557 272 0.1754 0.1203 0.2463 4.03e-07 5m6b:B, 5m6b:A, 5m6b:D, 4oua:A
30 6jua:A 533 120 0.0942 0.0675 0.3000 5.23e-07 6jub:A, 6jud:A
31 6jua:A 533 97 0.0654 0.0469 0.2577 2.0 6jub:A, 6jud:A
32 3w6w:A 583 120 0.0942 0.0617 0.3000 5.50e-07 6ju7:A, 6ju7:B, 6ju8:A, 6ju8:B, 6ju9:A, 6ju9:B
33 3w6w:A 583 92 0.0602 0.0395 0.2500 0.94 6ju7:A, 6ju7:B, 6ju8:A, 6ju8:B, 6ju9:A, 6ju9:B
34 6ju4:B 560 120 0.0942 0.0643 0.3000 6.11e-07 6ju4:A, 6ju5:A, 6ju5:B, 6jua:B, 6jub:B, 6juc:A, 6juc:B, 6jud:B, 3w6w:B
35 6ju4:B 560 92 0.0602 0.0411 0.2500 0.68 6ju4:A, 6ju5:A, 6ju5:B, 6jua:B, 6jub:B, 6juc:A, 6juc:B, 6jud:B, 3w6w:B
36 6hqi:A 444 232 0.1492 0.1284 0.2457 3.55e-06
37 5ce9:A 339 52 0.0524 0.0590 0.3846 7.38e-06 5ce9:B
38 6els:A 459 52 0.0497 0.0414 0.3654 1.25e-05 6elt:A, 6elv:A
39 8bbq:A 324 101 0.0890 0.1049 0.3366 1.55e-05 8bbq:B, 8bbr:A, 8bbr:B
40 8bbq:A 324 40 0.0393 0.0463 0.3750 0.78 8bbq:B, 8bbr:A, 8bbr:B
41 6z1s:A 381 49 0.0576 0.0577 0.4490 2.40e-05
42 6z1s:A 381 39 0.0419 0.0420 0.4103 1.9
43 2y9w:A 391 275 0.1440 0.1407 0.2000 2.84e-05 2y9w:B, 2y9x:A, 2y9x:B, 2y9x:C, 2y9x:D
44 1bug:A 336 234 0.1361 0.1548 0.2222 3.94e-05 1bug:B
45 4j3r:A 372 79 0.0576 0.0591 0.2785 0.002 6gsg:A, 4j3p:A, 4j3q:A, 4j3q:B, 5or3:A, 5or3:B, 5or3:C, 5or3:D, 5or4:A, 5or4:B, 5or4:C, 5or4:D
46 8ibk:A 546 68 0.0602 0.0421 0.3382 0.28 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
47 2osu:A 306 112 0.0812 0.1013 0.2768 1.5 3brm:A, 3brm:B, 2osu:B
48 7sgr:H 69 47 0.0393 0.2174 0.3191 2.8
49 5hog:B 432 53 0.0445 0.0394 0.3208 5.6 4c93:A, 4c93:B, 4c95:A, 4c95:B, 5hog:A, 5hoi:A, 5hoi:B, 5hoi:C, 5nxq:A, 5nxq:B
50 7bzj:A 183 49 0.0393 0.0820 0.3061 9.0 4k47:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218