Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AIEVKLANMEAEINTLKSKLELTNKLHAFSMGKKSGKKFFVTNHERMPFSKVKALCSELRGTVAIPRNAEENKAIQEVAK
TSAFLGITDEVTEGQFMYVTGGRLTYSNWKKDQPDDWYGHGLGGGEDCVHIVDNGLWNDDSCQRPYTAVCEFPA

The query sequence (length=154) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1afa:1 154 154 0.9675 0.9675 0.9675 5.97e-111 1afa:2, 1afa:3, 1afb:1, 1afb:2, 1afb:3, 1afd:1, 1afd:2, 1afd:3, 1bch:1, 1bch:2, 1bch:3, 1bcj:1, 1bcj:2, 1bcj:3, 1fif:A, 1fif:B, 1fif:C, 1fih:A, 1fih:B, 1fih:C, 1kmb:1, 1kmb:2, 1kmb:3, 2kmb:1, 2kmb:2, 2kmb:3, 3kmb:1, 3kmb:3, 3kmb:2, 4kmb:1, 4kmb:2, 4kmb:3, 1kwt:A, 1kwt:B, 1kwt:C, 1kwu:A, 1kwu:B, 1kwu:C, 1kwv:A, 1kwv:B, 1kwv:C, 1kww:A, 1kww:B, 1kww:C, 1kwx:A, 1kwx:B, 1kwx:C, 1kwy:A, 1kwy:B, 1kwy:C, 1kwz:A, 1kwz:B, 1kwz:C, 1kx0:A, 1kx0:B, 1kx0:C, 1kx1:C, 1kx1:F, 1kx1:A, 1kx1:B, 1kx1:D, 1kx1:E, 2msb:B, 2msb:A, 1rtm:1, 1rtm:2, 1rtm:3
2 1hup:A 141 143 0.4740 0.5177 0.5105 6.55e-47
3 1kza:1 115 117 0.4091 0.5478 0.5385 6.43e-42 1kza:2, 1kzb:1, 1kzb:2, 1kzc:1, 1kzc:2, 1kzd:1, 1kzd:2, 1kze:1, 1kze:2, 1rdi:1, 1rdi:2, 1rdj:1, 1rdj:2, 1rdk:1, 1rdk:2, 1rdl:1, 1rdl:2, 1rdm:1, 1rdm:2, 1rdn:1, 1rdn:2, 1rdo:1, 1rdo:2
4 2ric:C 158 155 0.3896 0.3797 0.3871 1.69e-32 1b08:A, 1b08:B, 1b08:C, 3dbz:A, 3dbz:B, 3dbz:C, 4e52:B, 4e52:C, 4e52:A, 3g81:A, 3g81:B, 3g81:C, 3g83:A, 3g83:B, 3g83:C, 3g84:A, 3g84:B, 3g84:C, 2ggu:A, 2ggu:B, 2ggu:C, 2ggx:A, 2ggx:B, 2ggx:C, 3ikn:A, 3ikn:B, 3ikn:C, 3ikp:A, 3ikp:B, 3ikp:C, 3ikq:A, 3ikq:B, 3ikq:C, 3ikr:A, 3ikr:B, 3ikr:C, 4m17:A, 4m17:B, 4m17:C, 4m17:D, 4m17:E, 4m17:F, 4m17:G, 4m17:H, 4m17:I, 4m17:J, 4m17:K, 4m17:L, 4m18:A, 4m18:E, 4m18:B, 4m18:C, 4m18:D, 4m18:L, 4m18:F, 4m18:G, 4m18:H, 4m18:I, 4m18:J, 4m18:K, 2orj:A, 2orj:B, 2orj:C, 2ork:A, 2ork:B, 2ork:C, 2os9:A, 2os9:B, 2os9:C, 5oxr:B, 5oxr:C, 5oxr:A, 5oxs:A, 5oxs:B, 5oxs:C, 1pw9:A, 1pw9:B, 1pw9:C, 1pwb:A, 1pwb:B, 1pwb:C, 2ria:A, 2ria:B, 2ria:C, 2rib:A, 2rib:B, 2rib:C, 2ric:B, 2ric:A, 2rid:A, 2rid:B, 2rid:C, 2rie:A, 2rie:B, 2rie:C
5 6bbe:A 155 155 0.3247 0.3226 0.3226 1.05e-26 6bbd:A, 4dn8:A
6 5jq1:A 130 104 0.2662 0.3154 0.3942 6.47e-25 1dv8:A, 5jpv:A, 5jpv:B, 5jq1:B, 8ts0:A, 6yau:A
7 6py1:A 130 115 0.2857 0.3385 0.3826 3.35e-24 6puv:A, 6w12:A, 6xiy:A
8 3pak:A 145 120 0.2857 0.3034 0.3667 2.28e-23 5ffr:A, 5ffs:A, 5fft:A, 3paq:A, 3par:A, 3pbf:A, 1r13:A, 1r14:A, 4wr9:A, 4wrc:A, 4wre:A, 4wrf:A, 4wuw:A, 4wux:A
9 6ryj:A 122 124 0.2922 0.3689 0.3629 3.26e-23 6ryg:A, 6rym:A, 6ryn:A
10 8urf:A 128 115 0.2597 0.3125 0.3478 2.19e-18
11 2ox8:A 129 109 0.2468 0.2946 0.3486 3.62e-17 2ox8:B, 2ox8:C, 2ox8:D
12 2ox9:C 131 132 0.2597 0.3053 0.3030 1.83e-16 2ox9:A, 2ox9:B, 2ox9:D
13 4yli:D 155 152 0.2403 0.2387 0.2434 9.75e-13 4yli:A, 4yli:B, 4yli:C, 4yli:E, 4yli:F, 4ymd:A, 4ymd:B, 4ymd:D, 4ymd:F, 4ymd:C, 4ymd:E
14 1htn:A 156 159 0.2727 0.2692 0.2642 2.18e-12 1tn3:A
15 6jjj:A 151 118 0.2273 0.2318 0.2966 3.89e-12 6jjj:B, 6jjj:C, 6jjj:D, 6jjj:E, 6jjj:F
16 1sl6:A 168 158 0.2662 0.2440 0.2595 3.77e-10 1k9j:A, 1sl6:B, 1sl6:C, 1sl6:D, 1sl6:E, 1sl6:F, 1xph:A
17 1tdq:B 126 108 0.1948 0.2381 0.2778 5.84e-10
18 6pwr:A 129 107 0.1948 0.2326 0.2804 1.16e-09 6pws:A, 6pwt:A
19 4gko:L 136 102 0.1948 0.2206 0.2941 2.50e-09 4g9a:A, 4g9a:B, 4g9a:C, 4g9a:D, 4gko:G, 4gko:H, 4gko:I, 4gko:J, 4gko:K, 2h2t:B
20 6ghv:D 133 122 0.2208 0.2556 0.2787 3.87e-08 6ghv:A, 6ghv:B, 6ghv:C, 6ghv:E, 6ghv:F, 2it5:A, 2it6:A, 1k9i:A, 1k9i:C, 1k9i:D, 1k9i:E, 1k9i:H, 1k9i:B, 1k9i:F, 1k9i:G, 1k9i:I, 1k9i:J, 7nl6:A, 7nl7:A, 1sl4:A, 1sl5:A, 2xr5:A, 2xr6:A
21 3whd:C 148 97 0.2013 0.2095 0.3196 1.20e-06 3whd:A
22 8h4v:A 148 106 0.2143 0.2230 0.3113 1.82e-06 8h4v:B, 8hb5:A, 5kth:A, 5kti:A, 4kzv:A, 4kzv:B, 4kzw:A, 4kzw:B, 4zrv:A, 4zrv:C, 4zrv:B, 4zrw:A
23 3wh2:A 132 126 0.2208 0.2576 0.2698 5.59e-06 3wh3:A
24 2vuv:A 129 122 0.1883 0.2248 0.2377 1.42e-04 2vuz:A
25 1egg:B 144 117 0.1753 0.1875 0.2308 0.001 1egg:A, 1egi:A, 1egi:B, 7jub:A, 7juc:A, 7jud:A, 7jud:B, 7jue:A, 7juf:A, 7juf:B, 7jug:A, 7juh:A, 7l61:A, 7l62:A, 7l63:A, 7l64:A, 7l65:A, 7l66:A, 7l67:A, 7l68:A, 7l68:B
26 2py2:A 127 121 0.1623 0.1969 0.2066 0.008 2py2:B, 2py2:C, 2py2:D, 2py2:E, 2py2:F
27 3vyk:A 128 121 0.1883 0.2266 0.2397 0.019
28 5f2q:B 135 76 0.1234 0.1407 0.2500 0.021 5f2q:A, 5f2q:C, 5f2q:D, 5f2q:E, 5f2q:F, 5f2q:G, 5f2q:H, 5f2q:I, 5f2q:J, 1jzn:A, 1jzn:B, 1jzn:C, 1jzn:D, 1jzn:E, 1muq:B, 1muq:A, 1muq:C, 1muq:D, 1muq:E
29 5e4l:A 428 112 0.1818 0.0654 0.2500 0.026
30 5e4l:A 428 73 0.1234 0.0444 0.2603 0.056
31 4wqq:A 141 69 0.1039 0.1135 0.2319 0.027 1wmy:A, 1wmy:B, 1wmz:A, 1wmz:B, 1wmz:C, 1wmz:D, 4wqq:B, 4wqq:C, 4wqq:D
32 5e4k:A 424 113 0.1818 0.0660 0.2478 0.036
33 5e4k:A 424 73 0.1234 0.0448 0.2603 0.058
34 5xts:A 460 70 0.1169 0.0391 0.2571 0.048 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
35 4c16:A 280 120 0.1948 0.1071 0.2500 0.060 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
36 5vyb:A 143 121 0.1948 0.2098 0.2479 0.077
37 5e4l:B 386 142 0.2013 0.0803 0.2183 0.081
38 5e4l:B 386 67 0.1104 0.0440 0.2537 0.085
39 3cfw:A 156 113 0.1948 0.1923 0.2655 0.16 5vc1:A
40 7x0f:C 458 28 0.0714 0.0240 0.3929 0.23 7x0e:A, 7x0f:A, 7x0f:B, 7x0f:D, 7x17:A, 7x17:B, 7x17:C, 7x17:D
41 5k8y:A 136 125 0.1494 0.1691 0.1840 0.37 5k8y:B, 5m62:A, 5m62:B
42 3kqg:A 169 100 0.1688 0.1538 0.2600 0.43 4ak8:A, 4ak8:B, 4ak8:C, 4ak8:D, 3c22:A, 3c22:B, 3c22:C, 3c22:D, 5g6u:A, 5g6u:B, 5g6u:D, 5g6u:C, 3kqg:B, 3kqg:C, 3kqg:D, 3kqg:E, 3kqg:F, 4n32:A, 4n32:B, 4n32:C, 4n32:D, 4n33:A, 4n33:B, 4n33:C, 4n33:D, 4n34:A, 4n34:B, 4n34:C, 4n34:D, 4n35:A, 4n35:B, 4n35:C, 4n35:D, 4n36:A, 4n36:B, 4n36:C, 4n36:D, 4n37:A, 4n37:B, 4n37:C, 4n37:D, 4n38:A, 4n38:B, 4n38:C, 4n38:D, 3p5d:A, 3p5d:B, 3p5d:C, 3p5d:D, 3p5e:A, 3p5e:B, 3p5e:C, 3p5e:D, 3p5f:B, 3p5f:C, 3p5f:A, 3p5f:D, 3p5g:A, 3p5g:B, 3p5g:C, 3p5g:D, 3p5h:B, 3p5h:D, 3p5h:A, 3p5h:C, 3p5i:A, 3p5i:B, 3p5i:C, 3p5i:D, 3p7f:A, 3p7f:B, 3p7f:C, 3p7f:D, 3p7g:A, 3p7g:B, 3p7g:C, 3p7g:D, 3p7h:A, 3p7h:B, 3p7h:C, 3p7h:D, 7ytq:A, 7ytq:B, 7ytq:C, 7ytq:D
43 6jk4:A 126 116 0.1494 0.1825 0.1983 0.46
44 2brs:B 115 112 0.1818 0.2435 0.2500 0.52
45 6a7t:A 137 85 0.0974 0.1095 0.1765 1.1 6m5m:A
46 4m87:A 257 51 0.1364 0.0817 0.4118 1.9 4m87:B, 4m89:A, 4m89:B
47 6xwb:A 319 58 0.1104 0.0533 0.2931 2.2 6xwb:B
48 4ce5:A 325 58 0.1039 0.0492 0.2759 2.4 4ce5:B, 8x1f:A, 8x1f:B, 7xg5:A, 7xg5:B, 8xiy:A, 8xiy:B
49 3ukk:A 517 55 0.1169 0.0348 0.3273 3.2 4gde:A, 4gde:B, 4gde:C, 4gde:D, 5hhf:A, 5hhf:B, 5hhf:C, 5hhf:D, 4u8i:A, 4u8i:B, 4u8i:C, 4u8i:D, 4u8j:A, 4u8j:B, 4u8j:C, 4u8j:D, 4u8k:A, 4u8k:B, 4u8k:C, 4u8k:D, 4u8l:A, 4u8l:B, 4u8l:C, 4u8l:D, 4u8m:A, 4u8m:B, 4u8m:C, 4u8m:D, 4u8n:A, 4u8n:B, 4u8n:C, 4u8n:D, 4u8o:A, 4u8o:B, 4u8o:C, 4u8o:D, 4u8p:A, 4u8p:B, 4u8p:C, 4u8p:D, 3uka:A, 3uka:B, 3uka:C, 3uka:D, 3ukf:A, 3ukf:B, 3ukf:C, 3ukf:D, 3ukf:E, 3ukf:F, 3ukf:G, 3ukf:H, 3ukh:A, 3ukh:B, 3ukh:C, 3ukh:D, 3ukh:E, 3ukh:F, 3ukh:G, 3ukh:H, 3ukk:B, 3ukk:C, 3ukk:D, 3ukl:A, 3ukl:B, 3ukl:C, 3ukl:D, 3ukl:E, 3ukl:F, 3ukl:G, 3ukl:H, 3ukp:A, 3ukp:B, 3ukp:C, 3ukp:D, 3ukp:E, 3ukp:F, 3ukp:G, 3ukp:H, 3ukq:A, 3ukq:B, 3ukq:C, 3ukq:D, 3ute:A, 3ute:B, 3ute:C, 3ute:D, 3utf:A, 3utf:B, 3utf:C, 3utf:D, 3utg:A, 3utg:B, 3utg:C, 3utg:D, 3uth:A, 3uth:B, 3uth:C, 3uth:D, 5vwt:A, 5vwt:B, 5vwt:C, 5vwt:D, 5vwu:A, 5vwu:B, 5vwu:C, 5vwu:D, 4wx1:A, 4wx1:B, 4wx1:C, 4wx1:D
50 4pve:A 490 47 0.0974 0.0306 0.3191 3.3 4pvh:A, 4pvj:A, 4pvk:A, 4pwb:A, 4pwc:A, 3tsh:A, 3tsj:A, 3tsj:B
51 6ezn:F 650 22 0.0649 0.0154 0.4545 4.4 8agb:A, 8age:A, 6c26:A, 7oci:F
52 8agc:A 697 22 0.0649 0.0143 0.4545 4.5
53 5b1w:A 130 105 0.1688 0.2000 0.2476 5.6 5b1w:B, 5b1w:C, 5b1w:D, 5b1x:A, 5b1x:B, 5b1x:C, 5b1x:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218