Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AHSIRVDGDIILGGLFPVHAKGERGVPCGELKKEKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALEQS
LTFVQAKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKIPQISYASTAPELSDNTRYDFFSRVVPPDSYQAQAMVDIVTALGWNYVS
TLASEGNYGESGVEAFTQISREIGGVSIAQSQKIPREPRPGEFEKIIKRLLETPNARAVIMFANEDDIRRILEAAKKLQQ
SGHFLWIGSDSWGSKIAPVYQQEEIAEGAVTILPKRASIDGFDRYFRSRTLANNRRNVWFAEFWEENFGCKLKCTGLERI
ARDSSYEQEGKVQFVIDAVYSMAYALHNMHKDLCPGYIGLCPRMSTIDGKELLGYIRAVNFNGSAGTPVTFNENGDAPGR
YDIFQYQITNKSTEYKVIGHWTNQLHLKVEDMQWAHREHTHPASE

The query sequence (length=445) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6e5v:B 447 450 0.9663 0.9620 0.9556 0.0 6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
2 8jd6:R 774 441 0.7618 0.4380 0.7687 0.0 7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
3 5c5c:A 432 442 0.7236 0.7454 0.7285 0.0
4 3mq4:A 386 440 0.6607 0.7617 0.6682 0.0
5 8tr2:A 745 458 0.4944 0.2953 0.4803 8.12e-144 2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
6 8jcu:3 765 465 0.4876 0.2837 0.4667 2.10e-141 6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
7 8jd5:2 785 443 0.4494 0.2548 0.4515 1.18e-129 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
8 7mtq:B 744 445 0.4472 0.2675 0.4472 1.37e-128 8jd4:2
9 7epb:A 779 468 0.4494 0.2567 0.4274 5.69e-126 7epb:B, 7mtq:A
10 8tao:B 771 461 0.4360 0.2516 0.4208 7.13e-113 7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
11 7dge:A 784 443 0.4270 0.2423 0.4289 2.05e-112 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
12 6n51:B 793 468 0.4360 0.2446 0.4145 1.42e-111 6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
13 8szi:B 802 473 0.3393 0.1883 0.3192 4.43e-67 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
14 8szh:A 835 483 0.3461 0.1844 0.3188 2.94e-66 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
15 7dtv:A 779 488 0.3461 0.1977 0.3156 5.34e-66 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
16 5k5t:A 578 502 0.3416 0.2630 0.3028 1.34e-63
17 5x2n:B 459 436 0.2742 0.2658 0.2798 3.53e-34 5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
18 5x2m:D 422 424 0.2539 0.2678 0.2665 1.68e-30 5x2p:D
19 5x2n:C 433 451 0.2360 0.2425 0.2328 1.90e-24 5x2m:A, 5x2m:C, 5x2n:A, 5x2o:A, 5x2o:C, 5x2p:A, 5x2p:C, 5x2q:A, 5x2q:C
20 7lzh:A 798 211 0.1101 0.0614 0.2322 4.08e-12 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
21 6uo8:B 696 181 0.1169 0.0747 0.2873 4.64e-09 7ca3:B, 7eb2:D
22 7cum:B 675 181 0.1169 0.0770 0.2873 6.66e-09 7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
23 6uo8:A 689 275 0.1438 0.0929 0.2327 1.63e-07 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
24 7yfr:A 691 140 0.0742 0.0478 0.2357 3.60e-06 7yfr:C
25 4tlm:C 750 142 0.0809 0.0480 0.2535 5.36e-06 4tll:C
26 4tlm:A 796 142 0.0809 0.0452 0.2535 5.85e-06 6e7r:A, 6e7r:C, 6e7s:A, 6e7s:C, 6e7t:A, 6e7t:C, 6e7u:A, 6e7u:C, 6e7v:A, 6e7v:C, 6e7w:A, 6e7w:C, 6e7x:A, 6e7x:C, 5ewj:A, 5ewj:C, 5ewl:A, 5ewl:C, 5ewm:A, 5ewm:C, 8g18:A, 8g18:C, 3qel:A, 3qem:A, 3qem:C, 4tll:A, 5tq2:A, 5un1:G, 5un1:A, 5un1:C
27 7eor:B 770 142 0.0764 0.0442 0.2394 7.45e-06 8e96:A, 8e96:C, 7eor:D, 4pe5:A, 4pe5:C, 8usw:A, 8usw:C
28 7yfl:A 708 142 0.0764 0.0480 0.2394 7.58e-06 7yfl:C
29 7yfg:C 659 142 0.0764 0.0516 0.2394 1.41e-05 2a5t:A, 5dex:A, 5h8f:B, 5h8h:B, 5h8n:B, 5h8q:B, 5i2k:B, 5i2n:B, 5i56:A, 5i57:A, 5i59:A, 5kcj:B, 5kdt:B, 4kfq:A, 4kfq:B, 4nf4:A, 4nf5:A, 4nf6:A, 4nf8:A, 6ovd:A, 6ove:A, 1pb7:A, 1pb8:A, 1pb9:A, 1pbq:A, 5tp9:B, 5tpa:B, 5u8c:A, 6usu:A, 6usv:A, 6uz6:A, 6uzg:A, 6uzr:A, 6uzw:A, 6uzx:A, 5vih:A, 5vii:A, 5vij:A, 1y1m:A, 1y1z:A, 1y20:A, 7yfg:A, 7yfh:A, 7yfh:C
30 9arh:A 802 146 0.0742 0.0411 0.2260 1.61e-05 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
31 4mlc:A 336 117 0.0764 0.1012 0.2906 0.005 4q6b:A
32 3td9:A 350 83 0.0629 0.0800 0.3373 0.006
33 4n0q:B 345 121 0.0584 0.0754 0.2149 0.20 4n0q:A, 4n0q:C, 4n0q:D
34 6d03:C 679 72 0.0472 0.0309 0.2917 0.72 1a8e:A, 1a8f:A, 1b3e:A, 8brc:A, 6ctc:A, 6d03:D, 6d04:C, 6d04:D, 6d05:C, 6d05:D, 1d3k:A, 1d4n:A, 1dtg:A, 5dyh:A, 5dyh:B, 7ffm:A, 7ffu:A, 3fgs:A, 1fqe:A, 1fqf:A, 4h0w:A, 5h52:A, 6jas:A, 1jqf:A, 1n7w:A, 1n7x:A, 1n84:A, 2o7u:B, 2o7u:A, 2o7u:C, 2o7u:D, 2o7u:E, 2o7u:F, 2o7u:G, 2o7u:H, 2o7u:I, 2o84:X, 1oqg:A, 1oqh:A, 3qyt:A, 1ryo:A, 6soy:C, 6soz:C, 1suv:C, 1suv:D, 6uj6:A, 3v83:A, 3v83:B, 3v83:C, 3v83:D, 3v83:E, 3v83:F, 3ve1:B, 3ve1:D, 5wtd:A, 4x1b:A, 4x1d:A, 4x1d:B, 5x5p:A, 5y6k:A
35 4dqd:A 361 120 0.0629 0.0776 0.2333 1.00 3sg0:A
36 8wch:A 396 66 0.0472 0.0530 0.3182 1.2 8wch:B
37 4zxh:A 1314 36 0.0292 0.0099 0.3611 1.5 4zxi:A
38 5x4j:A 471 51 0.0449 0.0425 0.3922 2.1 5x4h:A, 5x4i:A, 5x4k:A
39 6n9q:P 277 99 0.0472 0.0758 0.2121 3.2 6n9i:A, 6n9i:B, 6n9i:C, 6n9q:D, 6n9r:A, 6n9r:P, 6n9r:X
40 6sdx:A 347 91 0.0517 0.0663 0.2527 3.6 6rad:A
41 6mdm:D 713 117 0.0742 0.0463 0.2821 3.8 1d2n:A, 6ip2:B, 6ip2:C, 6ip2:D, 6ip2:E, 6ip2:F, 6ip2:A, 6mdm:A, 6mdm:B, 6mdm:C, 6mdm:E, 6mdn:A, 6mdn:B, 6mdn:C, 6mdn:D, 6mdn:E, 6mdo:A, 6mdo:B, 6mdo:C, 6mdo:D, 6mdo:E, 6mdo:F, 6mdp:A, 6mdp:B, 6mdp:C, 6mdp:D, 6mdp:E, 6mdp:F, 1nsf:A
42 3j94:F 466 117 0.0742 0.0708 0.2821 4.1
43 3j94:A 490 117 0.0742 0.0673 0.2821 4.4 3j94:B, 3j94:C, 3j94:D, 3j94:E, 3j95:B, 3j95:C, 3j95:D, 3j95:E, 6mdm:F
44 8pkz:A 146 94 0.0472 0.1438 0.2234 4.5 8pdk:A, 8pdk:B, 8pe0:A, 8pe0:B, 8pfa:A, 8pfa:B
45 3cc2:B 337 58 0.0427 0.0564 0.3276 5.0 3cc4:B, 3cc7:B, 3cce:B, 3ccj:B, 3ccl:B, 3ccm:B, 3ccq:B, 3ccr:B, 3ccs:B, 3ccu:B, 3ccv:B, 3cd6:B, 3cma:B, 3cme:B, 3cpw:B, 3cxc:B, 1ffk:B, 3g4s:B, 3g6e:B, 3g71:B, 3i55:B, 3i56:B, 1jj2:B, 1k73:D, 1k8a:D, 1k9m:D, 1kc8:D, 1kd1:D, 1kqs:B, 1m1k:D, 1m90:D, 1n8r:D, 1nji:D, 2otj:B, 2otl:B, 3ow2:B, 1q7y:D, 1q81:D, 1q82:D, 1q86:D, 2qa4:B, 2qex:B, 1qvf:B, 1qvg:B, 1s72:B, 4v9f:B, 1vq4:B, 1vq5:B, 1vq6:B, 1vq7:B, 1vq8:B, 1vq9:B, 1vqk:B, 1vql:B, 1vqm:B, 1vqn:B, 1vqo:B, 1vqp:B, 1w2b:B, 1yhq:B, 1yi2:B, 1yij:B, 1yit:B, 1yj9:B, 1yjn:B, 1yjw:B
46 6cgy:A 276 98 0.0494 0.0797 0.2245 8.7 6cgy:H, 6cgy:L, 6cgz:A, 6cgz:B, 6cgz:C, 6ch0:C, 6ch0:F, 6ch0:I

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218