Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AGSTIITSLQRKEGHSLGFSITGGFKQADGQYSGIYISKIAKDSIAAVDGKLSAGDILLKINDESMTNVPHSRAVQMLRS
EGKIITIVASRQQ

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8bp4:A 93 93 1.0000 1.0000 1.0000 3.73e-63 8bp4:C, 8bp4:B
2 8cn1:H 101 78 0.3226 0.2970 0.3846 3.03e-12 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
3 4wyu:A 201 88 0.3441 0.1592 0.3636 3.41e-12 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
4 7p73:A 420 75 0.3226 0.0714 0.4000 1.02e-11 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
5 8bq8:C 93 89 0.3226 0.3226 0.3371 3.74e-11 8bq8:A, 8bq8:B
6 2kaw:A 90 77 0.3118 0.3222 0.3766 2.02e-10 6lcb:A, 2mx6:A
7 2r4h:C 98 76 0.2688 0.2551 0.3289 4.76e-10
8 1l6o:A 95 94 0.3548 0.3474 0.3511 2.20e-09 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
9 2m0z:A 97 82 0.2688 0.2577 0.3049 2.98e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 6xa7:B 96 96 0.3548 0.3438 0.3438 3.15e-09 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
11 2ka9:A 189 78 0.3118 0.1534 0.3718 9.79e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 2ka9:A 189 77 0.2796 0.1376 0.3377 1.47e-05 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
13 2exg:A 101 88 0.3011 0.2772 0.3182 2.18e-08 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
14 5heb:A 119 73 0.3011 0.2353 0.3836 8.91e-08 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
15 6zbq:A 89 77 0.2796 0.2921 0.3377 1.31e-07 6zc4:A
16 8bv7:A 95 58 0.2258 0.2211 0.3621 3.11e-07 8buw:A, 8buw:B
17 8c1t:A 90 77 0.2903 0.3000 0.3506 3.75e-07 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
18 2l4t:A 124 110 0.3656 0.2742 0.3091 3.98e-07 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
19 5wou:A 95 81 0.3011 0.2947 0.3457 4.47e-07
20 7pc3:A 405 77 0.3011 0.0691 0.3636 1.26e-06 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
21 2kpl:A 129 79 0.2688 0.1938 0.3165 1.86e-06
22 3cyy:B 81 57 0.2366 0.2716 0.3860 2.56e-06 3cyy:A
23 5n7d:A 423 79 0.2688 0.0591 0.3165 5.54e-06 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
24 3jxt:A 96 73 0.2903 0.2812 0.3699 8.62e-06 3jxt:B
25 7qqn:C 414 83 0.2796 0.0628 0.3133 1.27e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
26 3tsz:A 341 72 0.2581 0.0704 0.3333 2.29e-05 3shw:A
27 7d6f:A 87 79 0.2473 0.2644 0.2911 2.33e-05
28 2pdz:A 86 81 0.2796 0.3023 0.3210 5.67e-05
29 2qt5:A 194 86 0.2581 0.1237 0.2791 6.09e-05 2qt5:B
30 2qt5:A 194 77 0.2151 0.1031 0.2597 0.002 2qt5:B
31 2i0i:A 81 73 0.2903 0.3333 0.3699 3.30e-04 2i0i:B, 2i0i:C
32 7weg:B 96 68 0.2688 0.2604 0.3676 4.02e-04 7weg:A
33 6ar4:B 87 78 0.2581 0.2759 0.3077 5.06e-04 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
34 2koh:A 111 83 0.2688 0.2252 0.3012 5.71e-04 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
35 5zys:A 90 75 0.2581 0.2667 0.3200 8.05e-04
36 7qct:A 90 82 0.2258 0.2333 0.2561 0.003 7qct:B
37 4xhv:A 94 68 0.2151 0.2128 0.2941 0.003
38 6yx0:B 112 87 0.2258 0.1875 0.2414 0.004 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
39 7p70:A 407 77 0.2796 0.0639 0.3377 0.006 7pc4:A, 7qql:A
40 7pc5:A 405 68 0.2581 0.0593 0.3529 0.009
41 1b8q:A 127 57 0.1828 0.1339 0.2982 0.010
42 1ihj:B 95 77 0.2043 0.2000 0.2468 0.022 1ihj:A
43 6gbe:A 119 83 0.2151 0.1681 0.2410 0.028
44 3r0h:D 199 85 0.1935 0.0905 0.2118 0.084 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
45 3pv3:A 392 74 0.2366 0.0561 0.2973 0.097 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
46 7ou2:B 650 43 0.1613 0.0231 0.3488 0.12
47 5f67:A 98 81 0.2903 0.2755 0.3333 0.13 5f67:B
48 7ou2:A 721 43 0.1613 0.0208 0.3488 0.14 5akb:E, 7oto:B, 7oto:A, 7ou0:B, 7ou0:A, 7ou4:A, 7ou4:B
49 1ng9:A 794 43 0.1613 0.0189 0.3488 0.14 7ai5:B, 7ai5:A, 7ai6:A, 7ai6:B, 7ai7:A, 7ai7:B, 7aib:B, 7aib:A, 7aic:A, 7aic:B, 5akb:A, 5akb:B, 5akc:A, 5akc:B, 5akc:E, 5akc:F, 5akc:I, 5akc:J, 5akd:A, 5akd:B, 5akd:E, 5akd:F, 5akd:I, 5akd:J, 1e3m:A, 1e3m:B, 6i5f:A, 6i5f:B, 3k0s:A, 3k0s:B, 1ng9:B, 1oh5:A, 1oh5:B, 1oh6:A, 1oh6:B, 1oh7:A, 1oh7:B, 1oh8:A, 1oh8:B, 1w7a:A, 1w7a:B, 1wb9:A, 1wb9:B, 1wbb:A, 1wbb:B, 1wbd:A, 1wbd:B, 2wtu:A, 2wtu:B, 3zlj:A, 3zlj:B
50 6ezi:A 86 58 0.1505 0.1628 0.2414 0.25 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
51 4xh7:A 110 57 0.1613 0.1364 0.2632 0.40
52 3qw4:C 447 48 0.1613 0.0336 0.3125 0.69 3qw4:B
53 2bon:B 265 36 0.1290 0.0453 0.3333 0.81 2jgr:A
54 8blu:B 195 51 0.1828 0.0872 0.3333 1.1 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
55 4ynn:A 400 50 0.1505 0.0350 0.2800 1.2 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
56 4xqm:A 94 63 0.1505 0.1489 0.2222 1.3
57 3vqg:A 85 60 0.1505 0.1647 0.2333 1.5
58 2bon:A 287 30 0.1290 0.0418 0.4000 2.2
59 5iry:A 539 17 0.0860 0.0148 0.4706 3.4 5iry:B
60 2os6:A 89 81 0.1720 0.1798 0.1975 3.6
61 8d3x:A 989 41 0.1183 0.0111 0.2683 3.7 8d3u:A, 8d3w:A
62 8h6s:A 306 18 0.0968 0.0294 0.5000 5.2 5czc:A, 5czd:A, 7f2r:A, 7f2r:C, 8h6s:B
63 1i3u:A 127 93 0.2473 0.1811 0.2473 6.2
64 4aec:A 323 53 0.1398 0.0402 0.2453 7.9 4aec:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218