Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AGSLVVLGSINADHILNLQSFPTPGETVTGNHYQVAFGGKGANQAVAAGRSGANIAFIACTGDDSIGESVRQQLATDNID
ITPVSVIKGESTGVALIFVNGEGENVIGIHAGANAALSPALVEAQRERIANASALLMQLESPLESVMAAAKIAHQNKTIV
ALNPAPARELPDELLALVDIITPNETEAEKLTGIRVENDEDAAKAAQVLHEKGIRTVLITLGSRGVWASVNGEGQRVPGF
RVQAVDTIAAGDTFNGALITALLEEKPLPEAIRFAHAAAAIAVTRKGAQPSVPWREEIDAFLDRQR

The query sequence (length=306) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1gqt:B 307 305 0.9967 0.9935 1.0000 0.0 1gqt:A, 1gqt:C, 1gqt:D, 1rk2:A, 1rk2:B, 1rk2:C, 1rk2:D, 1rkd:A, 1rks:A
2 4xck:A 306 299 0.5915 0.5915 0.6054 8.81e-117 4xck:B, 4xck:C, 4xck:D, 4xda:A, 4xda:B, 4xda:C, 4xda:D
3 8cqx:A 300 302 0.4118 0.4200 0.4172 1.98e-63 8cqx:B, 8cqx:C, 8cqx:D, 6znx:A, 6znx:B, 6znx:D
4 6a8a:A 327 313 0.3824 0.3578 0.3738 3.47e-51 6a8a:B, 6a8b:A, 6a8b:B, 6a8c:A, 6a8c:B, 5zwy:A, 5zwy:B
5 5c41:A 317 301 0.3529 0.3407 0.3588 1.30e-50 5byf:A, 5byf:B, 5c3y:A, 5c3y:B, 5c3y:C, 5c3y:D, 5c3y:E, 5c3y:F, 5c3y:G, 5c3y:H, 5c3y:I, 5c3y:J, 5c3y:K, 5c3y:L, 5c3z:A, 5c3z:B, 5c40:A, 5c40:B, 5c41:B, 5c41:C, 5c41:D, 2fv7:A, 2fv7:B, 6wjz:A, 6wjz:B, 6wk0:A, 6wk0:B, 6wk0:C, 6wk0:D
6 6znx:C 265 300 0.3889 0.4491 0.3967 2.47e-50
7 6ils:B 313 305 0.3529 0.3450 0.3541 5.20e-47 6ils:A, 6ilt:A, 6ilt:B
8 6xk2:A 320 321 0.3268 0.3125 0.3115 1.51e-30 6xk2:B, 6xk2:C, 6xk2:D
9 3ikh:A 286 304 0.2908 0.3112 0.2928 1.20e-26 3i3y:D, 3ikh:B, 3ikh:C, 3ikh:D
10 3in1:A 312 301 0.3007 0.2949 0.3056 2.41e-21 3in1:B
11 3kzh:A 316 267 0.2190 0.2120 0.2509 4.44e-21 3kzh:B
12 7ag6:A 302 291 0.2876 0.2914 0.3024 1.20e-20 7ag6:B, 7agh:C, 7agh:D, 7agh:A, 7agh:B, 7agk:A, 7agk:B, 7agk:C
13 3iq0:B 308 271 0.2353 0.2338 0.2657 7.60e-20 3iq0:A
14 3go6:A 287 292 0.3268 0.3484 0.3425 1.04e-19 3go6:B, 3go7:A, 3go7:B
15 1tz3:A 299 290 0.2647 0.2709 0.2793 2.90e-19 1tz6:A, 1tz6:B
16 1v1a:A 301 296 0.2680 0.2724 0.2770 2.35e-18 1v1a:B, 1v1b:A, 1v1b:D, 1v1b:B, 1v1b:C
17 7w93:A 307 251 0.1928 0.1922 0.2351 1.70e-17 7vsk:A, 7vte:A, 7vte:B, 7vte:C, 7vte:D, 7vtf:A, 7vtf:B, 7vtf:C, 7vtf:D, 7vtg:A, 7vtg:B, 7vtg:C, 7vtg:D, 7vva:A, 7vva:B, 7vva:C, 7vva:D
18 2i6a:A 343 260 0.2320 0.2070 0.2731 2.42e-16 1bx4:A, 2i6a:B, 2i6a:C, 2i6a:D, 2i6b:A, 2i6b:B, 5kb5:A, 5kb6:A, 5kb6:B, 4o1l:A, 4o1l:B
19 4wjm:A 312 303 0.2680 0.2628 0.2706 4.98e-16
20 2c49:A 299 313 0.2157 0.2207 0.2109 1.08e-15 2c49:B
21 5ygg:A 310 292 0.2418 0.2387 0.2534 5.23e-15 5eyn:A, 5f0z:A, 5f11:A
22 2dcn:A 308 296 0.2353 0.2338 0.2432 9.58e-14 2dcn:B, 2dcn:C, 2dcn:D, 2dcn:E, 2dcn:F, 2dcn:G, 2dcn:H, 2dcn:I, 2dcn:J, 2dcn:K, 2dcn:L
23 3ih0:A 304 282 0.2288 0.2303 0.2482 5.85e-11 3gbu:A, 3gbu:B, 3gbu:C, 3gbu:D
24 2var:A 311 307 0.2190 0.2154 0.2182 9.10e-11 2var:B, 2var:C
25 3ubo:A 338 269 0.2124 0.1923 0.2416 1.05e-09 3ubo:B
26 3lki:B 322 298 0.2582 0.2453 0.2651 1.72e-09
27 6su9:A 295 103 0.0915 0.0949 0.2718 5.73e-09 6su9:B
28 4s1h:A 287 108 0.1144 0.1220 0.3241 7.51e-09 4s1h:B, 4s1i:A, 4s1i:B
29 2afb:A 329 298 0.2288 0.2128 0.2349 4.62e-08
30 4k8p:A 332 273 0.2026 0.1867 0.2271 3.29e-07 4e3a:A, 4e3a:B, 4jks:A, 4jks:B, 4jku:A, 4jku:B, 4k8c:A, 4k8c:B, 4k8k:A, 4k8k:B, 4k8p:B, 4k8t:A, 4k8t:B, 4k93:A, 4k93:B, 4k9c:A, 4k9c:B, 4k9i:A, 4k9i:B, 4kad:A, 4kad:B, 4kah:A, 4kah:B, 4kal:A, 4kal:B, 4kan:A, 4kan:B, 4kbe:A, 4kbe:B, 4lbg:A, 4lbg:B, 4lbx:A, 4lbx:B, 4lc4:A, 4lc4:B, 4lca:A, 4lca:B
31 3kd6:A 300 134 0.1307 0.1333 0.2985 8.24e-07 3kd6:B
32 3n1c:A 309 131 0.1307 0.1294 0.3053 8.67e-07 3cqd:A, 3cqd:B, 3n1c:D, 3n1c:B, 3n1c:C, 3umo:A, 3umo:B, 3ump:A, 3ump:B, 3uqd:A, 3uqd:C, 3uqd:B, 3uqd:D, 3uqe:A, 3uqe:B
33 1rfu:A 312 127 0.1373 0.1346 0.3307 3.80e-06 1lhr:A, 1lhr:B, 1rft:A, 1rfu:B, 1rfu:C, 1rfu:D, 1rfu:E, 1rfu:F, 1rfu:G, 1rfu:H, 1rfv:A, 1rfv:B, 1ygj:A, 1ygk:A, 1yhj:A
34 3ie7:A 309 164 0.1438 0.1424 0.2683 5.81e-06 3jul:A
35 4en4:A 310 49 0.0686 0.0677 0.4286 1.85e-05 2ajp:A, 2ajp:B, 4en4:B, 4eoh:A, 4eoh:B, 3fhx:A, 3fhx:B, 3fhy:A, 3fhy:B, 3keu:A, 3keu:B, 8wr2:A, 8wr2:B, 2yxt:A, 2yxt:B, 2yxu:A, 2yxu:B
36 6yk0:A 309 58 0.0784 0.0777 0.4138 4.12e-05 6yk0:B, 6yk0:C, 6yk0:D, 6yk1:A, 6yk1:B, 6yk1:C, 6yk1:D
37 4n09:A 345 284 0.2255 0.2000 0.2430 1.06e-04 4n09:B, 4n09:C, 4n09:D, 3otx:A, 3otx:B, 2xtb:A
38 3loo:B 341 255 0.1993 0.1789 0.2392 1.16e-04 3loo:A, 3loo:C
39 3uq6:A 345 261 0.1863 0.1652 0.2184 1.62e-04 4dc3:A, 4dc3:B, 3uq6:B, 3uq9:A, 3uq9:B, 3vaq:A, 3vaq:B, 3vas:A, 3vas:B
40 2i5b:A 269 123 0.1275 0.1450 0.3171 2.48e-04 2i5b:C, 2i5b:D, 2i5b:B, 2i5b:E
41 7l07:A 214 100 0.1013 0.1449 0.3100 3.37e-04
42 4ebu:A 306 254 0.2092 0.2092 0.2520 5.91e-04 4eum:A, 4eum:B
43 4e84:A 313 108 0.1046 0.1022 0.2963 7.19e-04 4e84:B, 4e8w:A, 4e8w:B, 4e8y:A, 4e8y:B, 4e8z:A, 4e8z:B
44 7r8y:A 228 116 0.1242 0.1667 0.3276 0.001
45 8ug1:B 305 299 0.2092 0.2098 0.2140 0.002 9fhd:A, 9fhd:B, 9fhe:A, 9fhe:B, 3nbv:A, 3nbv:B, 3nbw:A, 3nbw:B, 3nc2:A, 3nc2:B, 3nc9:A, 3nc9:B, 3nca:A, 8omf:A, 8omf:B, 8omj:A, 8omj:B, 8omk:A, 8omk:B, 3q92:A, 3q92:B, 3qa2:A, 3qa2:B, 3qai:A, 3qai:B, 3ro4:A, 8ug1:A, 8ug3:A, 8ug3:B, 6ul7:A, 6w0n:A, 6w0n:B, 6w0w:A, 6w0w:B, 6w0x:A, 6w0x:B, 6w0y:A, 6w0y:B, 6w0z:A, 6w0z:B, 5wbm:A, 5wbm:B, 5wbo:A, 5wbo:B, 5wbp:A, 5wbq:A, 5wbq:B, 5wbr:A, 5wbr:B, 5wbz:A, 5wbz:B
46 3b1n:B 320 88 0.0817 0.0781 0.2841 0.002 3b1n:A, 3b1p:A, 3b1q:A, 3b1q:B, 3b1q:C, 3b1q:D, 3b1q:E, 3b1q:F, 3b1r:A, 3b1r:B, 3b1r:C, 3b1r:D, 3b1r:E, 3b1r:F
47 4c5k:D 276 62 0.0719 0.0797 0.3548 0.002 4c5k:A, 4c5k:B, 4c5k:C, 4c5l:A, 4c5l:B, 4c5l:C, 4c5l:D, 4c5m:A, 4c5m:B, 4c5m:C, 4c5m:D, 4c5n:A, 4c5n:B, 4c5n:C, 4c5n:D
48 3zs7:A 277 68 0.0752 0.0830 0.3382 0.004
49 2ddo:A 263 102 0.1078 0.1255 0.3235 0.008 2ddw:A, 2ddw:B
50 8ome:A 298 37 0.0523 0.0537 0.4324 0.013 2hw1:A, 8ome:D, 8ome:B, 8ome:C
51 8omd:A 296 45 0.0556 0.0574 0.3778 0.018 8omd:C, 8omd:B, 8omd:D, 6p2d:A
52 1td2:A 287 122 0.1242 0.1324 0.3115 0.027 1td2:B
53 6k8z:B 298 47 0.0621 0.0638 0.4043 0.042 6k8z:A, 6k90:A, 6k90:B, 6k91:A, 6k91:B, 6k92:A, 6k92:B
54 7c1y:A 356 255 0.2059 0.1770 0.2471 0.083 7c1y:B, 7c1z:A, 7c1z:B
55 2f02:A 319 103 0.0980 0.0940 0.2913 0.14 2f02:B
56 4ywr:A 228 47 0.0621 0.0833 0.4043 0.14
57 2jg1:A 318 89 0.0752 0.0723 0.2584 0.33 2jg1:B, 2jg1:C, 2jg1:D, 2jgv:B, 2jgv:D
58 3mbh:A 290 114 0.1046 0.1103 0.2807 0.73 3mbh:B, 3mbh:C, 3mbh:D, 3mbh:E, 3mbh:F, 3mbj:A
59 7fca:D 282 270 0.2026 0.2199 0.2296 0.89 7cf8:A, 7cf8:E, 7fca:A, 7fca:E
60 3gdn:A 521 105 0.0850 0.0499 0.2476 0.96 3gdn:B, 3gdp:A, 3gdp:B, 1ju2:A, 1ju2:B
61 5ysq:B 280 134 0.1078 0.1179 0.2463 1.9 7e4l:A, 7e4l:B, 5ysp:A, 5ysp:B, 5ysq:A
62 2a9y:A 351 286 0.2190 0.1909 0.2343 2.0 2a9z:A, 2aa0:A, 2ab8:A, 2abs:A, 1dgm:A, 1lii:A, 1lij:A, 1lik:A
63 1jxi:A 254 98 0.0948 0.1142 0.2959 2.4 1jxi:B
64 5zwb:A 271 40 0.0523 0.0590 0.4000 4.1 5zw9:A, 5zwa:A, 5zwa:B
65 6wb7:A 296 87 0.0882 0.0912 0.3103 4.6 6wb7:B, 6wb7:C, 6wb7:D
66 7aam:B 287 42 0.0490 0.0523 0.3571 6.8 7aam:A
67 5ts3:A 265 35 0.0458 0.0528 0.4000 7.2 5ts3:B
68 1yt8:A 525 102 0.0882 0.0514 0.2647 8.6
69 7qcb:A 240 56 0.0458 0.0583 0.2500 9.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218