Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AGGAARPLGEFICQLCKEEYADPFALAQHKCSRIVRVEYRCPECAKVFSCPANLASHRRWHKPR

The query sequence (length=64) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8jpy:A 64 64 1.0000 1.0000 1.0000 3.49e-43 8jq1:A
2 2i13:B 144 51 0.2969 0.1319 0.3725 1.67e-06
3 2i13:B 144 51 0.2656 0.1181 0.3333 4.93e-05
4 2i13:B 144 54 0.2812 0.1250 0.3333 2.19e-04
5 2i13:B 144 51 0.2656 0.1181 0.3333 0.003
6 2i13:A 151 51 0.2969 0.1258 0.3725 1.96e-06
7 2i13:A 151 51 0.2656 0.1126 0.3333 3.28e-04
8 2i13:A 151 51 0.2656 0.1126 0.3333 0.004
9 2i13:A 151 51 0.2500 0.1060 0.3137 0.015
10 1mey:F 84 51 0.2500 0.1905 0.3137 2.57e-05 1mey:C
11 1mey:F 84 52 0.2500 0.1905 0.3077 8.34e-05 1mey:C
12 7txc:E 84 51 0.2500 0.1905 0.3137 1.06e-04
13 7txc:E 84 51 0.2031 0.1548 0.2549 0.60
14 2lce:A 64 51 0.2812 0.2812 0.3529 2.09e-04
15 6e93:A 112 51 0.2500 0.1429 0.3137 4.25e-04 6e94:A
16 6e93:A 112 54 0.2188 0.1250 0.2593 7.2 6e94:A
17 2n26:A 55 51 0.2500 0.2909 0.3137 6.52e-04
18 4m9v:C 60 52 0.2344 0.2500 0.2885 0.001 4gzn:C, 4m9v:F
19 1x6e:A 72 51 0.2500 0.2222 0.3137 0.001
20 5v3g:D 170 51 0.2500 0.0941 0.3137 0.001 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
21 5v3g:D 170 59 0.2500 0.0941 0.2712 0.007 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
22 5v3g:D 170 51 0.2344 0.0882 0.2941 0.010 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
23 5v3g:D 170 51 0.2344 0.0882 0.2941 0.022 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
24 5v3g:D 170 51 0.2188 0.0824 0.2745 0.022 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
25 2yrj:A 46 23 0.2031 0.2826 0.5652 0.002
26 2cot:A 77 51 0.2188 0.1818 0.2745 0.003
27 2cot:A 77 26 0.2031 0.1688 0.5000 0.004
28 2eoe:A 46 23 0.1875 0.2609 0.5217 0.004 2ytk:A
29 2ma7:A 73 55 0.2500 0.2192 0.2909 0.008
30 5wjq:D 281 51 0.2344 0.0534 0.2941 0.010 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
31 5wjq:D 281 49 0.2344 0.0534 0.3061 0.051 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
32 5wjq:D 281 51 0.2500 0.0569 0.3137 0.055 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
33 5wjq:D 281 51 0.2031 0.0463 0.2549 0.13 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
34 5wjq:D 281 49 0.2188 0.0498 0.2857 0.27 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
35 5wjq:D 281 49 0.2188 0.0498 0.2857 0.35 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
36 5wjq:D 281 23 0.1719 0.0391 0.4783 1.0 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
37 5wjq:D 281 51 0.2188 0.0498 0.2745 1.1 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
38 5wjq:D 281 51 0.2031 0.0463 0.2549 3.9 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
39 2ee8:A 106 57 0.2500 0.1509 0.2807 0.011
40 2ee8:A 106 51 0.2031 0.1226 0.2549 2.2
41 2yt9:A 95 49 0.2344 0.1579 0.3061 0.012
42 2dlq:A 124 47 0.2188 0.1129 0.2979 0.015
43 2ema:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.018
44 2kmk:A 82 49 0.2188 0.1707 0.2857 0.019
45 2ep3:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.021
46 2emj:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.022
47 2yta:A 41 23 0.1875 0.2927 0.5217 0.034
48 2eq2:A 46 23 0.1875 0.2609 0.5217 0.036 2ytr:A
49 2rsj:A 92 60 0.2500 0.1739 0.2667 0.039 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
50 7y3l:A 57 49 0.2031 0.2281 0.2653 0.076
51 7y3l:A 57 24 0.1406 0.1579 0.3750 5.3
52 2enf:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.088 2yti:A, 2ytn:A, 2yu8:A
53 2eoy:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.10
54 2eoj:A 44 23 0.1875 0.2727 0.5217 0.11
55 3w5k:B 110 50 0.2188 0.1273 0.2800 0.11
56 3w5k:B 110 51 0.2969 0.1727 0.3725 0.33
57 3w5k:B 110 50 0.2500 0.1455 0.3200 0.81
58 2ytf:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.11 2eof:A
59 2el4:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.12
60 2emk:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.13
61 2en6:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.14
62 2wbt:A 125 54 0.2344 0.1200 0.2778 0.14 2wbt:B
63 2en4:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.16
64 2ytj:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.17
65 2eq1:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.17
66 2ytb:A 42 23 0.1719 0.2619 0.4783 0.21
67 2en9:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 0.24
68 2ene:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.24
69 2emg:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.25
70 2eom:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.26
71 1p7a:A 37 23 0.1562 0.2703 0.4348 0.26 1u85:A, 1u86:A
72 2emy:A 46 23 0.1875 0.2609 0.5217 0.27 2el5:A
73 2emc:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.31
74 2emi:A 46 24 0.1562 0.2174 0.4167 0.32 2ytp:A
75 2em4:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.33
76 2ytd:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.34
77 2emp:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.37
78 6ml4:A 143 51 0.2188 0.0979 0.2745 0.37 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
79 6ml4:A 143 50 0.2031 0.0909 0.2600 0.42 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
80 2epu:A 45 23 0.1406 0.2000 0.3913 0.37
81 2emw:A 44 23 0.1719 0.2500 0.4783 0.38
82 2eol:A 42 23 0.1406 0.2143 0.3913 0.39
83 2en1:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.42 2yth:A
84 2em2:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.46
85 2em6:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.50
86 2em3:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.51
87 7w1m:H 322 48 0.2031 0.0404 0.2708 0.52 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
88 7w1m:H 322 49 0.1875 0.0373 0.2449 4.5 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
89 2ysv:A 42 23 0.1719 0.2619 0.4783 0.53
90 2ytq:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.74 2eog:A
91 2eor:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 0.74
92 2en0:A 42 23 0.1562 0.2381 0.4348 0.74
93 2eq0:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 0.84
94 2ept:A 41 23 0.1562 0.2439 0.4348 0.90
95 2eq3:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 0.90
96 7nf9:A 67 30 0.1406 0.1343 0.3000 1.0
97 2em7:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 1.2
98 1va1:A 37 40 0.2031 0.3514 0.3250 1.2
99 2emz:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 1.2
100 2el6:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 1.2
101 2epz:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 1.4
102 2elz:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 1.4
103 2emf:A 46 23 0.1250 0.1739 0.3478 1.5
104 2eow:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 1.5
105 2emm:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 1.6
106 2emv:A 44 23 0.1562 0.2273 0.4348 1.7
107 2eoi:A 44 23 0.1562 0.2273 0.4348 1.7
108 2yts:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 1.7
109 2ytm:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 1.8
110 2yte:A 42 23 0.1406 0.2143 0.3913 2.0
111 2yte:A 42 36 0.1875 0.2857 0.3333 2.8
112 2rsi:A 92 23 0.1562 0.1087 0.4348 2.0 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
113 2m9a:A 89 24 0.1719 0.1236 0.4583 2.0
114 2eoh:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 2.1
115 2nab:A 41 28 0.1875 0.2927 0.4286 2.2
116 8tho:A 100 21 0.1719 0.1100 0.5238 2.3 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
117 8e3e:F 121 51 0.2031 0.1074 0.2549 2.3 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
118 2enh:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 2.3
119 8pv1:Cb 101 21 0.1562 0.0990 0.4762 2.4 8pv2:Cb, 8pv3:Cb, 8pv4:Cb, 8pv5:Cb, 8pv6:Cb, 8pv7:Cb, 8pv8:Cb, 8pvk:Cb, 8pvl:Cb
120 2eme:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 2.4
121 2mdg:A 55 55 0.2188 0.2545 0.2545 2.5
122 2em1:A 44 23 0.1406 0.2045 0.3913 2.6
123 2em5:A 46 23 0.1250 0.1739 0.3478 2.7
124 2lvr:A 30 19 0.1250 0.2667 0.4211 3.1
125 2ysp:A 46 23 0.1250 0.1739 0.3478 3.3
126 2eop:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 3.3
127 2epy:A 42 23 0.1406 0.2143 0.3913 3.3
128 2emh:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 3.4
129 2epr:A 48 32 0.1406 0.1875 0.2812 4.4
130 2eox:A 44 23 0.1406 0.2045 0.3913 4.6
131 2yto:A 46 23 0.1250 0.1739 0.3478 4.6
132 2ytg:A 46 23 0.1250 0.1739 0.3478 4.7
133 2eml:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 4.8
134 2eqw:A 42 23 0.1406 0.2143 0.3913 5.5
135 2eq4:A 46 23 0.1719 0.2391 0.4783 5.8
136 7y3m:C 70 24 0.1406 0.1286 0.3750 5.8 8u15:C, 8u15:F, 8u16:C, 8u16:F, 8u17:C, 8u17:F, 7y3m:B, 7y3m:A, 7y3m:F, 7y3m:J, 7y3m:I
137 8cjf:B 638 62 0.2344 0.0235 0.2419 6.0 8cjd:A, 8cjd:B, 8cje:A, 8cje:B, 8cje:C, 8cje:D, 8cjf:A, 8cjg:A, 8cjg:B, 8jz2:A, 8jz3:A, 8jz4:A, 8jz5:A, 8jz6:A
138 2en7:A 44 23 0.1562 0.2273 0.4348 6.0
139 2eoz:A 46 23 0.1562 0.2174 0.4348 6.0
140 2zzj:A 238 33 0.2031 0.0546 0.3939 6.1
141 2eok:A 42 23 0.1250 0.1905 0.3478 6.1
142 6wmi:A 146 18 0.1406 0.0616 0.5000 7.0 6wmi:D
143 6wmi:A 146 53 0.2344 0.1027 0.2830 8.2 6wmi:D
144 4kyw:A 254 15 0.1094 0.0276 0.4667 7.2 4esj:A, 4esj:B
145 2epv:A 44 23 0.1562 0.2273 0.4348 7.8
146 2ep1:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 8.7 2ep2:A
147 2enc:A 46 23 0.1406 0.1957 0.3913 9.4
148 2epc:A 42 21 0.1406 0.2143 0.4286 9.7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417