BioLiP

>protein
AELVASAKAAISQASDVAALDNVRVEYLGKKGHLTLQMTTLRELPPEERPAAGAVINEAKEQVQQALNARKAELESAALN
ARLAAETIDVSLPGRRIENGGLHPVTRTIDRIESFFGELGFTVATGPEIEDDYHNFDALNIPGHHPARADHDTFWFDTTR
LLRTQTSGVQIRTMKAQQPPIRIIAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQMEGLIVDTNISFTNLKGTLHDFLRNFFEEDLQIRFR
PSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPEVYSGFAFGMGMERLTMLRYGVTDLRSFFENDLRFLK
QFK

The query sequence (length=323) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3pco:C	323	323	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6oz5:A, 6oz5:C, 6p24:A, 6p26:A, 6p26:C, 3pco:A
2	6p8t:H	326	307	0.5975	0.5920	0.6287	7.00e-146	6p8t:C, 6p8t:D, 6p8t:G
3	4p72:D	244	244	0.5263	0.6967	0.6967	1.99e-128	4p72:C, 4p73:C, 4p73:D, 4p74:C, 4p74:D, 4p75:C, 4p75:D
4	7k98:A	343	327	0.4737	0.4461	0.4679	2.66e-97	7daw:A, 7db7:A, 7db8:A, 7k98:D, 7k9m:A, 7ka0:A, 7ka0:D, 7kab:A
5	1eiy:A	345	341	0.4830	0.4522	0.4575	1.81e-94	2akw:A, 2aly:A, 2amc:A, 1b70:A, 1b7y:A, 3hfz:A, 2iy5:A, 1jjc:A, 3teh:A, 4tva:A
6	2rhs:C	271	259	0.4241	0.5055	0.5290	6.57e-94	2rhq:A, 2rhs:A
7	5mgu:A	407	274	0.2693	0.2138	0.3175	3.77e-35	3cmq:A, 3hfv:A, 5mgh:A, 5mgw:A, 8p8x:A, 3teg:A, 3tup:A
8	7by6:A	299	272	0.2632	0.2843	0.3125	1.24e-33
9	3l4g:C	508	261	0.2663	0.1693	0.3295	2.48e-33	3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
10	7dpi:C	292	272	0.2601	0.2877	0.3088	6.88e-33	7dpi:A
11	2du4:A	466	237	0.1765	0.1223	0.2405	1.00e-08	2du3:B, 2du5:B, 2du6:B
12	5x6c:A	539	162	0.1331	0.0798	0.2654	2.73e-08	5x6c:B
13	5x6c:A	539	72	0.0588	0.0353	0.2639	1.8	5x6c:B
14	2du3:A	534	144	0.1084	0.0655	0.2431	3.07e-06	2du5:A, 2du6:A
15	8dvm:A	612	59	0.0681	0.0359	0.3729	2.1	4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
16	3bk7:A	593	43	0.0526	0.0287	0.3953	2.6	3j15:B, 5lw7:B, 1yqt:A, 5yv5:A
17	2wk1:A	242	31	0.0372	0.0496	0.3871	3.8
18	4rkc:A	398	35	0.0495	0.0402	0.4571	4.2	4rkc:B, 4rkd:A, 4rkd:B, 4rkd:C, 4rkd:D, 4rkd:E, 4rkd:F, 4rkd:G, 4rkd:H, 6t3v:A, 6zup:B, 6zup:A, 6zur:B, 6zur:A, 6zvg:A, 6zvg:B, 6zvg:C, 6zvg:D
19	7dur:R	371	47	0.0464	0.0404	0.3191	4.4	7lll:R, 7lly:R
20	6yhs:E	175	65	0.0743	0.1371	0.3692	4.6	7m4v:G, 7m4w:G, 7m4x:G, 7m4y:G, 7m4z:G, 7ryf:G, 7ryg:G, 7ryh:G, 7uvv:G, 7uvw:G, 7uvx:G, 7uvy:G, 7uvz:G, 7uw1:G, 6v39:G, 6v3a:G, 6v3b:G, 6v3d:G, 6ysi:E
21	6kjv:B	424	48	0.0464	0.0354	0.3125	4.7	6kjv:A, 6kk1:A, 6kk1:B, 6kk7:A, 6kk7:B, 5vew:A, 5vew:B, 5vex:A, 5vex:B
22	6ln2:A	437	32	0.0341	0.0252	0.3438	7.5	3c59:A, 3c5t:A, 3iol:A, 5otu:A, 5otu:C, 5otv:C, 5otv:A, 5otw:C, 5otw:A, 5otx:A, 5otx:C, 4zgm:A
23	6hyj:B	223	112	0.1053	0.1525	0.3036	7.6	6hyj:A, 6hyy:A, 6hyy:B, 1l8l:A, 1l8l:B, 1l8o:A, 1l8o:B, 1nnl:A, 1nnl:B, 6q6j:A, 6q6j:B
24	6nb3:A	1169	101	0.0743	0.0205	0.2376	8.3	5gmq:A, 6j11:A, 6j11:B, 6j11:C, 7m5e:C, 7m5e:E, 7m5e:A, 6nb4:A, 6pxh:A, 6pxh:B, 6q04:C, 6q04:A, 6q04:B, 6q05:C, 6q05:A, 6q05:B, 6q06:C, 6q06:A, 6q06:B, 6q07:C, 6q07:A, 6q07:B, 7ymt:B, 7ymt:C, 7ymv:A, 7ymv:B, 7ymy:B, 7ymz:B, 7yn0:A, 7yn0:B, 7yn0:C
25	1lpm:A	534	68	0.0619	0.0375	0.2941	8.7	1lpn:A, 1lpo:A, 1lpp:A, 1lps:A, 3rar:A
26	7qh8:A	471	19	0.0310	0.0212	0.5263	8.9	7qhn:A, 7qi8:A

[Back]