Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ADYQGKNVVIIGLGLTGLSCVDFFLARGVTPRVMDTRMTPPGLDKLPEAVERHTGSLNDEWLMAADLIVASPGIALAHPS
LSAAADAGIEIVGDIELFCREAQAPIVAITGSNGKSTVTTLVGEMAKAAGVNVGVGGNIGLPALMLLDDECELYVLELSS
FQLETTSSLQAVAATILNVTEDHMDRYPFGLQQYRAAKLRIYENAKVCVVNADDALTMPIRERCVSFGVNMGDYHLNHGE
TWLRVKGEKVLNVKEMKLSGQHNYTNALAALALADAAGLPRASSLKALTTFTGLPHRFEVVLEHNGVRWINDSKATNVGS
TEAALNGLHVDGTLHLLLGGDGKSADFSPLARYLNGDNVRLYCFGRDGAQLAALRPEVAEQTETMEQAMRLLAPRVQPGD
MVLLSPACASLDQFKNFEQRGNEFARLAKELGSH

The query sequence (length=434) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2jfg:A 439 439 1.0000 0.9886 0.9886 0.0 5a5f:A, 9bn8:A, 9bn9:A, 1eeh:A, 2jff:A, 2jfh:A, 1uag:A, 2uag:A, 3uag:A, 4uag:A, 2uuo:A, 2uup:A, 2vtd:A, 2vte:A, 8vw0:A, 8vw1:A, 8vw2:A, 2wjp:A, 2x5o:A, 2xpc:A, 2y1o:A, 2y66:A, 2y67:A, 2y68:A
2 8dp2:A 446 443 0.5207 0.5067 0.5102 3.00e-122 7u35:A, 7u35:B, 7u35:C
3 7ti7:A 442 434 0.4493 0.4412 0.4493 5.44e-110
4 4buc:A 427 395 0.2581 0.2623 0.2835 1.33e-33 4buc:B
5 8egn:A 309 249 0.1359 0.1909 0.2369 5.82e-07 9d9k:A, 8dof:A, 8egm:A, 8egm:B, 8egm:C, 8egm:D, 8egm:E, 8egm:F, 8egm:G, 8egm:H, 8egn:B, 8ewa:A, 8ewa:B, 6x9f:A, 6x9f:B, 6x9f:C, 6x9f:D, 6x9f:E, 6x9f:F, 6x9f:G, 6x9f:H, 6x9n:A, 6x9n:B, 6x9n:C, 6x9n:D, 6x9n:E, 6x9n:F, 6x9n:G, 6x9n:H
6 6vr7:A 485 246 0.1406 0.1258 0.2480 7.77e-07
7 4hv4:A 465 292 0.1636 0.1527 0.2432 2.37e-06 4hv4:B
8 1gqy:B 469 307 0.1705 0.1578 0.2410 2.38e-06 1gqy:A, 1p31:A, 1p31:B, 1p3d:A, 1p3d:B
9 8g6p:A 508 279 0.1682 0.1437 0.2616 2.79e-06
10 4qf5:A 459 285 0.1751 0.1656 0.2667 4.99e-06 4qdi:A, 4qf5:B, 4ziy:A
11 3zl8:A 427 378 0.2097 0.2131 0.2407 2.12e-04
12 7lgm:A 719 174 0.1129 0.0682 0.2816 0.004 7lgm:B
13 6cau:A 307 266 0.1590 0.2248 0.2594 0.013
14 4bub:B 483 164 0.1060 0.0952 0.2805 0.16 4bub:A
15 2am1:A 454 198 0.1060 0.1013 0.2323 0.22 2am2:A, 3zm5:A, 3zm6:A
16 2esd:A 474 125 0.0760 0.0696 0.2640 0.32 2esd:B, 2esd:C, 2esd:D, 2euh:A, 2euh:B, 2euh:C, 2euh:D, 2id2:A, 2id2:B, 2id2:C, 2id2:D, 2qe0:A, 2qe0:B, 2qe0:C, 2qe0:D, 1qi1:A, 1qi1:B, 1qi1:C, 1qi1:D
17 7q8e:A 397 94 0.0576 0.0630 0.2660 0.42 6gs2:B, 6gs2:D, 6h5e:B, 6h5e:D, 7q8e:C
18 3lxd:A 409 66 0.0507 0.0538 0.3333 0.96
19 3lxd:A 409 137 0.0783 0.0831 0.2482 9.5
20 2wtz:B 508 348 0.1843 0.1575 0.2299 1.0 2wtz:A, 2wtz:D, 2xja:A, 2xja:B, 2xja:C, 2xja:D
21 4cvm:A 443 296 0.1751 0.1716 0.2568 1.5 4cvk:A, 4cvl:A
22 7bva:A 480 152 0.0968 0.0875 0.2763 3.2 7bva:B, 7bvb:A, 7bvb:B
23 3ihg:A 535 69 0.0507 0.0411 0.3188 3.8 3ihg:B, 3ihg:C
24 4p56:B 317 34 0.0300 0.0410 0.3824 4.6 4p56:A, 4p56:C
25 4c12:A 493 234 0.1198 0.1055 0.2222 5.1 4c13:A
26 2ww9:A 490 40 0.0369 0.0327 0.4000 6.1 2wwa:A
27 5xla:A 490 87 0.0530 0.0469 0.2644 6.7 3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
28 5w81:A 1173 129 0.0737 0.0273 0.2481 7.4
29 3pyz:A 410 100 0.0622 0.0659 0.2700 7.5 3n2a:A, 3qcz:A
30 7yj0:D 622 34 0.0300 0.0209 0.3824 7.8 7yj0:A, 7yj0:B, 7yj0:C
31 6qrb:A 220 78 0.0645 0.1273 0.3590 8.3 6nw6:A, 6nw6:B, 6nw7:A, 6nw7:B, 6qo2:A, 6qo2:B, 6qo3:A, 6qo3:B, 6qo4:A, 6qo4:B, 6qo6:A, 6qo6:B, 6qoa:A, 6qoa:B, 6qoc:A, 6qoc:B, 6qod:A, 6qod:B, 6qoe:B, 6qof:A, 6qof:B, 6qog:A, 6qoh:A, 6qoh:B, 6qoi:A, 6qoi:B, 6qoj:A, 6qoj:B, 6qok:A, 6qok:B, 6qol:A, 6qol:B, 6qom:A, 6qon:A, 6qon:B, 6qoo:A, 6qoo:B, 6qop:A, 6qop:B, 6qoq:A, 6qoq:B, 6qor:A, 6qor:B, 6qos:A, 6qos:B, 6qot:A, 6qot:B, 6qou:A, 6qou:B, 6qov:A, 6qov:B, 6qow:A, 6qow:B, 6qox:B, 6qqq:A, 6qqq:B, 6qqr:B, 6qqs:A, 6qqt:A, 6qqt:B, 6qqu:A, 6qqu:B, 6qqv:A, 6qqv:B, 6qqw:A, 6qqx:A, 6qqx:B, 6qqy:A, 6qqy:B, 6qqz:A, 6qr0:A, 6qr1:A, 6qr2:A, 6qr3:A, 6qr3:B, 6qr4:A, 6qr4:B, 6qr5:A, 6qr6:A, 6qr6:B, 6qr7:A, 6qr7:B, 6qr8:A, 6qr8:B, 6qr9:A, 6qr9:B, 6qra:A, 6qra:B, 6qrb:B, 6qrc:A, 6qrc:B, 6qrd:A, 6qrd:B, 6qre:A, 6qre:B, 6qrf:A, 6qrg:A, 6qrg:B, 7rez:A, 7rez:B, 7rf0:A, 7rf0:B
32 4y81:C 240 35 0.0276 0.0500 0.3429 9.1
33 6fw8:B 417 40 0.0276 0.0288 0.3000 9.6 6esd:B, 6esd:A, 6fw7:B, 6fw7:A, 6fw8:A, 6fw9:B, 6fw9:A, 6fwa:B, 6fwa:A, 6g2p:B, 6g2p:A, 5g3s:A, 5g3s:B, 5g3t:A, 5g3t:B, 5g3t:C, 5g3t:D, 5g3u:A, 5g3u:B, 5zbc:A, 5zbc:B, 5zbd:A, 5zbd:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218