BioLiP

>protein
AALEPTDSGAPSAIVMFPVGEKPNPKGAAMKPVVFNHLIHEKKIADCETCHHTGDPVSCSTCHTVEGKAEGDYITLDRAM
HATDIAARAKGNTPTSCVSCHQSETKERRECAGCHAITTPKDDEAWCATCHDITPSMTPSEMQKGIAGTLLPGDNEALAA
ETVLAEATVAPVSPMLAPYKVVIDALADKYEPSDFTHRRHLTSLMESIKDDKLAQAFHDKPEILCATCHHRSPLSLTPPK
CGSCHTKEIDAADPGRPNLMAAYHLECMGCHKGMAVARPRDTDCTTCHKAAA

The query sequence (length=292) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	19hc:A	292	292	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	19hc:B, 1ofw:A, 1ofw:B, 1ofy:A, 1ofy:B
2	1duw:A	289	287	0.7774	0.7855	0.7909	7.14e-176
3	1gws:A	503	286	0.3938	0.2286	0.4021	2.71e-64	2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
4	1gws:A	503	98	0.0959	0.0557	0.2857	0.17	2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
5	1gws:A	503	111	0.1130	0.0656	0.2973	1.1	2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
6	1gws:A	503	269	0.2089	0.1213	0.2268	1.8	2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
7	2e84:A	513	296	0.4007	0.2281	0.3953	3.26e-52
8	2e84:A	513	291	0.2397	0.1365	0.2405	0.014
9	1z1n:X	516	274	0.3048	0.1725	0.3248	1.94e-41
10	1z1n:X	516	272	0.2397	0.1357	0.2574	0.038
11	1z1n:X	516	116	0.1164	0.0659	0.2931	0.063
12	1qn0:A	112	106	0.1130	0.2946	0.3113	1.98e-04	1qn1:A, 1wad:A
13	1j0p:A	108	94	0.1062	0.2870	0.3298	0.018	2cdv:A, 2ewi:A, 2ewk:A, 2ewu:A, 2ffn:A, 1it1:A, 1j0o:A, 1wr5:A, 2yxc:A, 2yyw:A, 2yyx:A, 2z47:A, 2z47:B
14	2cy3:A	118	118	0.1199	0.2966	0.2966	0.030	1w7o:A
15	3cao:A	103	59	0.0753	0.2136	0.3729	0.038	3car:A
16	3cao:A	103	95	0.1027	0.2913	0.3158	0.095	3car:A
17	3cyr:A	107	99	0.1062	0.2897	0.3131	0.053	1gm4:A, 1gmb:A, 2kmy:A, 2ksu:A, 1up9:A, 1upd:A
18	3cyr:A	107	92	0.0925	0.2523	0.2935	2.5	1gm4:A, 1gmb:A, 2kmy:A, 2ksu:A, 1up9:A, 1upd:A
19	2bq4:B	115	125	0.1301	0.3304	0.3040	0.082	2bq4:A
20	6jzb:A	251	100	0.1027	0.1195	0.3000	0.083
21	1i77:A	107	77	0.0753	0.2056	0.2857	0.087
22	3ov0:A	318	241	0.2089	0.1918	0.2531	0.14	3oue:A, 3ouq:A, 1rwj:A
23	1nlt:A	228	96	0.0788	0.1009	0.2396	0.16
24	1a2i:A	107	97	0.0959	0.2617	0.2887	0.73	2bpn:A, 2cth:A, 2cth:B, 2cym:A, 1gx7:E, 1mdv:A, 1mdv:B
25	3pmq:A	593	76	0.0788	0.0388	0.3026	1.3
26	4lsy:B	88	71	0.0685	0.2273	0.2817	1.5
27	6wn6:B	264	137	0.1267	0.1402	0.2701	1.7	6wn6:A, 6wn6:C, 6wn6:D
28	1gyo:A	106	56	0.0616	0.1698	0.3214	1.7	1gyo:B
29	1zzh:B	308	83	0.0685	0.0649	0.2410	2.6	1zzh:A, 1zzh:C, 1zzh:D
30	5um2:A	316	56	0.0651	0.0601	0.3393	2.7
31	2f17:A	255	109	0.1096	0.1255	0.2936	3.3	2f17:B, 1ig3:A, 1ig3:B
32	3h4n:B	69	72	0.0719	0.3043	0.2917	3.8	3h4n:A
33	6lod:A	218	129	0.1027	0.1376	0.2326	4.2	6loe:A
34	6knb:B	1120	42	0.0582	0.0152	0.4048	4.5	6knc:B
35	6z1p:AV	129	26	0.0411	0.0930	0.4615	4.7
36	4lmh:D	695	52	0.0616	0.0259	0.3462	4.9	4lmh:A, 4lmh:B, 4lmh:C
37	4nn2:A	124	36	0.0479	0.1129	0.3889	5.5	4nn2:B
38	4pgh:D	358	68	0.0753	0.0615	0.3235	6.0	4pgh:A, 4pgh:B, 4pgh:C
39	4haj:A	71	83	0.0856	0.3521	0.3012	6.3	4hb6:A, 4hb8:A, 4hbf:A, 4hc3:A, 4hdl:A, 2ldo:A, 2lzz:A, 2mz9:A, 2n91:A, 1os6:A, 3sel:X, 3sj0:X, 3sj1:X, 3sj4:X
40	8d9m:A	258	47	0.0548	0.0620	0.3404	6.9	7lq5:A, 7lq5:B, 7lq5:C
41	6e1c:B	323	113	0.0925	0.0836	0.2389	7.0
42	7lr8:B	415	108	0.0993	0.0699	0.2685	9.4	7lr8:A

[Back]