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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    1 1b6g:A (1.15) BS03 GOL 3.8.1.5 GO:0003824 ... P22643 10393294
    2 1b6g:A (1.15) BS04 GOL 3.8.1.5 GO:0003824 ... P22643 10393294
    3 1b6g:A (1.15) BS05 GOL 3.8.1.5 GO:0003824 ... P22643 10393294
    4 1bg4:A (1.75) BS01 GOL 3.2.1.8 GO:0004553 ... P56588 9792094
    5 1bg4:A (1.75) BS02 GOL 3.2.1.8 GO:0004553 ... P56588 9792094
    6 1bg4:A (1.75) BS03 GOL 3.2.1.8 GO:0004553 ... P56588 9792094
    7 1bg4:A (1.75) BS04 GOL 3.2.1.8 GO:0004553 ... P56588 9792094
    8 1bg4:A (1.75) BS05 GOL 3.2.1.8 GO:0004553 ... P56588 9792094
    9 1bg4:A (1.75) BS06 GOL 3.2.1.8 GO:0004553 ... P56588 9792094
    10 1bhp:A (1.7) BS02 GOL ? GO:0006952 ... P01543 15299761
    11 1bo5:O (3.2) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9843423
    12 1bo5:Z (3.2) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9843423
    13 1bot:O (3.05) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9843423
    14 1bot:Z (3.05) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9843423
    15 1bu6:O (2.37) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    16 1bu6:X (2.37) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    17 1bu6:Y (2.37) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    18 1bu6:Z (2.37) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    19 1bwf:O (3.0) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 10090737
    20 1bwf:Y (3.0) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 10090737
    21 1dbf:A (1.3) BS03 GOL 5.4.99.5 GO:0004106 ... P19080 10818343
    22 1dbf:A (1.3) BS04 GOL 5.4.99.5 GO:0004106 ... P19080 10818343
    23 1dbf:A (1.3) BS05 GOL 5.4.99.5 GO:0004106 ... P19080 10818343
    24 1dbf:B (1.3) BS04 GOL 5.4.99.5 GO:0004106 ... P19080 10818343
    25 1dbf:C (1.3) BS03 GOL 5.4.99.5 GO:0004106 ... P19080 10818343
    26 1df7:A (1.7) BS03 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    27 1df7:A (1.7) BS04 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    28 1df7:A (1.7) BS05 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    29 1dg5:A (2.0) BS03 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    30 1dg7:A (1.8) BS03 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    31 1dg7:A (1.8) BS04 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    32 1dg7:A (1.8) BS05 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    33 1dg8:A (2.0) BS02 GOL 1.5.1.3 GO:0004146 ... P9WNX1 10623528
    34 1eu5:A (1.45) BS01 GOL 3.6.1.23 GO:0000287 ... P06968 11375495
    35 1euw:A (1.05) BS01 GOL 3.6.1.23 GO:0000287 ... P06968 11375495
    36 1fx8:A (2.2) BS01 GOL ? GO:0005372 ... P0AER0 11039922
    37 1fx8:A (2.2) BS02 GOL ? GO:0005372 ... P0AER0 11039922
    38 1gk1:B (2.4) BS01 GOL 3.5.1.93 GO:0016787 ... P07662 11742126
    39 1gk1:D (2.4) BS01 GOL 3.5.1.93 GO:0016787 ... P07662 11742126
    40 1gla:G (2.6) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 8430315
    41 1glb:G (2.6) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 8430315
    42 1glf:O (2.62) BS03 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    43 1glf:X (2.62) BS03 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    44 1glf:Y (2.62) BS03 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    45 1glf:Z (2.62) BS03 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 9817843
    46 1glj:O (3.0) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 10090737
    47 1glj:Y (3.0) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 10090737
    48 1gll:O (3.0) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 10090737
    49 1gll:Y (3.0) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 10090737
    50 1gm6:A (2.13) BS01 GOL ? GO:0005549 ... P81608 12027882
    51 1gu1:A (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    52 1gu1:B (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    53 1gu1:C (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    54 1gu1:D (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    55 1gu1:E (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    56 1gu1:F (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    57 1gu1:G (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    58 1gu1:H (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    59 1gu1:I (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    60 1gu1:J (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    61 1gu1:K (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    62 1gu1:L (1.8) BS02 GOL 4.2.1.10 GO:0003855 ... P15474 11937054
    63 1h5y:A (2.0) BS03 GOL 4.3.2.10 GO:0000105 ... Q8ZY16 11679715
    64 1h5y:A (2.0) BS04 GOL 4.3.2.10 GO:0000105 ... Q8ZY16 11679715
    65 1h5y:B (2.0) BS03 GOL 4.3.2.10 GO:0000105 ... Q8ZY16 11679715
    66 1h5y:B (2.0) BS04 GOL 4.3.2.10 GO:0000105 ... Q8ZY16 11679715
    67 1h6b:A (2.6) BS02 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    68 1h6d:A (2.05) BS02 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    69 1h6d:B (2.05) BS02 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    70 1h6d:C (2.05) BS03 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    71 1h6d:D (2.05) BS03 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    72 1h6d:E (2.05) BS02 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
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    74 1h6d:G (2.05) BS03 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    75 1h6d:H (2.05) BS03 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    76 1h6d:I (2.05) BS02 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
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    78 1h6d:K (2.05) BS03 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    79 1h6d:L (2.05) BS03 GOL 1.1.99.28 GO:0000166 ... Q07982 11705375
    80 1isp:A (1.3) BS01 GOL 3.1.1.3 GO:0004806 ... P37957 12077437
    81 1iuq:A (1.55) BS01 GOL 2.3.1.15
    2.3.1.n5    		 GO:0004366 ... P10349 14684887
    82 1iuq:A (1.55) BS02 GOL 2.3.1.15
    2.3.1.n5    		 GO:0004366 ... P10349 14684887
    83 1iuq:A (1.55) BS03 GOL 2.3.1.15
    2.3.1.n5    		 GO:0004366 ... P10349 14684887
    84 1iuq:A (1.55) BS04 GOL 2.3.1.15
    2.3.1.n5    		 GO:0004366 ... P10349 14684887
    85 1iuq:A (1.55) BS05 GOL 2.3.1.15
    2.3.1.n5    		 GO:0004366 ... P10349 14684887
    86 1jqa:A (2.05) BS03 GOL 1.1.1.6 GO:0005829 ... P32816 11566129
    87 1k3y:A (1.3) BS02 GOL 1.11.1.-
    2.5.1.18
    5.3.3.-    		 GO:0004364 ... P08263 12211029
    88 1k3y:A (1.3) BS03 GOL 1.11.1.-
    2.5.1.18
    5.3.3.-    		 GO:0004364 ... P08263 12211029
    89 1k3y:B (1.3) BS03 GOL 1.11.1.-
    2.5.1.18
    5.3.3.-    		 GO:0004364 ... P08263 12211029
    90 1k4o:A (1.1) BS03 GOL 4.1.99.12 GO:0003824 ... Q8TG90 11827524
    91 1l1g:A (1.5) BS03 GOL 3.4.21.36 GO:0004252 ... P00772 12198297
    92 1lb3:A (1.21) BS04 GOL ? GO:0005506 ... P29391 12459904
    93 1lb3:A (1.21) BS05 GOL ? GO:0005506 ... P29391 12459904
    94 1lk6:I (2.8) BS03 GOL ? GO:0002020 ... P01008 12578831
    95 1mqf:A (2.5) BS04 GOL 1.11.1.6 GO:0004096 ... P42321 14646074
    96 1mu7:A (2.0) BS02 GOL 3.1.4.- GO:0005634 ... Q9NUW8 12470949
    97 1mu7:B (2.0) BS02 GOL 3.1.4.- GO:0005634 ... Q9NUW8 12470949
    98 1mu9:A (2.05) BS02 GOL 3.1.4.- GO:0005634 ... Q9NUW8 12470949
    99 1mu9:B (2.05) BS02 GOL 3.1.4.- GO:0005634 ... Q9NUW8 12470949
    100 1nhc:A (1.7) BS01 GOL 3.2.1.15 GO:0004650 ... P26213 14623112
    101 1nhc:B (1.7) BS02 GOL 3.2.1.15 GO:0004650 ... P26213 14623112
    102 1nhc:D (1.7) BS02 GOL 3.2.1.15 GO:0004650 ... P26213 14623112
    103 1nhc:E (1.7) BS04 GOL 3.2.1.15 GO:0004650 ... P26213 14623112
    104 1nhc:F (1.7) BS02 GOL 3.2.1.15 GO:0004650 ... P26213 14623112
    105 1nm0:A (2.3) BS05 GOL 1.11.1.6 GO:0004096 ... P42321 14646074
    106 1p1j:A (1.7) BS03 GOL 5.5.1.4 GO:0004512 ... P11986 12832758
    107 1p1j:B (1.7) BS03 GOL 5.5.1.4 GO:0004512 ... P11986 12832758
    108 1q4g:A (2.0) BS04 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... P05979 14672659
    109 1q4g:A (2.0) BS05 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... P05979 14672659
    110 1q4g:B (2.0) BS03 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... P05979 14672659
    111 1q4g:B (2.0) BS04 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... P05979 14672659
    112 1q4g:B (2.0) BS05 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... P05979 14672659
    113 1qa7:D (1.9) BS02 GOL 2.7.7.48
    3.4.22.28
    3.6.1.15    		 GO:0004197 ... P08617 10603326
    114 1qd1:A (1.7) BS02 GOL 2.1.2.5
    4.3.1.4    		 GO:0005542 ... P53603 10673422
    115 1qd1:B (1.7) BS02 GOL 2.1.2.5
    4.3.1.4    		 GO:0005542 ... P53603 10673422
    116 1r9d:A (1.8) BS01 GOL ? GO:0003824 ... Q8GEZ8 15096031
    117 1r9d:B (1.8) BS01 GOL ? GO:0003824 ... Q8GEZ8 15096031
    118 1rhy:B (2.3) BS01 GOL 4.2.1.19 GO:0000105 ... P0CO22 14724278
    119 1txg:A (1.7) BS01 GOL 1.1.1.- GO:0005737 ... O29390 15557260
    120 1txg:B (1.7) BS01 GOL 1.1.1.- GO:0005737 ... O29390 15557260
    121 1u02:A (1.92) BS02 GOL 3.1.3.12 GO:0000287 ... Q9HIW7 16815921
    122 1u02:A (1.92) BS03 GOL 3.1.3.12 GO:0000287 ... Q9HIW7 16815921
    123 1uoe:A (2.0) BS01 GOL 2.7.1.121 GO:0004371 ... P76015 15476397
    124 1uoe:B (2.0) BS01 GOL 2.7.1.121 GO:0004371 ... P76015 15476397
    125 1vc4:B (1.8) BS01 GOL 4.1.1.48 GO:0000162 ... P84126 22120743
    126 1xc4:A (2.8) BS02 GOL 4.2.1.20 GO:0000162 ... P0A877 15451433
    127 1xc4:B (2.8) BS02 GOL 4.2.1.20 GO:0000162 ... P0A877 15451433
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    200 2rgl:B (2.2) BS02 GOL 3.2.1.21 GO:0004553 ... Q75I93 18308333
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

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