Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 44457 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.

    • Sort results by
    << < 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    33401 6ujb:A (3.51) BS04 CA ? GO:0001525 ... P06756 31955848
    33402 6ujb:B (3.51) BS01 CA ? GO:0001570 ... P26012 31955848
    33403 6ujc:A (3.56) BS01 CA ? GO:0001525 ... P06756 31955848
    33404 6ujc:A (3.56) BS02 CA ? GO:0001525 ... P06756 31955848
    33405 6ujc:A (3.56) BS03 CA ? GO:0001525 ... P06756 31955848
    33406 6ujc:A (3.56) BS04 CA ? GO:0001525 ... P06756 31955848
    33407 6ujc:B (3.56) BS01 CA ? GO:0001570 ... P26012 31955848
    33408 6uke:X (1.62) BS03 CA N/A N/A N/A 31879785
    33409 6ukf:X (1.0) BS03 CA N/A N/A N/A 31879785
    33410 6ukh:X (2.82) BS03 CA N/A N/A N/A 31879785
    33411 6uki:X (2.7) BS03 CA N/A N/A N/A 31879785
    33412 6uki:Y (2.7) BS03 CA N/A N/A N/A 31879785
    33413 6ulb:A (1.75) BS01 CA ? N/A P04278 N/A
    33414 6ulm:A (2.15) BS01 CA ? GO:0005509 ... Q12864 33682793
    33415 6ulm:A (2.15) BS02 CA ? GO:0005509 ... Q12864 33682793
    33416 6ulm:A (2.15) BS03 CA ? GO:0005509 ... Q12864 33682793
    33417 6ulm:B (2.15) BS01 CA ? GO:0005509 ... Q12864 33682793
    33418 6ulm:B (2.15) BS02 CA ? GO:0005509 ... Q12864 33682793
    33419 6ulm:B (2.15) BS03 CA ? GO:0005509 ... Q12864 33682793
    33420 6ulw:A (3.4) BS01 CA N/A GO:0031177 ... N/A 32066969
    33421 6ulw:D (3.4) BS01 CA N/A GO:0031177 ... N/A 32066969
    33422 6ur9:A (2.1) BS04 CA 2.7.7.7 GO:0000166 ... D9N168 32188786
    33423 6usc:A (1.59) BS01 CA ? GO:0001934 ... Q8WWA0 31930911
    33424 6usc:A (1.59) BS02 CA ? GO:0001934 ... Q8WWA0 31930911
    33425 6usc:A (1.59) BS03 CA ? GO:0001934 ... Q8WWA0 31930911
    33426 6usc:B (1.59) BS01 CA ? GO:0001934 ... Q8WWA0 31930911
    33427 6usc:B (1.59) BS02 CA ? GO:0001934 ... Q8WWA0 31930911
    33428 6usc:B (1.59) BS03 CA ? GO:0001934 ... Q8WWA0 31930911
    33429 6uss:A (2.5) BS01 CA ? N/A A0A081TVR9 32993284
    33430 6uss:B (2.5) BS01 CA ? N/A A0A081TVR9 32993284
    33431 6ust:A (2.6) BS01 CA 3.1.6.1 GO:0004065 ... A0A174CV66 32993284
    33432 6ust:B (2.6) BS01 CA 3.1.6.1 GO:0004065 ... A0A174CV66 32993284
    33433 6ust:C (2.6) BS01 CA 3.1.6.1 GO:0004065 ... A0A174CV66 32993284
    33434 6ust:D (2.6) BS01 CA 3.1.6.1 GO:0004065 ... A0A174CV66 32993284
    33435 6utu:C (2.85) BS01 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33436 6utu:C (2.85) BS02 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33437 6utu:C (2.85) BS03 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33438 6utu:F (2.85) BS01 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33439 6utu:F (2.85) BS02 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33440 6utu:F (2.85) BS03 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33441 6utu:I (2.85) BS01 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33442 6utu:I (2.85) BS02 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33443 6utu:I (2.85) BS03 CA ? GO:0009306 ... Q00518 31906428
    33444 6uuy:B (1.37) BS03 CA 2.8.2.- GO:0046872 ... A0A094ZWQ2 32027942
    33445 6uvw:A (2.551) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33446 6uvw:A (2.551) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33447 6uvw:A (2.551) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33448 6uvw:D (2.551) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33449 6uvw:D (2.551) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33450 6uvx:B (2.3) BS01 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33451 6uw0:A (2.72) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33452 6uw0:A (2.72) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33453 6uw0:B (2.72) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33454 6uw0:B (2.72) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33455 6uw1:B (2.205) BS02 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33456 6uw3:B (2.4) BS02 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33457 6uw3:B (2.4) BS03 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33458 6uw5:B (2.2) BS03 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33459 6uw5:B (2.2) BS04 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33460 6uw7:B (2.342) BS02 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    33461 6uwg:A (2.22) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33462 6uwg:A (2.22) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33463 6uwg:A (2.22) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33464 6uwg:A (2.22) BS06 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33465 6uwh:A (2.299) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33466 6uwh:A (2.299) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33467 6uwh:A (2.299) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33468 6uwh:A (2.299) BS06 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    33469 6uwi:A (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33470 6uwi:A (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33471 6uwi:A (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33472 6uwi:A (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33473 6uwi:A (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33474 6uwi:A (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33475 6uwi:B (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33476 6uwi:B (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33477 6uwi:B (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33478 6uwi:B (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33479 6uwi:B (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33480 6uwi:B (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33481 6uwi:C (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33482 6uwi:C (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33483 6uwi:C (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33484 6uwi:C (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33485 6uwi:C (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33486 6uwi:C (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33487 6uwi:D (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33488 6uwi:D (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33489 6uwi:D (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33490 6uwi:D (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33491 6uwi:D (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33492 6uwi:D (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33493 6uwi:E (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33494 6uwi:E (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33495 6uwi:E (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33496 6uwi:E (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33497 6uwi:E (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33498 6uwi:E (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33499 6uwi:F (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33500 6uwi:F (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33501 6uwi:F (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33502 6uwi:F (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33503 6uwi:F (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33504 6uwi:F (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33505 6uwi:G (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33506 6uwi:G (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33507 6uwi:G (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33508 6uwi:G (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33509 6uwi:G (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33510 6uwi:G (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33511 6uwi:H (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33512 6uwi:H (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33513 6uwi:H (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33514 6uwi:H (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33515 6uwi:H (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33516 6uwi:H (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33517 6uwi:I (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33518 6uwi:I (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33519 6uwi:I (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33520 6uwi:I (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33521 6uwi:I (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33522 6uwi:I (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33523 6uwi:J (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33524 6uwi:J (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33525 6uwi:J (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33526 6uwi:J (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33527 6uwi:J (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33528 6uwi:J (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33529 6uwi:K (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33530 6uwi:K (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33531 6uwi:K (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33532 6uwi:K (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33533 6uwi:K (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33534 6uwi:K (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33535 6uwi:L (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33536 6uwi:L (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33537 6uwi:L (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33538 6uwi:L (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33539 6uwi:L (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33540 6uwi:L (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33541 6uwi:M (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33542 6uwi:M (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33543 6uwi:M (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33544 6uwi:M (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33545 6uwi:M (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33546 6uwi:M (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33547 6uwi:N (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33548 6uwi:N (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33549 6uwi:N (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33550 6uwi:N (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33551 6uwi:N (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33552 6uwi:N (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33553 6uwi:a (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33554 6uwi:a (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33555 6uwi:a (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33556 6uwi:a (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33557 6uwi:a (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33558 6uwi:a (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33559 6uwi:b (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33560 6uwi:b (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33561 6uwi:b (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33562 6uwi:b (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33563 6uwi:b (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33564 6uwi:b (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33565 6uwi:c (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33566 6uwi:c (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33567 6uwi:c (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33568 6uwi:c (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33569 6uwi:c (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33570 6uwi:c (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33571 6uwi:d (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33572 6uwi:d (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33573 6uwi:d (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33574 6uwi:d (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33575 6uwi:d (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33576 6uwi:d (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33577 6uwi:e (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33578 6uwi:e (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33579 6uwi:e (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33580 6uwi:e (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33581 6uwi:e (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33582 6uwi:e (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33583 6uwi:f (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33584 6uwi:f (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33585 6uwi:f (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33586 6uwi:f (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33587 6uwi:f (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33588 6uwi:f (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33589 6uwi:g (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33590 6uwi:g (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33591 6uwi:g (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33592 6uwi:g (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33593 6uwi:g (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33594 6uwi:g (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33595 6uwi:h (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33596 6uwi:h (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33597 6uwi:h (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33598 6uwi:h (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33599 6uwi:h (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33600 6uwi:h (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218