>rna
uaacugaagaguuugaucauggcucagauugaacgcuggcggcaggcuuaacacaugcaagucgagcgggggaagcggac
cuagcggcggacgggugaguaaugcuuaggaaucugccuauuagugggggacaacaucucgaaagggaugcuaauaccgc
auacguccuacgggagaaagcagggccuugcgcuaauagaugagccuaagucggauuagcuaguuggugggguaaaggcc
uaccaaggcgacgaucuguagcgggucugagaggaugauccgccacacugggacugagacacggcccagacuccuacggg
aggcagcaguggggaauauuggacaauggggggaacccugauccagccaugccgcgugugugaagaaggccuuaugguug
uaaagcacuuuaagcgaggaggaggcuacuuuaguuaauaccuagagauaguggacguuacucgcagaauaagcaccggc
uaacucugugccagcagccgcgguaauacagagggugcgagcguuaaucggauuuacugggcguaaagcgugcguaggcg
gcuuauuaagucggaugugaaauccccgagcuuaacuugggaauugcauucgauacuggugagcuagaguaugggagagg
augguagaauuccagguguagcggugaaaugcguagagaucuggaggaauaccgauggcgaaggcagccaucuggccuaa
uacugacgcugagguacgaaagcauggggagcaaacaggauuagauacccugguaguccaugccguaaacgaugucuacu
agccguuggggccggcuuuaguggcgcagcuaacgcgauaaguagaccgccuggggaguacggucgcaagacuaaaacuc
aaaugaauugacgg

The query sequence (length=894) is searched through a non-redundant set of database sequences rna_nr.fasta.gz clustered at 100% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ypu:2	894	894	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6yt9:2
2	6v39:sN1	1528	921	0.9978	0.5838	0.9685	0.0	6v3a:sN1, 6v3b:sN1, 6v3e:sN1
3	7m4u:a	1528	921	0.9978	0.5838	0.9685	0.0	7m4w:a, 7m4x:a, 7m4y:a, 7m4z:a, 7ryf:a, 7ryg:a, 7ryh:a, 7uvv:a, 7uvw:a, 7uvx:a, 7uvy:a, 7uvz:a, 7uw1:a
4	8rd8:iN	1503	915	0.9105	0.5416	0.8896	0.0	8rdv:iN, 8rdw:iN
5	7unr:a	1522	916	0.8770	0.5151	0.8559	0.0	7unu:a, 7unv:a, 7unw:a
6	8cd1:a	1526	921	0.8792	0.5151	0.8534	0.0	6spe:a, 6spg:a
7	6spc:a	1519	916	0.8702	0.5122	0.8493	0.0
8	8cep:A	1046	903	0.8490	0.7256	0.8405	0.0
9	8b0x:A	1500	905	0.8501	0.5067	0.8398	0.0
10	8cgu:A	1047	904	0.8490	0.7249	0.8396	0.0
11	8phj:A	1503	906	0.8501	0.5057	0.8389	0.0
12	8qoa:A	1513	907	0.8501	0.5023	0.8379	0.0
13	7ug7:16	1514	910	0.8501	0.5020	0.8352	0.0
14	8cai:A	1114	900	0.8434	0.6768	0.8378	0.0
15	6vwl:1	1521	911	0.8501	0.4997	0.8342	0.0
16	7y7c:A	1520	916	0.8523	0.5013	0.8319	0.0	7y7d:A, 7y7e:A, 7y7f:A, 7y7g:A, 7y7h:A
17	8akn:B	1519	916	0.8523	0.5016	0.8319	0.0	8am9:B, 9ax7:A, 8aye:A, 8b7y:C, 9cg5:A, 9cg6:A, 9cg7:A, 8eiu:A, 8emm:A, 9fbv:A, 8fto:A, 8g6w:A, 8hsp:A, 8htz:A, 8hu1:A, 8ifb:A, 8ifc:A, 7k00:A, 7oiz:A, 7oj0:A, 7p3k:A, 8pva:A, 8r6c:A, 8r8m:A
18	6vwm:1	1508	911	0.8490	0.5033	0.8332	0.0	6vwn:1
19	8cgr:A	1060	916	0.8512	0.7179	0.8308	0.0
20	8cgj:A	1130	917	0.8535	0.6752	0.8321	0.0
21	7n30:16	1526	923	0.8568	0.5020	0.8299	0.0
22	8syl:a	1528	923	0.8546	0.5000	0.8277	0.0
23	8q4f:A	1512	916	0.8490	0.5020	0.8286	0.0
24	8p16:2	1536	925	0.8568	0.4987	0.8281	0.0	8p17:2, 8p18:2, 8qk7:2
25	8g7p:a	1529	923	0.8546	0.4997	0.8277	0.0	8g7q:a
26	8ekc:a	1528	923	0.8546	0.5000	0.8277	0.0	8fzd:a, 8fze:a, 8fzf:a, 8fzg:a, 8fzh:a, 8fzi:a, 8fzj:a, 8g7r:a, 8g7s:a
27	7o5h:A	964	909	0.8423	0.7811	0.8284	0.0
28	6ztj:AA	1533	930	0.8579	0.5003	0.8247	0.0	6ztl:AA, 6ztm:AA, 6ztn:AA, 6zto:AA, 6ztp:AA, 6zu1:AA
29	6w7m:A	1512	930	0.8579	0.5073	0.8247	0.0
30	6w77:A	1519	930	0.8579	0.5049	0.8247	0.0
31	7uph:I	4438	930	0.8579	0.1728	0.8247	0.0
32	4u1u:AA	1538	930	0.8579	0.4987	0.8247	0.0	4u1v:AA, 4u20:AA, 4u24:AA, 4u25:AA, 4u26:AA, 4u27:AA, 4v6t:AA, 4v7c:AA, 4v7d:BA, 4v9c:CA, 4v9d:AA, 4wf1:AA, 4woi:AA
33	8r3v:A2	1537	930	0.8579	0.4990	0.8247	0.0	8rcl:A2, 8rcm:A2, 8rcs:A2, 8rct:A2
34	8pkl:A	1535	930	0.8579	0.4997	0.8247	0.0
35	7oe0:A	1510	927	0.8557	0.5066	0.8252	0.0
36	7nax:A	1526	930	0.8579	0.5026	0.8247	0.0
37	7nav:A	1510	930	0.8579	0.5079	0.8247	0.0
38	7nau:A	1522	930	0.8579	0.5039	0.8247	0.0
39	7nat:A	1430	930	0.8579	0.5364	0.8247	0.0
40	7nas:A	974	930	0.8579	0.7875	0.8247	0.0
41	7n31:16	1533	930	0.8579	0.5003	0.8247	0.0	7otc:a
42	6lkq:s	1532	930	0.8579	0.5007	0.8247	0.0	7qg8:0, 7qgn:0, 7tos:16S, 4v85:AA, 4v89:AA
43	8k3o:A	1426	930	0.8579	0.5379	0.8247	0.0	8k4e:A
44	7jss:3	1539	930	0.8579	0.4984	0.8247	0.0	7jsw:3, 7jsz:3, 7jt1:3, 7jt2:3, 7jt3:3
45	3j9z:SA	1542	930	0.8579	0.4974	0.8247	0.0	3ja1:SA, 7n1p:16, 8peg:A, 8r3v:A1, 8rcl:A1, 8rcm:A1, 8rcs:A1, 8rct:A1, 4v6k:BA, 4v6l:AA, 4v6m:AA, 4v6n:BA, 4v6o:AA, 4v6p:AA, 4v6q:AA, 4v6r:AA, 4v6s:BA, 4v6v:AA
46	5j88:BA	1533	930	0.8579	0.5003	0.8247	0.0
47	5j88:AA	1534	930	0.8579	0.5000	0.8247	0.0
48	5j7l:BA	1533	930	0.8579	0.5003	0.8247	0.0	5j8a:BA, 5jc9:BA
49	5j7l:AA	1534	930	0.8579	0.5000	0.8247	0.0	5j8a:AA, 5jc9:AA
50	6i7v:AA	1533	930	0.8579	0.5003	0.8247	0.0	6i7v:BA, 5iqr:2, 5it8:BA, 5j5b:BA, 5j91:BA, 3jcd:a, 3jce:a, 4v6c:AA, 4v6d:AA, 4v6e:AA, 4v7b:AA, 4v7s:AA, 4v7t:AA, 4v7u:AA, 4v7v:AA, 4v9o:BA, 4v9o:DA, 4v9o:FA, 4v9o:HA, 4v9p:BA, 4v9p:DA, 4v9p:FA, 4v9p:HA, 4www:QA, 4ybb:BA, 2ykr:A
51	6hrm:1	4450	930	0.8579	0.1724	0.8247	0.0
52	6h4n:a	1534	930	0.8579	0.5000	0.8247	0.0
53	8ghu:a	1532	930	0.8579	0.5007	0.8247	0.0
54	8g34:v	1539	930	0.8579	0.4984	0.8247	0.0
55	8eyq:A	1525	930	0.8579	0.5030	0.8247	0.0
56	6by1:BA	1541	930	0.8579	0.4977	0.8247	0.0
57	7boh:A	1527	930	0.8579	0.5023	0.8247	0.0
58	7bog:A	1071	930	0.8579	0.7162	0.8247	0.0
59	7bof:A	1070	930	0.8579	0.7168	0.8247	0.0
60	7bod:A	1078	930	0.8579	0.7115	0.8247	0.0	7boi:A
61	6awb:A	1443	930	0.8579	0.5315	0.8247	0.0	6awc:A
62	7afo:A	971	930	0.8579	0.7899	0.8247	0.0
63	7afl:A	1054	930	0.8579	0.7277	0.8247	0.0
64	7afi:A	1066	930	0.8579	0.7195	0.8247	0.0
65	5afi:a	1539	930	0.8579	0.4984	0.8247	0.0	6awd:A, 9ax8:a, 6bu8:A, 7cpj:a, 7d6z:f, 7d80:B, 6dnc:A, 6enf:a, 6enj:a, 6enu:a, 8g2u:v, 8g31:v, 8g38:v, 6gwt:a, 6gxm:a, 6gxn:a, 6gxo:a, 6gxp:a, 6h58:a, 6h58:aa, 3j9y:a, 3jcj:g, 3jcn:a, 5jte:AA, 5ju8:AA, 7k50:3, 7k51:3, 7k52:3, 7k53:3, 7k54:3, 7k55:3, 5kcr:1a, 5kcs:1a, 5kps:27, 5kpv:26, 5kpw:26, 5kpx:26, 5l3p:a, 7lv0:3, 5lza:a, 5lzb:a, 5lzc:a, 5lzd:a, 5lze:a, 5lzf:a, 5mgp:a, 5np6:D, 5nwy:0, 5o2r:a, 6o7k:g, 6o9k:a, 6ofx:3, 6og7:3, 6ogf:3, 6ogg:3, 6ogi:3, 8qbt:i, 7qgh:0, 7qgr:0, 7ss9:3, 7ssd:3, 7ssl:3, 7ssn:3, 7sso:3, 7ssw:3, 7st2:3, 7st6:3, 7st7:3, 8t5d:v, 8t5h:v, 4u1u:CA, 4u1v:CA, 4u20:CA, 4u24:CA, 4u25:CA, 4u26:CA, 4u27:CA, 5u9f:A, 5u9g:A, 5uyk:A, 5uyl:A, 5uym:A, 5uyn:A, 5uyp:A, 5uyq:A, 4v9c:AA, 4v9d:BA, 8vs9:16S, 8vsa:16S, 6wd0:3, 6wd1:3, 6wd2:3, 6wd3:3, 6wd4:3, 6wd5:3, 6wd6:3, 6wd7:3, 6wd8:3, 6wd9:3, 6wda:3, 6wdb:3, 6wdc:3, 6wdd:3, 6wde:3, 6wdf:3, 6wdg:3, 6wdh:3, 6wdi:3, 6wdj:3, 6wdk:3, 6wdl:3, 6wdm:3, 5we6:a, 4wf1:CA, 6wnv:3, 6wnw:3, 4woi:DA, 6xe0:W, 6y69:a, 6ysr:a
66	4adv:A	1410	927	0.8557	0.5426	0.8252	0.0
67	7acj:2	1534	930	0.8579	0.5000	0.8247	0.0	8bf7:2, 8bge:2, 8bgh:2, 8bh4:2, 8bhj:2, 8bhl:2, 8bhn:2, 8bhp:2, 8bil:2, 8bim:2, 7boe:A, 6c4i:a, 8fiz:AA, 5h5u:h, 5it8:AA, 5j5b:AA, 5j91:AA, 7m5d:2, 5mdv:2, 5mdw:2, 5mdy:2, 5mdz:2, 5me0:A, 5me1:A, 7n2c:16, 7n2u:16, 7n2v:16, 7nar:A, 5no2:A, 5no3:A, 5no4:A, 7nwt:2, 7nww:2, 7o19:AA, 7o1a:AA, 7o1c:AA, 7oif:2, 7oig:2, 7oii:2, 6om6:2, 6ore:2, 6orl:2, 6osk:2, 6osq:2, 6ost:2, 6ot3:2, 7ot5:2, 6ouo:2, 7q4k:AA, 6q97:2, 6q98:2, 6q9a:2, 7sa4:2, 6tbv:16S1, 6tc3:16S1, 6w6k:A, 4ybb:AA, 7zta:16S1
68	7ac7:2	1540	930	0.8579	0.4981	0.8247	0.0	6by1:AA, 7nso:a, 7nsp:a, 7nsq:a, 7pjs:a, 7pjt:a, 7pju:a, 7pjv:a, 7pjw:a, 7pjx:a, 7pjy:a, 7pjz:a, 7s1g:C, 7s1h:C, 7s1i:C, 7s1j:C, 7s1k:C, 6szs:a, 5wdt:a, 5we4:a, 5wf0:a, 5wfk:a, 5wfs:a, 6yss:a, 6yst:a, 6ysu:a
69	7abz:2	1540	930	0.8579	0.4981	0.8247	0.0
70	8a3l:A	1539	930	0.8579	0.4984	0.8247	0.0	7nbu:A
71	4a2i:A	1530	927	0.8557	0.5000	0.8252	0.0	3jbu:A, 3jbv:A, 5my1:A, 6o9j:a, 7oe1:A, 4v4h:AA, 4v4h:CA, 4v4q:AA, 4v4q:CA, 4v50:AA, 4v50:CA, 4v52:AA, 4v52:CA, 4v53:AA, 4v53:CA, 4v54:AA, 4v54:CA, 4v55:AA, 4v55:CA, 4v56:AA, 4v56:CA, 4v57:AA, 4v57:CA, 4v5b:BA, 4v5b:DA, 4v5h:AA, 4v5y:AA, 4v5y:CA, 4v64:AA, 4v64:CA, 4v65:A1, 4v66:A1, 4v69:AA, 4v6c:CA, 4v6d:CA, 4v6e:CA, 4v6y:AA, 4v6z:AA, 4v70:AA, 4v71:AA, 4v72:AA, 4v73:AA, 4v74:AA, 4v75:AA, 4v76:AA, 4v77:AA, 4v78:AA, 4v79:AA, 4v7a:AA, 4v7i:BA, 4v7s:CA, 4v7t:CA, 4v7u:CA, 4v7v:CA, 4www:XA
72	7oi0:A	963	925	0.8535	0.7923	0.8249	0.0
73	5u4i:a	1533	930	0.8568	0.4997	0.8237	0.0
74	8jsg:g	1539	930	0.8568	0.4977	0.8237	0.0
75	7b5k:a	1533	930	0.8568	0.4997	0.8237	0.0
76	7acr:2	1534	930	0.8568	0.4993	0.8237	0.0
77	5uz4:A	1527	926	0.8535	0.4997	0.8240	0.0
78	8jsh:g	1074	926	0.8535	0.7104	0.8240	0.0
79	6vz2:D	1523	930	0.8557	0.5023	0.8226	0.0	6vz3:D, 6vz5:D, 6xza:A1, 6xzb:A1
80	6vyy:D	1522	930	0.8557	0.5026	0.8226	0.0	6vyz:D
81	6vyx:D	1521	930	0.8557	0.5030	0.8226	0.0
82	8upo:D	1524	930	0.8557	0.5020	0.8226	0.0	8upr:D, 8uql:D, 8uqm:D, 8uqp:D, 8ur0:D, 8urh:D, 8uri:D, 8urx:D, 8ury:D, 6vu3:D, 6vyq:D, 6vyr:D, 6vys:D, 6vyt:D, 6vyu:D, 6vyw:D, 6vz7:D, 6vzj:D, 6x6t:D, 6x7f:D, 6x7k:D, 6x9q:D, 6xdq:D, 6xdr:D, 6xgf:D, 6xii:D, 6xij:D
83	8eyt:A	1415	930	0.8535	0.5392	0.8204	0.0
84	4v4v:AA	1488	912	0.8400	0.5047	0.8235	0.0	4v4w:AA
85	6spf:a	1390	917	0.8300	0.5338	0.8092	0.0
86	6nqb:A	1341	692	0.6275	0.4183	0.8107	2.07e-148
87	6w7n:A	1372	695	0.6286	0.4096	0.8086	9.62e-147
88	6w7w:2	871	679	0.6152	0.6315	0.8100	1.61e-144
89	7p7q:a	1521	921	0.7841	0.4609	0.7611	7.71e-123	7p7r:a, 7p7s:a, 7p7t:a, 7p7u:a
90	7p48:a	1479	917	0.7796	0.4713	0.7601	7.71e-123	8y38:a, 8y39:a
91	7nhk:a	1517	921	0.7841	0.4621	0.7611	7.71e-123
92	7kgb:a	1519	692	0.6085	0.3581	0.7861	2.77e-122	7msc:a, 7msh:a, 7msm:a, 7msz:a, 7mt2:a, 7mt3:a, 7mt7:a, 7sfr:a, 5v93:a
93	8buu:a	1538	696	0.6096	0.3544	0.7830	3.59e-121
94	7qv2:a	1545	695	0.6074	0.3515	0.7813	1.67e-119
95	3j9w:AA	1544	695	0.6074	0.3517	0.7813	1.67e-119	5njt:A, 7qgu:W, 7qh4:W
96	6ha1:a	1533	695	0.6074	0.3542	0.7813	1.67e-119	6ha8:a, 6htq:a, 7o5b:A, 8qcq:a, 8qpp:A, 7qv1:a, 7qv3:a, 8r55:A
97	8p2g:a	1534	690	0.6040	0.3520	0.7826	6.00e-119	8p2h:a
98	8p2f:a	1526	690	0.6040	0.3539	0.7826	6.00e-119
99	7nhm:a	1531	690	0.6040	0.3527	0.7826	6.00e-119
100	6wub:a	1121	695	0.6074	0.4844	0.7813	2.79e-117
101	8uu9:a	1515	695	0.6074	0.3584	0.7813	2.79e-117
102	8uu5:a	1523	695	0.6074	0.3565	0.7813	2.79e-117
103	8uu4:a	1516	695	0.6074	0.3582	0.7813	2.79e-117	8uu6:a, 8uu7:a, 8uu8:a
104	6o8x:a	1528	695	0.6074	0.3554	0.7813	2.79e-117	6o8y:a, 6o90:a
105	6o8w:a	1523	695	0.6074	0.3565	0.7813	2.79e-117	6o8z:a, 6w6p:a
106	7nhn:a	1513	695	0.6074	0.3589	0.7813	2.79e-117
107	5zeb:a	1506	686	0.6007	0.3566	0.7828	3.61e-116	5zep:a, 5zeu:a
108	6yef:a	1545	694	0.6051	0.3502	0.7795	1.30e-115
109	5t7v:A	1419	694	0.6051	0.3813	0.7795	1.30e-115
110	6fxc:Aa	1539	694	0.6051	0.3515	0.7795	1.30e-115	6fxc:Ba, 5ngm:Aa, 6s0x:a, 6s13:a
111	5tcu:A	1464	896	0.7595	0.4638	0.7578	4.67e-115
112	7nhl:a	1538	695	0.6051	0.3518	0.7784	1.68e-114
113	5nd8:a	1542	695	0.6051	0.3508	0.7784	1.68e-114
114	7kwg:a	1552	695	0.6051	0.3486	0.7784	1.68e-114
115	8byv:a	1533	695	0.6051	0.3529	0.7784	1.68e-114
116	8bh7:a	1541	695	0.6051	0.3511	0.7784	1.68e-114	5nd9:a
117	8bh6:a	1547	695	0.6051	0.3497	0.7784	1.68e-114	5li0:a
118	7bgd:a	1096	695	0.6051	0.4936	0.7784	1.68e-114
119	7asp:X	1447	896	0.7584	0.4686	0.7567	7.82e-113
120	8wif:a	1517	690	0.6018	0.3546	0.7797	2.81e-112
121	8wib:a	1515	690	0.6018	0.3551	0.7797	2.81e-112	8wid:a
122	8whx:a	1515	690	0.6018	0.3551	0.7797	2.81e-112	8wi7:a, 8wi9:a
123	5myj:AA	1535	692	0.6007	0.3498	0.7760	2.81e-112
124	6dzi:h	1511	690	0.6018	0.3561	0.7797	2.81e-112	6dzk:A, 8fr8:a, 5o5j:A, 5o61:BA, 8v9j:a, 8v9k:a, 8v9l:a
125	7aso:X	1415	896	0.7573	0.4784	0.7556	4.70e-110
126	8crx:A	1505	691	0.5962	0.3542	0.7713	2.85e-102
127	8cwo:A	1034	686	0.5906	0.5106	0.7697	1.72e-99
128	8fmw:A	1529	719	0.6007	0.3512	0.7469	3.79e-81
129	8cdv:A	1247	543	0.4653	0.3336	0.7661	2.28e-78
130	8cdu:A	1333	538	0.4609	0.3091	0.7658	2.95e-77	8cec:A, 8ced:A, 8cee:A
131	6xyw:2	1743	716	0.5996	0.3075	0.7486	1.06e-76
132	5x8p:a	1480	435	0.3770	0.2277	0.7747	8.33e-68	5x8r:a
133	5x8p:a	1480	389	0.3423	0.2068	0.7866	1.08e-66	5x8r:a
134	4v61:AA	1478	435	0.3770	0.2280	0.7747	8.33e-68
135	4v61:AA	1478	392	0.3434	0.2077	0.7832	1.80e-64
136	5mmj:a	1484	435	0.3770	0.2271	0.7747	8.33e-68	5mmm:a
137	5mmj:a	1484	392	0.3434	0.2069	0.7832	1.80e-64	5mmm:a
138	6eri:BA	1481	435	0.3770	0.2275	0.7747	8.33e-68
139	6eri:BA	1481	392	0.3434	0.2073	0.7832	1.80e-64
140	5xyu:A	1379	178	0.1723	0.1117	0.8652	1.42e-50
141	7jil:2	1475	116	0.1074	0.0651	0.8276	5.34e-20
142	5u4j:a	307	32	0.0358	0.1042	1.0000	1.95e-09

[Back]