>rna
gcuaaaccuagccccaaacccacuccaccuuacuaccagacaaccuuagccaaaccauuuacccaaauaaaguauaggcg
auagaaauugaaaccuggcgcaauagauauaguaccgcaagggaaagaugaaaaauuauaaccaagcauaauauagcaag
gacuaaccccuauaccuucugcauaaugaauuaacuagaaauaacuuugcaaggagagccaaagcuaagacccccgaaac
cagacgagcuaccuaagaacagcuaaaagagcaagauuuauagguagaggcgacaaaccuaccgagccuggugauagcug
guuguccaagauagaaucuuaguucaacuuuaaauuugcccacagaacccucuaaauccccuuguaaauuuaacuguuag
uccaaagaggaacagcucuuuggacacuaggaaaaaaccuuguagagagaguaaaaaauuuaacacccauaguaggccua
aaagcagccaccaauuaagaaagcguucaagcucaacacaucccaaacauauaacugaacuccucacacccaauuggacc
aaucuaucacccuauagaagaacuaauguuaguauaaguaacaugaaaacauucuccuccgcauaagccugcgucagauu
aaaaugaacugacaauuaacagcccaauaucuacaaucaaccaacaagucauuauuacccucacugucaacccaacacag
gcaugcucauaaggaaagguuaaaaaaaguaaaaggaacucggcaccuguuuaccaaaaacaucaccucuagcaucacca
guauuagaggcaguucagcugucucuuacuuuuaaccagugaaauugaccugcccgugaagaggcgggcauaacacagca
agacgagacccuauggagcuuuaauuuauuaaugcaaacaguaccaaaccugcauuaaaagcaguacaugcuaagacuuc
accagucaaagcgaacuauccaauaacuugaccaacggaacaaguuacccuaggcuaucuacuuucaaauuccucccugu
acgaaaggacaagagaaauaaggccuacuucacaaagcgccuuccccuaaaugauaucaucucaacuuaguauuauaccc
acacccacccaagaacaggguuugu

The query sequence (length=1145) is searched through a non-redundant set of database sequences rna_nr.fasta.gz clustered at 100% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7po4:A	1145	1145	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	7oi7:A	1054	1152	0.9083	0.9867	0.9028	0.0
3	7ods:A	1445	1012	0.8175	0.6478	0.9249	0.0
4	7ods:A	1445	131	0.1092	0.0865	0.9542	1.10e-52
5	7ods:A	1445	83	0.0655	0.0519	0.9036	4.11e-22
6	7odr:A	1448	1012	0.8175	0.6464	0.9249	0.0
7	7odr:A	1448	131	0.1100	0.0870	0.9618	2.36e-54
8	7odr:A	1448	83	0.0655	0.0518	0.9036	4.11e-22
9	8qsj:A	1418	984	0.7956	0.6425	0.9258	0.0
10	8qsj:A	1418	131	0.1039	0.0839	0.9084	5.17e-41
11	8qsj:A	1418	83	0.0655	0.0529	0.9036	4.11e-22
12	7odt:A	1453	860	0.7092	0.5588	0.9442	0.0
13	7odt:A	1453	130	0.1083	0.0853	0.9538	3.94e-52
14	7odt:A	1453	131	0.1083	0.0853	0.9466	1.83e-50
15	7odt:A	1453	83	0.0655	0.0516	0.9036	4.11e-22
16	8pk0:A	1423	857	0.7048	0.5671	0.9417	0.0
17	8pk0:A	1423	130	0.1083	0.0871	0.9538	3.94e-52
18	8pk0:A	1423	131	0.1057	0.0850	0.9237	6.64e-45
19	8pk0:A	1423	83	0.0655	0.0527	0.9036	4.11e-22
20	6i9r:A	1501	856	0.7031	0.5363	0.9404	0.0
21	6i9r:A	1501	132	0.1118	0.0853	0.9697	3.91e-57
22	6i9r:A	1501	130	0.1057	0.0806	0.9308	5.13e-46
23	6i9r:A	1501	82	0.0655	0.0500	0.9146	3.18e-23
24	6zm6:A	1531	866	0.7092	0.5304	0.9376	0.0
25	6zm6:A	1531	133	0.1144	0.0856	0.9850	1.40e-61
26	6zm6:A	1531	131	0.1118	0.0836	0.9771	3.03e-58
27	6zm6:A	1531	89	0.0655	0.0490	0.8427	8.96e-14
28	8any:A	1558	866	0.7083	0.5205	0.9365	0.0	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
29	8any:A	1558	133	0.1144	0.0841	0.9850	1.40e-61	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
30	8any:A	1558	120	0.1013	0.0745	0.9667	1.83e-50	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
31	8any:A	1558	89	0.0655	0.0481	0.8427	8.96e-14	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
32	6zs9:XA	1501	857	0.7022	0.5356	0.9382	0.0
33	6zs9:XA	1501	132	0.1118	0.0853	0.9697	3.91e-57
34	6zs9:XA	1501	130	0.1057	0.0806	0.9308	5.13e-46
35	6zs9:XA	1501	82	0.0655	0.0500	0.9146	3.18e-23
36	6zsc:XA	1500	857	0.7022	0.5360	0.9382	0.0
37	6zsc:XA	1500	132	0.1118	0.0853	0.9697	3.91e-57
38	6zsc:XA	1500	130	0.1057	0.0807	0.9308	5.13e-46
39	6zsc:XA	1500	82	0.0655	0.0500	0.9146	3.18e-23
40	6zsa:XA	1499	857	0.7022	0.5364	0.9382	0.0	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
41	6zsa:XA	1499	132	0.1118	0.0854	0.9697	3.91e-57	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
42	6zsa:XA	1499	130	0.1057	0.0807	0.9308	5.13e-46	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
43	6zsa:XA	1499	82	0.0655	0.0500	0.9146	3.18e-23	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
44	7og4:XA	1498	857	0.7022	0.5367	0.9382	0.0
45	7og4:XA	1498	132	0.1118	0.0854	0.9697	3.91e-57
46	7og4:XA	1498	130	0.1048	0.0801	0.9231	2.39e-44
47	7og4:XA	1498	82	0.0655	0.0501	0.9146	3.18e-23
48	6zm5:A	1534	869	0.7092	0.5293	0.9344	0.0
49	6zm5:A	1534	133	0.1144	0.0854	0.9850	1.40e-61
50	6zm5:A	1534	131	0.1118	0.0834	0.9771	3.03e-58
51	6zm5:A	1534	89	0.0655	0.0489	0.8427	8.96e-14
52	7l08:A	1527	869	0.7092	0.5318	0.9344	0.0	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
53	7l08:A	1527	131	0.1127	0.0845	0.9847	1.81e-60	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
54	7l08:A	1527	133	0.1118	0.0838	0.9624	1.82e-55	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
55	7l08:A	1527	82	0.0655	0.0491	0.9146	3.18e-23	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
56	7oic:A	1383	1007	0.7939	0.6573	0.9027	0.0
57	7oic:A	1383	130	0.1022	0.0846	0.9000	3.11e-38
58	7oic:A	1383	82	0.0655	0.0542	0.9146	3.18e-23
59	7oi8:A	1092	920	0.7362	0.7720	0.9163	0.0	7oi9:A, 7oia:A, 7oib:A, 5oom:A
60	7oi8:A	1092	210	0.1633	0.1712	0.8905	8.35e-64	7oi9:A, 7oia:A, 7oib:A, 5oom:A
61	7oi6:A	1208	920	0.7362	0.6978	0.9163	0.0
62	7oi6:A	1208	127	0.0978	0.0927	0.8819	1.13e-32
63	7oi6:A	1208	82	0.0620	0.0588	0.8659	1.93e-15
64	7o9m:A	1454	862	0.6996	0.5509	0.9292	0.0
65	7o9m:A	1454	130	0.1118	0.0880	0.9846	6.50e-60
66	7o9m:A	1454	111	0.0943	0.0743	0.9730	3.97e-47
67	7o9m:A	1454	83	0.0655	0.0516	0.9036	4.11e-22
68	7o9k:A	1436	853	0.6908	0.5508	0.9273	0.0
69	7o9k:A	1436	130	0.1118	0.0891	0.9846	6.50e-60
70	7o9k:A	1436	111	0.0943	0.0752	0.9730	3.97e-47
71	7o9k:A	1436	82	0.0655	0.0522	0.9146	3.18e-23
72	7oid:A	1472	855	0.6908	0.5374	0.9251	0.0	7oie:A
73	7oid:A	1472	131	0.1083	0.0842	0.9466	1.83e-50	7oie:A
74	7oid:A	1472	130	0.1022	0.0795	0.9000	3.11e-38	7oie:A
75	7oid:A	1472	82	0.0655	0.0510	0.9146	3.18e-23	7oie:A
76	8k2a:L1	1500	866	0.6969	0.5320	0.9215	0.0	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
77	8k2a:L1	1500	131	0.1083	0.0827	0.9466	1.83e-50	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
78	8k2a:L1	1500	130	0.1074	0.0820	0.9462	6.59e-50	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
79	8k2a:L1	1500	82	0.0655	0.0500	0.9146	3.18e-23	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
80	3j7y:A	1472	855	0.6891	0.5360	0.9228	0.0	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
81	3j7y:A	1472	131	0.1083	0.0842	0.9466	1.83e-50	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
82	3j7y:A	1472	130	0.1022	0.0795	0.9000	3.11e-38	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
83	3j7y:A	1472	82	0.0655	0.0510	0.9146	3.18e-23	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
84	7a5f:A3	1503	855	0.6891	0.5250	0.9228	0.0	7a5g:A3, 7a5k:A3
85	7a5f:A3	1503	120	0.1013	0.0772	0.9667	1.83e-50	7a5g:A3, 7a5k:A3
86	7a5f:A3	1503	130	0.1022	0.0778	0.9000	3.11e-38	7a5g:A3, 7a5k:A3
87	7a5f:A3	1503	82	0.0655	0.0499	0.9146	3.18e-23	7a5g:A3, 7a5k:A3
88	7of4:A	1463	856	0.6865	0.5373	0.9182	0.0	7of6:A
89	7of4:A	1463	130	0.1066	0.0834	0.9385	3.07e-48	7of6:A
90	7of4:A	1463	111	0.0943	0.0738	0.9730	3.97e-47	7of6:A
91	7of4:A	1463	82	0.0655	0.0513	0.9146	3.18e-23	7of6:A
92	7of3:A	1386	856	0.6865	0.5671	0.9182	0.0
93	7of3:A	1386	130	0.1083	0.0895	0.9538	3.94e-52
94	7of3:A	1386	110	0.0934	0.0772	0.9727	1.43e-46
95	7of3:A	1386	82	0.0655	0.0541	0.9146	3.18e-23
96	7of2:A	1410	856	0.6865	0.5574	0.9182	0.0
97	7of2:A	1410	130	0.1066	0.0865	0.9385	3.07e-48
98	7of2:A	1410	111	0.0943	0.0766	0.9730	3.97e-47
99	7of2:A	1410	82	0.0655	0.0532	0.9146	3.18e-23
100	7a5i:A3	1485	864	0.6891	0.5313	0.9132	0.0
101	7a5i:A3	1485	131	0.1083	0.0835	0.9466	1.83e-50
102	7a5i:A3	1485	130	0.1022	0.0788	0.9000	3.11e-38
103	7a5i:A3	1485	82	0.0655	0.0505	0.9146	3.18e-23
104	7pd3:A	1280	856	0.6821	0.6102	0.9124	0.0
105	7pd3:A	1280	107	0.0908	0.0813	0.9720	6.64e-45
106	7pd3:A	1280	82	0.0655	0.0586	0.9146	3.18e-23
107	7of0:A	1376	856	0.6803	0.5661	0.9100	0.0
108	7of0:A	1376	130	0.1083	0.0901	0.9538	3.94e-52
109	7of0:A	1376	110	0.0934	0.0778	0.9727	1.43e-46
110	7of0:A	1376	79	0.0655	0.0545	0.9494	1.14e-27
111	5ool:A	1441	854	0.6777	0.5385	0.9087	0.0
112	5ool:A	1441	111	0.0943	0.0749	0.9730	3.97e-47
113	5ool:A	1441	130	0.1022	0.0812	0.9000	3.11e-38
114	5ool:A	1441	82	0.0655	0.0520	0.9146	3.18e-23
115	7a5j:A	1492	854	0.6777	0.5201	0.9087	0.0
116	7a5j:A	1492	120	0.1013	0.0777	0.9667	1.83e-50
117	7a5j:A	1492	130	0.1022	0.0784	0.9000	3.11e-38
118	7a5j:A	1492	82	0.0655	0.0503	0.9146	3.18e-23
119	7a5h:A	1457	854	0.6777	0.5326	0.9087	0.0
120	7a5h:A	1457	111	0.0943	0.0741	0.9730	3.97e-47
121	7a5h:A	1457	130	0.1022	0.0803	0.9000	3.11e-38
122	7a5h:A	1457	82	0.0655	0.0515	0.9146	3.18e-23
123	7of5:A	1389	856	0.6777	0.5587	0.9065	0.0
124	7of5:A	1389	130	0.1083	0.0893	0.9538	3.94e-52
125	7of5:A	1389	111	0.0943	0.0778	0.9730	3.97e-47
126	7of5:A	1389	82	0.0655	0.0540	0.9146	3.18e-23
127	7of7:A	1376	856	0.6690	0.5567	0.8949	0.0
128	7of7:A	1376	130	0.1083	0.0901	0.9538	3.94e-52
129	7of7:A	1376	111	0.0943	0.0785	0.9730	3.97e-47
130	7of7:A	1376	79	0.0655	0.0545	0.9494	1.14e-27
131	8qu5:A	1049	615	0.4996	0.5453	0.9301	0.0
132	8qu5:A	1049	249	0.1991	0.2173	0.9157	8.06e-89
133	8qu5:A	1049	210	0.1633	0.1783	0.8905	8.35e-64
134	8qu1:A	938	838	0.6384	0.7793	0.8723	0.0
135	8qu1:A	938	182	0.1467	0.1791	0.9231	1.80e-65
136	8qu1:A	938	38	0.0332	0.0405	1.0000	1.16e-12
137	7qh6:A	1133	460	0.3738	0.3778	0.9304	0.0
138	7qh6:A	1133	407	0.3362	0.3398	0.9459	4.27e-176
139	7qh6:A	1133	132	0.1031	0.1041	0.8939	1.12e-37
140	7qh6:A	1133	82	0.0655	0.0662	0.9146	3.18e-23
141	7qh7:A	1256	487	0.3729	0.3400	0.8768	1.60e-145
142	7qh7:A	1256	305	0.2419	0.2205	0.9082	1.31e-106
143	7qh7:A	1256	107	0.0900	0.0820	0.9626	3.09e-43
144	7qh7:A	1256	128	0.1022	0.0932	0.9141	5.17e-41
145	7qh7:A	1256	65	0.0550	0.0502	0.9692	8.84e-24
146	8oin:B8	1571	580	0.3852	0.2807	0.7603	2.98e-68	8oiq:B8
147	7nqh:BA	1544	580	0.3852	0.2856	0.7603	2.98e-68	7nql:BA, 7nsh:BA, 7nsi:BA, 7nsj:BA, 6ydp:BA, 6ydw:BA
148	6gaw:BA	1549	580	0.3852	0.2847	0.7603	2.98e-68	6gb2:BA
149	5aj4:BA	1515	580	0.3843	0.2904	0.7586	1.39e-66	4v19:A
150	4ce4:A	1444	315	0.2061	0.1634	0.7492	6.83e-25

[Back]