>rna
gcuaaaccuagccccaaacccacuccaccuuacuaccaaaccuuagccaaaccauuuacauaaaguauaggcgauagaaa
uugggcgcaauagauauaguaccgcaagggaaagaugaaaaauaccaagcauaauauagcaaggacuaaccccuauaccu
ucugaugaauuaacuagaaauaacuuugcaaggagagccaaagcuaagacccccgaaaccagacgagcuaccuaagaaca
gauuuauagguagaggcgacaaaccuaccgagccuggugauagcugguuguccaagauagaaucuuaguucaacuuuaaa
uuugcccacagaaccaaauccccuuguaaauuuaacuguuaguccaaagaggaacagcucuuuggacacuaggaaaaaac
cuuguagagagaguaaaaaauuuaacacccauaguaggccuaaaagcagccaccaauuaagaaagcguucaagcucaaca
ccucccaaacauauaacugaacuccucacacccaauuggaccaaucuaucacccuauagaagaacuaauguuaguauaag
uaacaugaaaacauucuccuccgcauaagccugcgucagaucacugacaauuaacagcccaauaucuacaaucaaccaac
aagucauuauuacccucacugucaacccaacaggcaugcucauaaggaaagguuaaaaaaaguaaaaggaaacaucaccu
cuagcaucaccaguauuagaggccagcugucucuuacuuuuaaccagugaaauugaccugcccgugaggcgggcauaaca
cagcaagacgagacccuauggagcuuuaauuuauuaaugcaaacaccugcauuaaaaauuucaguacaugcuaagacuuc
accagucaaagcgaaccucaauugauccaauaacuugaccaacggaacaaguuacccuaggguaucuacuuuauuccucc
cuguacgaaaggacaagagaaauaaggccuacuucacaaagcgccuucuaaaugauaucaucucaacuuaauacccacac
ccaagaacaggguu

The query sequence (length=1054) is searched through a non-redundant set of database sequences rna_nr.fasta.gz clustered at 100% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7oi7:A	1054	1054	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	7oi8:A	1092	862	0.8178	0.7894	1.0000	0.0	7oi9:A, 7oia:A, 7oib:A, 5oom:A
3	7oi8:A	1092	193	0.1831	0.1767	1.0000	7.30e-99	7oi9:A, 7oia:A, 7oib:A, 5oom:A
4	7oi6:A	1208	862	0.8178	0.7136	1.0000	0.0
5	7oi6:A	1208	112	0.1063	0.0927	1.0000	7.78e-54
6	7oi6:A	1208	81	0.0731	0.0637	0.9506	8.06e-29
7	7po4:A	1145	1152	0.9867	0.9083	0.9028	0.0
8	8qu5:A	1049	591	0.5607	0.5634	1.0000	0.0
9	8qu5:A	1049	228	0.2163	0.2173	1.0000	2.55e-118
10	8qu5:A	1049	193	0.1831	0.1840	1.0000	7.30e-99
11	8qu1:A	938	626	0.5769	0.6482	0.9712	0.0
12	8qu1:A	938	167	0.1584	0.1780	1.0000	2.07e-84
13	8qu1:A	938	130	0.1224	0.1375	0.9923	1.28e-61
14	8qu1:A	938	39	0.0370	0.0416	1.0000	2.96e-13
15	7oid:A	1472	479	0.4469	0.3200	0.9833	0.0	7oie:A
16	7oid:A	1472	255	0.2287	0.1637	0.9451	4.33e-106	7oie:A
17	7oid:A	1472	118	0.1063	0.0761	0.9492	1.70e-45	7oie:A
18	7oid:A	1472	129	0.1129	0.0808	0.9225	7.90e-44	7oie:A
19	7oid:A	1472	81	0.0769	0.0550	1.0000	1.33e-36	7oie:A
20	7oid:A	1472	34	0.0323	0.0231	1.0000	1.78e-10	7oie:A
21	7oic:A	1383	479	0.4469	0.3406	0.9833	0.0
22	7oic:A	1383	252	0.2249	0.1714	0.9405	3.37e-102
23	7oic:A	1383	118	0.1063	0.0810	0.9492	1.70e-45
24	7oic:A	1383	129	0.1129	0.0860	0.9225	7.90e-44
25	7oic:A	1383	81	0.0769	0.0586	1.0000	1.33e-36
26	7oic:A	1383	34	0.0323	0.0246	1.0000	1.78e-10
27	3j7y:A	1472	481	0.4478	0.3207	0.9813	0.0	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
28	3j7y:A	1472	252	0.2287	0.1637	0.9563	5.57e-110	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
29	3j7y:A	1472	118	0.1063	0.0761	0.9492	1.70e-45	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
30	3j7y:A	1472	129	0.1129	0.0808	0.9225	7.90e-44	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
31	3j7y:A	1472	81	0.0769	0.0550	1.0000	1.33e-36	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
32	3j7y:A	1472	34	0.0323	0.0231	1.0000	1.78e-10	3j9m:A, 6nu2:A, 6nu3:A
33	7a5f:A3	1503	481	0.4478	0.3140	0.9813	0.0	7a5g:A3, 7a5k:A3
34	7a5f:A3	1503	252	0.2287	0.1603	0.9563	5.57e-110	7a5g:A3, 7a5k:A3
35	7a5f:A3	1503	118	0.1063	0.0745	0.9492	1.70e-45	7a5g:A3, 7a5k:A3
36	7a5f:A3	1503	108	0.0968	0.0679	0.9444	6.15e-40	7a5g:A3, 7a5k:A3
37	7a5f:A3	1503	81	0.0769	0.0539	1.0000	1.33e-36	7a5g:A3, 7a5k:A3
38	7a5f:A3	1503	34	0.0323	0.0226	1.0000	1.78e-10	7a5g:A3, 7a5k:A3
39	7of3:A	1386	479	0.4459	0.3391	0.9812	0.0
40	7of3:A	1386	254	0.2220	0.1688	0.9213	7.36e-94
41	7of3:A	1386	124	0.1129	0.0859	0.9597	1.69e-50
42	7of3:A	1386	81	0.0769	0.0584	1.0000	1.33e-36
43	7of3:A	1386	125	0.1063	0.0808	0.8960	1.72e-35
44	7of3:A	1386	34	0.0323	0.0245	1.0000	1.78e-10
45	7of0:A	1376	479	0.4459	0.3416	0.9812	0.0
46	7of0:A	1376	254	0.2154	0.1650	0.8937	5.81e-80
47	7of0:A	1376	124	0.1129	0.0865	0.9597	1.69e-50
48	7of0:A	1376	125	0.1063	0.0814	0.8960	1.72e-35
49	7of0:A	1376	81	0.0740	0.0567	0.9630	1.73e-30
50	7of0:A	1376	34	0.0323	0.0247	1.0000	1.78e-10
51	6zsa:XA	1499	483	0.4478	0.3149	0.9772	0.0	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
52	6zsa:XA	1499	262	0.2287	0.1608	0.9198	4.40e-96	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
53	6zsa:XA	1499	108	0.0968	0.0680	0.9444	6.15e-40	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
54	6zsa:XA	1499	81	0.0769	0.0540	1.0000	1.33e-36	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
55	6zsa:XA	1499	123	0.1053	0.0740	0.9024	1.33e-36	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
56	6zsa:XA	1499	34	0.0323	0.0227	1.0000	1.78e-10	6zsb:XA, 6zsd:XA, 6zse:XA, 6zsg:XA
57	7pd3:A	1280	478	0.4440	0.3656	0.9791	0.0
58	7pd3:A	1280	248	0.2249	0.1852	0.9556	9.32e-108
59	7pd3:A	1280	125	0.1091	0.0898	0.9200	1.32e-41
60	7pd3:A	1280	81	0.0769	0.0633	1.0000	1.33e-36
61	7pd3:A	1280	34	0.0323	0.0266	1.0000	1.78e-10
62	5ool:A	1441	478	0.4440	0.3248	0.9791	0.0
63	5ool:A	1441	245	0.2249	0.1645	0.9673	3.33e-112
64	5ool:A	1441	125	0.1129	0.0826	0.9520	2.18e-49
65	5ool:A	1441	118	0.1063	0.0777	0.9492	1.70e-45
66	5ool:A	1441	81	0.0769	0.0562	1.0000	1.33e-36
67	5ool:A	1441	34	0.0323	0.0236	1.0000	1.78e-10
68	7og4:XA	1498	483	0.4478	0.3151	0.9772	0.0
69	7og4:XA	1498	262	0.2287	0.1609	0.9198	4.40e-96
70	7og4:XA	1498	108	0.0968	0.0681	0.9444	6.15e-40
71	7og4:XA	1498	122	0.1053	0.0741	0.9098	1.03e-37
72	7og4:XA	1498	81	0.0769	0.0541	1.0000	1.33e-36
73	7og4:XA	1498	34	0.0323	0.0227	1.0000	1.78e-10
74	7a5j:A	1492	478	0.4440	0.3137	0.9791	0.0
75	7a5j:A	1492	245	0.2249	0.1588	0.9673	3.33e-112
76	7a5j:A	1492	118	0.1063	0.0751	0.9492	1.70e-45
77	7a5j:A	1492	108	0.0968	0.0684	0.9444	6.15e-40
78	7a5j:A	1492	81	0.0769	0.0543	1.0000	1.33e-36
79	7a5j:A	1492	34	0.0323	0.0228	1.0000	1.78e-10
80	7a5h:A	1457	478	0.4440	0.3212	0.9791	0.0
81	7a5h:A	1457	245	0.2249	0.1627	0.9673	3.33e-112
82	7a5h:A	1457	125	0.1129	0.0817	0.9520	2.18e-49
83	7a5h:A	1457	118	0.1063	0.0769	0.9492	1.70e-45
84	7a5h:A	1457	81	0.0769	0.0556	1.0000	1.33e-36
85	7a5h:A	1457	34	0.0323	0.0233	1.0000	1.78e-10
86	6zsc:XA	1500	484	0.4478	0.3147	0.9752	0.0
87	6zsc:XA	1500	262	0.2287	0.1607	0.9198	4.40e-96
88	6zsc:XA	1500	108	0.0968	0.0680	0.9444	6.15e-40
89	6zsc:XA	1500	81	0.0769	0.0540	1.0000	1.33e-36
90	6zsc:XA	1500	123	0.1053	0.0740	0.9024	1.33e-36
91	6zsc:XA	1500	34	0.0323	0.0227	1.0000	1.78e-10
92	7of4:A	1463	482	0.4459	0.3213	0.9751	0.0	7of6:A
93	7of4:A	1463	250	0.2230	0.1606	0.9400	4.37e-101	7of6:A
94	7of4:A	1463	125	0.1129	0.0813	0.9520	2.18e-49	7of6:A
95	7of4:A	1463	123	0.1063	0.0766	0.9106	2.86e-38	7of6:A
96	7of4:A	1463	81	0.0769	0.0554	1.0000	1.33e-36	7of6:A
97	7of4:A	1463	34	0.0323	0.0232	1.0000	1.78e-10	7of6:A
98	7of2:A	1410	482	0.4459	0.3333	0.9751	0.0
99	7of2:A	1410	250	0.2230	0.1667	0.9400	4.37e-101
100	7of2:A	1410	125	0.1129	0.0844	0.9520	2.18e-49
101	7of2:A	1410	123	0.1063	0.0794	0.9106	2.86e-38
102	7of2:A	1410	81	0.0769	0.0574	1.0000	1.33e-36
103	7of2:A	1410	34	0.0323	0.0241	1.0000	1.78e-10
104	6zs9:XA	1501	485	0.4478	0.3145	0.9732	0.0
105	6zs9:XA	1501	262	0.2287	0.1606	0.9198	4.40e-96
106	6zs9:XA	1501	108	0.0968	0.0680	0.9444	6.15e-40
107	6zs9:XA	1501	81	0.0769	0.0540	1.0000	1.33e-36
108	6zs9:XA	1501	123	0.1053	0.0740	0.9024	1.33e-36
109	6zs9:XA	1501	34	0.0323	0.0227	1.0000	1.78e-10
110	7of5:A	1389	479	0.4431	0.3362	0.9749	0.0
111	7of5:A	1389	247	0.2220	0.1685	0.9474	2.61e-103
112	7of5:A	1389	125	0.1129	0.0857	0.9520	2.18e-49
113	7of5:A	1389	81	0.0769	0.0583	1.0000	1.33e-36
114	7of5:A	1389	125	0.1063	0.0806	0.8960	1.72e-35
115	7of5:A	1389	34	0.0323	0.0245	1.0000	1.78e-10
116	6i9r:A	1501	486	0.4478	0.3145	0.9712	0.0
117	6i9r:A	1501	261	0.2277	0.1599	0.9195	1.58e-95
118	6i9r:A	1501	108	0.0968	0.0680	0.9444	6.15e-40
119	6i9r:A	1501	81	0.0769	0.0540	1.0000	1.33e-36
120	6i9r:A	1501	123	0.1053	0.0740	0.9024	1.33e-36
121	6i9r:A	1501	34	0.0323	0.0227	1.0000	1.78e-10
122	7of7:A	1376	479	0.4412	0.3379	0.9708	0.0
123	7of7:A	1376	247	0.2144	0.1642	0.9150	9.58e-88
124	7of7:A	1376	125	0.1129	0.0865	0.9520	2.18e-49
125	7of7:A	1376	125	0.1063	0.0814	0.8960	1.72e-35
126	7of7:A	1376	81	0.0740	0.0567	0.9630	1.73e-30
127	7of7:A	1376	34	0.0323	0.0247	1.0000	1.78e-10
128	8qsj:A	1418	487	0.4459	0.3315	0.9651	0.0
129	8qsj:A	1418	258	0.2287	0.1700	0.9341	1.21e-101
130	8qsj:A	1418	126	0.1129	0.0839	0.9444	1.01e-47
131	8qsj:A	1418	82	0.0769	0.0571	0.9878	6.19e-35
132	8qsj:A	1418	123	0.1015	0.0755	0.8699	8.06e-29
133	8qsj:A	1418	34	0.0323	0.0240	1.0000	1.78e-10
134	8k2a:L1	1500	490	0.4478	0.3147	0.9633	0.0	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
135	8k2a:L1	1500	259	0.2287	0.1607	0.9305	1.57e-100	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
136	8k2a:L1	1500	129	0.1129	0.0793	0.9225	7.90e-44	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
137	8k2a:L1	1500	124	0.1063	0.0747	0.9032	3.70e-37	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
138	8k2a:L1	1500	81	0.0769	0.0540	1.0000	1.33e-36	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
139	8k2a:L1	1500	34	0.0323	0.0227	1.0000	1.78e-10	8k2b:L1, 8xt0:L1, 8xt1:L1, 8xt2:L1, 8xt3:L1
140	7a5i:A3	1485	490	0.4478	0.3178	0.9633	0.0
141	7a5i:A3	1485	252	0.2287	0.1623	0.9563	5.57e-110
142	7a5i:A3	1485	118	0.1063	0.0754	0.9492	1.70e-45
143	7a5i:A3	1485	129	0.1129	0.0801	0.9225	7.90e-44
144	7a5i:A3	1485	81	0.0769	0.0545	1.0000	1.33e-36
145	7a5i:A3	1485	34	0.0323	0.0229	1.0000	1.78e-10
146	7o9k:A	1436	484	0.4431	0.3252	0.9649	0.0
147	7o9k:A	1436	250	0.2277	0.1671	0.9600	4.30e-111
148	7o9k:A	1436	125	0.1129	0.0829	0.9520	2.18e-49
149	7o9k:A	1436	81	0.0769	0.0564	1.0000	1.33e-36
150	7o9k:A	1436	129	0.1063	0.0780	0.8682	6.23e-30
151	7o9k:A	1436	34	0.0323	0.0237	1.0000	1.78e-10
152	7o9m:A	1454	494	0.4478	0.3246	0.9555	0.0
153	7o9m:A	1454	255	0.2277	0.1651	0.9412	7.25e-104
154	7o9m:A	1454	125	0.1129	0.0818	0.9520	2.18e-49
155	7o9m:A	1454	82	0.0769	0.0557	0.9878	6.19e-35
156	7o9m:A	1454	129	0.1063	0.0770	0.8682	6.23e-30
157	7o9m:A	1454	34	0.0323	0.0234	1.0000	1.78e-10
158	7odt:A	1453	493	0.4469	0.3242	0.9554	0.0
159	7odt:A	1453	262	0.2287	0.1659	0.9198	4.40e-96
160	7odt:A	1453	129	0.1129	0.0819	0.9225	7.90e-44
161	7odt:A	1453	125	0.1063	0.0771	0.8960	1.72e-35
162	7odt:A	1453	82	0.0769	0.0557	0.9878	6.19e-35
163	7odt:A	1453	34	0.0323	0.0234	1.0000	1.78e-10
164	7ods:A	1445	493	0.4469	0.3260	0.9554	0.0
165	7ods:A	1445	262	0.2287	0.1668	0.9198	4.40e-96
166	7ods:A	1445	129	0.1129	0.0824	0.9225	7.90e-44
167	7ods:A	1445	125	0.1063	0.0775	0.8960	1.72e-35
168	7ods:A	1445	82	0.0769	0.0561	0.9878	6.19e-35
169	7ods:A	1445	34	0.0323	0.0235	1.0000	1.78e-10
170	7odr:A	1448	493	0.4469	0.3253	0.9554	0.0
171	7odr:A	1448	262	0.2287	0.1664	0.9198	4.40e-96
172	7odr:A	1448	129	0.1129	0.0822	0.9225	7.90e-44
173	7odr:A	1448	82	0.0769	0.0559	0.9878	6.19e-35
174	7odr:A	1448	126	0.1063	0.0773	0.8889	2.23e-34
175	7odr:A	1448	34	0.0323	0.0235	1.0000	1.78e-10
176	8pk0:A	1423	490	0.4421	0.3275	0.9510	0.0
177	8pk0:A	1423	262	0.2287	0.1694	0.9198	4.40e-96
178	8pk0:A	1423	126	0.1129	0.0836	0.9444	1.01e-47
179	8pk0:A	1423	125	0.1063	0.0787	0.8960	1.72e-35
180	8pk0:A	1423	82	0.0769	0.0569	0.9878	6.19e-35
181	8pk0:A	1423	34	0.0323	0.0239	1.0000	1.78e-10
182	8any:A	1558	499	0.4478	0.3030	0.9459	0.0	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
183	8any:A	1558	262	0.2287	0.1547	0.9198	4.40e-96	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
184	8any:A	1558	108	0.0968	0.0655	0.9444	6.15e-40	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
185	8any:A	1558	129	0.1063	0.0719	0.8682	6.23e-30	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
186	8any:A	1558	88	0.0769	0.0520	0.9205	1.35e-26	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
187	8any:A	1558	34	0.0323	0.0218	1.0000	1.78e-10	8oir:B8, 8oit:B8, 7qi4:A, 7qi5:A, 7qi6:A
188	6zm6:A	1531	499	0.4469	0.3076	0.9439	0.0
189	6zm6:A	1531	262	0.2287	0.1574	0.9198	4.40e-96
190	6zm6:A	1531	108	0.0968	0.0666	0.9444	6.15e-40
191	6zm6:A	1531	129	0.1063	0.0732	0.8682	6.23e-30
192	6zm6:A	1531	88	0.0769	0.0529	0.9205	1.35e-26
193	6zm6:A	1531	34	0.0323	0.0222	1.0000	1.78e-10
194	6zm5:A	1534	502	0.4478	0.3077	0.9402	0.0
195	6zm5:A	1534	262	0.2287	0.1571	0.9198	4.40e-96
196	6zm5:A	1534	108	0.0968	0.0665	0.9444	6.15e-40
197	6zm5:A	1534	129	0.1063	0.0730	0.8682	6.23e-30
198	6zm5:A	1534	88	0.0769	0.0528	0.9205	1.35e-26
199	6zm5:A	1534	34	0.0323	0.0222	1.0000	1.78e-10
200	7l08:A	1527	502	0.4478	0.3091	0.9402	0.0	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
201	7l08:A	1527	262	0.2287	0.1578	0.9198	4.40e-96	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
202	7l08:A	1527	108	0.0968	0.0668	0.9444	6.15e-40	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
203	7l08:A	1527	81	0.0769	0.0530	1.0000	1.33e-36	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
204	7l08:A	1527	129	0.1063	0.0733	0.8682	6.23e-30	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
205	7l08:A	1527	34	0.0323	0.0223	1.0000	1.78e-10	7l20:A, 6vlz:A, 6vmi:A
206	7qh6:A	1133	432	0.3966	0.3689	0.9676	0.0
207	7qh6:A	1133	415	0.3577	0.3327	0.9084	2.45e-148
208	7qh6:A	1133	121	0.1082	0.1006	0.9421	1.70e-45
209	7qh6:A	1133	81	0.0769	0.0715	1.0000	1.33e-36
210	7qh7:A	1256	230	0.2097	0.1760	0.9609	1.21e-101
211	7qh7:A	1256	182	0.1727	0.1449	1.0000	9.52e-93
212	7qh7:A	1256	247	0.2144	0.1799	0.9150	2.66e-88
213	7qh7:A	1256	120	0.1120	0.0939	0.9833	2.16e-54
214	7qh7:A	1256	116	0.1063	0.0892	0.9655	2.82e-48
215	7qh7:A	1256	73	0.0617	0.0518	0.8904	1.37e-16
216	7qh7:A	1256	34	0.0323	0.0271	1.0000	1.78e-10

[Back]