BioLiP

>protein
YVGFANLPNQLYRKSVKQGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLSDLYSNEYPGPSLRIKKTVKVETTKVLIKENGVTLRL
TIDDTPGFGDAVDNSNCWQAVINHIEKKFEDYLNAESMVTRSKLADNRVHCCLYFIAPTGHGLKPLDVEFMKNLHDKVNI
IPLIAKADTMTPEECLRFKKQIMKEIHEHKIQLYEFPESRVPFAVVGSNTVLERVRGRQYPWGVAEVENIDHCDFTVLRN
MLVRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSKKLSSV

The query sequence (length=270) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	9bht:C	282	288	0.9778	0.9362	0.9167	0.0	9bht:D, 9bhw:A, 9bhw:D
2	7m6j:D	273	272	0.8222	0.8132	0.8162	6.66e-170	7m6j:C, 6n0b:C, 6n0b:A, 6n0b:B, 6n0b:D, 6n12:A, 6n12:B, 3t5d:A, 3t5d:C, 6uqq:A, 6uqq:B
3	2qag:C	224	264	0.6889	0.8304	0.7045	1.14e-121
4	3tw4:A	218	257	0.6333	0.7844	0.6654	3.51e-117	3tw4:B
5	8dkt:A	264	266	0.5778	0.5909	0.5865	2.06e-108
6	6upq:A	270	270	0.5556	0.5556	0.5556	4.38e-106	3ftq:A, 7m6j:F, 6upr:A
7	3ftq:B	252	262	0.5519	0.5913	0.5687	8.35e-106	3ftq:C, 3ftq:D, 2qnr:B, 6upa:A
8	7m6j:A	234	253	0.5111	0.5897	0.5455	3.35e-93
9	9bhw:B	299	292	0.5000	0.4515	0.4623	6.96e-93	9bhw:C
10	6uqq:C	280	272	0.4963	0.4786	0.4926	1.09e-91	3sop:A, 3sop:B, 6uqq:D, 4z51:A, 4z54:A, 4z54:B
11	2qa5:B	234	272	0.5519	0.6368	0.5478	1.03e-90	2qa5:A, 2qag:A, 2qnr:A
12	9bht:A	220	258	0.4778	0.5864	0.5000	1.33e-88	9bht:F
13	8pfh:B	287	289	0.4741	0.4460	0.4429	9.69e-87	8fwp:B, 8sgd:B, 8sgd:D
14	5cyo:A	272	271	0.4815	0.4779	0.4797	5.63e-86	5cyo:B, 4yqf:B, 4yqf:A
15	6mq9:B	267	271	0.4630	0.4682	0.4613	1.06e-85	6mq9:A, 6mq9:D, 6mq9:C, 6mqb:A, 6mqk:A, 6mqk:D, 6mqk:B, 6mqk:C, 6mql:A
16	9bht:E	288	289	0.4778	0.4479	0.4464	2.01e-82	9bht:B
17	5cyp:A	248	267	0.4704	0.5121	0.4757	1.07e-79	5cyp:B, 5cyp:C
18	7m6j:E	296	290	0.4593	0.4189	0.4276	2.94e-78	7m6j:B, 6upa:B
19	8dkt:B	262	272	0.4407	0.4542	0.4375	3.64e-75
20	6upq:B	247	250	0.4185	0.4575	0.4520	4.10e-73
21	8pfh:C	289	287	0.4519	0.4221	0.4251	7.11e-73
22	6upr:B	270	271	0.4296	0.4296	0.4280	1.52e-72
23	8sgd:A	291	289	0.4185	0.3883	0.3910	2.07e-71	8fwp:A, 8pfh:A, 8sgd:C
24	5cyp:D	227	268	0.4333	0.5154	0.4366	1.55e-70
25	4kva:B	258	267	0.4222	0.4419	0.4270	1.32e-68	4kv9:A, 4kv9:B, 4kva:A
26	2qag:B	246	270	0.3926	0.4309	0.3926	1.40e-53
27	8pfh:D	291	289	0.3667	0.3402	0.3426	9.74e-51
28	5irr:B	281	279	0.3000	0.2883	0.2903	7.93e-31	5irr:A
29	5xc3:A	168	68	0.0778	0.1250	0.3088	0.003	5xc5:A
30	2f9m:A	182	66	0.0889	0.1319	0.3636	0.007	4c4p:A, 5c46:F, 5c4g:B, 4d0l:B, 4d0l:D, 4d0l:F, 4d0m:B, 4d0m:D, 4d0m:H, 4d0m:J, 4d0m:N, 4d0m:P, 4d0m:R, 4d0m:T, 4d0m:X, 4d0m:Z, 4d0m:d, 4d0m:h, 2d7c:A, 2d7c:B, 5euq:B, 5ez5:A, 5ez5:B, 2f9l:A, 5fbl:B, 5fbq:B, 5fbr:B, 5fbv:B, 5fbw:B, 2gzd:A, 2gzd:B, 2gzh:A, 2hv8:A, 2hv8:B, 2hv8:C, 6iy1:A, 6iy1:B, 6iy1:C, 6iy1:D, 6iy1:E, 6iy1:F, 5jcz:A, 5jcz:D, 5jcz:I, 4lwz:A, 4lwz:C, 4lx0:A, 4lx0:C, 1oiv:A, 1oiv:B, 1oiw:A, 1oix:A, 4ojk:A, 4ojk:B, 4uj3:A, 4uj3:D, 4uj3:G, 4uj3:J, 4uj3:M, 4uj3:P, 4uj3:S, 4uj3:V, 4uj4:A, 4uj4:D, 4uj4:G, 4uj4:J, 4uj5:A, 4uj5:B, 8vof:B, 1yzk:A
31	1ukv:Y	197	66	0.0852	0.1168	0.3485	0.013	2bcg:Y, 1yzn:A
32	5xr4:B	171	66	0.0889	0.1404	0.3636	0.038	5xr4:A, 5xr6:A, 5xr6:B, 5xr7:A, 5xr7:B
33	6if2:B	178	67	0.0815	0.1236	0.3284	0.069	6ekk:C, 6ekk:D, 6if3:B
34	3sfv:A	179	66	0.0815	0.1229	0.3333	0.084	8alk:B, 7eq2:A, 7eq2:B, 4fmb:B, 4fmb:D, 4fmb:F, 4fmc:B, 4fmc:D, 4fmd:B, 4fmd:D, 4fmd:F, 4fme:B, 4fme:E, 2fol:A, 4hlq:B, 4hlq:D, 4hlq:F, 4hlq:H, 4hlq:J, 4i1o:A, 4i1o:C, 4i1o:E, 4i1o:G, 4iru:B, 4iru:D, 4iru:F, 4jvs:B, 3nkv:A, 3nkv:B, 5o74:B, 5o74:D, 5o74:F, 5o74:H, 5o74:J, 5o74:L, 6sku:B, 5szh:B, 5szk:B, 3tkl:A
35	2rhd:A	164	71	0.0852	0.1402	0.3239	0.18
36	7o9k:C	255	42	0.0630	0.0667	0.4048	0.29	7o9m:C
37	3bfk:B	179	67	0.0852	0.1285	0.3433	0.31	3bfk:A, 3bfk:C, 3bfk:D, 3bfk:E
38	6b40:A	553	97	0.0963	0.0470	0.2680	0.43	6b40:E
39	7jgr:D	441	43	0.0630	0.0385	0.3953	0.50	7jgs:D, 7jk2:D, 7jk3:D, 7jk4:D, 7jk5:D, 7jk6:D
40	1vg8:A	184	66	0.0741	0.1087	0.3030	0.52	7f6j:A, 7f6j:B, 6iyb:A, 6iyb:C, 8kb8:C, 8kb8:D, 3law:A, 3law:B, 3law:C, 3law:D, 3law:E, 1t91:A, 1t91:B, 1t91:C, 1t91:D, 1vg0:B, 1vg1:A, 1vg8:B, 1vg8:C, 1vg8:D, 1vg9:B, 1vg9:D, 1vg9:F, 1vg9:H, 6wcw:B, 1yhn:A, 5z2m:A, 5z2m:C, 8zq3:A
41	7pd3:z	311	30	0.0519	0.0450	0.4667	0.52	8pk0:z, 8qsj:z
42	3q85:B	151	26	0.0519	0.0927	0.5385	0.53	4aii:A, 4aii:B, 3q85:A
43	6yxy:EM	330	41	0.0667	0.0545	0.4390	0.56
44	6yxx:EM	308	41	0.0667	0.0584	0.4390	0.59
45	2oil:A	174	69	0.0778	0.1207	0.3043	0.61	3tso:A, 3tso:B
46	4cz2:B	179	68	0.0741	0.1117	0.2941	0.70	4cym:A, 4cym:B, 4cym:C, 4cz2:A, 4cz2:C, 6ff8:A, 6ff8:B, 5oec:B, 5oed:B
47	2j3e:A	249	100	0.0926	0.1004	0.2500	1.0	3bb3:A, 3bb4:A, 3def:A
48	3rwm:B	179	67	0.0741	0.1117	0.2985	1.2	3rwo:B, 3rwo:A
49	5c1s:A	288	24	0.0481	0.0451	0.5417	1.5	5c1s:B, 5c1t:A, 5c1t:B
50	3iev:A	302	187	0.1778	0.1589	0.2567	1.6	7c1o:A, 3r9w:A, 3r9x:A
51	1x3s:A	177	64	0.0815	0.1243	0.3438	1.6
52	3cbq:A	169	20	0.0444	0.0710	0.6000	1.6
53	2g6b:A	162	70	0.0704	0.1173	0.2714	1.7
54	1h65:A	257	73	0.0741	0.0778	0.2740	2.0	3bb1:A, 3bb1:B, 3bb1:C, 3bb1:D, 3bb1:E, 3bb1:F, 3bb1:G, 3bb1:H, 1h65:B, 1h65:C
55	9cc9:A	850	53	0.0667	0.0212	0.3396	2.1	9cc8:A, 9cc8:B, 9cc8:C, 9cc8:D, 9cc8:E, 9cc8:F, 9cc9:B, 9cc9:C, 9cc9:D, 9cc9:E, 9cc9:F, 9cc9:G, 9cc9:H, 9cc9:I, 9cc9:J, 9cc9:K, 9cc9:L
56	4d0g:A	167	67	0.0704	0.1138	0.2836	2.1	4drz:A, 1z0f:A
57	3qkt:A	339	61	0.0778	0.0619	0.3443	2.3	4ncj:C, 4ncj:D, 3qkt:C
58	3qku:A	359	61	0.0778	0.0585	0.3443	2.3	1f2u:A, 1f2u:D, 1f2u:C, 1f2u:B, 3qks:A, 3qks:B
59	5d2l:F	238	80	0.0926	0.1050	0.3125	2.4	5d2l:J, 5d2l:P
60	3qkt:B	319	61	0.0778	0.0658	0.3443	2.4	4ncj:A, 4ncj:B, 3qkt:D, 3qku:B
61	7pr1:A	587	68	0.0963	0.0443	0.3824	2.5	7pr1:B, 7pru:A, 7pru:B
62	2bme:A	176	68	0.0741	0.1136	0.2941	2.7	2bmd:A, 2bme:B, 2bme:C, 2bme:D, 1yu9:A, 1z0k:A, 1z0k:C
63	6yxy:EQ	471	150	0.1333	0.0764	0.2400	3.3
64	6h4d:A	274	27	0.0444	0.0438	0.4444	3.3
65	6s5f:A	188	69	0.0815	0.1170	0.3188	3.3
66	1lkx:C	679	127	0.1370	0.0545	0.2913	3.4	1lkx:A, 1lkx:B, 1lkx:D
67	8ij9:A	168	68	0.0704	0.1131	0.2794	3.8	3bbp:A, 3bbp:B, 3bbp:C, 3cwz:A, 4dkx:A, 4dkx:B, 2e9s:A, 2e9s:B, 2e9s:C, 2fe4:A, 2ffq:A, 2gil:A, 2gil:B, 2gil:C, 2gil:D, 8ij9:B, 5lef:A, 5lef:B, 2y8e:A, 2y8e:B, 1yzq:A
68	5dvr:A	386	48	0.0593	0.0415	0.3333	3.9
69	6hh2:A	174	68	0.0778	0.1207	0.3088	4.9	8fo2:B
70	2wjg:A	170	39	0.0407	0.0647	0.2821	5.3	2wjg:B, 2wjh:A, 2wjh:B, 2wji:A, 2wji:B, 2wjj:A, 2wjj:B
71	7am2:BT	300	23	0.0519	0.0467	0.6087	5.5
72	2cxx:A	184	67	0.0741	0.1087	0.2985	5.8	2cxx:B, 2cxx:C
73	7yq0:A	173	21	0.0370	0.0578	0.4762	5.8	7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
74	1ky2:A	180	75	0.0704	0.1056	0.2533	6.1	1ky3:A, 4phf:A, 4phg:A, 4phh:A, 4phh:B, 4phh:C, 4phh:D
75	6mfu:A	216	21	0.0444	0.0556	0.5714	6.5	6mfu:B, 6mfu:C, 6mfu:D
76	7c3k:B	389	18	0.0407	0.0283	0.6111	6.5	7c3k:A, 8jqz:A, 8jqz:B
77	1byu:B	215	67	0.0593	0.0744	0.2388	6.8	6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
78	3pqc:B	194	169	0.1593	0.2216	0.2544	7.1	3pqc:A
79	1lc7:A	358	171	0.1407	0.1061	0.2222	7.4	1lc5:A, 1lc8:A, 1lkc:A
80	5h56:B	195	50	0.0667	0.0923	0.3600	7.7	5h56:A, 5h5k:A, 5h5k:B, 4s2e:A, 4s2e:B, 4s35:A, 4s35:B, 5xai:B, 5xai:A, 5xb2:B, 5xb2:A, 5xb3:A, 5xb3:B, 5xb5:A
81	7vex:A	412	18	0.0407	0.0267	0.6111	7.8	8h4m:A
82	2j68:A	680	33	0.0519	0.0206	0.4242	8.1	2w6d:A, 2w6d:B
83	6o62:A	169	64	0.0667	0.1065	0.2812	8.9
84	7lwb:A	182	67	0.0630	0.0934	0.2537	9.8	7bwt:B, 4lhv:A, 4lhv:B, 4lhv:C, 4lhv:D, 4lhw:A, 4lhw:B, 4lhw:C, 4lhw:D, 4lhw:E, 4lhy:A, 4lhy:B, 4lhz:A, 4lhz:B, 4li0:A, 4li0:B, 3qbt:A, 3qbt:C, 3qbt:E, 3qbt:G, 6rir:A, 6rir:B, 6sq2:A, 6sq2:B, 6stf:A, 6stf:B, 6stf:C, 6stf:D, 6stf:E, 6stg:A, 6stg:B, 5szi:A, 3tnf:A, 6whe:A, 6whe:B, 6yx5:A, 6zsi:A, 6zsi:B, 6zsj:A, 6zsj:B
85	5irm:C	770	21	0.0444	0.0156	0.5714	9.8	5irl:A, 5irm:A, 5irn:A

[Back]