BioLiP

>protein
YTVKFQPDPIDKKGWSVIDFNNCCTQDGGWYLNMGWGVESLIDNNPGTQWLCRWDVKEPLPYYFVFDMGKEYTLFRFGFA
NPVAPAAHVWAGTSKAGYVEASIDNENWVKLKDWTSPKIGEPNVNMDVPATQARYIRFVITDTYPTYDGLRVSLGEVYAW
GLEHHHH

The query sequence (length=167) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3hnm:A	167	167	1.0000	1.0000	1.0000	3.26e-126	3hnm:B, 3hnm:C, 3hnm:D
2	4lks:A	157	130	0.1677	0.1783	0.2154	0.011	4lks:C, 4lqr:A, 4p5y:A
3	7rga:E	270	142	0.2275	0.1407	0.2676	0.018	3qxt:A, 3qxt:B, 3qxv:A, 3qxv:B, 3qxv:C, 3qxv:D, 3qxv:E, 7rg7:A, 7rga:A, 7rga:B, 7rga:C, 7rga:D, 7rga:G, 7rga:F, 2w1q:A, 2w1q:B, 2w1s:A, 2w1s:B, 2w1u:A, 2w1u:C, 2wdb:A, 2wdb:C, 2wdb:D
4	7w1e:E	644	39	0.1078	0.0280	0.4615	0.23	7w1e:A, 7w1e:C, 7w1e:D, 7w1e:F, 7w1e:B
5	7eu1:A	1065	32	0.0838	0.0131	0.4375	0.41
6	8xme:A	1176	32	0.0838	0.0119	0.4375	0.41	7eu0:A, 8xmb:A, 8xmc:A, 8xmd:A
7	2w1u:B	146	143	0.2156	0.2466	0.2517	0.56	2w1u:D, 2wdb:B
8	7yvv:A	335	61	0.1198	0.0597	0.3279	0.76
9	1tvg:A	136	106	0.1557	0.1912	0.2453	1.1
10	2v72:A	137	31	0.0659	0.0803	0.3548	1.2
11	3hna:A	280	45	0.1078	0.0643	0.4000	1.9	3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
12	4jb0:A	367	48	0.1138	0.0518	0.3958	2.6	4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
13	5fq9:B	247	26	0.0659	0.0445	0.4231	2.8	1fof:A, 1fof:B, 5fq9:A, 1h5x:A, 1h5x:B, 1h8y:A, 1h8y:B, 2hp5:A, 2hp5:B, 2hp5:C, 2hp5:D, 1k54:A, 1k54:B, 1k6r:A, 1k6r:B, 1k6s:A, 1k6s:B, 7l5t:A, 7l5t:B, 3lce:A, 3lce:B, 5mmy:B, 5mnu:A, 5mnu:B, 5mox:A, 5mox:B, 5moz:A, 5moz:B, 6rtn:A, 6rtn:B, 4s2o:A, 4s2o:B, 6skp:A, 6skp:B, 6skq:A, 6skq:B, 6skq:C, 6skq:D, 6skr:A, 6skr:B, 2wgi:A, 2wgi:B, 2wgv:A, 2wgv:B, 2wkh:A, 2wkh:B, 4wz5:A, 4wz5:B, 6zrg:A, 6zrh:A, 6zrh:B, 6zrh:C, 6zrh:D, 6zri:A, 6zri:B, 6zri:C, 6zri:D, 6zw2:A
14	7rd0:A	482	71	0.1257	0.0436	0.2958	4.8
15	1kqf:A	982	50	0.1138	0.0193	0.3800	4.9	1kqg:A
16	3hem:A	291	49	0.0719	0.0412	0.2449	5.2	1kpi:A
17	8wlv:A	158	64	0.1018	0.1076	0.2656	6.4	8wlv:B, 8wlv:C, 8wlv:D, 8wlw:A, 8wlw:C, 8wlw:B, 8wlw:D, 8wlx:A, 8wlx:B, 5xko:A, 5xko:B, 5xkp:A, 5xkp:B, 5xkp:C, 5xkp:D, 5xkq:A, 5xkq:B, 5xkq:C, 5xkq:D, 5xkr:A, 5xkr:B, 5xkr:C, 5xkr:D

[Back]