BioLiP

>protein
YTTFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYE
LEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITSLEELQI
AMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRLKCYLHETLEAIINR
LVEAEVHRLVDVVKGIVSLSDILQALV

The query sequence (length=267) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4qfs:C	267	267	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	2v8q:E	304	295	1.0000	0.8783	0.9051	0.0	6b1u:E, 6b1u:F, 6b2e:C, 8bik:C, 8bik:F, 6c9f:C, 6c9g:C, 6c9h:C, 6c9j:C, 4cfe:E, 4cfe:F, 4cff:E, 4cff:F, 4cfh:E, 6e4t:C, 6e4u:C, 6e4w:C, 4eag:C, 4eai:C, 4eaj:C, 4eak:C, 4eal:C, 5ezv:E, 5ezv:F, 5iso:E, 5iso:F, 7jhg:G, 7jhh:G, 7jij:G, 5kq5:C, 7m74:G, 7myj:E, 7myj:F, 4qfg:C, 4qfr:C, 4rer:G, 4rew:G, 5t5t:C, 5ufu:C, 2uv4:A, 2uv5:A, 2uv6:A, 2uv7:A, 2v92:E, 2v9j:E, 2y8l:E, 2y8q:E, 2ya3:E, 4zhx:E, 4zhx:F
3	3tdh:C	316	295	0.3820	0.3228	0.3458	2.45e-44	3t4n:C, 3te5:C
4	2oox:E	333	297	0.3521	0.2823	0.3165	8.88e-44	2oox:G, 2ooy:G, 2ooy:E, 2qr1:G, 2qr1:E, 2qrc:G, 2qrc:E, 2qrd:G, 2qrd:E, 2qre:G, 2qre:E
5	3kpc:A	124	115	0.1423	0.3065	0.3304	1.11e-06	3kpb:A, 3kpb:C, 3kpb:D, 3kpd:A, 3kpd:B, 3kpd:C, 3kpd:D
6	3lfz:A	280	208	0.1648	0.1571	0.2115	3.92e-04	3kh5:A
7	3lfz:A	280	209	0.1685	0.1607	0.2153	3.96e-04	3kh5:A
8	3lfz:A	280	196	0.1498	0.1429	0.2041	0.003	3kh5:A
9	8qqp:A	464	144	0.1236	0.0711	0.2292	5.83e-04	8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
10	2rc3:C	128	121	0.1199	0.2500	0.2645	0.001	2rc3:A, 2rc3:D, 2rc3:B
11	7oj1:B	425	105	0.0974	0.0612	0.2476	0.009
12	4gqy:A	147	78	0.0861	0.1565	0.2949	0.011	4gqy:B, 4gqy:C, 4gqy:D
13	4gqy:A	147	143	0.1311	0.2381	0.2448	1.3	4gqy:B, 4gqy:C, 4gqy:D
14	2qh1:B	185	157	0.1536	0.2216	0.2611	0.011	1pvm:A, 1pvm:B, 2qh1:A
15	4fry:B	138	117	0.1086	0.2101	0.2479	0.026	4fry:A
16	3tsb:A	490	164	0.1236	0.0673	0.2012	0.18	3tsd:A, 3usb:A
17	5g5x:A	119	58	0.0674	0.1513	0.3103	0.23
18	2yvx:A	442	55	0.0749	0.0452	0.3636	0.36	8h5e:A, 4u9n:B, 4wib:B, 5x9g:A, 5x9g:B, 5x9g:C, 5x9g:D, 5x9h:A, 5x9h:B, 2yvx:B, 2yvx:C, 2yvx:D, 2yvy:A, 2zy9:A, 2zy9:B
19	8gpv:A	255	208	0.1798	0.1882	0.2308	0.50
20	7pmz:B	430	94	0.0974	0.0605	0.2766	0.59	7pmz:A, 7pmz:C, 7pmz:D, 7pmz:E, 7pmz:F, 7pmz:G, 7pmz:H, 7pmz:I, 7pmz:J, 7pmz:K, 7pmz:L, 7pmz:M, 7pmz:N, 7pmz:O, 7pmz:P
21	1zfj:A	476	103	0.0787	0.0441	0.2039	1.3
22	8kdb:A	2117	87	0.0787	0.0099	0.2414	1.8	8kdc:A
23	3pc3:A	504	46	0.0375	0.0198	0.2174	2.8	3pc2:A, 3pc4:A
24	6mo0:A	164	38	0.0449	0.0732	0.3158	3.2	6mo0:B, 6mo1:A, 6mo1:B, 6mo2:A, 6mo2:B
25	3it6:A	193	36	0.0487	0.0674	0.3611	3.8	3it6:C
26	6ao8:A	569	39	0.0524	0.0246	0.3590	3.9
27	7jrg:A	487	166	0.1461	0.0801	0.2349	6.0	8e73:A, 8e73:M, 7jrg:M, 7jrp:A, 7jrp:M
28	7dn3:A	1293	41	0.0487	0.0101	0.3171	6.8	7du2:A
29	7d58:A	1387	43	0.0487	0.0094	0.3023	7.0	7a6h:A, 7ae1:A, 7ae3:A, 7aea:A, 7fji:A, 7fjj:A, 8ity:A, 8iue:A, 8iuh:A
30	7urg:A	401	43	0.0449	0.0299	0.2791	8.0	7urg:B
31	7w7g:A	1528	118	0.1199	0.0209	0.2712	8.5

[Back]