BioLiP

>protein
YSHKFTVVVLRATKVTKGAFGDMLDTPDPYVELFISTTPDSRKRTRHFNNDINPVWNETFEFILDPNQENVLEITLMDAN
YVMDETLGTATFTVSSMKVGEKKEVPFIFNQVTEMVLEMSLEV

The query sequence (length=123) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1cjy:A	633	123	1.0000	0.1943	1.0000	2.82e-82	1bci:A, 1cjy:B, 1rlw:A
2	6iej:A	126	123	0.7967	0.7778	0.7967	8.56e-72	6iej:B, 6iej:C
3	5ixc:A	684	84	0.2358	0.0424	0.3452	2.35e-11	5ixc:B, 5izr:A, 5izr:B, 5izr:D
4	5izr:C	659	77	0.2276	0.0425	0.3636	1.31e-10
5	4lt7:A	128	91	0.2114	0.2031	0.2857	6.25e-07	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
6	7atp:A	129	92	0.2276	0.2171	0.3043	1.21e-06
7	6uwa:A	187	74	0.1870	0.1230	0.3108	8.13e-06	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
8	2uzp:A	142	74	0.2114	0.1831	0.3514	9.46e-06	2uzp:B, 2uzp:C
9	3pfq:A	523	75	0.1789	0.0421	0.2933	1.42e-05	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
10	5ue8:A	847	123	0.2602	0.0378	0.2602	6.39e-04	5ue8:B, 1y8f:A
11	6nyt:A	135	80	0.1789	0.1630	0.2750	0.001
12	4ihb:E	126	71	0.1870	0.1825	0.3239	0.002	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
13	5cch:E	280	43	0.1545	0.0679	0.4419	0.003	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
14	5cch:E	280	63	0.1707	0.0750	0.3333	2.0	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
15	5a50:A	165	73	0.1789	0.1333	0.3014	0.004	5a4x:A, 5a4x:B, 5a50:B, 5a51:A, 5a51:B, 4v29:A, 4v29:B
16	4lcv:C	129	37	0.1138	0.1085	0.3784	0.012
17	5h4z:A	129	106	0.2439	0.2326	0.2830	0.014	5h4y:A, 5h4z:B
18	6ank:B	263	58	0.1463	0.0684	0.3103	0.015	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
19	6ank:B	263	64	0.1545	0.0722	0.2969	5.0	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
20	3hn8:A	279	37	0.1220	0.0538	0.4054	0.020	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
21	3hn8:A	279	117	0.2683	0.1183	0.2821	0.82	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
22	9bcz:A	606	77	0.1789	0.0363	0.2857	0.030
23	5a52:A	154	74	0.1463	0.1169	0.2432	0.20
24	4p42:A	455	81	0.1789	0.0484	0.2716	0.20	4npk:A
25	4p42:A	455	75	0.1545	0.0418	0.2533	3.2	4npk:A
26	2zkm:X	708	76	0.2033	0.0353	0.3289	0.94	2fju:B
27	3b7y:A	144	68	0.1301	0.1111	0.2353	2.2
28	4p42:B	431	81	0.1789	0.0510	0.2716	2.4
29	4p42:B	431	75	0.1545	0.0441	0.2533	3.2
30	1i19:A	541	39	0.1057	0.0240	0.3333	3.2	2i0k:A, 1i19:B
31	6kxk:D	553	42	0.0976	0.0217	0.2857	3.9	6kxk:F, 6kxu:A, 6kxu:B, 6kxu:C, 6kxu:D, 6kxu:E, 6kxu:F, 6kxu:G, 6kxu:H
32	7vg3:A	860	41	0.0976	0.0140	0.2927	4.3	7vg2:A
33	7knc:A	919	55	0.1138	0.0152	0.2545	5.5
34	6sga:F2	915	29	0.0813	0.0109	0.3448	5.5	7pua:F2, 6sgb:F2
35	8jwf:A	1204	39	0.1057	0.0108	0.3333	6.2	8jwg:A, 8jwi:A
36	6c8c:A	119	30	0.1057	0.1092	0.4333	6.6	6c8c:B, 4fjo:A, 4gk5:E, 2lsi:A, 2lsj:A, 2lsk:A, 2n1g:A
37	7m1a:AAA	177	67	0.1301	0.0904	0.2388	7.9	7m1a:BBB
38	8zuh:B	137	61	0.1626	0.1460	0.3279	9.1

[Back]