BioLiP

>protein
YSDVPKFIRDVSIKQHEWMRESIKLIASENITSLAVREACATDFMHAEGLPGKRLYQGCKYIDEVETLCIELSKELFKAE
HANVQPTSGVVANLAVFFAETKPGDKLMALSVPDGGHISHWKVSAAGIRGLKVINHPFDPEEMNIDADAMVKKILEEKPK
LILFGGSLFPFPHPVADAYEAAQEVGAKIAYDGAHVLGLIAGKQFQDPLREGAEYLMGSTHKTFFGPQGGVILTTKENAD
KIDSHVFPGHLHHKAGLAIALAEMLEFGEAYAKQVIKNAKALAQALYERGFNVLCEHKDFTESHQVIIDIESSPDIEFSA
SELAKMYEEANIILNKNLLPWDDVNNSDNPSGIRLGTQECTRLGMKEKEMEEIAEFMKRIAIDKEKPEKVREDVKEFAKE
YSTIHYSFDEGDGFKYLRFY

The query sequence (length=420) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4uqv:G	429	427	1.0000	0.9790	0.9836	0.0	4uqv:A, 4uqv:B, 4uqv:C, 4uqv:D, 4uqv:E, 4uqv:F, 4uqv:H, 4uqv:I, 4uqv:J, 4uqv:K, 4uqv:L
2	4bhd:B	395	425	0.9262	0.9848	0.9153	0.0
3	1kkj:A	405	367	0.3381	0.3506	0.3869	1.50e-69	1kkp:A, 1kl1:A, 1kl2:A, 1kl2:B, 2vgs:A, 2vgt:A, 2vgu:A, 2vgv:A, 2vgw:A, 2vi8:A, 2vi9:A, 2via:A, 2vib:A, 2vmn:A, 2vmo:A, 2vmp:A, 2vmq:A, 2vmr:A, 2vms:A, 2vmt:A, 2vmu:A, 2vmv:A, 2vmw:A, 2vmx:A, 2vmy:A, 2vmy:B, 2vmz:A, 2w7d:A, 2w7e:A, 2w7f:A, 2w7g:A, 2w7h:A, 2w7i:A, 2w7j:A, 2w7k:A, 2w7l:A, 2w7m:A, 1yjs:A, 1yjy:A, 1yjz:A
4	4n0w:A	416	406	0.3619	0.3654	0.3744	8.50e-69	4n0w:B, 4n0w:C, 4n0w:D, 4ot8:A, 4ot8:C, 4ot8:B, 4ot8:D, 4otl:A, 4otl:B, 4otl:D, 4otl:C
5	6ymd:A	420	396	0.3500	0.3500	0.3712	1.11e-67	6ymd:B, 6ymf:A
6	9boh:A	402	390	0.3548	0.3706	0.3821	2.69e-67	9boh:B, 9bow:A, 9bow:B, 9bpe:A, 9bpe:B, 2dkj:A, 2dkj:B, 8ssy:A, 8ssy:B, 8sui:B
7	3pgy:B	404	410	0.3524	0.3663	0.3610	3.22e-67	3pgy:A
8	6tgh:A	410	398	0.3619	0.3707	0.3819	9.96e-65	6tgh:C, 6tgh:B, 6tgh:D, 6ti1:A, 6ti1:C, 6ti3:A, 6ti3:C, 6ti3:B, 6ti3:D, 6ti4:A, 6ti4:C, 4wxf:A, 4wxf:C, 4wxg:A, 4wxg:C, 6yrw:A, 6yrw:C, 6yrw:B, 6yrw:D
9	1dfo:B	417	390	0.3548	0.3573	0.3821	6.34e-61	1dfo:A, 1dfo:D, 1dfo:C, 1eqb:A, 1eqb:B, 1eqb:D, 1eqb:C, 3g8m:A
10	7x5o:B	412	404	0.3429	0.3495	0.3564	1.38e-59	7v3d:A, 7v3d:B, 7x5n:A, 7x5n:B, 7x5o:A
11	6cd1:A	452	390	0.3405	0.3164	0.3667	4.04e-58	6ccz:A, 6ccz:B, 6cd1:B, 6cd1:C, 6cd1:D, 6cd1:E, 6cd1:F, 6cd1:G, 6cd1:H
12	8dsk:A	472	406	0.3310	0.2945	0.3424	4.82e-58	8dsk:B, 8dsk:C, 8dsk:D, 8fsd:A, 8fsd:B, 8fsd:C, 8fsd:D, 8tqf:A, 8tqf:B, 8tqf:C, 8tqf:D, 7ujh:A, 7ujh:B, 6uxi:A, 6uxi:B, 6uxj:A, 6uxj:B, 6uxj:C, 6uxj:D, 6uxl:A, 6uxl:B
13	6smr:A	473	406	0.3310	0.2939	0.3424	5.30e-58	6smr:B, 6smr:C, 6smr:D
14	6uld:A	428	388	0.3143	0.3084	0.3402	1.07e-52	6uld:B
15	7e13:A	475	452	0.3405	0.3011	0.3164	1.53e-51	7e13:B, 7e13:C, 7e13:D
16	7byi:A	463	414	0.3143	0.2851	0.3188	2.39e-50	8aql:A, 8aql:B, 8aql:C, 8aql:D, 9box:A, 9box:C, 9box:B, 9box:D, 7byi:B, 8fjt:A, 8fjt:B, 8fju:A, 8fju:B, 8gks:A, 8gks:B, 8gkt:A, 8gkt:B, 8gku:A, 8gku:B, 8gkw:A, 8gkw:B, 8gky:A, 8gky:B, 8gkz:A, 8gkz:B, 6m5o:A, 6m5o:B, 6qvg:A, 6qvg:B, 6qvl:A, 6qvl:B, 8t4o:A, 8t4o:B, 8t4p:A, 8t4p:B, 8tlc:A, 8tlc:B, 5v7i:A, 5v7i:B
17	6smn:D	480	452	0.3310	0.2896	0.3075	2.92e-50	6smn:A, 6smn:B, 6smn:C, 6smw:A, 6smw:B, 6smw:C, 6smw:D
18	1rv3:B	466	423	0.3262	0.2940	0.3239	7.78e-49	1cj0:A, 1ls3:A, 1ls3:B, 1ls3:C, 1ls3:D, 1rv3:A, 1rv4:A, 1rv4:B, 1rvu:A, 1rvu:B, 1rvy:A, 1rvy:B
19	4o6z:A	448	415	0.3119	0.2924	0.3157	2.80e-48	4o6z:B, 4o6z:C
20	5gvk:A	442	420	0.3024	0.2873	0.3024	8.69e-47	5gvk:B, 5gvk:C, 5gvl:A, 5gvl:B, 5gvl:C, 5gvm:A, 5gvm:B, 5gvm:C, 5gvn:A, 5gvn:B, 5gvn:C, 5gvp:A, 5gvp:B, 5gvp:C, 4oyt:A, 4oyt:B, 4oyt:C, 4pff:A, 4pff:B, 4pff:C, 4pfn:A, 4pfn:B, 4pfn:C, 4tmr:A, 4tmr:B, 4tmr:C, 4tn4:A, 4tn4:B, 4tn4:C, 5xmp:A, 5xmp:B, 5xmp:C, 5xmq:A, 5xmq:B, 5xmq:C, 5xmr:A, 5xmr:B, 5xmr:C, 5xms:A, 5xms:B, 5xms:C, 5xmt:A, 5xmt:B, 5xmt:C, 5xmu:A, 5xmu:B, 5xmu:C, 5xmv:A, 5xmv:B, 5xmv:C, 5yfy:A, 5yfy:B, 5yfy:C, 5yfz:A, 5yfz:B, 5yfz:C, 5yg0:A, 5yg0:B, 5yg0:C, 5yg1:A, 5yg1:B, 5yg1:C, 5yg2:A, 5yg2:B, 5yg2:C, 5yg3:A, 5yg3:B, 5yg3:C, 5yg4:A, 5yg4:B, 5yg4:C
21	1eji:A	478	424	0.3262	0.2866	0.3231	9.56e-46	8a11:B, 1bj4:A, 1cj0:B, 1eji:B, 1eji:C, 1eji:D, 6fl5:A, 6fl5:D, 6fl5:G, 6fl5:J, 6m5w:A
22	6hrh:A	429	262	0.1524	0.1492	0.2443	0.027	6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
23	5hh9:A	390	122	0.0881	0.0949	0.3033	0.088	5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
24	5k1r:B	440	126	0.0738	0.0705	0.2460	0.16	5k1r:A
25	4zah:A	370	95	0.0476	0.0541	0.2105	0.22	4zah:B, 4zah:C, 4zah:D, 4zah:E, 4zah:F, 4zah:G, 4zah:H
26	3mc6:A	426	128	0.0762	0.0751	0.2500	0.96	3mc6:C
27	8gm4:A	462	106	0.0595	0.0541	0.2358	1.3
28	5dny:A	352	64	0.0524	0.0625	0.3438	1.3	3auz:A, 5dny:C, 5f3w:A, 5f3w:C, 4tug:A, 4tug:B, 4tug:C, 4tug:D, 4tug:E, 4tug:F, 4tui:B, 4tui:A
29	8fny:A	497	106	0.0595	0.0503	0.2358	1.5	8fny:C, 8fo6:A, 8gm5:A, 7shq:A
30	2ywf:A	532	26	0.0310	0.0244	0.5000	1.6	2ywg:A, 2ywh:A
31	8guh:A	394	200	0.1095	0.1168	0.2300	2.5	3a2b:A, 8h1q:A, 8h1y:A, 8h20:A, 8h21:A, 8h29:A, 8iyp:A, 8iyt:A
32	6ndn:A	406	146	0.0810	0.0837	0.2329	2.9	1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
33	8a5e:A	583	53	0.0405	0.0292	0.3208	3.0	8a5e:D, 7q4v:A, 7q4v:E, 7q4w:A, 7q4w:E
34	3w1k:B	452	42	0.0333	0.0310	0.3333	3.1	3w1k:A, 3w1k:C, 3w1k:D, 3w1k:E
35	3ztv:A	565	83	0.0500	0.0372	0.2530	3.7	3zu0:A
36	7dog:A	319	57	0.0357	0.0470	0.2632	4.8	7dog:B
37	8c45:A	1218	49	0.0429	0.0148	0.3673	6.5	8c45:B, 8q56:A
38	1wyu:B	473	114	0.0690	0.0613	0.2544	6.8	1wyu:D, 1wyu:F, 1wyu:H, 1wyv:B, 1wyv:D, 1wyv:F, 1wyv:H

[Back]