BioLiP

>protein
YRWRRKNGIFNTRLSRTIGYTVKKTTVRTPSWNVDMMRFNINDFLPPGGGSNPLTVPFEYYRIRKVKVEFWPCSPITQGD
RGVGSTAVILDDNFVTKANALTYDPYVNYSSRHTITQPFSYHSRYFTPKPVLDRTIDYFQPNNKRNQLWLRLQTTGNVDH
VGLGTAFENSIYDQDYNIRITMYVQFREFNLKDPPL

The query sequence (length=196) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ola:A0	196	196	1.0000	1.0000	1.0000	2.11e-146	6e2z:A6, 6e32:A1, 6e32:AN, 6e34:AA, 6e39:A1, 6e39:A5, 6ola:A1, 6ola:A2, 6ola:A3, 6ola:A4, 6ola:A5, 6ola:A6, 6ola:A7, 6ola:A8, 6ola:A9, 6ola:AA, 6ola:AB, 6ola:AC, 6ola:AD, 6ola:AE, 6ola:AF, 6ola:AG, 6ola:AH, 6ola:AI, 6ola:AJ, 6ola:AK, 6ola:AL, 6ola:AM, 6ola:AN, 6ola:AO, 6ola:AP, 6ola:AQ, 6ola:AR, 6ola:AS, 6ola:AT, 6ola:AU, 6ola:AV, 6ola:AW, 6ola:AX, 6ola:AY, 6ola:AZ, 6ola:Aa, 6ola:Ab, 6ola:Ac, 6ola:Ad, 6ola:Ae, 6ola:Af, 6ola:Ag, 6ola:Ah, 6ola:Ai, 6ola:Aj, 6ola:Ak, 6ola:Al, 6ola:Am, 6ola:An, 6ola:Ao, 6ola:Ap, 6ola:Aq, 6ola:Ar, 6ola:As, 6ola:At, 6ola:Au, 6ola:Av, 6ola:Aw, 6ola:Ax, 3r0r:A
2	5j37:E	206	210	0.3367	0.3204	0.3143	3.55e-14	5j37:B, 5j37:A, 5j37:D, 5j37:C
3	6rxu:CP	233	79	0.1122	0.0944	0.2785	0.19	5jpq:g, 5oql:g, 6rxt:CP, 6rxv:CP, 6rxx:CP, 6rxy:CP, 6rxz:CP
4	2o5c:A	634	47	0.0714	0.0221	0.2979	1.3	1i7d:A, 2o19:A, 2o19:B, 2o54:A, 2o54:B, 2o59:A, 2o59:B, 2o5c:B, 2o5e:A, 2o5e:B
5	1lck:A	164	48	0.0816	0.0976	0.3333	1.5	1bhf:A, 1cwd:L, 1cwe:A, 1cwe:C, 1fbz:A, 1fbz:B, 2iim:A, 1ijr:A, 1lcj:A, 1lkk:A, 1lkl:A, 1x27:A, 1x27:B, 1x27:C, 1x27:D, 1x27:E, 1x27:F
6	6oq5:A	2346	112	0.1429	0.0119	0.2500	1.9	6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
7	8qeo:A	2146	112	0.1429	0.0130	0.2500	4.9
8	2wqy:C	140	41	0.0612	0.0857	0.2927	5.0	2fbw:C, 2fbw:P, 2h88:C, 2h88:P, 2h89:C, 6myo:C, 6myp:C, 6myq:C, 6myr:C, 6mys:C, 6myt:C, 6myu:C, 2wqy:P, 1yq3:C, 1yq4:C
9	8qen:A	2363	112	0.1429	0.0118	0.2500	5.1	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
10	8ffz:A	314	43	0.0663	0.0414	0.3023	5.2
11	5adk:A	416	42	0.0714	0.0337	0.3333	6.1	5adj:A, 5adj:B, 5adk:B, 5adl:A, 5adl:B, 5adm:A, 5adm:B, 5adn:A, 5adn:B, 6av6:A, 6av6:B, 6av6:C, 6av6:D, 6av7:A, 6av7:B, 6av7:C, 6av7:D, 4c3a:A, 4c3a:B, 4car:A, 4car:B, 4cft:A, 4cft:B, 6cie:A, 6cie:B, 6cie:C, 6cie:D, 6cif:A, 6cif:B, 6cif:C, 6cif:D, 4cty:A, 4cty:B, 4ctz:A, 4ctz:B, 4cu0:A, 4cu0:B, 4cu1:A, 4cu1:B, 4cul:A, 4cul:B, 4cum:A, 4cum:B, 4cun:A, 4cun:B, 4cvg:A, 4cvg:B, 4cwv:A, 4cwv:B, 4cww:A, 4cww:B, 4cwx:A, 4cwx:B, 4cwy:A, 4cwy:B, 4cwz:A, 4cwz:B, 4cx0:A, 4cx0:B, 4cx1:A, 4cx1:B, 4cx2:A, 4cx2:B, 1d0c:A, 1d0c:B, 1d0o:A, 1d0o:B, 1d1v:A, 1d1v:B, 1d1w:A, 1d1w:B, 1d1x:A, 1d1x:B, 1d1y:A, 1d1y:B, 4d1o:A, 4d1o:B, 4d1p:A, 4d1p:B, 4d33:A, 4d33:B, 4d34:A, 4d34:B, 4d35:A, 4d35:B, 4d36:A, 4d36:B, 4d37:A, 4d37:B, 4d38:A, 4d38:B, 4d39:A, 4d39:B, 4d3a:A, 4d3a:B, 1dm6:A, 1dm6:B, 1dm7:A, 1dm7:B, 1dm8:A, 1dm8:B, 1dmi:A, 1dmi:B, 1dmj:A, 1dmj:B, 1dmk:A, 1dmk:B, 3dqs:A, 3dqs:B, 3dqt:A, 3dqt:B, 3e7s:A, 3e7s:B, 3eah:A, 3eah:B, 1ed4:A, 1ed4:B, 1ed5:A, 1ed5:B, 1ed6:A, 1ed6:B, 8fgn:A, 8fgn:B, 8fgn:C, 8fgn:D, 8fgo:A, 8fgo:B, 8fgo:C, 8fgo:D, 8fgp:A, 8fgp:B, 8fgp:C, 8fgp:D, 8fgq:A, 8fgq:B, 8fgq:C, 8fgq:D, 8fgr:A, 8fgr:B, 8fgr:C, 8fgr:D, 8fgs:A, 8fgs:B, 8fgs:C, 8fgs:D, 8fgt:A, 8fgt:B, 8fgt:C, 8fgt:D, 8fgu:A, 8fgu:B, 8fgu:C, 8fgu:D, 5fj2:A, 5fj2:B, 5fj3:A, 5fj3:B, 1foi:A, 1foi:B, 1foj:A, 1foj:B, 1fol:A, 1fol:B, 1foo:A, 1foo:B, 1fop:A, 1fop:B, 5fvy:A, 5fvy:B, 5fvz:A, 5fvz:B, 2g6o:A, 2g6o:B, 2hx2:A, 2hx2:B, 1i83:A, 1i83:B, 4imx:A, 4imx:B, 4jsk:A, 4jsk:B, 4jsl:A, 4jsl:B, 4jsm:A, 4jsm:B, 3jww:A, 3jww:B, 3jwx:A, 3jwx:B, 3jwy:A, 3jwy:B, 3jwz:A, 3jwz:B, 4k5h:A, 4k5h:B, 4k5i:A, 4k5i:B, 4k5j:A, 4k5j:B, 4k5k:A, 4k5k:B, 4kcp:A, 4kcp:B, 4kcq:A, 4kcq:B, 4kcr:A, 4kcr:B, 4kcs:A, 4kcs:B, 4luw:A, 4luw:B, 7m56:A, 7m56:B, 1m9j:A, 1m9j:B, 1m9k:A, 1m9k:B, 1m9m:A, 1m9m:B, 1m9q:A, 1m9q:B, 1m9r:A, 1m9r:B, 3n5p:A, 3n5p:B, 3n5q:A, 3n5q:B, 3n5r:A, 3n5r:B, 3n5s:A, 3n5s:B, 3n5t:A, 3n5t:B, 3n67:A, 3n67:B, 3n68:A, 3n68:B, 3n69:A, 3n69:B, 3n6a:A, 3n6a:B, 3n6b:A, 3n6b:B, 3n6c:A, 3n6c:B, 3n6d:A, 3n6d:B, 3n6e:A, 3n6e:B, 3n6f:A, 3n6f:B, 3n6g:A, 3n6g:B, 6nh1:A, 6nh1:B, 6nh1:C, 6nh1:D, 6nh2:A, 6nh2:B, 6nh2:C, 6nh2:D, 6nh3:A, 6nh3:B, 6nh3:C, 6nh3:D, 6nh4:A, 6nh4:B, 6nh4:C, 6nh4:D, 6nh5:A, 6nh5:B, 6nh5:C, 6nh5:D, 6nh6:A, 6nh6:B, 6nh6:C, 6nh6:D, 6nh7:A, 6nh7:B, 6nh8:A, 6nh8:B, 6nh8:C, 6nh8:D, 6nhf:A, 6nhf:B, 6nhf:C, 6nhf:D, 3nld:A, 3nld:B, 3nle:A, 3nle:B, 3nlf:A, 3nlf:B, 3nlg:A, 3nlg:B, 3nlh:A, 3nlh:B, 3nli:A, 3nli:B, 3nlt:A, 3nlt:B, 3nlu:A, 3nlu:B, 3nos:A, 3nos:B, 1nse:A, 1nse:B, 2nse:A, 2nse:B, 3nse:A, 3nse:B, 4nse:A, 4nse:B, 5nse:A, 5nse:B, 6nse:A, 6nse:B, 7nse:A, 7nse:B, 8nse:A, 8nse:B, 9nse:A, 9nse:B, 1p6l:A, 1p6l:B, 1p6m:A, 1p6m:B, 1p6n:A, 1p6n:B, 3pnh:A, 3pnh:B, 6pou:A, 6pou:B, 6pou:C, 6pou:D, 6pou:E, 6pou:F, 6pov:A, 6pov:B, 6pov:C, 6pov:D, 6pow:A, 6pow:B, 6pow:C, 6pow:D, 6pox:A, 6pox:B, 6pox:C, 6pox:D, 6poy:A, 6poy:B, 6poy:C, 6poy:D, 6poz:A, 6poz:B, 6poz:C, 6poz:D, 6pp0:A, 6pp0:B, 6pp0:C, 6pp0:D, 6pp1:A, 6pp1:B, 6pp1:C, 6pp1:D, 6pp2:A, 6pp2:B, 6pp2:C, 6pp2:D, 6pp3:A, 6pp3:B, 6pp3:C, 6pp3:D, 6pp4:A, 6pp4:B, 6pp4:C, 6pp4:D, 1q2o:A, 1q2o:B, 3rqo:A, 3rqo:B, 3rqp:A, 3rqp:B, 1rs8:A, 1rs8:B, 1rs9:A, 1rs9:B, 7tsg:A, 7tsg:B, 7tsg:C, 7tsg:D, 7tsh:A, 7tsh:B, 7tsh:C, 7tsh:D, 7tsi:A, 7tsi:B, 7tsi:C, 7tsi:D, 7tsk:A, 7tsk:B, 7tsk:C, 7tsk:D, 7tsl:A, 7tsl:B, 7tsl:C, 7tsl:D, 7tsm:A, 7tsm:B, 7tsm:C, 7tsm:D, 7tsn:A, 7tsn:B, 7tsn:C, 7tsn:D, 7tso:A, 7tso:B, 7tso:C, 7tso:D, 7tsp:A, 7tsp:B, 7tsp:C, 7tsp:D, 7uao:A, 7uao:B, 7uao:C, 7uao:D, 8ufr:A, 8ufr:B, 8ufr:C, 8ufr:D, 8ufs:A, 8ufs:B, 8ufs:C, 8ufs:D, 8uft:A, 8uft:B, 8uft:C, 8uft:D, 8ufu:A, 8ufu:B, 8ufu:C, 8ufu:D, 4uh7:A, 4uh7:B, 4uh8:A, 4uh8:B, 4uh9:A, 4uh9:B, 4uha:A, 4uha:B, 5uo8:A, 5uo8:B, 5uo8:C, 5uo8:D, 5uo9:A, 5uo9:B, 5uo9:C, 5uo9:D, 5uoa:A, 5uoa:B, 5uob:A, 5uob:B, 5uob:C, 5uob:D, 5uoc:A, 5uoc:B, 5uoc:C, 5uoc:D, 5uod:A, 5uod:B, 4upq:A, 4upq:B, 4upr:A, 4upr:B, 4ups:A, 4ups:B, 4upt:A, 4upt:B, 5vv6:A, 5vv6:B, 5vv7:A, 5vv7:B, 5vv8:A, 5vv8:B, 5vv9:A, 5vv9:B, 5vva:A, 5vva:B, 5vvb:A, 5vvb:B, 5vvb:C, 5vvb:D, 5vvc:A, 5vvc:B, 5vvc:C, 5vvc:D, 5vvd:A, 5vvd:B, 5vvd:C, 5vvd:D, 5vvg:A, 5vvg:B, 5vvn:A, 5vvn:B, 1zzs:A, 1zzs:B, 1zzt:A, 1zzt:B
12	5dgr:A	573	109	0.1122	0.0384	0.2018	8.9	5dgr:B
13	2woc:A	291	58	0.0816	0.0550	0.2759	9.2	2woc:B, 2woc:C, 2wod:A, 2wod:B, 2woe:A, 2woe:C, 2woe:B

[Back]