BioLiP

>protein
YNTISITVVDADDVGVNFVVSKVLSTLHNKGIFNGEVGVTFPRMDKNVGDIITLFSKTGVDRKVLTSTLNTLTDFIHIGK
PKEADKVKTYRKVDTKSKGKLIRRCIKRKGVSAETAESLYGNYKGEKCKLPYIVVNSKSTGQRFSMFLEECENSEKFNSY
GLCIV

The query sequence (length=165) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7wkp:A	167	165	1.0000	0.9880	1.0000	2.76e-119	8k0k:I, 8k22:H, 8k23:H, 8k23:h, 8k24:h, 8k24:H, 8k27:I, 8k28:I, 8k29:I, 7wwu:I
2	4al5:A	189	155	0.2485	0.2169	0.2645	8.41e-06	6b44:L, 6b45:L, 6b46:L, 6b47:L, 6b48:L, 7ecv:L, 7elm:I, 7elm:S, 7eln:I, 7eln:S, 7eqg:L, 7jzw:C, 7jzx:C, 7jzy:C, 7jzz:C, 6ne0:L, 7t3j:C, 7t3k:C, 7t3k:c, 7t3l:C, 7t3l:c, 7taw:C, 7taw:c, 7tax:C, 5uz9:L, 6vqv:K, 6vqx:J, 6w1x:L, 7we6:I, 7we6:S, 6whi:L, 2xlj:A, 2xlk:A, 2xlk:B, 7yhs:L
3	8ydb:B	175	170	0.2667	0.2514	0.2588	2.57e-04	8w1p:I, 8yeo:B, 8yh9:B
4	2xli:A	167	156	0.2182	0.2156	0.2308	3.81e-04	4al6:A, 4al7:A
5	5o6u:B	182	155	0.2242	0.2033	0.2387	0.002
6	5o7h:B	129	145	0.2182	0.2791	0.2483	0.014
7	6rm3:SNN	167	82	0.1333	0.1317	0.2683	0.51
8	1gxd:A	624	50	0.1152	0.0304	0.3800	0.64	1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
9	6vfp:A	439	64	0.1152	0.0433	0.2969	1.5	6bx7:A, 6mga:A
10	6z1p:AS	728	93	0.1576	0.0357	0.2796	2.1
11	5x2b:L	283	52	0.1152	0.0671	0.3654	3.8	5x2b:C, 5x2b:A, 5x2b:B, 5x2b:D, 5x2b:E, 5x2b:F, 5x2b:G, 5x2b:H, 5x2b:I, 5x2b:J, 5x2b:K
12	8u7h:C	1111	34	0.0848	0.0126	0.4118	3.9
13	2q6h:A	512	59	0.1030	0.0332	0.2881	4.0	2a65:A, 7dii:A, 7dii:B, 7dix:A, 7dix:B, 7dj1:A, 7dj1:B, 7dj2:A, 7dj2:B, 7djc:A, 3f3a:A, 3f3c:A, 3f3d:A, 3f3e:A, 3f48:A, 3f4i:A, 3f4j:A, 8ft4:A, 8ft5:A, 4fxz:A, 4fy0:A, 3gjc:A, 3gjc:B, 3gjd:A, 3gwu:A, 3gwv:A, 3gww:A, 4hmk:A, 4hmk:B, 4hod:A, 7lqj:A, 7lqk:A, 7lql:A, 4mm4:A, 4mm4:B, 4mm5:A, 4mm6:A, 4mm7:A, 4mm8:A, 4mm9:A, 4mma:A, 4mmb:A, 4mmc:A, 4mmd:A, 4mmd:B, 4mme:A, 4mme:B, 4mmf:A, 4mmf:B, 3mpn:A, 3mpq:A, 6nle:A, 2q72:A, 2qb4:A, 2qei:A, 2qju:A, 3qs4:A, 3qs5:A, 3qs6:A, 3tt1:A, 3tt1:B, 3tu0:A, 3usg:A, 3usi:A, 3usi:B, 3usj:A, 3usj:B, 3usk:A, 3usk:B, 3usk:C, 3usk:D, 3usl:A, 3usm:A, 3uso:A, 3uso:B, 3usp:A, 6xwm:A, 6xwm:B
14	7yll:A	329	113	0.2000	0.1003	0.2920	4.8
15	7c79:L	131	105	0.1515	0.1908	0.2381	4.8	7c7a:L, 6w6v:L
16	5t9t:A	526	53	0.1030	0.0323	0.3208	7.0	5t9t:B
17	8ova:AG	150	52	0.0970	0.1067	0.3077	8.9	7ase:R, 5opt:R, 8ove:AG, 4v8m:AG

[Back]