Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
YNLDVRGARSFSPPRAGRHFGYRVLQVGNGVIVGAPGEGNSTGSLYQCQSGTGHCLPVTLRGSNYTSKYLGMTLATDPTD
GSILACDPGLSRTCDQNTYLSGLCYLFRQNLQGPMLQGRPGFQECIKGNVDLVFLFDGSMSLQPDEFQKILDFMKDVMKK
LSNTSYQFAAVQFSTSYKTEFDFSDYVKWKDPDALLKHVKHMLLLTNTFGAINYVATEVFREELGARPDATKVLIIITDG
EATDSGNIDAAKDIIRYIIGIGKHFQTKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIQDLTSFNMELSSSG
ISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVRAGYLGYTVTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRV
LLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELCGVDVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFIYQRRQLGFEEVSELQGD
PGYPLGRFGEAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQGAVYIFNGRHGGLSPQPSQRIEGTQVLSGIQWFGRSIHGVKDLEG
DGLADVAVGAESQMIVLSSRPVV

The query sequence (length=583) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5e6u:A 583 583 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5e6r:A, 5e6s:A, 5e6s:C, 5e6s:E
2 7p2d:A 751 611 0.4065 0.3156 0.3879 9.84e-133 7akk:D, 7akk:H, 1bho:1, 1bho:2, 1ido:A, 1jlm:A, 1m1u:A, 3q3g:G, 3q3g:E, 3q3g:I, 3q3g:L, 3qa3:G, 3qa3:E, 3qa3:I, 3qa3:L, 6rhw:C, 8voi:A, 4xw2:A
3 4nen:A 1063 613 0.4168 0.2286 0.3964 7.52e-125
4 4neh:A 1084 613 0.4168 0.2242 0.3964 1.73e-124 5es4:A, 3k6s:A, 3k71:G
5 6bxj:A 619 180 0.3070 0.2892 0.9944 2.15e-121 3bn3:A, 3bqm:B, 3bqm:C, 3bqn:B, 3bqn:C, 6bxb:A, 6bxb:B, 6bxf:A, 6bxf:B, 6ckb:A, 6ckb:B, 1cqp:A, 1cqp:B, 3e2m:A, 3e2m:B, 3eob:I, 3eob:J, 3f74:C, 3f78:A, 3f78:B, 3f78:C, 3hi6:A, 3hi6:B, 2ica:A, 4ixd:A, 7kc3:C, 7kc5:A, 7kc5:C, 7kc6:C, 7kc6:A, 1lfa:A, 1lfa:B, 3m6f:A, 1mjn:A, 1mq8:B, 1mq8:D, 1mq9:A, 2o7n:A, 1rd4:A, 1rd4:B, 1rd4:C, 1rd4:D, 1t0p:A, 3tcx:B, 3tcx:D, 3tcx:F, 3tcx:H, 3tcx:J, 3tcx:L, 3tcx:N, 3tcx:P, 3tcx:R, 3tcx:T, 3tcx:V, 3tcx:X, 3tcx:Z, 3tcx:b, 1xdd:A, 1xdd:B, 1xdg:A, 1xdg:B, 1xuo:A, 1xuo:B, 1zoo:A, 1zoo:B, 1zop:A, 1zop:B
6 7usl:A 856 282 0.2093 0.1425 0.4326 1.32e-61 7usm:A
7 7usl:A 856 117 0.0840 0.0572 0.4188 1.20e-17 7usm:A
8 3k6s:C 885 281 0.2144 0.1412 0.4448 7.99e-60 5es4:C, 5es4:E, 5es4:G, 3k6s:E, 3k6s:G, 3k71:A, 3k71:C, 3k71:E, 3k72:A, 3k72:C
9 3k6s:C 885 154 0.0961 0.0633 0.3636 3.41e-14 5es4:C, 5es4:E, 5es4:G, 3k6s:E, 3k6s:G, 3k71:A, 3k71:C, 3k71:E, 3k72:A, 3k72:C
10 4irz:A 592 303 0.1904 0.1875 0.3663 5.88e-40 3v4p:A, 3v4p:C, 3v4v:A, 3v4v:C
11 7ceb:A 553 273 0.1492 0.1573 0.3187 8.61e-27 7cec:A
12 6rhv:C 170 167 0.0995 0.3412 0.3473 4.25e-26
13 7nxd:A 905 291 0.1509 0.0972 0.3024 1.04e-21 9ckv:A, 7nwl:A, 3vi3:A, 3vi3:C, 3vi4:C, 3vi4:A, 4wjk:A, 4wk0:A, 4wk2:A, 4wk4:A
14 4g1e:A 964 210 0.1201 0.0726 0.3333 2.84e-21 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
15 8t2v:A 946 240 0.1355 0.0835 0.3292 1.58e-16 4cak:A, 3fcs:A, 3fcs:C, 3fcu:A, 3fcu:C, 3fcu:E, 8gcd:A, 8gce:A, 5hdb:A, 5hdb:C, 7l8p:A, 7l8p:C, 7la4:A, 3nid:A, 3nid:C, 3nif:A, 3nif:C, 3nig:A, 3nig:C, 8t2u:A, 3t3m:A, 3t3m:C, 3t3p:A, 3t3p:C, 7tct:A, 7tct:C, 7td8:A, 7td8:C, 7tho:A, 7tho:C, 7tmz:A, 7tmz:C, 7tpd:A, 7tpd:C, 1tye:A, 1tye:C, 1tye:E, 7u60:A, 7u60:C, 7u9f:A, 7u9f:C, 7u9v:A, 7u9v:C, 7ubr:A, 7ubr:C, 7ucy:A, 7ucy:C, 7udg:A, 7udg:C, 7udh:A, 7udh:C, 7ue0:A, 7ue0:C, 7ufh:A, 7ufh:C, 7uh8:A, 7uh8:C, 7uje:A, 7uje:C, 7ujk:A, 7ujk:C, 7uk9:A, 7uk9:C, 7uko:A, 7uko:C, 7ukp:A, 7ukp:C, 7ukt:A, 7ukt:C, 6v4p:A, 2vc2:A, 2vdk:A, 2vdl:A, 2vdm:A, 2vdn:A, 2vdo:A, 2vdp:A, 2vdq:A, 2vdr:A, 4z7n:A, 4z7n:C, 4z7o:A, 4z7o:C, 4z7q:A, 4z7q:C, 3zdx:A, 3zdx:C, 3zdy:A, 3zdy:C, 3zdz:A, 3zdz:C, 3ze0:A, 3ze0:C, 3ze1:A, 3ze1:C, 3ze2:A, 3ze2:C
16 4cn9:A 397 189 0.0858 0.1259 0.2646 5.28e-09 4cn9:B
17 4cn9:A 397 135 0.0669 0.0982 0.2889 1.57e-05 4cn9:B
18 1aox:A 201 170 0.0772 0.2239 0.2647 1.99e-08 1aox:B, 4bj3:B, 4bj3:A, 1dzi:A, 5hj2:C, 5hj2:A, 5hj2:B, 5hj2:D, 5hj2:E, 6nd9:C, 6nd9:F, 6nd9:I, 6nd9:L, 6nd9:O, 6nd9:R, 6ndb:C, 6ndb:F, 6ndb:I, 6ndb:L, 6ndb:O, 6ndb:R, 6ndd:C, 6ndd:F, 6ndd:I, 6ndd:L, 6ndd:O, 6ndd:R, 6ndh:C, 6ndh:L, 6ndh:O, 6ndh:R, 5thp:C, 5thp:F, 5thp:I, 5thp:L, 5thp:O, 5thp:R, 1v7p:C
19 1pt6:B 195 172 0.0738 0.2205 0.2500 2.26e-06 4a0q:A, 4a0q:B, 2b2x:A, 2b2x:B, 5hgj:A, 5hgj:B, 2m32:A, 1mhp:A, 1mhp:B, 1pt6:A, 1qc5:A, 1qc5:B, 1qcy:A
20 8d3d:A 1314 183 0.0669 0.0297 0.2131 2.05e-04 8d3c:A, 8d3c:B, 8d3c:C, 8d3c:D, 8d3c:E, 8d3c:F, 8d3c:G, 8d3c:H, 8d3c:I, 8d3c:J, 8d3c:K, 8d3c:L, 8d3c:M, 8d3c:N, 8d3c:O, 8d3c:P, 8d3d:B, 8d3d:C, 8d3d:D, 8d3d:E, 8d3d:F, 8d3d:G, 8d3d:H, 8d3d:I, 8d3d:J, 8d3d:K, 8d3d:L, 8d3d:M, 8d3d:N, 8d3d:O, 8d3d:P, 7f49:A, 3hxo:A, 3hxq:A, 7wn3:A, 7wn3:B, 7wn3:E, 7wn3:G, 7wn4:E, 7wn4:G, 7wn6:A, 7wn6:B, 7wn6:E, 7wn6:G, 7wpp:E, 7wpp:G, 7wpq:A, 7wpq:B, 7wpq:E, 7wpq:G, 7wpr:A, 7wpr:B, 7wpr:E, 7wpr:F, 7wpr:G, 7wpr:H, 7wpr:I, 7wpr:J, 7wpr:K, 7wpr:L, 7wpr:M, 7wpr:N, 7wpr:O, 7wpr:P, 7wpr:Q, 7wpr:R, 7wps:A, 7wps:B, 7wps:E, 7wps:G, 7wps:I, 7wps:K, 7wps:M, 7wps:O, 7wps:Q, 7wps:S, 7wps:U, 7wps:W, 7wps:Y, 7wps:a, 7wqt:A, 7wqt:B, 7wqt:E, 7wqt:F, 7wqt:G, 7wqt:H, 7wqt:I, 7wqt:J, 7wqt:K, 7wqt:L, 7wqt:M, 7wqt:N, 7wqt:O, 7wqt:P, 7wqt:Q, 7wqt:R
21 3ppv:A 184 146 0.0600 0.1902 0.2397 2.17e-04 3zqk:A, 3zqk:B, 3zqk:C
22 4oku:B 241 145 0.0617 0.1494 0.2483 0.027 4okr:A, 4okr:B, 4oku:A
23 1t47:A 362 83 0.0429 0.0691 0.3012 0.30 1t47:B
24 9etn:A 551 97 0.0463 0.0490 0.2784 0.47
25 8sgx:X 657 36 0.0223 0.0198 0.3611 1.1 8sgx:S, 8sgx:Z, 8sgx:V, 8sgy:V, 8sgy:B, 8sgy:S, 8sgy:Z, 8sgy:Y, 8sgz:V, 8sgz:Z, 8sgz:X, 8sgz:S, 8sgz:B, 8sgz:Y
26 4tx8:A 374 79 0.0360 0.0561 0.2658 2.0
27 6xtz:A 421 84 0.0412 0.0570 0.2857 2.6
28 7svt:B 141 84 0.0429 0.1773 0.2976 2.7
29 2v9k:A 467 38 0.0172 0.0214 0.2632 2.9
30 7kn8:B 708 74 0.0360 0.0297 0.2838 3.2 7kn8:A
31 7d0j:B 734 34 0.0240 0.0191 0.4118 4.8 7a4p:B, 7bgi:B, 7blx:B, 8cmo:B, 7dz7:B, 7dz8:B, 8h2u:B, 6ijj:B, 6ijo:B, 6jo5:B, 6jo6:B, 6qph:B, 7r3k:B, 6rhz:B, 6sl5:B, 7wyi:B, 7wzn:B, 6yxr:B, 7zq9:B, 7zqc:B, 7zqd:B, 7zqd:B2, 6zzx:B, 6zzy:B
32 6alw:A 288 99 0.0497 0.1007 0.2929 5.2 6alw:B, 6b9i:A, 6b9i:B
33 4wzw:A 505 51 0.0223 0.0257 0.2549 7.1
34 7yfx:A 746 39 0.0257 0.0201 0.3846 7.4 7yfy:A, 7ygn:A
35 7ejh:A 253 43 0.0206 0.0474 0.2791 9.7 7ejh:B, 7ejh:C, 7ejh:D, 7eji:A, 7eji:B, 7eji:C, 7eji:D, 7ejj:A, 7ejj:B, 7ejj:C, 7ejj:D, 4rf2:A, 4rf2:B, 7vdo:D, 7vdo:A, 7vdo:B, 7ve7:A, 7ve7:B, 7ve7:C, 7ve7:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218