Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
WVCAQPSSQKATNHNLHITEKLEVLAKAYSVQGDKWRALGYAKAINALKSFHKPVTSYQEACSIPGIGKRMAEKIIEILE
SGHLRKLDHISESVPVLELFSNIWGAGTKTAQMWYQQGFRSLEDIRSQASLTTQQAIGLKHYSDFLERMPREEATEIEQT
VQKAAQAFNSGLLCVACGSYRRGKATCGDVDVLITHPDGRSHRGIFSRLLDSLRQEGFLTDDLVSQEENGQQQKYLGVCR
LPGPGRRHRRLDIIVVPYSEFACALLYFTGSAHFNRSMRALAKTKGMSLSEHALSTAVGRVLPTPTEKDVFRLLGLPYRE
PAERDW

The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7m0d:B 340 337 1.0000 0.9588 0.9674 0.0 2bcq:A, 2bcr:A, 2bcs:A, 2bcu:A, 2bcv:A, 3c5f:A, 3c5f:B, 3c5g:A, 3c5g:B, 5ca7:B, 5ca7:A, 5chg:A, 5chg:B, 5cj7:A, 5cj7:B, 5cp2:B, 5cr0:A, 5cr0:B, 5cwr:A, 5cwr:B, 5ddm:B, 5ddy:A, 5ddy:C, 5ddy:E, 5ddy:G, 5dkw:A, 5dkw:B, 4fo6:A, 2gws:A, 2gws:E, 2gws:I, 2gws:M, 3hw8:A, 3hwt:A, 3hx0:A, 3hx0:F, 3hx0:K, 3hx0:P, 5iii:A, 5iij:A, 5iik:A, 5iil:A, 5iim:A, 5iin:A, 5iio:A, 5iio:M, 5iio:E, 5iio:I, 4k4g:A, 4k4g:M, 4k4g:E, 4k4g:I, 4k4h:A, 4k4h:E, 4k4h:I, 4k4h:M, 4k4i:A, 4k4i:E, 4k4i:I, 4k4i:M, 7m07:A, 7m08:A, 7m09:A, 7m0a:A, 7m0b:A, 7m0c:A, 7m0d:A, 7m0e:A, 7m0e:B, 7m0e:C, 7m0e:D, 7m43:A, 7m44:A, 7m45:A, 7m46:A, 7m47:A, 7m48:A, 7m49:A, 7m4a:A, 7m4b:A, 7m4c:A, 7m4d:A, 7m4e:A, 7m4f:A, 7m4g:A, 7m4h:A, 7m4i:A, 7m4j:A, 7m4k:A, 7m4l:A, 3mda:A, 3mdc:A, 3mgh:A, 3mgh:C, 3mgi:A, 2pfn:A, 2pfo:A, 2pfp:A, 2pfq:A, 3pml:A, 3pml:B, 3pmn:A, 3pnc:A, 1rzt:A, 1rzt:M, 1rzt:E, 1rzt:I, 8u0o:A, 8u0p:A, 7un7:A, 3upq:A, 3uq0:A, 3uq2:A, 4x5v:A, 4xa5:A, 4xq8:B, 4xq8:A, 4xrh:B, 4xrh:A, 1xsl:A, 1xsl:E, 1xsl:I, 1xsl:M, 1xsn:A, 1xsp:A, 4xus:A
2 4rq2:A 333 329 0.3528 0.3453 0.3495 3.07e-61 6bel:A, 6bem:A, 5bol:A, 5bom:A, 1bpd:A, 1bpe:A, 1bpx:A, 1bpy:A, 1bpz:A, 2bpc:A, 2bpf:A, 2bpg:A, 2bpg:B, 5bpc:A, 6bte:A, 6btf:A, 3c2k:A, 3c2l:A, 3c2m:A, 6cly:A, 6cpq:A, 6cr3:A, 6cr4:A, 6cr5:A, 6cr6:A, 6cr7:A, 6cr8:A, 6cr9:A, 6crb:A, 6crc:A, 6crh:A, 6cti:A, 6ctj:A, 6ctk:A, 6ctl:A, 6ctm:A, 6ctn:A, 6cto:A, 6ctp:A, 6ctq:A, 6ctr:A, 6ctt:A, 6ctu:A, 6ctv:A, 6ctw:A, 6ctx:A, 6cu9:A, 6cua:A, 6cub:A, 5db6:A, 5db7:A, 5db8:A, 5db9:A, 5dba:A, 5dbb:A, 5dbc:A, 6dia:A, 6dic:A, 4do9:A, 4doa:A, 4dob:A, 4doc:A, 6e3r:A, 6e3v:A, 6e3w:A, 6e3x:A, 5eoz:A, 4f5n:A, 4f5o:A, 4f5p:A, 4f5q:A, 4f5r:A, 4f5r:B, 2fmp:A, 2fmq:A, 2fms:A, 6g2q:A, 3gdx:A, 4gxi:A, 4gxj:A, 4gxk:A, 5hhh:A, 5hhi:A, 1huo:A, 1huo:B, 1huz:A, 1huz:B, 2i9g:A, 7ice:A, 7icf:A, 7icg:A, 7ich:A, 7ici:A, 7icj:A, 7ick:A, 7icl:A, 7icm:A, 7icn:A, 7ico:A, 7icp:A, 7icq:A, 7icr:A, 7ics:A, 7ict:A, 7icu:A, 7icv:A, 8ica:A, 8icb:A, 8icc:A, 8ice:A, 8icf:A, 8icg:A, 8ich:A, 8ici:A, 8icj:A, 8ick:A, 8icl:A, 8icm:A, 8icn:A, 8ico:A, 8icp:A, 8icq:A, 8icr:A, 8ics:A, 8ict:A, 8icu:A, 8icv:A, 8icw:A, 8icx:A, 8icy:A, 8icz:A, 9ica:A, 9icb:A, 9icc:A, 9ice:A, 9icf:A, 9icg:A, 9ich:A, 9ici:A, 9icj:A, 9ick:A, 9icl:A, 9icm:A, 9icn:A, 9ico:A, 9icp:A, 9icq:A, 9icr:A, 9ics:A, 9ict:A, 9icu:A, 9icv:A, 9icw:A, 9icx:A, 9icy:A, 2iso:A, 2isp:A, 3isb:A, 3isc:A, 3isd:A, 5j0o:A, 5j0p:A, 5j0q:A, 5j0r:A, 5j0s:A, 5j0t:A, 5j0u:A, 5j0w:A, 5j0x:A, 5j0y:A, 5j29:A, 5j2a:A, 5j2b:A, 5j2c:A, 5j2d:A, 5j2e:A, 5j2f:A, 5j2g:A, 5j2h:A, 5j2i:A, 5j2j:A, 5j2k:A, 3jpn:A, 3jpo:A, 3jpp:A, 3jpq:A, 3jpr:A, 3jps:A, 3jpt:A, 4jwm:A, 4jwn:A, 7k96:A, 7k97:A, 4kld:A, 4kle:A, 4klf:A, 4klg:A, 4klh:A, 4kli:A, 4klj:A, 4kll:A, 4klm:A, 4klo:A, 4klq:A, 4kls:A, 4klt:A, 4klu:A, 3lk9:A, 4lvs:A, 4m2y:A, 4m47:A, 4m9g:A, 4m9h:A, 4m9j:A, 4m9l:A, 4m9n:A, 3mby:A, 4mf2:A, 4mf8:A, 4mfa:A, 4mfc:A, 4mff:A, 1mq2:A, 1mq3:A, 6mr7:A, 6mr8:A, 7mz0:A, 7mz1:A, 7mz2:A, 7mz3:A, 7mz4:A, 7mz8:A, 6n2r:A, 6n2s:A, 6n2t:A, 6nkr:A, 6nks:A, 6nkt:A, 6nku:A, 6nkv:A, 6nkw:A, 6nkx:A, 6nky:A, 6nkz:A, 4nlk:A, 4nln:A, 4nlz:A, 6nl0:A, 4nm1:A, 4nm2:A, 1nom:A, 4nxz:A, 4ny8:A, 4o5c:A, 4o5e:A, 4o5k:A, 4o9m:A, 3ogu:A, 4p2h:A, 2p66:A, 4pgq:A, 4pgx:A, 4pgy:A, 4ph5:A, 4pha:A, 4phd:A, 4phe:A, 4php:A, 6ph5:A, 6ph6:A, 6pkz:A, 4ppx:A, 2pxi:A, 4r63:A, 4r64:A, 4r65:A, 4r66:A, 7rbe:A, 7rbf:A, 7rbg:A, 7rbh:A, 7rbi:A, 7rbj:A, 7rbk:A, 7rbl:A, 7rbm:A, 7rbn:A, 7rbo:A, 3rh4:A, 3rh5:A, 3rh6:A, 3rje:A, 3rjf:A, 3rjg:A, 3rjh:A, 3rji:A, 3rjj:A, 3rjk:A, 4rpx:A, 4rpy:A, 4rpz:A, 4rq0:A, 4rq1:A, 4rq3:A, 4rq4:A, 4rq5:A, 4rq6:A, 4rq7:A, 4rq8:A, 4rt2:A, 4rt3:A, 7s9j:A, 7s9k:A, 7s9l:A, 7s9m:A, 7s9n:A, 7s9o:A, 7s9p:A, 7s9q:A, 5tb8:A, 5tb9:A, 5tba:A, 5tbb:A, 5tbc:A, 3tfr:A, 3tfs:A, 4tup:A, 4tuq:A, 4tur:A, 4tus:A, 1tv9:A, 1tva:A, 5tzv:A, 5u2r:A, 5u2s:A, 5u2t:A, 6u2o:A, 6u6b:A, 5u8g:A, 5u8h:A, 5u8i:A, 5u9h:A, 4uaw:A, 4uay:A, 4uaz:A, 4ub1:A, 4ub2:A, 4ub3:A, 4ub4:A, 4ub5:A, 4ubb:A, 4ubc:A, 5ugn:A, 5ugo:A, 5ugp:A, 6uok:F, 6uok:A, 6uol:A, 6uom:A, 3uxp:A, 3uxp:B, 5v1f:A, 5v1g:A, 5v1h:A, 5v1i:A, 5v1j:A, 5v1n:A, 5v1o:A, 5v1p:A, 5v1r:A, 3v72:A, 3v7j:A, 3v7k:A, 5vez:A, 8vf8:A, 8vf9:A, 8vfa:A, 8vfb:A, 8vfc:A, 8vfd:A, 8vfe:A, 8vff:A, 8vfg:A, 8vfh:A, 8vfi:A, 8vfj:A, 5vrw:A, 5vrx:A, 5vry:A, 5vrz:A, 5vs0:A, 5vs1:A, 5vs2:A, 5vs3:A, 5vs4:A, 6w2m:A, 5wnx:A, 5wny:A, 5wnz:A, 5wo0:A, 4ymm:A, 4ymn:A, 4ymo:A, 4yn4:A, 4z6c:A, 4z6d:A, 4z6e:A, 4z6f:A, 1zjm:A, 1zjn:A, 1zqa:A, 1zqb:A, 1zqc:A, 1zqd:A, 1zqe:A, 1zqf:A, 1zqg:A, 1zqh:A, 1zqi:A, 1zqj:A, 1zqk:A, 1zql:A, 1zqm:A, 1zqn:A, 1zqo:A, 1zqp:A, 1zqq:A, 1zqr:A, 1zqs:A, 1zqt:A, 1zqz:A
3 4yd1:A 334 335 0.3436 0.3353 0.3343 4.59e-56 6aec:A, 6aeh:A, 6ak5:A, 6ak6:A, 6ak8:A, 6ak9:A, 6akh:A, 7co6:A, 7co8:A, 7co9:A, 7coa:A, 7cob:A, 7coc:A, 7cod:A, 6ipd:A, 6ipe:A, 6ipf:A, 6ipg:A, 6iph:A, 6ipi:A, 6ipj:A, 6ipk:A, 6ipl:A, 6ipm:A, 6ipn:A, 7kss:A, 7kst:A, 7ksu:A, 7ksv:A, 7ksw:A, 7ksx:A, 7ksy:A, 7ksz:A, 7kt0:A, 7kt1:A, 7kt2:A, 7kt3:A, 7kt4:A, 7kt5:A, 7kt6:A, 7kt7:A, 7kt8:A, 7kt9:A, 7kta:A, 7ktb:A, 7ktc:A, 7ktd:A, 7kte:A, 7ktf:A, 7ktg:A, 7kth:A, 7kti:A, 7ktj:A, 7ktk:A, 7ktl:A, 7ktm:A, 7ktn:A, 4lzg:A, 4m04:A, 4m0a:A, 6p1m:A, 6p1n:A, 6p1o:A, 6p1p:A, 6p1q:A, 6p1r:A, 6p1s:A, 6p1t:A, 6p1u:A, 6p1v:A, 6p1w:A, 5twp:A, 5twq:A, 5twr:A, 5tws:A, 5txx:A, 5txz:A, 5tyb:A, 5tyc:A, 5tyd:A, 5tye:A, 5tyf:A, 5tyg:A, 5tyu:A, 5tyv:A, 5tyw:A, 5tyx:A, 5tyy:A, 5tyz:A, 6vez:A, 6vf0:A, 6vf1:A, 6vf2:A, 6vf3:A, 6vf4:A, 6vf5:A, 6vf6:A, 6vf7:A, 6vf8:A, 6vf9:A, 6vfa:A, 6vfb:A, 6vfc:A, 5vz7:A, 5vz8:A, 5vz9:A, 5vza:A, 5vzb:A, 5vzc:A, 5vzd:A, 5vze:A, 5vzf:A, 5vzg:A, 5vzh:A, 5vzi:A, 6wic:A, 6wid:A, 6wie:A, 4ycx:A, 4yd2:A, 5zlc:A
4 2ihm:B 336 333 0.3436 0.3333 0.3363 3.73e-55 2ihm:A
5 6go7:A 338 339 0.3252 0.3136 0.3127 7.97e-45 6go5:B, 4i2i:A, 4qze:A, 4qzf:A, 4qzh:A, 4qzi:A
6 4i27:A 361 344 0.3374 0.3047 0.3198 1.05e-44 5d46:A, 5d49:A, 5d4b:A, 5d4b:B, 6go4:A, 6go5:A, 6go6:A, 4i28:A, 4i29:A, 4i2a:A, 4i2b:A, 4i2c:A, 4i2d:A, 4i2e:A, 4i2f:A, 4i2g:A, 4i2h:A, 4i2j:A, 4iqt:A, 4iqu:A, 4iqv:A, 4iqw:A, 1jms:A, 1kdh:A, 1kej:A, 4qz8:A, 4qz9:A, 4qza:A, 4qzb:A, 4qzc:A, 4qzd:A, 4qzg:A
7 3au2:A 575 313 0.2791 0.1583 0.2907 2.13e-23 3au6:A, 3auo:A, 3auo:B, 3b0x:A, 3b0y:A
8 4p4o:A 306 274 0.2178 0.2320 0.2591 3.51e-20 4p4m:A, 4p4p:A
9 2w9m:B 559 313 0.2454 0.1431 0.2556 3.99e-07 2w9m:A
10 5hrf:A 178 153 0.1319 0.2416 0.2810 5.30e-07 7cpw:A, 7cpw:B, 8e9a:A, 8e9a:B, 5hr9:A, 5hr9:B, 5hrb:A, 5hrd:A, 5hrd:B, 5hrd:C, 5hrd:D, 5hre:A, 5hrf:B, 5hrg:A, 5hrg:B, 5hrh:A, 5hrh:B, 5hri:A, 5hri:B, 5hrk:A, 5hrk:B, 5hrl:A, 5hrl:B, 8ild:A, 8ild:B, 8ile:B, 8ile:A, 8ilf:B, 8ilf:A, 8ilg:A, 8ilg:B, 8ilh:B, 8ilh:A, 8ilh:C, 8ilh:D, 8ili:A, 8ili:B, 8ili:C, 8ili:D, 2m2u:A, 2m2w:A, 5xm8:A, 5xm8:B, 5xm8:C, 5xm8:D, 5xm9:A, 5xm9:B, 5xm9:C, 5xm9:D, 5xma:A, 5xma:B
11 2zja:A 700 121 0.1135 0.0529 0.3058 0.36 2zj5:A
12 3j7y:f 95 39 0.0368 0.1263 0.3077 0.84
13 6qw6:5J 803 60 0.0552 0.0224 0.3000 1.2 8h6e:4G, 8h6j:4G, 8h6k:4G, 8h6l:4G, 8qp8:N, 6qx9:5J, 8y6o:G
14 8r09:N 834 60 0.0552 0.0216 0.3000 1.2 6ahd:N, 5o9z:G, 8q7n:N, 8qo9:N, 8qpe:N, 8qzs:N, 8r0b:N, 8rc0:E, 8rm5:N
15 1kg5:A 225 62 0.0552 0.0800 0.2903 3.5 1kg2:A, 1kg3:A, 1kg4:A, 1kg6:A, 1kg7:A, 1kqj:A, 1mud:A, 1mun:A, 1muy:A, 1wef:A, 1weg:A, 1wei:A
16 2gc4:D 147 38 0.0429 0.0952 0.3684 3.9 2gc4:H, 2gc4:L, 2gc4:P, 2gc7:D, 2gc7:H, 2gc7:L, 2gc7:P, 1mg2:D, 1mg2:H, 1mg2:L, 1mg2:P, 1mg3:D, 1mg3:H, 1mg3:L, 1mg3:P, 2mta:C
17 8ef9:A 599 79 0.0798 0.0434 0.3291 4.0 8efc:A, 8efk:A
18 4rs2:B 183 30 0.0368 0.0656 0.4000 4.6 4rs2:A
19 7e0l:A 491 52 0.0491 0.0326 0.3077 5.2 7e0l:B, 7e0l:K, 7e0l:M, 7wsx:A, 7wsx:B
20 7bge:m 72 41 0.0399 0.1806 0.3171 7.2 7kwg:m
21 7elb:A 1937 132 0.0982 0.0165 0.2424 7.8 7ckm:A, 7elb:C, 6kld:A, 6kle:A, 6klh:A, 6klh:C
22 6ao8:A 569 78 0.0675 0.0387 0.2821 8.1

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218