Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
WTYHYSTKAYSWNISRKYCQNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADNE
PNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVR

The query sequence (length=157) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1g1q:A 160 157 1.0000 0.9812 1.0000 1.18e-115 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
2 3cfw:A 156 156 0.6497 0.6538 0.6538 7.60e-73 5vc1:A
3 4c16:A 280 156 0.6178 0.3464 0.6218 2.04e-66 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
4 6py1:A 130 120 0.2229 0.2692 0.2917 1.33e-11 6puv:A, 6w12:A, 6xiy:A
5 6pwr:A 129 115 0.2166 0.2636 0.2957 1.66e-09 6pws:A, 6pwt:A
6 4gko:L 136 115 0.2166 0.2500 0.2957 3.15e-09 4g9a:A, 4g9a:B, 4g9a:C, 4g9a:D, 4gko:G, 4gko:H, 4gko:I, 4gko:J, 4gko:K, 2h2t:B
7 3kqg:A 169 118 0.2420 0.2249 0.3220 3.24e-09 4ak8:A, 4ak8:B, 4ak8:C, 4ak8:D, 3c22:A, 3c22:B, 3c22:C, 3c22:D, 5g6u:A, 5g6u:B, 5g6u:D, 5g6u:C, 3kqg:B, 3kqg:C, 3kqg:D, 3kqg:E, 3kqg:F, 4n32:A, 4n32:B, 4n32:C, 4n32:D, 4n33:A, 4n33:B, 4n33:C, 4n33:D, 4n34:A, 4n34:B, 4n34:C, 4n34:D, 4n35:A, 4n35:B, 4n35:C, 4n35:D, 4n36:A, 4n36:B, 4n36:C, 4n36:D, 4n37:A, 4n37:B, 4n37:C, 4n37:D, 4n38:A, 4n38:B, 4n38:C, 4n38:D, 3p5d:A, 3p5d:B, 3p5d:C, 3p5d:D, 3p5e:A, 3p5e:B, 3p5e:C, 3p5e:D, 3p5f:B, 3p5f:C, 3p5f:A, 3p5f:D, 3p5g:A, 3p5g:B, 3p5g:C, 3p5g:D, 3p5h:B, 3p5h:D, 3p5h:A, 3p5h:C, 3p5i:A, 3p5i:B, 3p5i:C, 3p5i:D, 3p7f:A, 3p7f:B, 3p7f:C, 3p7f:D, 3p7g:A, 3p7g:B, 3p7g:C, 3p7g:D, 3p7h:A, 3p7h:B, 3p7h:C, 3p7h:D, 7ytq:A, 7ytq:B, 7ytq:C, 7ytq:D
8 8urf:A 128 120 0.2229 0.2734 0.2917 7.15e-09
9 4zes:A 147 117 0.2420 0.2585 0.3248 9.10e-09 4zes:B, 4zet:A, 4zet:B
10 5e4k:A 424 116 0.2102 0.0778 0.2845 1.86e-08
11 5e4k:A 424 101 0.1783 0.0660 0.2772 5.83e-05
12 6lfj:A 133 108 0.2038 0.2406 0.2963 2.69e-08 6kzr:A, 6kzr:B, 6lfj:B, 6lkr:A, 6lkr:B
13 3wh2:A 132 119 0.2420 0.2879 0.3193 2.81e-08 3wh3:A
14 5b1w:A 130 118 0.2293 0.2769 0.3051 4.70e-08 5b1w:B, 5b1w:C, 5b1w:D, 5b1x:A, 5b1x:B, 5b1x:C, 5b1x:D
15 1sl6:A 168 124 0.2420 0.2262 0.3065 8.98e-08 1k9j:A, 1sl6:B, 1sl6:C, 1sl6:D, 1sl6:E, 1sl6:F, 1xph:A
16 6ghv:D 133 124 0.2293 0.2707 0.2903 1.05e-07 6ghv:A, 6ghv:B, 6ghv:C, 6ghv:E, 6ghv:F, 2it5:A, 2it6:A, 1k9i:A, 1k9i:C, 1k9i:D, 1k9i:E, 1k9i:H, 1k9i:B, 1k9i:F, 1k9i:G, 1k9i:I, 1k9i:J, 7nl6:A, 7nl7:A, 1sl4:A, 1sl5:A, 2xr5:A, 2xr6:A
17 8h4v:A 148 119 0.2420 0.2568 0.3193 2.34e-07 8h4v:B, 8hb5:A, 5kth:A, 5kti:A, 4kzv:A, 4kzv:B, 4kzw:A, 4kzw:B, 4zrv:A, 4zrv:C, 4zrv:B, 4zrw:A
18 5k8y:A 136 110 0.1975 0.2279 0.2818 6.07e-07 5k8y:B, 5m62:A, 5m62:B
19 4c9f:D 134 117 0.2229 0.2612 0.2991 6.93e-07 4c9f:A, 4c9f:B, 4c9f:C, 4caj:A, 4caj:B, 4caj:C, 4caj:D, 3zhg:A, 3zhg:B, 3zhg:C, 3zhg:D
20 2ric:C 158 43 0.1274 0.1266 0.4651 1.05e-06 1b08:A, 1b08:B, 1b08:C, 3dbz:A, 3dbz:B, 3dbz:C, 4e52:B, 4e52:C, 4e52:A, 3g81:A, 3g81:B, 3g81:C, 3g83:A, 3g83:B, 3g83:C, 3g84:A, 3g84:B, 3g84:C, 2ggu:A, 2ggu:B, 2ggu:C, 2ggx:A, 2ggx:B, 2ggx:C, 3ikn:A, 3ikn:B, 3ikn:C, 3ikp:A, 3ikp:B, 3ikp:C, 3ikq:A, 3ikq:B, 3ikq:C, 3ikr:A, 3ikr:B, 3ikr:C, 4m17:A, 4m17:B, 4m17:C, 4m17:D, 4m17:E, 4m17:F, 4m17:G, 4m17:H, 4m17:I, 4m17:J, 4m17:K, 4m17:L, 4m18:A, 4m18:E, 4m18:B, 4m18:C, 4m18:D, 4m18:L, 4m18:F, 4m18:G, 4m18:H, 4m18:I, 4m18:J, 4m18:K, 2orj:A, 2orj:B, 2orj:C, 2ork:A, 2ork:B, 2ork:C, 2os9:A, 2os9:B, 2os9:C, 5oxr:B, 5oxr:C, 5oxr:A, 5oxs:A, 5oxs:B, 5oxs:C, 1pw9:A, 1pw9:B, 1pw9:C, 1pwb:A, 1pwb:B, 1pwb:C, 2ria:A, 2ria:B, 2ria:C, 2rib:A, 2rib:B, 2rib:C, 2ric:B, 2ric:A, 2rid:A, 2rid:B, 2rid:C, 2rie:A, 2rie:B, 2rie:C
21 5e4l:A 428 108 0.2038 0.0748 0.2963 1.87e-06
22 5e4l:A 428 101 0.1783 0.0654 0.2772 6.67e-05
23 1egg:B 144 118 0.2229 0.2431 0.2966 7.07e-06 1egg:A, 1egi:A, 1egi:B, 7jub:A, 7juc:A, 7jud:A, 7jud:B, 7jue:A, 7juf:A, 7juf:B, 7jug:A, 7juh:A, 7l61:A, 7l62:A, 7l63:A, 7l64:A, 7l65:A, 7l66:A, 7l67:A, 7l68:A, 7l68:B
24 5l0t:B 40 33 0.1083 0.4250 0.5152 7.92e-06 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
25 2vuv:A 129 123 0.2229 0.2713 0.2846 1.44e-05 2vuz:A
26 6tl9:F 130 61 0.0892 0.1077 0.2295 2.23e-05 6tl9:B, 6tl9:C, 6tl9:G
27 5e4l:B 386 101 0.1783 0.0725 0.2772 6.13e-05
28 5e4l:B 386 44 0.1083 0.0440 0.3864 0.25
29 5xts:A 460 114 0.1911 0.0652 0.2632 6.17e-05 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
30 3cdg:J 123 62 0.1146 0.1463 0.2903 9.64e-05 3cdg:E, 3cii:G, 3cii:I
31 6jjj:A 151 114 0.1975 0.2053 0.2719 1.06e-04 6jjj:B, 6jjj:C, 6jjj:D, 6jjj:E, 6jjj:F
32 6ryj:A 122 45 0.1338 0.1721 0.4667 1.67e-04 6ryg:A, 6rym:A, 6ryn:A
33 5jq1:A 130 122 0.1783 0.2154 0.2295 1.93e-04 1dv8:A, 5jpv:A, 5jpv:B, 5jq1:B, 8ts0:A, 6yau:A
34 6a7s:B 138 109 0.1720 0.1957 0.2477 2.50e-04 6a7t:B, 6m5m:B
35 3vyk:A 128 107 0.1847 0.2266 0.2710 3.35e-04
36 2ox8:A 129 121 0.1720 0.2093 0.2231 4.49e-04 2ox8:B, 2ox8:C, 2ox8:D
37 5f2q:B 135 72 0.1529 0.1778 0.3333 5.04e-04 5f2q:A, 5f2q:C, 5f2q:D, 5f2q:E, 5f2q:F, 5f2q:G, 5f2q:H, 5f2q:I, 5f2q:J, 1jzn:A, 1jzn:B, 1jzn:C, 1jzn:D, 1jzn:E, 1muq:B, 1muq:A, 1muq:C, 1muq:D, 1muq:E
38 6a7t:A 137 123 0.1911 0.2190 0.2439 5.32e-04 6m5m:A
39 4yli:D 155 68 0.1401 0.1419 0.3235 7.65e-04 4yli:A, 4yli:B, 4yli:C, 4yli:E, 4yli:F, 4ymd:A, 4ymd:B, 4ymd:D, 4ymd:F, 4ymd:C, 4ymd:E
40 6bbe:A 155 46 0.1274 0.1290 0.4348 0.002 6bbd:A, 4dn8:A
41 3poy:A 1005 36 0.0955 0.0149 0.4167 0.002 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
42 1xkb:A 91 34 0.0955 0.1648 0.4412 0.003 3k9x:A
43 7alj:A 115 34 0.0892 0.1217 0.4118 0.003
44 7alj:A 115 32 0.0955 0.1304 0.4688 0.042
45 7alj:A 115 34 0.0828 0.1130 0.3824 2.8
46 5mwb:A 118 34 0.0955 0.1271 0.4412 0.004
47 5mwb:A 118 34 0.0828 0.1102 0.3824 0.009
48 5mwb:A 118 29 0.0764 0.1017 0.4138 0.33
49 2ox9:C 131 121 0.1720 0.2061 0.2231 0.005 2ox9:A, 2ox9:B, 2ox9:D
50 1hup:A 141 43 0.1146 0.1277 0.4186 0.005
51 3pak:A 145 115 0.1720 0.1862 0.2348 0.009 5ffr:A, 5ffs:A, 5fft:A, 3paq:A, 3par:A, 3pbf:A, 1r13:A, 1r14:A, 4wr9:A, 4wrc:A, 4wre:A, 4wrf:A, 4wuw:A, 4wux:A
52 3j82:A 131 53 0.0892 0.1069 0.2642 0.013
53 4xlw:C 118 28 0.0828 0.1102 0.4643 0.014 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
54 4xlw:C 118 28 0.0764 0.1017 0.4286 1.2 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
55 4xlw:C 118 39 0.0828 0.1102 0.3333 7.3 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
56 4wqq:A 141 103 0.1783 0.1986 0.2718 0.018 1wmy:A, 1wmy:B, 1wmz:A, 1wmz:B, 1wmz:C, 1wmz:D, 4wqq:B, 4wqq:C, 4wqq:D
57 4d0f:A 125 29 0.0764 0.0960 0.4138 0.019 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
58 4d0f:A 125 29 0.0764 0.0960 0.4138 0.18 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
59 4d0f:A 125 37 0.0828 0.1040 0.3514 3.8 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
60 3h5c:B 312 38 0.0892 0.0449 0.3684 0.021
61 5uk5:A 194 28 0.0828 0.0670 0.4643 0.029 2rqz:A, 2rr2:A
62 5uk5:A 194 31 0.0828 0.0670 0.4194 0.89 2rqz:A, 2rr2:A
63 3wsr:A 120 82 0.1274 0.1667 0.2439 0.044 3wsr:B
64 2e3x:B 129 50 0.0764 0.0930 0.2400 0.051
65 2bpe:A 128 62 0.0955 0.1172 0.2419 0.056 2bpe:B, 2bph:A, 2bph:B, 2cl8:A, 2cl8:B
66 7odu:A 129 61 0.0955 0.1163 0.2459 0.060
67 1byf:A 123 97 0.1401 0.1789 0.2268 0.067 1byf:B, 1tlg:A, 1tlg:B
68 1bj3:A 129 54 0.0955 0.1163 0.2778 0.11 1j34:A, 1j35:A, 1x2t:A, 1x2t:C
69 1kza:1 115 43 0.1019 0.1391 0.3721 0.13 1kza:2, 1kzb:1, 1kzb:2, 1kzc:1, 1kzc:2, 1kzd:1, 1kzd:2, 1kze:1, 1kze:2, 1rdi:1, 1rdi:2, 1rdj:1, 1rdj:2, 1rdk:1, 1rdk:2, 1rdl:1, 1rdl:2, 1rdm:1, 1rdm:2, 1rdn:1, 1rdn:2, 1rdo:1, 1rdo:2
70 3vpp:B 122 54 0.0955 0.1230 0.2778 0.16 3vpp:A
71 6a48:A 651 28 0.0828 0.0200 0.4643 0.21
72 3t3a:A 122 63 0.0892 0.1148 0.2222 0.25 3t3a:B
73 4xbm:B 401 33 0.0892 0.0349 0.4242 0.25
74 4xbm:B 401 17 0.0701 0.0274 0.6471 8.3
75 5fm9:A 154 32 0.0828 0.0844 0.4062 0.36 5fma:A, 5fma:B
76 8umo:K 113 61 0.1083 0.1504 0.2787 0.67
77 6r2w:L 143 33 0.0764 0.0839 0.3636 1.9 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
78 5b4x:A 710 33 0.0828 0.0183 0.3939 2.7 3a7q:A, 5b4x:C, 2e26:A
79 8h3m:C 930 40 0.0892 0.0151 0.3500 3.3
80 5vyg:B 43 35 0.0828 0.3023 0.3714 3.8 5vyg:A, 5vyg:C
81 5ms9:A 177 56 0.1210 0.1073 0.3393 4.7
82 7pgn:B 438 41 0.0955 0.0342 0.3659 4.7 7pgm:B, 7pgn:A, 2wfx:B
83 8em4:A 3818 33 0.0892 0.0037 0.4242 5.4 8em4:B
84 5k8b:A 394 45 0.0892 0.0355 0.3111 7.5 5k8b:B, 5k8b:C, 5k8b:D
85 8em7:A 4378 33 0.0892 0.0032 0.4242 7.9 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
86 4d90:A 127 56 0.1083 0.1339 0.3036 9.2 4d90:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218