BioLiP

>protein
WSYSQTLSANIQVNALQRYQEMIGGGCSGAFGWACQQFPTGLTPENQEEVTKILFDENIGGLSIVRNDIGSSPGSTILPT
CPATPAGPFNYQWDGSDSCQFNLTKTALKYNPELYVYANAWSAPGCMKTVGTENDGGQICGVRGTNCTYDWRQAYADYLV
QYVKFYQAEGIDISLLGAWNEPDFNPVTYESMESDGFQAKDFLEILYPTVKKAFPNLDVSCCDATGARQERNILYEVQQA
GGEHFFDVATWHNYQSSPERPFNVVGKPNIMTEWADGSGPWNTTWDVSGQLAEGLQWALYMHNAFTNSDTSGYNHWWCAG
GGADNVLISITGNSYEVSSRLWAFASYFRFARPGSVRIGATSSVENVYVSAYENKNGTVSIPVINAAHFPYEVTIDLQGL
KARKRVSTFLTDNSHNVTLMDQSELHGSVLKATVPPRAVQVFWLE

The query sequence (length=445) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8idp:A	446	446	1.0000	0.9978	0.9978	0.0	8idp:C, 8idp:B, 8idp:D, 8idq:A, 8idq:B, 8idq:C, 8idq:D
2	6krn:A	456	452	0.3910	0.3816	0.3850	8.97e-89
3	8cbc:A	455	456	0.3596	0.3516	0.3509	4.70e-74	8c48:A, 8c48:B, 8cbc:B, 7o0e:A, 7o0e:G, 8p67:A, 8p67:B
4	6m5z:A	433	436	0.3551	0.3649	0.3624	1.62e-72	6m5z:B
5	7n6o:A	433	456	0.2742	0.2818	0.2675	1.50e-27	7n6o:B
6	5ngl:B	454	416	0.2337	0.2291	0.2500	4.44e-18	5ngl:A, 5ngl:C
7	2y24:A	383	354	0.2000	0.2324	0.2514	2.11e-13
8	4uqa:A	391	336	0.1843	0.2097	0.2440	1.53e-11	5a6l:A, 5a6m:A, 4ckq:A, 4uqc:A
9	4qaw:A	537	335	0.1820	0.1508	0.2418	2.09e-11	4qaw:B, 4qaw:C, 4qaw:D, 4qaw:E, 4qaw:F, 4qaw:G, 4qaw:H, 4qb1:A, 4qb2:A, 4qb6:A
10	3kl0:A	397	349	0.1933	0.2166	0.2464	1.89e-09	3kl3:A, 3kl3:B, 3kl5:A, 3kl5:B, 3kl5:C
11	2wnw:B	445	80	0.0629	0.0629	0.3500	5.69e-07	2wnw:A
12	9fa6:A	501	437	0.2112	0.1876	0.2151	1.95e-06	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
13	5nxb:A	644	145	0.0854	0.0590	0.2621	0.027	4ccc:A, 4ccd:A, 4cce:A, 5nxb:B, 4ufh:A, 4ufi:A, 4ufj:A, 4ufk:A, 4ufl:A, 4ufm:A, 6y6s:A, 6y6t:A, 3zr5:A, 3zr6:A
14	5agd:B	344	69	0.0517	0.0669	0.3333	0.40	5agd:A, 4boj:A, 4boj:B, 4boj:C, 4d4b:A, 4d4b:B, 4d4c:A, 4d4c:B, 4d4d:A, 4d4d:B, 5m77:A, 5m77:B, 5n0f:A, 5n0f:B, 7nl5:A, 6zbm:A, 6zbw:A, 6zbw:B, 6zbx:A, 6zbx:B
15	7whg:G	221	54	0.0472	0.0950	0.3889	0.52
16	7u0e:H	224	204	0.1101	0.2188	0.2402	2.0	7u0e:A
17	7o4x:A	103	24	0.0247	0.1068	0.4583	2.9
18	7mi4:A	554	159	0.0944	0.0758	0.2642	3.0	7mi4:B, 7mi4:C, 7mi4:D, 7mi5:A, 7mi5:B, 7mi5:D, 7mi5:C, 7mi9:A, 7mi9:B, 7mi9:C, 7mi9:D, 7mib:A, 7mib:B, 7mib:C, 7mib:D, 7mid:A, 7mid:B
19	7lsu:A	765	81	0.0517	0.0301	0.2840	5.5	7lsa:A, 7lsr:A, 7lst:A
20	5e6f:A	130	23	0.0247	0.0846	0.4783	6.8	5e6f:B
21	5a6q:A	114	50	0.0360	0.1404	0.3200	7.1	5a6q:B, 5a6q:C, 5a6q:D, 5a6x:A, 5a6x:B, 5a6x:C, 5a6x:D, 5a6y:B, 5a6y:C, 5a6y:D, 5a6y:A, 5a6z:A, 5a6z:B, 5a6z:C, 5a6z:D, 5a70:A, 5a70:B, 5a70:C, 5a70:D, 5may:A, 5may:B, 5may:C, 5may:D, 5maz:A, 5maz:B, 5maz:C, 5maz:D, 5mb1:A, 5mb1:B, 5mb1:C, 5mb1:D, 4ut5:A, 4ut5:B, 4ut5:C, 4ut5:D

[Back]